Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032115.4
Sequence Length
1396 nt
GC Content
0.5895
GCACUGUUCAAACAGUCUCCCCAGCCUCCAGACACCUGUGCCGAGGAGGAGGGCAGGGCAGGCGGCAGCCUGGGCACAGGCCCCUAGGUGCUUACUCCUCACCUGUUUCCCACCUCUCCCCCAUAGCCAGCCCCACGGCCCUGGCAGGGUCCUGGCCACAGCAUGCCCAGUGCUGGGCUCUGCAGCUGCUGGGGUGGCCGGGUGCUGCCCCUGCUGCUGGCCUAUGUCUGCUACCUGCUGCUCGGUGCCACUAUCUUCCAGCUGCUAGAGAGGCAGGCGGAGGCUCAGUCCAGGGACCAGUUUCAGUUGGAGAAGCUGCGCUUCCUGGAGAACUACACCUGCCUGGACCAGUGGGCCAUGGAGCAGUUUGUGCAGGUCAUCAUGGAAGCCUGGGUGAAAGGUGUGAACCCCAAAGGCAACUCUACCAACCCCAGCAACUGGGACUUUGGCAGCAGUUUCUUCUUUGCAGGCACAGUCGUCACUACCAUAGGAUAUGGGAACCUGGCACCCAGCACAGAGGCAGGUCAGGUCUUCUGUGUCUUCUAUGCCCUGUUGGGCAUCCCGCUUAACGUGAUCUUCCUCAACCACCUGGGCACAGGGCUGCGUGCCCAUCUGGCCGCCAUUGAAAGAUGGGAGGACCGUCCCAGGCGCUCCCAGGUACUGCAAGUCCUGGGCCUGGCUCUGUUCCUGACCCUGGGGACGCUGGUCAUUCUCAUCUUCCCACCCAUGGUCUUCAGCCAUGUGGAGGGCUGGAGCUUCAGCGAGGGCUUCUACUUUGCUUUCAUCACUCUCAGCACCAUUGGCUUUGGGGACUAUGUUGUUGGCACAGACCCCAGCAAGCAUUAUAUCUCAGUGUAUCGGAGCCUGGCAGCCAUCUGGAUCCUCCUGGGCCUGGCGUGGCUGGCGCUGAUCCUCCCACUGGGCCCCCUGCUUCUGCACAGAUGCUGCCAGCUCUGGCUGCUCAGUCUGAGGCAAGGCUGUGGAGCCAAGGCGGCUCCAGGCAGGAGACCCAGGAGAGGCUCUACAGCAGCAAGAGGAGUCCAAGUCACACCCCAGGACUUCCCCAUAUCCAAGAAAGGACUGGGAAGCUGAGGACCCACGGACUCUUCACACAGCCUAGACGCUUCCUCCACUCCAGGUAGAGGGAUUUCGGGGGCCUUCUCAGAAGCAAGGAGUGGACAAGCCUCUUGGUUAAGGCUCCUCUUACCUCCCAAGCUCAUGGACAAGUGGCAAUCAGCUGGGGUCCCUCUUUUGGGGUACAAAGGAAAGGACAGAGGUGUGGGAGACCCAAGGUGGUCUUGAGAUUGACAGACAGCAAGUCCUUGGAGAUAGCCCCCGAGUCCAAGAACUUAGGCAGGGGCCCCAAGACAAUAAAGUUGGUCUCUACUAUCUCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-587.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -608.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 361.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............(((((((..(((((((((((..((((..(.(((((.(((((((..(((.((((.(((((((....))))..)))))))....)))..))))...))).))))).)..))))((((((.....(((...(((((.(.(((((((((......((((((((((.......)))).)))))))))))))))).)))))...)))))))))...))))))...(((((((.....(((((((....((((...(((.(.((((.(((.((((.((...((((((((((((((((.......))))))).).))))))))........((((((((((.((((((((.(((.(((....(((.(((((......(((((.(((((((..(((((((..((.((((((.((((((.((((.(((((...)))))...)))).)).))))...))))))..)))))...........(((((...)))))..))))..)))))))(((((((((.......).))))))))......((((((....))))))..(((.....)))..)))))......))))).)))....))).)))))))).)))((((((.(((.(((((((((((((((..((((((....(((((.(((...))))))))))))))..)(((((((......)))))))..)))).))))))))))......(((((((((((((((.((((...(((((((....(((((((.......))))))).......))).)))).))))))))..)))))))))))(((((((........)))))))(((((.......)))))..((((((.(((((((.(((((.........((((((...((((..((.......))..)))).))))))..(((....)))))))))))))))))))))(((.(.((((((......)))))).).))))))))))))))))))))))(((.((......)).)))..........(((((((((..((....((.(((..((((((....(((......)))..))))))))).))....)))))))))))....((((.(((.((((..((((((((..((((((((..........)))))).....))..)))))))).)))).))).)))).)).)))).))).)))).).)))...))))..)))))))..)))).)))((((.(((((((.....)))))))..)))).)))))..)))))))...(((((((...(((((((((.(((.....)))(((((.(...(((((...(((.((....)).))).)))))))))))........))))))))).)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{{{....,}}(((((((..((((((((,{,,{{{{{,,{{(({((,(((((((,.(((.(((({(((((((....))})..|)}}}},....)))..))))},,})}.}}}},.,,,({{{((((((..,,.(({...(((((,(.(((((((((......((((((((((.,...,.)))).)))))))))))))))),)))))}}})}})))))}}},}}||||{..({{(({({{.,{(((((((....((((...({{.{.{(((,(((.({((.{(...((((((((((((((((.......))))))).).))))))))........((((((((({,(((((((,{(((.(((..{.(((.(((((......(((((.{((((((..(((((((..{{.((((((.((((((.((((.(((((...)))))...)))).)).))))...))))))..)})))|,,..,,}},.(((((...}))))..))))..))))))}(((((((((.......)})})))))),.....((((((....))))))..(({....,)))..)))))......))))).))).}..))).)))))))).)))|(((((.,,{.(((((((((((((((..((((({...,(((((.(((...))))))))))))))..,,((((((,....,))))))}..)))).)))))))))).,....(((((((((((((({.{(((...(((((((....(((((((.......))))))).......))).)))).)))}})))|.,))))))))))(((((((........))))))){(({(.......}))))...(((({{(((((({{(((((,........((((((||.{{((..((.......)).,))})|))))))..(((....))}})))))))))))))))|((((.(.((((((......)))))).).))))}.)))))))))))))))).|,||||||,||||{|||..,||.,...(((((((((..((....{(,(((..((((((....(((......)))..))))))))).))....}})))))))))....{||{,|||.|||{..((((((((..((((((((.,,.....,,)))))).....))..)))))))).}))),))),)))}.)),)))).))}.)))),).))),..)))}..))))))}..)))),)))((((.(((((((.....)))))))..)))).)))))..))))))}...((({(((...(((((((((.{{{.....}}}{((((.(...(((((...(((.......}}.))).)))))}))))).,......))))))))).})))))),,..
Back