Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032186.5
Sequence Length
1897 nt
GC Content
0.3263
GCGUGCUCCCAACGUCGCCCCGGUUUGACGCACACGGCACCAAACUGUUUGAUUUAAUUUUGGAUGAGAUCGUUCUUGCAGCAAGAUGUUAAUAAGACAAAAUCUAGCCUUAGAUUGUAAGCAAAAGAAAUCAAGGUCAAGAUCUGGAAGCAAGAAGAAAAUGCUAACAUUACCUCAUGGUGCUGACGAGGUUUACAUUCUCCGAUGCAGGUUUUGUGGCCUAGUCUUUCGAGGACCCUUGUCUGUUCAGGAAGACUGGAUUAAGCACUUACAACGACAUAUUGUAAACGCUAAUCUUCCACGGACUGGAGCUGGCAUGGUGGAAGUCACGUCACUACUUAAAAAGCCUGCCUCCAUUACAGAAACUUCAUUUUCUCUACUAAUGGCCGAAGCAGCUUCAUAGAACCAGGAAACCUUUUAAAUAGCCAGUUUGAAUUGGAUGUAAAUUUGAAAUUCUUUUUUUUUAAGCCACAUUAAAUUAUCUGUUUAUAAAUACUAAAGCAGGAAAAUGGGGGGAAAGUGAAUUACAGUGACAUCAGAGCAAAUUGAAUACUUAAAACAGUAAGUAGUCUAUAUAUUUUAUAUAGGGUGGAAGAUGUGUUUUUAAGGUUUAUGAAGUUUUGUUGGUUAACUGUGUUCACUCAGUAAAAGAGCAGUACAUGUAAGCAGCCAUUAAUAAACUGUUGCACAUGGAUACUUAUAGACAGACUUAUUGGACAAUUAUGUUUUUUGCAGUGUUACCAGAAUCAAGGCUCUGUUUAUUCCCCACAAGACUUGCAUAGAAAAAUAAGAUAUUAUAUUUUGUUUGUAUGUAUUUAGUGUUUUGUAUAAUACCAAGAACCGCUGACUAAAUUUACUCAAAUUAGGGCAUUAAAUAUCAUGUACUUCAUAGUUUGAGACUGUUCACUCAAAUAGGGCAGAGUACUAUUCUAUCUAGAUGUGUAAGUGUUUUUUUUAAAAUCACAUGGAACGGUUUUUUUUAUACUAAAAAGUGGAGGGAGAUUUGUUUAAACAAGUAUUUCUAAAAGAAAUAUGUACAUAGUUCUGGAAAUUAUUUGUGGUAAGGAAAUAUUCUUUACUCCAGUUGCAUUUCUCAGACAAUAAAGUGGUGCAUCCAUGCUACCUCCUACUUUGUCAACAAAGAUGCUAUUUACCCUUUACAUUUUUGUAUCAUAAUAGAUUUUAAAAAUCUAAUGUUCUUUAUUGCAAGACAUUCUUUUGUUAACAGGUUUGUUUCUUUUUAAUGUUUUACCUAAAAUUUGACAUGCUUACAGGACAGGUUUGCCUCUUACUUUAUUUAACAUUGUAGAAAUGUAAUUAAUAAACAAUGCUCACUACACAGUUUAGAAUAGACGUUCUCAUUUAUAUUAUCUUCCAAAUUUGAUCAGUUAGCAAAACUUAAUACACCAAUUAAAAUAUUUCUACAUAUGAGAAUGUUUACAAUUUAAAUUUUAGAACUUGUUUUGGAUGUGAUUAUAUGUACGAAAAUCGUGUAACACUAUGCUCAUGCUAAGAACCGACAUAACAGAAUUACUGAAAUAAAUGUGCUGUGAGGAAUGGAAAAUAUGGUGCAGGUGUCUUGGUCAUGAUAAAUUGUGAUUCUUUUUAAAAAUUUUUUCCAAAAACAAUUAGGUAUUUUAAUCUGAAAUCAGAUUCCUUUACAAACAACAAGUUUUUGUAUGCAAGCACCAUUUUAUUUCAUGUAGUAUGGCUAAUACUAUAGUUGAACCAAGGAUAUGCAUUGAUUCUUUGCUUCGUAUGUAAAUAAAGUUAAAAACAGUUAAAAUAAGGAGUAUUUUGGUAGAGUAUAUACAUACCUCACUGCCAGUGAAAUUGCUUUCCUAUGGUAUAUCUCCUUACCAGAAAAAUCUCUAAAUAAAAAAAGGUUUAAAGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-418.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -458.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 485.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...(((..((..((((((((...((((((((.....(((((.(..((((((((.(((...((((((((((((((.........((((((((..(((((..((((((((((((((...........(((((((...((((((...((((((((((((.(((((.....((((((((...((((.......))))..(((((((((((((((.((((((((((..((((....)))).....))))))))))....(((((...((((((.((.((((((((((..(((((((((....(((((((((((.(((..((((.........)))).....))))))).((((((.(((((......)))))....)))))).......))))))).......(((...)))..........(((((((.....(((((....(((.(((((.(((((((....((.((((...((.(((((((..........)))))))))))))))))))))).))))).)))..)))))....)))))))..((((((......)))))).((((((((...)))))))))))))))))..)).......)))))))).)).)))))).......)))))..(((.......))).(((((((((..(((((............))))))))))..)))).((((((((((((.((((..(((..(((.....)))..))).)))).....))).)))))))))...)))))))))))))))....((((((((((...))))))))))........(((((((((((........)))))..)))))).........(((((((((..((((........))))......))))))))).((((((.........))))))))))))))........)))))...))))))))))))........((((((((......(((((.(((((..(((.((.(((..(((((((.((((((((((((...((((.(((....))).))))))))).)))))))(((((((((...)))))))))..(((((((((((((((((((...((.((((((....))).)))..))...))))).(((((((((..(........)..))))))))).......(((((((...)))))))(((((...((..(.((((......((((((...((((.((((...(((((..........)))))...)))).))))....))))))......)))).)..))...))))))).))))))))))))..)))))))..))).)).)))..))))).)))))))))).))).........))))))..)))))))((((.....))))...................((((.......)))).))))))))))))))...)))))..))))))))...(((.(((((((.........))))))))))..)))...))).))))).))))))..)))))))).).)))))...)))))))).((((((((....(((((((..((((...((((((((....))))))))..................(((((((......(((....((((((....))))))....))).........))))))).))))..))))))))))))))).((((((((.....))))))))))))))))..))..)))..((((((.(((((.......)))))...))))))...............)))))))((((((((((.((((((.....(((((...)))))...............)))))))))..)))))))....(((.(((((........))))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((...(((,,{{..{{{{{|||,..((((((((.....(((((.{..((((((((.{((...((((((((((((((,{.{({{,.((((((((..(((((..((((((((((((((...........((((((({{.((((((...((((((((((((.((((,,,{..,{{{{{{{...({({.......}}}},.(((((((((((((((.((((((((((,,((((....)))}.,}}.)))))))))),,,.(((..((((((.......))))))..))),}||{(((,,,,,.{{(((({(((.{(((((.,,.....}}}))},|....,,|}|{||,,||{{({.(((((......}))))....}}}}||,,{{.}}|||||{,{||,,,,,((,,,|}}|||,..,.,}||||||{,.{|.(((((...,(((,(({{{..,,{|||},,,{{,||||...{{.{((((((..........))))))).,}}))))))}}}||{|||||,|||{.|||,|{{{{|,,,}||{,{,(((({{(((.,...((.((((((((...)))))))).)).....,,}))))))}}))))))},,,)))}}},))}}},||||}}}}}}}},.,,....,,},{{{,(((((..(((((..,,....,,..))))))))))..}})}.((((((((((((.((((..(((..(((.....)))..))}.)))}.....))).)))))))))...))))))))))))))).,..((((((((((...))))))))))....,,{.(((((((((((........}}))),.}))))).,.......((((((((({{((((........)))).},,..})))))))).((((((.........))))))}}}}}}}},,,....,}},))}}.))))))))))))........{{((((((.,{,.,((((,,((,,{..(((.{(.(((..(((((((.((((((((((((...{(({.(({....))).}))))))))}}))))))(((((((({...}))))))))..{(((((((((((({({{((,,,((,((((((....})).)))..,,...))))}.(((((((((.,(........,,,))))))))).......(((((({...})))))),{({,...,,..{.|{(({{....,,||||...((((.((({...{{{{{..,,......}}))}...)))).)))}..,}))))))..}}},}}}},),,}}...,,,,})).)))))))))))}..)))))))..))).)}.))),,)})))})})))))))).))}.........)))))).}))))))),(({.....}}}}{{{{......}}}}.....,(((,......)))),))))))))))))))...)))))..)))))))).,,(({.{{{{{{{,{{{,...,)))))))))),.)))}..})).)))))},)))})..)))))))).}.)))))...)))))))).(((((((({...{((((((..((((...{(((((({....}})))))}..................{|||||{...,..(({....((((((....))))))....}}}..,......)}}}))),}}))..))))))))))))))).((((((((.....))))))))}}}||}}|,,||,.}|}..,{{{,|,||||{,},,..,}},,}...,|||,................))))))}((((((((((.((((((,{{..{((({...})))}...........,,}})))))))))..)))))))....(((.(((((........))))).)))...
Back