Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032192.4
Sequence Length
1815 nt
GC Content
0.6105
AGAGGCAGAGACACACGCGGAGAGGAGGAGAGGCUGAGGGAGGGAGGUGGAGAAGGACGGGAGAGGCAGAGAGAGGAGACACGCAGAGACACUCAGGAGGGGAGAGACACCGAGACGCAGAGACACUCAGGAGGGGAGAGACACCGAGACGCAGAGACACCCAGGCCGGGGAGCGCGAGGGAGCGAGGCACAGACCUGGCUCAGCGAGCGCGGGGGGCGAGCCCCGAGUCCCGAGAGCCUGGGGGCGCGCCCAGCCCGGGCGCCGACCCUCCUCCCGCUCCCGCGCCCUCCCCUCGGCGGGCACGGUAUUUUUAUCCGUGCGCGAACAGCCCUCCUCCUCCUCUCGCCGCACAGCCCGCCGCCUGCGCGGGGGAGCCCAGCACAGACCGCCGCCGGGACCCCGAGUCGCGCACCCCAGCCCCACCGCCCACCCCGCGCGCCAUGGACCCCAAGGACCGCAAGAAGAUCCAGUUCUCGGUGCCCGCGCCCCCUAGCCAGCUCGACCCCCGCCAGGUGGAGAUGAUCCGGCGCAGGAGACCAACGCCUGCCAUGCUGUUCCGGCUCUCAGAGCACUCCUCACCAGAGGAGGAAGCCUCCCCCCACCAGAGAGCCUCAGGAGAGGGGCACCAUCUCAAGUCGAAGAGACCCAACCCCUGUGCCUACACACCACCUUCGCUGAAAGCUGUGCAGCGCAUUGCUGAGUCUCACCUGCAGUCUAUCAGCAAUUUGAAUGAGAACCAGGCCUCAGAGGAGGAGGAUGAGCUGGGGGAGCUUCGGGAGCUGGGUUAUCCAAGAGAGGAAGAUGAGGAGGAAGAGGAGGAUGAUGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAGGACAGCCAGGCUGAAGUCCUGAAGGUCAUCAGGCAGUCUGCUGGGCAAAAGACAACCUGUGGCCAGGGUCUGGAAGGGCCCUGGGAGCGCCCACCCCCUCUGGAUGAGUCCGAGAGAGAUGGAGGCUCUGAGGACCAAGUGGAAGACCCAGCACUAAGUGAGCCUGGGGAGGAACCUCAGCGCCCUUCCCCCUCUGAGCCUGGCACAUAGGCACCCAGCCUGCAUCUCCCAGGAGGAAGUGGAGGGGACAUCGCUGUUCCCCAGAAACCCACUCUAUCCUCACCCUGUUUUGUGCUCUUCCCCUCGCCUGCUAGGGCUGCGGCUUCUGACUUCUAGAAGACUAAGGCUGGUCUGUGUUUGCUUGUUUGCCCACCUUUGGCUGAUACCCAGAGAACCUGGGCACUUGCUGCCUGAUGCCCACCCCUGCCAGUCAUUCCUCCAUUCACCCAGCGGGAGGUGGGAUGUGAGACAGCCCACAUUGGAAAAUCCAGAAAACCGGGAACAGGGAUUUGCCCUUCACAAUUCUACUCCCCAGAUCCUCUCCCCUGGACACAGGAGACCCACAGGGCAGGACCCUAAGAUCUGGGGAAAGGAGGUCCUGAGAACCUUGAGGUACCCUUAGAUCCUUUUCUACCCACUUUCCUAUGGAGGAUUCCAAGUCACCACUUCUCUCACCGGCUUCUACCAGGGUCCAGGACUAAGGCGUUUUUCUCCAUAGCCUCAACAUUUUGGGAAUCUUCCCUUAAUCACCCUUGCUCCUCCUGGGUGCCUGGAAGAUGGACUGGCAGAGACCUCUUUGUUGCGUUUUGUGCUUUGAUGCCAGGAAUGCCGCCUAGUUUAUGUCCCCGGUGGGGCACACAGCGGGGGGCGCCAGGUUUUCCUUGUCCCCCAGCUGCUCUGCCCCUUUCCCCUUCUUCCCUGACUCCAGGCCUGAACCCCUCCCGUGCUGUAAUAAAUCUUUGUAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-744.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -776.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 504.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((.((((((((.((((.((..(((((...((((..(((.((((((((..(((((.(((((((((((((((((.(((((.((..(((((((((........))....(((((((...)))..((((((((((.(((.((((.((((((((..((.(((..(((((((.((((((((.(((......))).))))..((.((.(((((((((.(((((.((.(......).)).))))).)))))..)))).))..)).....)))).)))))))..))).(((((((..((.((((((((....)).)))))).))......(((((((((((((((((.((.......)).)).((((((((((..(((.((..........)).)))..)))...))))))).(((((((((...((...(((((((((((.(((...))).))((((..((((.......))))))))...)))))........(((((((.((.((.((((((((........(((((((((.(.....).)))))...))))....(((((((((.((.((((((....))))))...))))..........)))))))..((((.(((((.....((((........)))).....))))).).))).....))))))..(((((.(((((((((((.....)))).........))))).)).)))))........((((........))))..)).)).)).))))))))))).))...))).))))))........)))))).))..)))))))..)))).)))((((((.....((((...((....((....))...))....)))).....))))))))..))))((((((..........((((((((((((.((.(((((((((((.(((((..(((..(.(((((((....))).)))).).)))..))))).))).((....))....((((((((...)))...)))))(((....)))...))))))))......)).)))))).))))))..)))))))))).)))).(((((((((((((.(((((((....))))))).......)))))...))))...))))....)))))).)))))))((((....)))))))).)))))))........((((((....)))))))).))))).)))))......((((((.......))))))....(((((((.........).))))))...(((((((((..((.((((..(((((((.((((((((((.(((...))).)))))..((((...)))).......(((...((((.....))))............((((((((((...((.((((....)))).)).....((((.....))))..))))))))))..(((((((((((((...(((((((((((((((.((((.....((((.........(((.(((..((((((....))))........))..))).)))))))..)))))))))).))...........)))))))..))))))))..)))))........)))...))))).)))))))..)))).))..)))))))))...)))))..((.(((((((..((......))..))))))).))........((((((....))))))..((((((((((((..(((....))))))))))).))))))))))).))))).)))))))))))..)))).)))))...))))))))))).)))......)))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((.((((((((.((((.((..(((((...((((..(((.((((((((..(((((.(((((((,({(({({{{.(((({.{{,,{{(((((((({{((,((,.,((((({{((,...}}}.,(((((((({{.{{,,{{{,.{,,{.,.,.{(({((({,((((((((,.(,((((.(((......))).))))..|,.||}|(((({,,,.,||||.,,}}}}..,.)}))}))}||{|||||..,,,)}))))},..|{{||||{|||||||{.},.||||||,,..((.((((((,{....,}.)))))).))..{{{{{{((((((((((({(((,(((((((.,.(((((((.((((((({((...((..,{...(,{({{(((.{.((({(.{((((......((......)}.......))))),|.|||...}}}.||,,||...,..,.,,,..,}))))),}}}})})}...,,.))..))),..}))))))))))))).}..|...(((((((((.(.....).)))))...)))).||,(((((((,(.{{.((((((....)))))),..|}}}|.........))))))){{(({{,(((((.....((((........)))).....))))){|{},,.,,}.,,.,||||.||||..}|}}}}}.}}}.((((((((..{{{....,.}).,..)))))))}.....,{{{........}))))})))))}))}.).)))))))))),,,))))))),))|{{.(((......))).},,))))))),.||||{{{.((((((.....((((...,,....((.,,,|}..,}},...)))).....)))))),|{{|,,,((((((..........((((((((((((.((.(((((((((((.(((((..(((..,.(((((((....))),)))).).)))..))))).))).{,..,,||....,||{,|||,..}}}.|,|||||(,,...})))}},))))))))......)).)))))).))))))..)))))))))).}}}}},.,{{{{{(((((.(((((((....))))))),......))))),..)))))..,}))))))))))))}}))))))((((....)))),.,|{((((((.....}))))).}|..,,)))}}})))})))}}.))))),|||,.((((((.......))))))....|||||{,,..},,,,}}.||||||,{.(((((((((..((.((((..(((((((.((((((((((.(((...})).))))).,((((...))))}......(((,..((((.....)))).......{{{..((((((((((.,,((.((((....)))),)).....((((.....))))..))))))))))..|||(((((((,(,,{{((({(({,,|||{{({{{{{..,,,|,,,.....,,..,||}}||.,,,{{({{.....,.........)),,}...,)})))),})))))),|||{,............)))),...,||..((({....))))..},,..}}}...))))).)))))))..)))).))..))))))))).|,|,,||..((.(((((((,.((......)),,))))))).))..,}....,{||{{.,,,)))))),.((((((((((((..(((....))))))))))).))))))))))).))))),)))))))))))..)))).)))))...))))))))))).)))......)))))))......
Back