Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032301.3
Sequence Length
1727 nt
GC Content
0.6358
GUGCUGCCUAGGAGACAAGACGCGAGGCCGGCAGCGCCCACCCGGUCGCAAUGGAGCUUCCCCUAGGGCGGUGCGAUGAUUCCCGCACCUGGGACGAUGACUCGGACCCAGAGUCAGAGACAGACCCAGACGCGCAGGCCAAGGCCUACGUGGCCCGCGUUCUCAGUCCGCCAAAAUCCGGGCUGGCGUUCUCGCGCCCCUCGCAGCUAUCCACACCCGCCGCGUCCCCGAGCGCUUCGGAGCCUCGGGCCGCGUCCAGGGUUUCGGCCGUAAGUGAGCCGGGCCUUCUGAGCCUUCCCCCGGAGCUGCUGCUCGAGAUCUGCUCCUACCUGGACGCCCGCCUCGUGCUCCACGUCCUGUCGCGGGUGUGCCACGCGCUCCGCGACCUCGUGUCUGACCAUGUCACCUGGAGGCUACGCGCGCUACGCCGCGUACGCGCGCCCUACCCAGUGGUGGAAGAGAAGAACUUUGACUGGCCGGCAGCCUGCAUUGCGCUGGAGCAGCACCUGUCCCGCUGGGCAGAGGAUGGGCGCUGGGUCGAAUACUUCUGCCUGGCCGAAGGCCACGUGGCUUCCGUUGACUCAGUGCUGCUGCUCCAGGGUGGGUCACUCUGUCUGUCGGGCUCCCGAGAUCGCAACGUCAACUUGUGGGACCUGCGGCAGCUGGGGACGGAGUCCAACCAGGUUCUGAUCAAGACCUUAGGCACUAAGCGAAAUAGUACCCAUGAGGGCUGGGUGUGGUCACUGGCAGCGCAGGACCACCGCGUGUGCUCCGGCUCCUGGGACAGCACAGUGAAGCUCUGGGACAUGGCAGCGGAUGGGCAGCAGUUCGGCGAGAUAAAGGCCAGCUCAGCCGUGCUGUGCCUCUCCUACCUGCCUGACAUCCUGGUGACUGGCACCUAUGACAAGAAGGUGACCAUCUACGACCCCAGAGCCGGCCCAGCCCUGUUGAAGCACCAGCAACUACACUCCAGACCCGUGCUGACCCUGCUGGCGGAUGACCGGCACAUCAUCUCAGGCAGCGAGGACCACACCCUGGUGGUGGUGGACCGCCGAGCCAACAGCGUCCUGCAGCGUCUGCAGCUGGACUCCUACCUGCUCUGCAUGUCCUACCAGGAACCCCAGCUCUGGGCUGGUGACAACCAGGGCCUGCUGCACGUCUUCGCCAACCGCAACGGCUGCUUCCAGCUUAUCCGGUCCUUUGAUGUGGGCCACAGCUUUCCCAUCACUGGGAUCCAGUACUCCGUGGGAGCCUUGUACACCACAUCCACUGACAAGACCAUCCGGGUGCACGUGCCCACAGACCCACCAAGGACCAUUUGCACCCGAAGGCAUGACAAUGGGCUCAAUAGGGUCUGUGCUGAGGGCAACCUGGUGGUGGCCGGCUCUGGAGACCUGUCGCUAGAGGUCUGGAGGCUGCAGGCCUGAGCAGGUGGGCGUGGAUGUGGAUACUGCCUGCCGGAGGCUGGGCUUCCUCCUCUGUUCUUGGGGGACCAUCCCCAAUGUUGGUGCUGCCUCCGCCCCGUGGGCCUAGGGCACAAGGAGUCCCAGCCACAUUCGGGUGAGCGUCCUGGCCUGGGCCCUAUGCCCGGGGGAAGGGUGAAAUUGGGGUUCAGGCCCACCCAGGGGGCCGCUUCCCACUCUUGGGCCCUGGUUUUGUUAUGAUUUGGAUGCCCCGCUCUCAGUUGAGAGCGAAGGAGAAAUAAACCUGACAUGUUGGUGCUUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-776.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -800.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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