Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032326.4
Sequence Length
1787 nt
GC Content
0.6323
GAACUUCCGGCUGUCAAGCUCCCGGCCGGGCUGACUCAAGCGGAGGCGCGCGGAACAGUCGCCGAGGCGAUUCCCGCCCAGGCUCCUGUAACCGCCAGGCAGCGGCCCCGCCAUGUCCCAGCCCCGGACCCCAGAGCAGGCACUGGAUACACCGGGGGACUGCCCCCCAGGCAGGAGAGACGAGGACGCUGGGGAGGGGAUCCAGUGCUCCCAACGCAUGCUCAGCUUCAGUGACGCCCUGCUGUCCAUCAUCGCCACCGUCAUGAUCCUGCCUGUGACCCACACGGAGAUCUCCCCAGAACAGCAGUUCGACAGAAGUGUACAGAGGCUUCUGGCAACACGGAUUGCCGUCUACCUGAUGACCUUUCUCAUCGUGACAGUGGCCUGGGCAGCACACACAAGGUUGUUCCAAGUUGUUGGGAAAACAGACGACACACUUGCCCUGCUCAACCUGGCCUGCAUGAUGACCAUCACCUUCCUGCCUUACACGUUUUCGUUAAUGGUGACCUUCCCUGAUGUGCCUCUGGGCAUCUUCUUGUUCUGUGUGUGUGUGAUCGCCAUUGGGGUCGUGCAGGCACUGAUUGUGGGGUACGCAUUCCACUUCCCGCACCUGCUGAGCCCGCAGAUCCAGCGCUCUGCCCACAGGGCUCUGUACCGACGACACGUCCUGGGCAUCGUCCUCCAAGGCCCGGCCCUGUGCUUUGCAGCGGCCAUCUUCUCUCUCUUCUUUGUCCCCUUGUCUUACCUGCUGAUGGUGACUGUCAUCCUCCUCCCCUAUGUCAGCAAGGUCACCGGCUGGUGCAGAGACAGGCUCCUGGGCCACAGGGAGCCCUCGGCUCACCCAGUGGAAGUCUUCUCGUUUGACCUCCACGAGCCACUCAGCAAGGAGCGCGUGGAAGCCUUCAGCGACGGAGUCUACGCCAUCGUGGCCACGCUUCUCAUCCUGGACAUCUGCGAAGACAACGUCCCGGACCCCAAGGAUGUGAAGGAGAGGUUCAGCGGCAGCCUCGUGGCCGCCCUGAGUGCGACCGGGCCGCGCUUCCUGGCGUACUUCGGCUCCUUCGCCACAGUGGGACUGCUGUGGUUCGCCCACCACUCACUCUUCCUGCAUGUGCGCAAGGCCACGCGGGCCAUGGGGCUGCUGAACACGCUCUCGCUGGCCUUCGUGGGUGGCCUCCCACUAGCCUACCAGCAGACCUCGGCCUUCGCCCGGCAGCCCCGCGAUGAGCUGGAGCGCGUGCGUGUCAGCUGCACCAUCAUCUUCCUGGCCAGCAUCUUCCAGCUGGCCAUGUGGACCACGGCGCUGCUGCACCAGGCGGAGACGCUGCAGCCCUCGGUGUGGUUUGGCGGCCGGGAGCAUGUGCUCAUGUUCGCCAAGCUGGCGCUGUACCCCUGUGCCAGCCUGCUGGCCUUCGCCUCCACCUGCCUGCUGAGCAGGUUCAGUGUGGGCAUCUUCCACCUCAUGCAGAUCGCCGUGCCCUGCGCCUUCCUGUUGCUGCGCCUGCUCGUGGGCCUGGCCCUGGCCACCCUGCGGGUCCUGCGGGGCCUCGCCCGGCCCGAACACCCCCCGCCAGCCCCCACGGGCCAGGACGACCCACAGUCCCAGCUCCUCCCUGCCCCCUGCUAGCAGCCACAGAGCCCACUCCCAGCCGUCCUCACCAGAGAUGGACCAGGGAGGACAGGAUGCUGGGCAGGGGAAGCCAAGUCACGGGCAGGCCGCAGUGGUUCUUGCGUGGCCUGGUUUUAUUUUCAUUGUGAAAUAUCAUGCUCUUAUUUCAGUCCUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-754.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -786.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 538.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((.((((..((((..((((((((((...((.((((.(((((((((.((((..(((..((((.....))))..)))..))))..))))......)).)))))))..))...))).))))).))...)))).)))))))))......(((((.....))))).((((((......(((((.(((((((((((....(((((((((..((((((((...(((((((((((((...)).)))..(((((((.(((.((((((((.((((((((((((.((.((.((((..(.((..(((.(((..((..((((((((.(((((((....(((((......)))))(((........))).....((((((((.((..(((((((((((..((......((((((((((....)))).......)))))).....))..)))))))....)))))))))))))).(((((.......((((((.(((....)))))).))).........))))).))))))).))).)))))))..)))))).)).).)))).))..)))))))..)))))))..)))))))))))..((.((((((....(((.(((((((((...(((((........)))))....((((((((.(...((((...))))..((((...)))).....(((((((.(((((.(((((((.(((((...........(......)............(((((((((((((((...)))))............)))))).))))....))))).))))))))))))...)))))))..).)))))))).(((((.....(((((.(((.........))).)))))))))).)))))).))).))).)))))))).....((((.(((((((((((((.(((((((.((((((.((((((((...((((.((........)).))))..)).)))))).))))......(((((.(((.(((....))).))))))))......))))))))).....)))))))....)))))).))))((((((((((.....(((((......))))).......)))))).)))).....((((.....))))..((((((((((.......(((.(((((.((..(((((......))))).))....))))))))....(((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((.((.((....(((.(.((((((((........)))))))).).)))....)).)).)))).)).....)))).)))))...)))))(((((((...((((((((((((((((....)))))))..((.((((((((.........)))))))).))))))))...))).))))..)))....((((((((.(((((((((.....))))).....((((......((((...))))....)))).)))).))))))))((((((((((((((((.....(((((((...((..(((((......)))))...))...)))).)))...))).))))))))....)))))...)))))))))))))))))(((((((((((.((..........(((((..(((((.((....)))))))....)))))....)).)))).)))))))(((((((.((((((.(..((((.....))))..).)))))).)))))))..........(((((((.........)))))))....))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,,.{((((,((((,,((({..((((((((((,,.{{.((((.(((((((((.((((..(((..((((.....))))..)))..))))..))))......))},))))))..}),..))))))))).)),,,|}}}.}}}}))))}.,,,,,(((((.,,,{}}}}|.((((((.,,,,,(((((.(({(((((((({{..,{(((({{{,.,{((({((,,,(({(((((((((,...{{{|||..,{{{{{{.{,|}|||||{{{.((((((((((((.{{.((.((((.,..((.,{({{(((..,({{((((((((.(((((((....(((({......)))))(((........))).....((((((((.((..((((,(({{(({{....{{(({{(((({{{{.,{,||}}...,,,.,,})))}..))))..,))))},.}}.)))))))))))))).(((((......,(((,{,.(((....))),,,.)))}........))))).))))))).))).)))))})}}))))}).)).).)))).))..}})))))..)))))))..))}}||||||}..{{.{{{{,{.|}}|||.{{((({(((,..(((({......|,)}}|}....|||||{||}|...((((...})))..{{{{...}}},.....{||||((,(((((.{{{{|||,{||||.........,.,......},....,,}},,,{||||||{{{{|{({,.,.|||,............))))))}|}||,.{,|}|||,|||||}|}}}||,,,||}}}}}.,,}))))))},.(((((.....(((((.(((.........))).)))))))))).}}|}}}.,}).)}|{|||||}}|,.,,.||||.||{{|||||||{,,((((((({{,((((.((((((((...((((.((.,....,.)).))))..)),}))))).)))){{(((((,{{{((((((((((((((((({{|.(((((((.(((((........))))))))))}}.))}.|{{{|({((((((((((..,..(((((......))))).......)))))).)))),),}))),,..,,,))))))))))))))||..,|{{|||||(((((,{.,,(((((..,.,.))}}}..|,...}}}))}},....(((....))),)))}))}}})))},},)))}}))))})}))))|||{||,|{,||.,..||{.{.((((((((........)))))))).),))},}}})).)),})))})),}},})),),)})))}}})))))|||||||}}}|||||||||(((((((....))))))){|{{.((((((((.........)))))))).}}}}))},...|||,||||,,{{{{{{.,,||||||.{|||||||||.....}}},....,||||,..|||{||{,,,)}}}....,.,..||||,||||||||((((((((((((((((.....{{(((((...,{..(((((......)))))...,,...))))),})...))).))))))))....}}}}}.}}))}}||}}}}}}}}))|(((((((((((.((..........(((((.,(((({{((....))))))).,..))))),...)).))))))))))))|{{||{{.{{||||,|,|||{{|,,,}))},,,},)))))).))))}}}.....,....{((((((.........))))))),,..,,...
Back