Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032354.5
Sequence Length
2281 nt
GC Content
0.4647
GUUCGUCUAGAUUUGUCGGCUUGCGGGGAGACUUCAGGAGUCGCUGUCUCUGAACUUCCAGCCUCAGAGACCGCCGCCCUUGUCCCCGAGGGCCAUGGGCCGGGUCUCAGGGCUUGUGCCCUCUCGCUUCCUGACGCUCCUGGCGCAUCUGGUGGUCGUCAUCACCUUAUUCUGGUCCCGGGACAGCAACAUACAGGCCUGCCUGCCUCUCACGUUCACCCCCGAGGAGUAUGACAAGCAGGACAUUCAUCCACUUCCUCUCUGCAGGCUGGUGGCCGCGCUCUCUGUCACCCUGGGCCUCUUUGCAGUGGAGCUGGCCGGUUUCCUCUCAGGAGUCUCCAUGUUCAACAGCACCCAGAGCCUCAUCUCCAUUGGGGCUCACUGUAGUGCAUCCGUGGCCCUGUCCUUCUUCAUAUUCGAGCGUUGGGAGUGCACUACGUAUUGGUACAUUUUUGUCUUCUGCAGUGCCCUUCCAGCUGUCACUGAAAUGGCUUUAUUCGUCACCGUCUUUGGGCUGAAAAAGAAACCCUUCUGAUUACCUUCAUGACGGGAACCUAAGGACGAAGCCUACAGGGGCAAGGGCCGCUUCGUAUUCCUGGAAGAAGGAAGGCAUAGGCUUCGGUUUUCCCCUCGGAAACUGCUUCUGCUGGAGGAUAUGUGUUGGAAUAAUUACGUCUUGAGUCUGGGAUUAUCCGCAUUGUAUUUAGUGCUUUGUAAUAAAAUAUGUUUUGUAGUAACAUUAAGACUUAUAUACAGUUUUAGGGGACAAUUGAGAUGGCUGAACUACUGAAUAAAAAAAAAACAACGCUGUUUUCUAGUCCUGCAGACCGUAAGAUACUUGGUAUCGCUUCUAUUUUGGUUACUACGGUAGGUGCCUGGCGGAAGGGAGUGGGCGGAGAUAUGUAAAUAGAAAGUGCGUACAGUUAGAACGUCCGGCACGUAACUGAUCGGAGCAUUCUGGGAAGAAGUAAUUUAUUCCUUUUCGGCAGCCGAAUGAAAAAAAAAUUUAAAAAAAUGUGCGAGCUAAUAUGGCAAAACAACUGGAAGGACGCUAAAUAAUAGGAUUGCUCAUACCAGCGCGUUAUGAACUCACCCUAGCUUGUAACGGAAUCUUUUUCACUGAGUGCAGAAUGUCGGCUGUUUGUCUGUAUCGUCAGGUGGGAUAAUCCUUACCUGUUCCUCCUCCGGAGGGCAGAUUAGAACAUGAUGAUUGGAGAUGCAUGAAACGUGAUUAACGUCUCUGCGUAAUCAGGACUUGCAACACCCUGAUUGCUCCUGUCUGAUUCUUUCUGACGAUCACUUACAUUUGUGUUAUGCUGAUUAGCAGAUAUCCACAAACAUAGCUAUGAAGUUCUGACUGGGAUAACCUUGCUGUUUGUCUAUUUUGCAGUCUUGCUAUUGCUGUUUGUCUAUUUUGCAGUCUUGCUAAAUUUGUUUGUUCUUGAAAAUUGUGAUUUGGUUUUUGUUGCUUUCUGGAAUUUAGGCAGUGAAAUAAUACAAAUGGGCUCUUUGUUUUUUGUCGUUUGAUAACUUUAAUCCUCACUUCUCAGGAAACAUUGCACAUCAGUAAAUAUCUGCAGUCUUGUGCACAUGGUGGUUGCCCUCAGGAUGGUAUUCAAUAGGAACUGUAUUUCUUUUUCCUUGAGGUAGGGUCUUGGUCUGUCGCCAAGGCAGGAGUGCACGGCGCAGAUGUAUAUACAUGGAUACAUUUGUUUUUGGAGAGUUGGUUGUUAAAAAUCUACCAGUACACCCCCAAGAAACUCAUCAUCACCAAUGACUUCUUCCCAAAUCCAGAGUCACUUUUCAGACUUGAGAUUGACCUCUCUUCAGCAUAUGGUAUGUUGACCACCCCCCUCUUUUGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUAGAGUGCAGUGUGCAGUGGUGGGAUCAUGGCUCACUGCAGCCUCAAACUCCCAGGCUCAGAUGAUCCUCCUGCAUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGUGAGCACCACCACACCUGGUUGUUUUAAAAUUUUUCUAUAGAGACAGGGUCUCACUGUGUUGCCCAAGCUGGUCCCAAACUCCUGGGCUCAAGCCGUCCUCCCCACUAGGCCUCUAGGCCUCCUAAAGUGCUAGGAUACAGGCAUGAGCCACCGCGUUUCUCCCACUCCCCUCUUUUGCACUUUUUUCUCCCUUAGUUUUGAAACAGUGGUUCACCUGGUUUGCCUACUAUUAUACUGUUCUGGUUGUUCCUUCUUACAUUAAUUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-693.09 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -735.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 602.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((.(((((((((..((((.((.(((.(((..((((((.(.((((((((((((..((((.....((((((.(.((((.((.(((...))).)).)))).)))))))(((((....))))).........((.((((...))))))..(((((((.((..((((((.....(((((((((.............(((((((..(((((.((.(.(((..((...((((((((((......(((......))).......(.(((((((((((((((.(......).))))))...))))....))))).)(((((((..((.(((((...))))).))))).))))....((((.((((((((((.......))))))))..))..))))....((((((((((((............((..((((((((.(((((..(((..((.(((....)))))..)))))))).))))))))..)).(((....(((((..........((((((((((((.....))...(((.(((((......))).)).)))..)))))))))))))))..))))))).)))))))).))))))))))))..))))))))))))))))))((((((((.....))))))))...((((((((((....((((.(((.......(((((.((((((((((......((((((....)))))).............(((((.......)))))(((((((.......))))))).(((((....((((((((...........................))))))))...)))))((..((((((.(((((...)))))(((........)))...))))))..))((((((.(.((.((((((((((((((.............(((((...(.(((((.((((.....))))..))))).)..))))).(((((((((((...............(((((((((.(((((((...((((.........(((((((((...(((((.(((..((((...((.((..............))))...))))...))).))...)))...)))))))))...)))).)))))))(((....)))....))))))))).((((((.....((((((((......))))))))..(((((...))))))))))).......(((((((..(((..(((.((.((((.....)))).)))))(((((((((...........)))))))))((((((.(((.((.(((((((((((((...((((((((((((((.((((.(((((.....(((((((..((......(((((....)))))......)))))))))....)))))))))..))(((((((.....((((....((((....((((((((.((((........))))...)))))))).....))))....)))).....)))))))..))))))))))))(((.....)))..(((((....)))))......((((........))))..(((((((((...(((......))).....)))))).))))))))))...)))))).))...)))))))))..(((((((((....(((......)))((((((((.....)))))))))))))))))....((((((((((........))))))))))((((((.(.((((((.(........).))))....)).)))))))..))))))))))......)))))))))))((((..(((((........)))))..))))....)))))((((((((...)))))))).......((......))..........................))).)))))).)).)))))))..((((((((((.((.(((((...))))).)).)))))))..)))....)))))))))))))))....))).))))...)))))..)))))))))))))).)))))))))))))))...))))..))))..............)))))))).).))).))).))).)))..)).)))).))))......((((((.((((((((...(((((((((....))))).....))))..)))))...))).))))))((((((((((........................................))))).))))).....((((......)))).........))))).))..)..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{.(((((...,,,((((((.((((({((..((((((.(.((((((((((((..((((..,..((((((,{.((((,((.{{{,,.))),}}.}))).})))))){((({..,.))))}...,,....||.{|{{...)))))}..{((((((.({..((((((.....(((((((((.............(((((((..(((((.({.{.(((..,,,{.((((((((((..,{.,(((.......||,.,|{{,,.(((((((((((((((.(......}.))))))...)))),...,)))).)|||{|||..|{.,{{{|...})))}.,}))},}}}}....((((.({((((((((.......)))))))).,))..))))....(((((((((((((,..,,......((..((((((((.(((((..(((..((.(((....)))))..)))))))).))))))))..))..||,,..((((({.,{{{{..{((((,{{(((.(,,...||,,.,,,,|||,,,,,,,,}}}.))}))}.,),,,,))),))))))...)))))),}))))))).))))))))))))..)))))})))))})))))}(((((((({....))))))))...(((({(((((....((((.(((.......((((,{((((((((((......((((((....))))))...,,.,,.,...,{{{{.,,,...}}}}|(((((((.......))))))),(((,(({{.(((,,(((((..{{...{{{.{(((({((((,,,,{{|||,,,,,.|||,,{{|,(((({{.(({((..,}}}}}{{,.,......))},.,))))))..}}|||,|||{|{{{(({({(((.((,,,,,{,,....,,,..{{||,,.{,(({{{.{{((,.,,,})}),,))),},),,)),))}{((((((((((..,............{((((((((.,{{{,,,...,{{,.......,{(((((((((...{((((.(((..((((...((.((..............))))...))))...))).))..,}}}...))))))))),}||||..,,}))),(((....)))....))))))))}.((((((.....((((((((,...,}))))))))..(((((...)))))))))))..,....{((((((.,(((..(((.((.((((.....)))).)))))(((((((((...........)))))))))((((((.{((,{(.(((((((((((((,..((((((((((((((.((((.(((((,{,..(((((({.{((......(((((....)))))......)))))))))..,,)))))))))..)){{(((((,,,.,((((....((((....((((((((.((((........))))...))))))))....,))))....))))....,)))))))..)))))))))))),{{.....|||..((({{....||}},......{{{{.,.....,)))),,||,((((((.,.({{......))}.....)))))).,,))))))))...)))))).)).,,)}})))))).,(((((((({....(({......)))((((((((.....))))))))))))))))}.,..{(((((((((........)))))))))}((((((.(.((((((.(........).))))....}},,))))))..)))))))))}..,}}.))))))))))}{{{{..(((((........))))),,))}),,..})},.((((((((...))))))))}}.},},||,,,..,))},.,}}}}}}}}},,,},..,}}.)}))),,,))),}))}))){(((,.,..{((((((.((.(((((...))))).)).)))))))}})).....)))))))))))))))},..))).))))...)))))..}))))))))))))).))))))))))))))}...})))..)))}.............,)))))))).).))).))),}}}.}}}}}}}}||.,,|{..,...}}||{{{{.{{{{{{{{,,.{((((((((....))))).....))))..})))}.,,||}.||||||((,{,(((((....{{{...........................,}}...))))).)))))}}},,||||..,,,.},,,.....,.,,}}})).,|..,......,,..........
Back