Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032369.4
Sequence Length
1685 nt
GC Content
0.5056
AGUCGCAGCGGUGACCGCGGGCGGGUGGGGCGCCGGGUGAAGAAACCAAGACGCAGAGAGGCCAAGCCCCUUGCCUUGGGUCACACAGCCAAAGGAGGCAGAGCCAGAACUCACAACCAGAUCCAGAGGCAACAGGGACAUGGCCACCUGGGACGAAAAGGCAGUCACCCGCAGGGCCAAGGUGGCUCCCGCUGAGAGGAUGAGCAAGUUCUUAAGGCACUUCACGGUCGUGGGAGACGACUACCAUGCCUGGAACAUCAACUACAAGAAAUGGGAGAAUGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCAGCCACCACCCACACCAGUCUCAGGCGAGGAAGGCAGAGCUGCAGCCCCUGACGUUGCCCCUGCCCCUGGCCCCGCACCCAGGGCCCCCCUUGACUUCAGGGGCAUGUUGAGGAAACUGUUCAGCUCCCACAGGUUUCAGGUCAUCAUCAUCUGCUUGGUGGUUCUGGAUGCCCUCCUGGUGCUUGCUGAGCUCAUCCUGGACCUGAAGAUCAUCCAGCCCGACAAGAAUAACUAUGCUGCCAUGGUAUUCCACUACAUGAGCAUCACCAUCUUGGUCUUUUUUAUGAUGGAGAUCAUCUUUAAAUUAUUUGUCUUCCGCCUGGAGUUCUUUCACCACAAGUUUGAGAUCCUGGAUGCCGUCGUGGUGGUGGUCUCAUUCAUCCUCGACAUUGUCCUCCUGUUCCAGGAGCACCAGUUUGAGGCUCUGGGCCUGCUGAUUCUGCUCCGGCUGUGGCGGGUGGCCCGGAUCAUCAAUGGGAUUAUCAUCUCAGUUAAGACACGUUCAGAACGGCAACUCUUAAGGUUAAAACAGAUGAAUGUACAAUUGGCCGCCAAGAUUCAACACCUUGAGUUCAGCUGCUCUGAGAAGGAACAAGAAAUUGAAAGACUUAACAAACUAUUGCGACAGCAUGGACUUCUUGGUGAAGUGAACUAGACCCGGACCAGCUCCCCUCAAAAAGAAGACACUGUCUCAUGGGCCUGUGCUGUCACGAGAGGAACAGCUGCCCCUCCUGGGCCGCUUGGUGAGAGGUUUGGUUUGAUACCUCUGCCUCCCUCCUGCCAGCAUGGAUUCUGGGUGGACACAGCCUUGUGGAAGGUCCAGUACCACCAAGAGCUGCCCAUCCACUCCCACCCCACACUGUAUCAAAUGUAUCACAUUUUCUCAUGUUGAACACUUUAGCCUUAAUUGAAAAUGAGCAACAAAGCUGGACAAUUGCUAGUUGUAUAUAAAAUUUAAUCUCACCGAAUGUACAGUUUUCAAAUUUCACGUGUAUAUUAAGGAACUGAUGCAUCUGAGCAUUCUGAAAGAAAGAAAAAGAAGCUACUUUAGCUGCCACCCCAUUCUAGAAAAGUCUCUUAUUUUCAAGCUGUUCUAAAUAGCUUCGUCUCAGUUUCCCCAAAAGGGGUACCCAGGCCCCUCCUCUGUGUGCCCCAGCUGCAUCAGCCAGCUUCUAGGUGGCUCCAUUGUUUUCUGCCACCUGACAACAUUUUUCCUCAAUUACUGUACAACUACUGUAUAAAAUAAAACAACUACUGUAUAAAAUAAACUCUCUCUUUUCCCUGGACCCUCCUACUGUAUUCUUUCCUCUGUGGCACCCAUACCAGCCUGCCAGUCGGAGAGCAAGCUAGCUACAGUGCCUGGUGCAGAAAUGGCAAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-541.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -571.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 556.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....))))).....((((.((((((....(((......)))...((((((((.(((((.(.(((((((((((((((.....(((......))).(((......))).......)))))).)))))..)))).).))))).((((((.......((.(((((((.((...))...))))))).))(((((((.((.......(((((..(((((......((((((.....))))))....))))))))))..........((((.((((..........((.((.((((((((.(((((..((................((((((..((((((((((......((((((((.(((........((((((........))))))........))).))))))))..(((.((((....(((((((...((((((....(((.((((((((((.....))))))....)))).)))))).)))...)))))))...)))).)))..((.((((.((((.........(((((.(((((....)))))))))).....((((((.(..((((...))))..).)))))).)))))))).)).........))))))))))))))))(((((((((((((..((...(((.(((...((((.((((((((((((((((((((...((((((.((((..((((((...))))))...)))))))))).((((((((..(((...(.((....)).)...)))..)))))))).....)))))))))))))))...((((((.....((((((.((((....((((((((.......(.(((((.(.....(((...)))).))))).)))))))))....)))).))))))......(((....))).....))))))........))))).)))))))))))))))))))).)))))......))....))))))))).......((((...)))).((((((((((((((.((.(((.(((..(((.((((.....)))).))).(((.((((((.(......).))))))))))))))).)).)))))))).((((.(((((((...(((((....)))))...)).))))).))))..))))))...))))..))))....(((.(((.(((((((((((((((....((((((...)))))).......))))))).(((((..(((.........))).)))))..................((.((((((((................))))))))..))...)))))))).))))))((((.......)))).....(((((...))))).....)))))))).(((((........))))).(((((((...))))))))).)))))))..((((....))))..))))))......)))))))))))))).))))....((((.....((((((((.............)))))))).....................((((((.....)))))).......(((.....))).......................(((.(((....(((((((((((((((....(((((..(......)..)))))...)))))).))......)))))))...))).)))...))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{((.{,{|,}}),||{{((((.((((((.{..(((......)))..,((((((((.(((((.(.(((((((((((((((.....(((......))).(((......))).......))))))}))))),.}))).).)))))..(((((((({...((,(((((((,((,.,||,..}}}}}|||||(((,{{{,{,|.},,..(((((..(((((......((((((.....))))))....)))))))))).,,........|,.,{||{||,,,(,,.{(((((({((((,((((((,,{(((({{((((,({(((({{((((((..((((((((({,..{{,(({(((((.({{|,..,,{,{{{(((........))))))},.....,}}}.})))))))..(((.((((....(((((((...((((((..,,(((.(((((((({{.....))))))...,))}).)}})))}}})...)))))))...)))).))).{(({(({{.(({{|,..,,,,,(({{.,{{(((.,..||||}}}}}}.....||||||}|,,,{{{{{,|}||,....}},.)})))}))),.}}.........})))))))))))))))|{{{{|{{{{{{,..,|,,,|||,{{|,,,{{{{.{{{|{||||||||{||{,||}.}||||{{.,||{|,|||||{,,,}}||||,|.||||}}}|||,({{{||||,,|||....,||,,,,)),,,,,))),,)|}}||||,,,,,|,||||||,,,,)))}},{{{,,{,,.{.((((((.((((....((((((((.......{.{{{((,{....,(((...)))).}}}}}.,))))))))....)))).)))))}......,,,....|}}..,|,}},,,,...||,,,||}}}.))))))}||||}}}}})))}.}}}||,{.,,,{{,,{{{{|,,,,{|.....|,{|{{,,,||}}..,|||,{{|{((((.{{.{{{.|{{..||{.((((.....)))).))),|||,{|{|||.|,,....,.})))))})))))))),)},)}})))||....(((((((...(((((((((((.........,.)))}}))).)))).))))))),})),,..,,,...|||.{{{.{(((,,{||||||{{..,,(((({,...}))})).......)))}})),{||{{..||||||.,....}))})))}},,.............,,.{{.{(((((((||...........,}.))))))))..))...)))))}))}))})),{(((.......}}},...,.{((({...))))),},..,,,.,,}}.{{{{{.,..,,,.))))),(((((({...})))))))))))))))..........{(((((.,.,,,)}}}}}.)))))))))))))).))))..,.({({..,..{(((((((.............)))))))).....................((((((.....)))))).......,{,.....})).......................{((.(((...,{((((((,,{({,{({{{{(((((..{......)..)))))..}))))|}.,,,...}.)))))))...))).)))...))))....
Back