Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032409.3
Sequence Length
2657 nt
GC Content
0.5852
AGAGGCACCGCCCCAAGUUUGUUGUGACCGGCGGGGGACGCCGGUGGUGGCGGCAGCGGCGGCUGCGGGGGCACCGGGCCGCGGCGCCACCAUGGCGGUGCGACAGGCGCUGGGCCGCGGCCUGCAGCUGGGUCGAGCGCUGCUGCUGCGCUUCACGGGCAAGCCCGGCCGGGCCUACGGCUUGGGGCGGCCGGGCCCGGCGGCGGGCUGUGUCCGCGGGGAGCGUCCAGGCUGGGCCGCAGGACCGGGCGCGGAGCCUCGCAGGGUCGGGCUCGGGCUCCCUAACCGUCUCCGCUUCUUCCGCCAGUCGGUGGCCGGGCUGGCGGCGCGGUUGCAGCGGCAGUUCGUGGUGCGGGCCUGGGGCUGCGCGGGCCCUUGCGGCCGGGCAGUCUUUCUGGCCUUCGGGCUAGGGCUGGGCCUCAUCGAGGAAAAACAGGCGGAGAGCCGGCGGGCGGUCUCGGCCUGUCAGGAGAUCCAGGCAAUUUUUACCCAGAAAAGCAAGCCGGGGCCUGACCCGUUGGACACGAGACGCUUGCAGGGCUUUCGGCUGGAGGAGUAUCUGAUAGGGCAGUCCAUUGGUAAGGGCUGCAGUGCUGCUGUGUAUGAAGCCACCAUGCCUACAUUGCCCCAGAACCUGGAGGUGACAAAGAGCACCGGGUUGCUUCCAGGGAGAGGCCCAGGUACCAGUGCACCAGGAGAAGGGCAGGAGCGAGCUCCGGGGGCCCCUGCCUUCCCCUUGGCCAUCAAGAUGAUGUGGAACAUCUCGGCAGGUUCCUCCAGCGAAGCCAUCUUGAACACAAUGAGCCAGGAGCUGGUCCCAGCGAGCCGAGUGGCCUUGGCUGGGGAGUAUGGAGCAGUCACUUACAGAAAAUCCAAGAGAGGUCCCAAGCAACUAGCCCCUCACCCCAACAUCAUCCGGGUUCUCCGCGCCUUCACCUCUUCCGUGCCGCUGCUGCCAGGGGCCCUGGUCGACUACCCUGAUGUGCUGCCCUCACGCCUCCACCCUGAAGGCCUGGGCCAUGGCCGGACGCUGUUCCUCGUUAUGAAGAACUAUCCCUGUACCCUGCGCCAGUACCUUUGUGUGAACACACCCAGCCCCCGCCUCGCCGCCAUGAUGCUGCUGCAGCUGCUGGAAGGCGUGGACCAUCUGGUUCAACAGGGCAUCGCGCACAGAGACCUGAAAUCCGACAACAUCCUUGUGGAGCUGGACCCAGACGGCUGCCCCUGGCUGGUGAUCGCAGAUUUUGGCUGCUGCCUGGCUGAUGAGAGCAUCGGCCUGCAGUUGCCCUUCAGCAGCUGGUACGUGGAUCGGGGCGGAAACGGCUGUCUGAUGGCCCCAGAGGUGUCCACGGCCCGUCCUGGCCCCAGGGCAGUGAUUGACUACAGCAAGGCUGAUGCCUGGGCAGUGGGAGCCAUCGCCUAUGAAAUCUUCGGGCUUGUCAAUCCCUUCUACGGCCAGGGCAAGGCCCACCUUGAAAGCCGCAGCUACCAAGAGGCUCAGCUACCUGCACUGCCCGAGUCAGUGCCUCCAGACGUGAGACAGUUGGUGAGGGCACUGCUCCAGCGAGAGGCCAGCAAGAGACCAUCUGCCCGAGUAGCCGCAAAUGUGCUUCAUCUAAGCCUCUGGGGUGAACAUAUUCUAGCCCUGAAGAAUCUGAAGUUAGACAAGAUGGUUGGCUGGCUCCUCCAACAAUCGGCCGCCACUUUGUUGGCCAACAGGCUCACAGAGAAGUGUUGUGUGGAAACAAAAAUGAAGAUGCUCUUUCUGGCUAACCUGGAGUGUGAAACGCUCUGCCAGGCAGCCCUCCUCCUCUGCUCAUGGAGGGCAGCCCUGUGAUGUCCCUGCAUGGAGCUGGUGAAUUACUAAAAGAACAUGGCAUCCUCUGUGUCGUGAUGGUCUGUGAAUGGUGAGGGUGGGAGUCAGGAGACAAGACAGCGCAGAGAGGGCUGGUUAGCCGGAAAAGGCCUCGGGCUUGGCAAAUGGAAGAACUUGAGUGAGAGUUCAGUCUGCAGUCCUCUGCUCACAGACAUCUGAAAAGUGAAUGGCCAAGCUGGUCUAGUAGAUGAGGCUGGACUGAGGAGGGGUAGGCCUGCAUCCACAGAGAGGAUCCAGGCCAAGGCACUGGCUGUCAGUGGCAGAGUUUGGCUGUGACCUUUGCCCCUAACACGAGGAACUCGUUUGAAGGGGGCAGCGUAGCAUGUCUGAUUUGCCACCUGGAUGAAGGCAGACAUCAACAUGGGUCAGCACGUUCAGUUACGGGAGUGGGAAAUUACAUGAGGCCUGGGCCUCUGCGUUCCCAAGCUGUGCGUUCUGGACCAGCUACUGAAUUAUUAAUCUCACUUAGCGAAAGUGACGGAUGAGCAGUAAGUAAGUAAGUGUGGGGAUUUAAACUUGAGGGUUUCCCUCCUGACUAGCCUCUCUUACAGGAAUUGUGAAAUAUUAAAUGCAAAUUUACAACUGCAGAUGACGUAUGUGCCUUGAACUGAAUAUUUGGCUUUAAGAAUGAUUCUUAUACUCUGAAGGUGAGAAUAUUUUGUGGGCAGGUAUCAACAUUGGGGAAGAGAUUUCAUGUCUAACUAACUAACUUUAUACAUGAUUUUUAGGAAGCUAUUGCCUAAAUCAGCGUCAACAUGCAGUAAAGGUUGUCUUCAACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1116.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1165.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 662.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((((((.((.....(((((.(((...(((.((((.(((((((((((((.((.(((.(((..(((((((((((((((...))))(((((.....)))))..)))))))))))..)))...))))))))))))))))).).)))).)))...))).)))))....))))))))))))))(((((((((((.(((((((.(((.(.(((...(((((((...)))).)))....))).).))).)))).)))...)))))))))))((((((..(((.((.(((.(((..(((((((((........))))))))).(((((((((((((((..((((((((((((((.((((((((.(.((((.....)))).)))))))))...))))...((((..((((((((((((...)))).....((((((..(.(((((((((((((((((((.((((.((....)).)))).(((((.....)))))....))))))))).).)))))))).).)....))))))((((.((((.((.((((((.((.......((((((((.((((((...(((..((((((.....(.(((((.......))))))..)))))))))....((((((((((((...(.....)..)))))))))))).((.(((((.((((.((((((((.(((.(((((((.(((((.(((((((((((..((((((.....((((.....))))..(((((...)))))..))))))..)))))......(((((..((....))))).))..)))))).)(((((((.((((....)))..).)))))))....((((....((.......))...)))).(((.(((............))).)))((((...........)))).)))))).))))).))).....))).))))).))))..)))))))(((.....))))))))).)))))))).)).)))))).)).)))).))))(((((.((.(((.....((((.((.....)).)))).....)))..)).)).)))........((((....))))))))))))..)))))).))))))))))))))))))))))).........((((((....))))))(((((.((((((((((((((........(((((((((((.(((..((.((((((((((((.(((((((...))).(((((..(((.((((((((((((....((((((((....))))))))..(((((((......)))))))...((.....))(((((((...((..(.(((.((((....((((((.....((((.(((((((((...(((.((.(((((((...(((..((..(((..((((((.((((...)))).))))).)..))).))..))).))))))).)))))..)))))))))..))))))))))....))))))))..))....(((((.(((.(((....(((..(((.((((((((((((.(........)))))...)))))))))))..)))..)))..)))..))).)).))))))).)))))))).)))).))).)))))..))))))))))..........))))))))..)))..((((....)))).....((((.((((((............))))))))))((((((.((((....)))).))))))..))))))).))))............((((((..(((((((......(((((((...)))))))))).(((.(((((((............))))))).)))..(((((.((((.((.....)).)).)))))))....))))...))))))))))))).))))))).))))))))))).)).)))))))))(((..((..(((((((...((((((.((((((((((......))(((((.(((((..........((((((......)))))).(((.((((((((((((.(((.((((.((....((((..((.((...((((((((((.......)))))))).))...)).))((((((.((((.......)))).))))))....)))))).)))).)))))))))...)))))))))..((((((((...(((((...))))).....)))))))).....(((((.(((((((((..(.....)..))))))..))))))))((((((.((((.(((((.......((((((....((.(((((....)))))))..))))))))))).)))).)).)))).(((((((..(((((....((((((.....))))))..))))).)))).)))...))))).)))))..........(((((...)))))))))))))))))))(((((.....))))).....(((((....)))))..(((((((.((((((.....((((((..(((.((((((.((...((((((.(((((((.((....)))))))))))))))..)).)))))))))...))))))........((((((.(((..........))).))))))..((((((((....)).))))))...)))))).).))))))....)))))))))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......((((((((((({{((.{.,.(((((.(((...(((.((((.(((((((((((({{((.(({.(((..(((((((((((((({...})))(((((.....)))))..)))))))))))..)))...))))))))))))))))).).)))).)))...))).))))).,,.))))))))))))))(((((((((((.(((((((.((({(.(((...(((((({...})))}}))....))),).))).)))).)))...)))))))))))((((((..(((.((.((({((({.(((((((((,(...,).))))))))).(((((((((((((((..((((((((((((({.((((((((.({((((.....))))},))))))},.,,|||}...((({,,((((((((((((...||||.....((((((,,(,((({(((((((((((((((,{(((,((...,||.|||,.{((((.....})))}....))))))))),),)}}}}})).}.},,,.))))))|,{{|((((|((.((((((.({...,{..{(((((((.(((((({,.(((..((((((..{,.{.({{{{....,,,))}))}..)))))))))....((((((((((((...{.....,..)))))))))))).((.(((((.((((.((((((((.{(((({(((((.(((({,((({(((((((,.{{{|||.....{{(({,,,{||||,{({(((.,,}}}}}..}}})}),,||,||,{{.,,{{|||||||.......}}.|||||},}))|)|{{||{{.{{{{|||.))},)).))))))}....{(((....((.......))...)))}.{{(.(({.....,......))),))),|||,........,,)))),))))}},))))}.}))}}},.)))},)))).))))..))))))){{,....,)))},)))).))))))))})).)))))).)).))))|))}}{{{,,.||}|{{,,,..{{{|.|{|...})).))})...}}}}}..,}}}).))),,......{(((....))))))))))))..)))})),})))))))))))))))))))))).}}}}},,,{(((((....)))))}(((((.((((((((((((((........(((((((((((.(((..({,(((({{{{{{{{,|||{(((,,.|||,(((((..(((.((((((((((((,{..((((((((....)))))))).|(((((((,,..,,}||||||.,,((,,,..}|(((((({...((,{{{{{{.{((({...{(((((.....((((.(((((((((..,(((.((.(((((((...(((.,(({.{{{,}||((((.((((...)))).))))}.|..,,}.)),.))).))))))),}),)}..)))))))))..)))))))))),..{||},,,}}|..}.,,.})||,.|||.,|,,}.||||,.{{{.|{{{{{(({{,,{{,,....,,)))}},}})))))))))}}..}}}.,,))},}||.,|},,}}.)))))}}.)))))))).)))).))).)))))..))))}}})))},........||||||}}..}}}..||{,..,,}}}}..,,,|((,{((((((.,..........}))))))))}((((((.((((....)))).))))))..))))))).))))............((((((.,(((((((......(((((((...))))))))))}(((.(((((((............))))))).)))..(((((.{(((.((.....)).)).)})))))....}))}...))))))))))))).))))))).)))))}}}})).)).)))))))))(((..((..(((((((..,(((((((((((((((((......))(((((.(((({{(........((((((......)))))).(((.((((((((((((.(((.((((.({....{({{..{,{((...((((((((((.......)))))))).}}...|)}}.((((((.((((.......)))).))))))....)})))).)))).)))))))))...)))))))))..{(((((((..,(((((...))))).,,..)))))))).,..,{((((,(({{{{{((..{.,...}..)))))},}))}}}}}}((((((.((((.(((((..,,,,,(({({{....{{.(((((....))))))}.,)))))}))))).)))).)))}})).(((((((..(((((....((((((.....))))))..))))).))))},))..,}}))).)))))..........(((((...)))))))))))))))))))}{{({....,}})}|.....{{{{{....}))))..((((((,.((((((.,.,.((({,,..(({{((((((.((.,.(((({,{(((((({.{{....})))))))))))))),.)).)))))))}}...}})))}...,,,..((((((.{{{..........})}.))))))..|{((((,{....}}.)))))}.,.)))))).,.))))))....)))))))))..))).
Back