Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032525.3
Sequence Length
1879 nt
GC Content
0.5710
AGUUGCCGCUGUCGUCCGCAGAGCCAGUUCCUAGCGCAGAGCCGCGCCCGCCAUGAGGGAGAUCGUGCACAUCCAGGCGGGCCAGUGCGGGAACCAGAUCGGCACCAAGUUUUGGGAAGUGAUCAGCGAUGAGCACGGCAUCGACCCGGCCGGAGGCUACGUGGGAGACUCGGCGCUGCAGCUGGAGAGAAUCAACGUCUACUACAAUGAGUCAUCGUCUCAGAAAUAUGUGCCCAGGGCCGCCCUGGUGGACUUAGAGCCAGGCACCAUGGACAGCGUGCGGUCUGGGCCUUUUGGGCAGCUUUUCCGGCCUGACAACUUCAUCUUUGGCCAGACGGGUGCAGGGAACAACUGGGCGAAAGGGCACUACACGGAGGGCGCGGAGCUGGUGGACGCAGUGCUGGACGUGGUGCGGAAGGAGUGCGAGCACUGCGACUGCCUGCAGGGCUUCCAGCUCACGCACUCGCUGGGCGGCGGCACGGGCUCAGGCAUGGGCACGCUGCUCAUCAGCAAGAUCCGUGAGGAGUUCCCGGACCGCAUCAUGAACACCUUCAGCGUCAUGCCCUCGCCCAAGGUGUCGGACACGGUGGUGGAGCCCUACAAUGCCACACUGUCGGUGCACCAGCUGGUGGAGAAUACAGACGAGACCUACUGCAUCGACAACGAGGCGCUCUAUGACAUCUGCUUCCGCACUCUGAAGCUGACAACGCCCACCUACGGGGACCUCAACCACCUGGUGUCCGCCACCAUGAGUGGGGUCACCACCUCGCUGCGCUUCCCGGGCCAGCUCAAUGCUGACCUGCGCAAGCUGGCGGUGAACAUGGUGCCCUUCCCGCGCCUGCACUUCUUCAUGCCUGGCUUCGCGCCGCUCACCAGCCGCGGCAGCCAGCAGUACCGGGCCCUGACCGUGCCCGAGCUCACCCAGCAGAUGUUCGACGCCAGGAACAUGAUGGCCGCCUGCGAUCCGCGCCAUGGCCGCUACCUGACCGUGGCCACCGUGUUCCGCGGGCCCAUGUCCAUGAAGGAGGUGGACGAGCAGAUGCUGGCCAUCCAGAGUAAGAACAGCAGCUACUUCGUGGAGUGGAUUCCCAACAACGUGAAGGUGGCCGUGUGCGACAUCCCGCCCCGCGGCCUGAAGAUGGCCUCCACCUUCAUCGGCAACAGCACGGCCAUCCAGGAGCUGUUCAAGCGCAUCUCCGAGCAGUUCUCAGCCAUGUUCCGGCGCAAGGCCUUCCUGCACUGGUUCACGGGUGAGGGCAUGGAUGAAAUGGAGUUCACCGAGGCGGAGAGCAACAUGAACGACCUGGUAUCCGAGUACCAGCAGUACCAGGAUGCCACCGCCAAUGACGGGGAGGAAGCUUUUGAGGAUGAGGAAGAGGAGAUCGAUGGAUAGUCGGAAUAGAGCCGCCCCAACUCAGAUCCUACAACACGCAAGUUCCUUCUUGAACCCUGGUGCCUCCUACCCUAUGGCCCUGAAUGGUGCACUGGUUUAAUUGUGUUGGUGUCGGCCCCUCACAAAUGCAGCCAAGUCAUGUAAUUAGUCAUCUGGAACAAAGACUAAAAACAGCAGAGAAUUGCGGGUUCUACCCAGUCAGAAGAUCACACCAUGGAGACUUUCUACUAGAGGACUUGAAAGAGAACUGAGGGGCCACAAAAUAAACUUCACCUUCCAUUAAGUGUUCAAGCAUGUCUGCAAAUUAGGAGGGAGUUAGAAACAGUCUUUUUCAUCCUUUGUGAUGAAGCCUGAAAUUGUGCCGUGUUGCCUUAUAUGAAUAUGCAGUAUGGGACUUUGAAAUAAUGAUUCAUAAUAAAAUACUAAACGUGUGUCUUCAUCUCUCUAGCCAUGUGCAUAAAUGACGUAAGUUACUUUGUAUGGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-717.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -749.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 363.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((..(((.(((((..((((.((((((.((((.(.(((.((((.(.(((((......)))))......).)))))))).))))))))))..(((((...((((...))))....))))).((.....)).((((.........))))..))))..))))).))).)))))))...((((((((((................(((((((((.((.(((((.....((.(((((((...)))))).).))...((((((((((((((.....(((((.((((((((...((.((((.(((((((((((.........((((((((((((.(.((((.((.((((....(((((.((..((((((.....(((((((.(((.((((.(((..((.(((((((..((((((((((((((((((((((.(((((......))))).))))...(((((.((....))))))).((((..(((((((...(((((((..((((.....))))..).))))))..)))..))))..))))..(((((.(.(.....).)))))).((((((.((.((((.((((((((((((((((((........(((....((((((((((..((((.((...........)).))..))..))))))))))....))))))))......((.(((((........))))).)).....(((......))).......))))))..))))))).)))).)).))))))(((((.((..(((((((.....(((.((((.....)))).))))))).))).)).)))))....(((((.......))))).))))))))))..((...))..))))))))...)))).))).))..))).)))).))).)))))..))))))))....)).)))))...((((((........))))))((((((((((((((...((((...(((((((.........))))))).))))...)))))))((((.(((.....))).))))...(((....))))))))))....((....(((.(.(((((((((((..((((....)).))..)))))).))))).))))...)).))))))))))))))).))))))))((((..(((.((((..(((.(((....((.((((((...((((((...((.((((((....(((((((.((.((..((((.(((.((....))))).))))..)).)).)))))))..((.((((......))))))....))))))))....)))))).)))(((((((..((((.....))))..))))))).(((.......))))))))..))).)))..)))))))..))))..(((....))).)))))))..)))).)))).))))))))))......)))))..((((......))))...((.(((...........)))))...))))))).))))))).....((((..(((.(((((((((..........((((((.(((..((((((............))))))..)))(((......)))((((...))))(((.(((((.((.((...))..)).))))))))....)))))).........)))))))))))).))))((((...((((((......(((............))).....)))))))))).....(((.((((.((((.....)))).)))).))).....((.(((((((((..(((....))).))))))))).))))))).)).)))))))))......((((.....)))).......))))))))))...(((((....((((....))))...))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{({{((((..(((.(((((..((((.((((((.((((.{.({{.{(((,({({(((......}}})},...,.,.)))))))).))))))))))..(((((...((({...})))....))))).((.....)).((((.........))))..))))..))))).))).)))))}}||,((((((((((......,.........(((((((((.((.(((((.....((.(((((((...)))))).).))...(((((((((((((({{...(((((.((((((((...,{,((((.(((((((((((.........{(((((((((((.(.((((.((.((((....(((((.((..((((({....,(((((((.(((.((((.(((.,((.(((((((..((((((((({.|(((((((|{|.{((|{,..(({|||.}|})|},}})|}}.,}}},,}{{((({{((((({.((((({(,,{(((((({..((((.....})))..|.||||}|,,|}},.}}))|,}}||,,{{(({.{.{,.,||||}},,})|(({(((.((.((((.(((((((((((((,((((,{,.....(((.,..((((((((((..,(((.((...........}).)).,},..))))))))))..,.)))),,,,......{(.(((((........))))).)}.....{{{......)))}..})).))))))..))))))).)))).)).)))))){((((.{{..(((((((.....(((.((((.....)))).)))))))},)).)).))))}.,,,|||||....,,.)}))),)},,..,,,}.}))}})))}}))))))))...))))),)).)).,))).)))).))).)))))..))))))))....)).)))))...((((((........))))))((((((((((((((...((((...(((((((.........))))))).))))...)))))))((((.(((.....))).))))...(((....))))))))))....{{....{({,(.(((((((((((..((((....))},)..)))))))))))).)))).,.}}.))))))))))))))).)))))))}((((..(({(((((..(((.(((....{(.((({((,,.((((({.,.{{.((((({....(((((((.((.((..((((.(({,((....))))).))))..)).)).))))))).,((.(({{.....,|)))}},...))))))))..}.)))))}.}}|(((((((..((((.....))))..)))))))}(({{,...,.}))))}))..))).)))..)))))))..))))..(((....))).))))))}..)))).)))).))))))))})......)))))..((({......)))).|.((.(((...........))))).}.))))))).))))))).....{{{{..(((.(((((((((..........((((((.(((..((((((............))))))..)))(((,....,)))((((...))))(((.(((((.((.{....,},.)).))))))))....)))))).........)))))))))))).,}}}{{{{...((((((......(((.,..,..,....))}....,))))))})}}.....(((.((((.((((.....)))).)))).))).....((.(((((((((..(((....))).))))))))).))))))).)).)))))))))......((((.....}}))},.....)))))))))),.,{{(((.{{.((((....)))).},))))),....
Back