Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032527.5
Sequence Length
1997 nt
GC Content
0.6460
ACUUCCGGAAGCGGCGGCGCUCGGGAGGAAGUGCCGAUCGGCUGCUGGGGCGAAAAGGGGGCGCCGGGCCGCUCUAGCCGGUGAGGCCGGCGGGCUCUCUGUGGCUGCGGCUGGGAAACCGCGCGGAGGAGGUGCCCGGCCGGGGACCAGCCCUGGUCCAGCGCCUCCCUCUCUCAGCAUGGACGAGGAGAGCCUGGAGUCGGCCUUGCAGACCUACCGUGCGCAGCUGCAGCAGGUGGAGCUGGCCUUGGGCGCCGGCCUGGAUUCGUCUGAGCAGGCUGACCUGCGCCAGCUGCAGGGGGACCUGAAGGAGCUCAUCGAGCUCACCGAGGCCAGCCUGGUGUCUGUCAGGAAGAGCAGCUUGUUGGCCGCGCUGGACGAAGAGCGCCCGGGCCGCCAGGAAGAUGCUGAGUACCAGGCUUUCCGGGAGGCCAUCACUGAGGCGGUGGAGGCACCAGCAGCGGCCCGUGGGUCCGGAUCAGAGACCGUUCCUAAAGCAGAGGCGGGGCCAGAAUCUGCGGCAGGUGGGCAGGAGGAGGAAGAGGGAGAGGACGAGGAAGAGCUGAGUGGGACAAAGGUGAGCGCGCCCUACUACAGCUCCUGGGGCACUCUGGAGUAUCACAACGCCAUGGUGGUGGGAACGGAAGAGGCGGAGGAUGGCUCGGCGGGUGUCCGUGUGCUUUACCUGUACCCCACUCACAAGUCUCUGAAGCCGUGCCCGUUCUUCCUGGAGGGAAAGUGCCGCUUUAAGGAGAACUGCAGGUUCUCCCAUGGGCAGGUGGUCUCUCUGGAUGAGCUGCGCCCCUUCCAGGACCCAGACCUGAGCUCCCUGCAGGCCGGCUCUGCGUGUCUGGCCAAGCACCAGGAUGGCCUCUGGCACGCAGCACGCAUCACCGAUGUGGACAACGGCUACUACACAGUCAAGUUUGACUCGCUGCUGCUGAGGGAGGCCGUGGUGGAGGGGGACGGCAUCCUGCCCCCACUGCGCACAGAGGCCACAGAGUCCGACUCAGACAGCGACGGUACGGGUGACUCCAGCUAUGCCAGAGUGGUGGGGUCGGACGCCGUGGACUCUGCACAGUCCUCUGCCCUCUGUCCGUCUCUUGCAGUGGUGGGGUCAGAUGCUGUGGACUCUGGGACCUGCAGCUCUGCCUUUGCUGGCUGGGAGGUGCACACGCGAGGUAUAGGCUCCAGACUCCUCACCAAGAUGGGCUAUGAGUUUGGCAAGGGUUUGGGCCGACACGCGGAAGGCCGGGUGGAGCCCAUCCAUGCUGUGGUGUUGCCUCGAGGGAAGUCGCUGGACCAGUGUGUGGAGACCCUGCAGAAGCAGACCAGGGUUGGCAAGGCUGGCACCAACAAGCCCCCCAGGUGCCGGGGAAGAGGGGCCAGGCCUGGGGGCCGCCCAGCUCCUCGGAAUGUGUUUGACUUCCUCAAUGAAAAGCUGCAAGGUCAGGCUCCUGGGGCCCUAGAAGCCGGGGCGGCCCCAGCGGGGAGGAGGAGCAAGGACAUGUACCAUGCCAGCAAGAGUGCCAAGCGGGCCCUGAGCCUGCGGCUCUUCCAGACUGAGGAGAAGAUCGAGCGAACCCAGCGGGACAUCAGGAGCAUCCAGGAGGCUCUCGCCCGCAACGCUGGCCGGCAUAGCGUGGCGUCAGCCCAGCUGCAGGAGAAGCUGGCAGGAGCCCAGCGCCAGCUGGGGCAGCUCCGGGCUCAGGAAGCCGGCCUGCAGCAGGAGCAGAGGAAGGCAGACACCCACAAGAAGAUGACUGAGUUCUAGAGACCCCACAAGCACUAUGGACGAAGCGUGGGACCCCAGCACGGGCUGCCCUCAGGAAGACCAGUGUUGCCCGAGGAGGGGCCGGCCUGCUGGCCUGGGGCGUGCAGACACUGCUGAGUGGAGACAGAGCUGCGGGGUCCCAUCUGGACACUUACUUGCCCACCUGCCAGUGUCUUGGGCAUUUCCUUGGCAAGGACAUUAAAGUGAUUUCAUCACAGUGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-951.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -984.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 461.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((..((((....)))))))(((((((((((.(...((((((((........((.(((.((((((.(((((.(((((((.((((((((((((((((...((((((((((......(((((((.((((((((..((((((((.....))))))))..))))))))((((((..(......)..))))))..(((.(((.((...)).))))))))))))))))))))))).......((((((((((((((((((((((..(((....))))))))))....)))))..((.((((....)))).))((((((...))))))..))))))))))((((......))))..)))).)))))))))))).)))))).)..)))))))))))))).)).(((((..(((........)))))))).....(((.((((((...)))))).))).))))))))(((((.((((..(((........)))..))))..((....)).)))))(((..((..(((((((((((((((((.((((..(((...((....(((.((..((((((((....((((((((((((.......(((...)))(((((((((.(((((((.(..((((.(..(.((....)).)..).))))..)))).)))).).)))))))))))))).))))))....))))))))....)))))....))...))).))))((((((((((...((((.((((...((((((((((..((((......))))..))))).)))))....)))).)))).))))))))))((((((.....((.....)).(((((...(((((((((.(((((..(....)..)))))...)))))))))..((((((...)))))).....)))))....((((((...(((((((((((((((((.((((((((.((.(((((((((((..((((...)))))))((((.(((..(((.((((.(.(((((((((..((.((...((((.((.((....)).)).))))...)).)).))))))))).).)))).)))))).))))))))))))...)).)).)))))))))))))).)))))))))))))))...)))))).((((((((((((.((((((((((.((....(((((.(.(.((((...(((.((((((((....(((...))).....))))))))..(((((((((((...(((.(((....))).)))..)))))(((((((..((((.(.((..(.......)..)).).))))..)))))))))))))((....))...(((((.(((((....((((((((.............)))))))).........))))).)))))(((((((((..((((((((...(((((((.(((((((..((....((((((.((((.((((((((((.(((........(((((.((((((((((.(..(.((..(..((.((((...)))))).(((....)))...((((((...((((((.(.((((((((.(.(((.((...............)))))).))).....))))).....).))))))..))))))...(((((((.((.....)).).))))))((((((........))))))...)..)))..).)).)))))))).)))))))))))))).)))))))))))))).....))))))))).))))))).....((((..........))))......(((((..((............)))))))....((((((.((((.((....)).)).)).)))))).))))))))))).))))))))).)))).).).)))))....))))).))))))).))))))))))))((((.....)))).))).))))))))))))))))..)))).)))))))))))......((((((...(((((...))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,(({{.{(((....)))))})||(((((((((.{...((((((((........((.(((.((((({{(((((.(((((((.((((((((((((((((...((((((((((......(((((((.((((((((..((((((((.....))))))))..))))))))((((((,......,..),)))))).,|{{.{{{.|(...}).}}))}|))))))))))))))))).,.,,,.((((((((((((((((((((((..,{{....)},)))))))....))))}..((.((((....)))).})((((((...)))))).,)))))))))){{{,..,,,.,)))}.)))).)))))))))))).)))))).)..)))))))))))))).)).(((({..{(({.....}})}}})))).....(((.((((((...)))))).))).))))))))(((((.((((..(((.,,...,,)))..)))}..((....)).))))){{{..{{,,(((((((((((((({(({((((..(((.,.((.{..((,{((,,((((((((....((((((((((((.......(((...)))(((((((((.(((((((.(..((((.{..(.((....)).)..}.))))..)))),}))).).))))))))))))))))}))))....))))))))...,}))))...,)).,.))).))))|(((((((((...((((.((((...((((((((((..((((......))))..))))).)))))....)))).)))).)))))))))}.(((((...,.((.....}).(((((,,.{((((((((.(((((..(....)..)))))...))))))))),.((((((...)))))).....))))}....((((((...(((((((((((((((((.(((((((({,(.(((((((((((..((({...}))))))((((.((,.{(((.((((.(.(((((((((..{(.((...((((.((.((....)).)).))))...)).}).))))))))).}.)))).)))))).))))))))))))..,,),)).)))))))))))))))))))))))))))))).....{((((((((((((((((.((((((((((,((...,({({(,(,(.{(((.{{((({{(((((((.,..((,...})),....)))))))|,,.((({,{((({,..(((.(((....))).)))..)))))|||,||{{{((((,({,{,,,,.({{..(((,(((({{((({.{{(({.,|||((((....))}},{{|{{|||(({..{{{{{{,.,|..,..}}}.}}}.))).((((((,,(..((((..((((....))))))))..))))))))...(((((((.(((((((..{{....(((((,,((((.((((((((((((({.......,(((((.(((((((({({{.(({(({((..((.((((...)))))).(({....}))...((((((...,.}||}}}.}||||||}.,.{{{,,{......}}...,...}}}.{{{||......((({{.{{...}),))))}.)))))).,{((((|,.,,|.},}})}{{{,{|.||((((((........))))))}.}).))),.,).)).)))))))).)))))))))))))),}))))))))))))).....},))))))).)))))))}}}},........}}}}.}})))}).))}|||||.}}},}}}},..,...))))))}}}}}||||,|,|{({,(({,{,||..|.||,||||||{||,,,,.,)))}})))}})))})))),),),)}))}..,.)}))}.))))))).))))))))))))})))))}))))...))).))))))))))))))})..})}}.)))))))))},......((((((...(((((...))))))))))).
Back