Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032546.4
Sequence Length
2056 nt
GC Content
0.5914
AAACAGUGCUACCCACAGAGUGAACAAGAGAGAGUCAUUUGGGAAACAAAAGGAGAAUUUUACAGAGAGAGAGGGAUAGCUAAAACUACGUGAGCCUGGCGAGGGUGCAGAGCAGAAAGUAGAGACUGUCCGAAGACUGCUAUCUGGGACGAGACAAGUUGUUAAAGGGACAGGAGAGAAAGCAGAGCUAUUUCAAGAGUGAGCCACAGAAGGGAAUCCAGAGGCCAUCUAAGCGAGGAAGGGUCUACAGGCAGUGAGUGAAGGCCAGGAGCAGGGCCCAGGCCAGGCACGACCACCGAGGGGAUGAACUUCACAGUGGGUUUCAAGCCGCUGCUAGGGGAUGCACACAGCAUGGACAACCUGGAGAAGCAGCUCAUCUGCCCCAUCUGCCUGGAGAUGUUCUCCAAACCAGUGGUGAUCCUGCCCUGCCAACACAACCUGUGCCGCAAAUGUGCCAACGACGUCUUCCAGGCCUCGAAUCCUCUAUGGCAGUCCCGGGGCUCCACCACUGUGUCUUCAGGAGGCCGUUUCCGCUGCCCAUCGUGCAGGCAUGAGGUUGUCCUGGACAGACACGGUGUCUACGGCCUGCAGCGAAACCUGCUAGUGGAGAACAUUAUCGACAUUUACAAGCAGGAGUCAUCCAGGCCGCUGCACUCCAAGGCUGAGCAGCACCUCAUGUGCGAGGAGCAUGAAGAAGAGAAGAUCAAUAUUUACUGCCUGAGCUGUGAGGUGCCCACCUGCUCUCUCUGCAAGGUCUUCGGUGCCCACAAGGACUGUGAGGUGGCCCCACUGCCCACCAUUUACAAACGCCAGAAGAAACAGGAUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAACACAACUUACUGCAGCCUUGAUCUCCCGAGCUCAAGUGAUCCUCCCAUCUUAGCCUCGCAGAACACUAAGAUUAUAGAUAGUGAGCUCAGCGAUGGCAUCGCGAUGCUGGUGGCAGGCAAUGACCGCGUGCAAGCAGUGAUCACACAGAUGGAGGAGGUGUGCCAGACUAUCGAGGACAAUAGCCGGAGGCAGAAGCAGUUGUUAAACCAGAGGUUUGAGAGCCUGUGCGCAGUGCUGGAGGAGCGCAAGGGUGAGCUGCUGCAGGCGCUGGCCCGGGAGCAAGAGGAGAAGCUGCAGCGCGUCCGCGGCCUCAUCCGUCAGUAUGGCGACCACCUGGAGGCCUCCUCUAAGCUGGUGGAGUCUGCCAUCCAGUCCAUGGAAGAGCCACAAAUGGCGCUGUAUCUCCAGCAGGCCAAGGAGCUGAUCAAUAAGGUCGGGGCCAUGUCGAAGGUGGAGCUGGCAGGGCGGCCGGAGCCAGGCUAUGAGAGCAUGGAGCAAUUCACCGUAAGGGUGGAGCACGUGGCCGAAAUGCUGCGGACCAUCGACUUCCAGCCAGGCGCUUCCGGGGAGGAAGAGGAGGUGGCCCCAGACGGAGAGGAGGGCAGCGCGGGGCCGGAGGAAGAGCGGCCGGAUGGGCCUUAAGGCCUGCGCCGACCCGACCCUGCUCGAGAGCCCGCGCUAGAGUCGGGGAGGAUCUGCGCAGAGACCGCAGCAUCACCCAAAUCGGCGCCGGCCCCGGGAGGAUCUCAAUAAAGAACUCGAGCGUCCCAGACCCGUAUCUCCUUUCGCUGCCCAACCCCGCAGCCUGGGCUUCGAAGGCGACCCGCCCACCAUCCUGCCCUUCCCAGAACCUGAGACCGUCUGGGGGGCGGAAGCCAAAUGAACCCCUAUUGGGCACCUCUGUGAUGCCAGGAGCGAACUGGUGAGCCCAGCGCCCUGGGAAGAGGGCCGAGGGCGGGGCGGUGGUGCCGGGACCUCUGAGGUCCUGGGGAUUUGGGGACCCUUGGGGUCCACAUGCACCUGGCUGACCUGGCUGAAAGCCGCUGUCUCGGAGCCCCCCACAGCAUUUUGUUCCCCUCCCGCUGGCCCGGGGGCCCCACCUUCCCACGGGUUCCCACGCUGCUGUGACUGCCCUGCCUCUACGACAAAAGCCAACGGGUCUUCAGUACUUUUAUUAAAAAAUAGUCACGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-814.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -850.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((((.........((((...((((...((...(((((.((((.((((((((((((..(((......))).((.(((((...(.((((((((..((((.(((((...((......)).))))).)))).(((((......)))))...(((((....((((.(((...))).))))........((((.(((..(((.((..((((((.((.....))(((((((((....((((.....((..(((((((.(((((((..((((((((((.((.....(.(.((((((.((((.((((((........))))))(((((..((((.....))))......))))).))))....)))))).))...)))))))))......((.(((......))).)).))))))))))........)))).))).))....))))...))).)))))).)))))))).)))))).)))).)))))((....))..((((((((((((((((.(((.......(((((....).))))......)))..))))))..))))))))))....(((((((....((..((((((((((..((......))..))))....))))))..))...)))))))))))))))).)))))..)).((((((((((.((..((.(((((((...((.....))....)))).)))))..))))))))))))...))).))))))))).)))))))))..))))))....))))((((((((((......).)))))..)))).....((..........))...)))))))))......((((((((.((((.((((....(((......(((((((.....((((((..((((......((((((.((((..(((((((((..(((((..........)))))..))..)))).)))...(.(((((((.(.(((.((.......)).))).).)))).))).)..))))))))))..((((((((.((.(((.(........))))))((....)).(((.(((((((...))))))).)))))).)))))(((((.....)))))..((((.(((.(((...)))))).))))..))))..).))))).)))))))(((....))).((((.((((((.(...(((.(((.(((.....(((((((...((((((((......))).)))))....(((((.(((.....((((((((......)))).((((...((.((........)).))..))))..(((((.(((...((.((((...(((((((..(((.(((.....))).)))..)..((((((.....)))))).....))))))...))))))..))).))))).....))))))).))))))))))))...))).))).))).).))))))))))..(((((((.(((((((..(((((...((((...((((((....((((.(((((((.(((((.((((.((......)).)).)).)))))((..((((((((.......))))).)))..))...))))))).)))).(((((((.(((......))).....((.(((((((..(((.((((((....(((((........)))))..((((((((.(((...((((((((((.((((((((((((((((.(........))))))).(((....)))................(((.(((((....(.(((((.(((..((((.....)))))))))))).))))))))))))))))))).))))).).)))).))).)))))))).)))))).)))((((((...))))))........))))..)))))((((...))))(((((...((.....)).)))))..........)))))))..))))))..))))....)))))..)))..)))).))))))))))..))))))))))))........))))...))))....))))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((,{{((((((((((.,.......,{((,||((({...{....((((,.{(({.({((((((({(({.{{{......||},{(.((((({,.,.((((((((.,({{,.{((((...(({{{{..,|{|}|||.|||}.{{{,|},..,})})))...{||||}}..((((.(((...))).))))....,,,.((({.,{..((((.(({.((((((.{{...,,|.(((((((((....((((,,..,({..(((((((.(({((((,,{(({{,(({{.{(,({(,(,((({{,{,.{{||.((((((........))))))(((((..((((.....))))......))))).,,,||{|.},,,)}})}}|,,|||..||{{{{...)))))}...}.}))))}.})}))))))))}.......}})).)}},|,....}))}...))).}}}}}}.|))|}|},.|)))}|.}))|.,}|||{(|,|.}}..((((((((((((((((,(((.,.....(((({....}.)))),...,.)))}.)))))),.})))))))))....{((((((,{,.((..((((((,((({{{,......,}..,,))}}}.))))))..)).,.}}}|||||||||||||.}|}||,.||.((((((((({.((..((.(((((((...((.....))....)))).)))))..))})))))))))...|||,|}}}}}}}),)))))||||,{|{}||}.,.,)}}|((({((((((......)})))))..}))),..,,||.},,,..,{,||...}}})))))),||,|,|{||||||,||||,|||{....{,,......((((((({{,,.{(((((..(({(......(((((((((((..((((((({(,.(((((..........)))))..}),.)))).)))...(.(((((((.(.(((.((.......)).))).}.)))),))).}..))))))))))..({({((.(.,,.|,..|,.}..,.|||.,.}}|,...||,(((.(((((((...))))))).)))|||,||,|{((((({.{{.||{.||.,,.)).)}),)).)))))))))))})))))))..),)))}}.}))))}}(((....))).((((.((((((.{...(((.(((.(((.....(((((((...((((((((......))).)))))....(((((.(((.....((((((((......)))).((((...{,.(({{{{....,)}))}}))))..(((((.(((...((.((((...((((({,..(((.(((.....))).))).{|..((((((.....))))))}}...})))))...))))))..))).))))).....))))))).))))))))))))...))).))).))).}.))))))))))..{||{||{.|{||||{..{|{{{.|.((((...{{((((....((((.(((((((,(((((.((((.((......)).)).)).)))))|(..((((((((.......))))).)))..)}...))))))).)))).{(((({(.,{{{......,,...{|{{,{||||{{{{(({.,{{{((,,,,({{(({{,.....}}})}.}||||,{||,|||.},,,{(((((((.((((((((((((((({.{........))))))),(((....)))..,,,.........,.(((.(((((....{.(((((.(((..((((.....)))))))))))).}))))))))}))))))))).))))).)}{|||{|||.,,))))))})))),),)))||||{|}}}}||||,.,..,,..,)))},}}))}(((|...})))(((((...((....|}}.)))))....,,....))))))),,)))))),,)))),...)))))..))),,)))).)))))))}),.,))))))))))))........,)))...))))....)))))).}|...................
Back