Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_032588.4

Sequence Length

1770 nt

GC Content

0.5220

AGAAUUCGGGCACCAGGAGAAGGAAGCCAACAGGAUCCGACCCGGUGUUUUGUGACAAAGGCAAGACCCCCAGGUCUACUUAGAGCAAAGUUAGUAGAGGAGGCAGCUAGGCGUGGCUCUCAUUCCUUCCCACAGAAUGGAUUAUAAGUCGAGCCUGAUCCAGGAUGGGAAUCCCAUGGAGAACUUGGAGAAGCAGCUGAUCUGCCCUAUCUGCCUGGAGAUGUUUACCAAGCCAGUGGUCAUCUUGCCGUGCCAGCACAACCUGUGCCGGAAGUGUGCCAAUGACAUCUUCCAGGCUGCAAAUCCCUACUGGACCAGCCGGGGCAGCUCAGUGUCCAUGUCUGGAGGCCGUUUCCGCUGCCCCACCUGCCGCCACGAGGUGAUCAUGGAUCGUCACGGAGUGUACGGCCUGCAGAGGAACCUGCUGGUGGAGAACAUCAUCGACAUCUACAAACAGGAGUGCUCCAGUCGGCCGCUGCAGAAGGGCAGUCACCCCAUGUGCAAGGAGCACGAAGAUGAGAAAAUCAACAUCUACUGUCUCACGUGUGAGGUGCCCACCUGCUCCAUGUGCAAGGUGUUUGGGAUCCACAAGGCCUGCGAGGUGGCCCCAUUGCAGAGUGUCUUCCAGGGACAAAAGACUGAACUGAAUAACUGUAUCUCCAUGCUGGUGGCGGGGAAUGACCGUGUGCAGACCAUCAUCACUCAGCUGGAGGAUUCCCGUCGAGUGACCAAGGAGAACAGUCACCAGGUAAAGGAAGAGCUGAGCCAGAAGUUUGACACGUUGUAUGCCAUCCUGGAUGAGAAGAAAAGUGAGUUGCUGCAGCGGAUCACGCAGGAGCAGGAGAAAAAGCUUAGCUUCAUCGAGGCCCUCAUCCAGCAGUACCAGGAGCAGCUGGACAAGUCCACAAAGCUGGUGGAAACUGCCAUCCAGUCCCUGGACGAGCCUGGGGGAGCCACCUUCCUCUUGACUGCCAAGCAACUCAUCAAAAGCAUUGUGGAAGCUUCCAAGGGCUGCCAGCUGGGGAAGACAGAGCAGGGCUUUGAGAACAUGGACUUCUUUACUUUGGAUUUAGAGCACAUAGCAGACGCCCUGAGAGCCAUUGACUUUGGGACAGAUGAGGAAGAGGAAGAAUUCAUUGAAGAAGAAGAUCAGGAAGAGGAAGAGUCCACAGAAGGGAAGGAAGAAGGACACCAGUAAGGAGCUGGAUGAAUGAGAGGCCCCCAGAUGCAGAGAGACUGGAGAGGGUGGGGAGGGGCCCAGCGGCCUUGGUGACAGGCCCAGGGUGGGAGGGGUCGGGGCCCCUGGAGGGGCAAUGGGGAGGUGAUGUCUUCUCUCUGCUCAGAGAGCAGGGACUAGGGUAGGACCCUCACCGCUGCGUCCAGCAGACACUGAACCAGAAUUGGAAACGUGCUUGAAACAAUCACACAGGACACUUUUCUACAUUGGUGCAAAAUGGAAUAUUUUGUACAUUUUUAAAAUGUGAUUUUUGUAUAUACUUGUAUAUGUAUGCCAAUUUGGUGCUUUUUGUAAAGGAACUUUUGUAUAAUAAUGCCUGGUCGUUGGGUGACCUGCGAUUGUCAGAAAGAGGGGAAGGAAGCCAGGUUGAUACAGCUGCCCACUUCCUUUCCUGAGCAGGAGGAUGGGGUAGCACUCACAGGGACGAUGUGCUGUAUUUCAGUGCCUAUCCCAGACAUACGGGGUGGUAACUGAGUUUGUGUUAUAUGUUGUUUUAAUAAAUGCACAAUGCUCUCUUCCUGUUCUUCAAAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-613.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -643.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 614.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.....(((((.((.(..(((..((....)).)))..))))))))(((.((((((..(((..((((((((((....(((..((((((((..((.((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))).))).....))))).))))).(((((((((((...)))))......))))))((.(((((((((((((((((...(((((((((((((...........(((.((((((.(((.(((((......))).)))))))).))))))..)))))).)))))))..((..((((((((.((((....((((((((.(.((.((((....)))).)).).....)))))))).(((.(((((.((.(((((((...))))))).))...(((((((((.((.(((.(.((((...(((((...(......)...)))))...))))..).)))..)).))))).))))...((((.((((((....((((.....))))..(((((..........)))))....(((((....)))))(.(((((((.(((((.((.....((((((((((((((...(((.(((((.(((........((..(((.((((((((..........))...(((....(((((.(((((.(((((...((((.......))))...))).......((((((.((.(((....))).)).)))))).)).))))))))))...))).....)))))))))..))...........))).))))).)))....)))))((((((..((((...(((((.(.(((.....))).).)))))........))))..)))).))..((((((((((((((.((.((((......))))))...(((.....(((((((....((.((.(((..((..(((((...(((.((....))..(((((((((...(((...))).((((((.....((..((.((.((((.((.((((..((.(((..(.....)..))).))((((((((..((.((.........)).))..))))))))...........)))))).))))..)).))..)).....)))))).)))))))))..(((.((((.........))))))).)))....)))))..))..))).)).)).....)))))))..)))))))))....)))).)))))))))))))......))))))).))))))).)((((((....))))))))))))..))))..))))).))))))).))(((((....)))))..))))))..))........(((((((((...))))))))).)))))))))....)))..))))).))(((......))).(((((...((((((.(((((((...........)))).))).))))))..)))))((((((....((((((((........))))))))...)))))).(((((........))))).......).)))))))).))....))).))))).)))....)))))).....))))....)))..)))))).)))..(((((((((((...(((((...))))).....)))))))))))(((((((((((.(((.((((((((........)).))))))...((((((..(((((((........)))))))..)))))).((((((....(((((...)))))...))))))..)))))))))))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,....,(((((.((.(..(((..((....)).)))..))))))))|((.((((((..(((..((((((((((....(((..((((((((..((.((((((((.({{(((,((((({{{{{(((((({{...,,.{|||{{...,}||,.,||||{((((((((((,...}}|,|{..{{{{{{{{,...,(((({,,,(({{(((...{((((((,(((((({.{{..,{{{.((((((((((,(((.((((({{,...}})|))}|||||{|{,,,,..,))),))))),|||,{,...{(({...,}}|.|}}},((((((((.{.((.((({....}))).)).|.....)))))))).{{{{{(({(,{,.||{(((,..,},,,}}}}}|,,|||{|||||(,(({(,{,..{{{{|,|((({{,..|.,,...,.,.}}}}}...}})}.||,|}}|,}}.}}}}|||||||..((({,|{{{{{,,.{((({..,,,)))){.(((((......,,..))))).,,||||||,.||||,||{.((((((({(,{{,.,{}}..}|||{{{||,|||||,,,{|||{{{{{|{||||,||.||||||,{{{(({{,{,||}}|,.....}},..||,....,||||.|||||.|||||||}|||||,..,,,)))),.,),,.,.....((((((.((.(((....))).)).))))))....))}))))))),.})))}},.})),}}))))}.,)},..}))}}..)),,,,)},,,))}}}})))}|{{({((..{(((...(((((.(.(((.....))).).)))))........))))..)))).}}..((({(({,{(((((.((.((((,.,..|}||||,..,((({,...{{{{||||...||.||.|||})||,,}))}|..}||||||}}.}))..(((((((((..,({{...))).((((((.....({..((.({.{((({{.,(((({,{,.{((..|,.,..}.,})),||({({(({{..{{.{{.,,,,,,,.}}.}}..}}}}}))}.....,},...)))))}.})))..}}.})..)).....)))))).}}}}}}}})..|||.,|,..,,.,..,.)))))..})}}...,)))))..,..})))}))},......||||{{{.....))))),}}.,})))})})|||||,}|}|{{....,)))}),.,}}))))||{(({(({..{,{(({{{|,,.,..,}))})))),)..}))}}),,,(((((....)))))..}||||{((|,...{|||}(((((((((...))))))))}..|}}}},,,,))})),)))))}}.))}}}|||...}}}.(((((...((((((.(((((((...........)))).))).))))))..)))))((((((({...}))))))}{((({,...))))))...,,,|||{((({...,,,,,,))))))},...,),)))))))).))....))))))})).))}....)))))).....))))....)))..)))))).)),..(((((((((((...((({(...})))),,,..)))))))))))(((((((((((.(((,((((((((........)).)))))}...{((((({{(,(((((........)))))))}.)))))}.((((((.{{.(((({...})))).}}))))))..)))))))))))))),}}......