Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032782.5
Sequence Length
2237 nt
GC Content
0.4707
AUUUGGAGAGUUAAAACUGUGCCUAACAGAGGUGUCCUCUGACUUUUCUUCUGCAAGCUCCAUGUUUUCACAUCUUCCCUUUGACUGUGUCCUGCUGCUGCUGCUGCUACUACUUACAAGGUCCUCAGAAGUGGAAUACAGAGCGGAGGUCGGUCAGAAUGCCUAUCUGCCCUGCUUCUACACCCCAGCCGCCCCAGGGAACCUCGUGCCCGUCUGCUGGGGCAAAGGAGCCUGUCCUGUGUUUGAAUGUGGCAACGUGGUGCUCAGGACUGAUGAAAGGGAUGUGAAUUAUUGGACAUCCAGAUACUGGCUAAAUGGGGAUUUCCGCAAAGGAGAUGUGUCCCUGACCAUAGAGAAUGUGACUCUAGCAGACAGUGGGAUCUACUGCUGCCGGAUCCAAAUCCCAGGCAUAAUGAAUGAUGAAAAAUUUAACCUGAAGUUGGUCAUCAAACCAGCCAAGGUCACCCCUGCACCGACUCGGCAGAGAGACUUCACUGCAGCCUUUCCAAGGAUGCUUACCACCAGGGGACAUGGCCCAGCAGAGACACAGACACUGGGGAGCCUCCCUGAUAUAAAUCUAACACAAAUAUCCACAUUGGCCAAUGAGUUACGGGACUCUAGAUUGGCCAAUGACUUACGGGACUCUGGAGCAACCAUCAGAAUAGGCAUCUACAUCGGAGCAGGGAUCUGUGCUGGGCUGGCUCUGGCUCUUAUCUUCGGCGCUUUAAUUUUCAAAUGGUAUUCUCAUAGCAAAGAGAAGAUACAGAAUUUAAGCCUCAUCUCUUUGGCCAACCUCCCUCCCUCAGGAUUGGCAAAUGCAGUAGCAGAGGGAAUUCGCUCAGAAGAAAACAUCUAUACCAUUGAAGAGAACGUAUAUGAAGUGGAGGAGCCCAAUGAGUAUUAUUGCUAUGUCAGCAGCAGGCAGCAACCCUCACAACCUUUGGGUUGUCGCUUUGCAAUGCCAUAGAUCCAACCACCUUAUUUUUGAGCUUGGUGUUUUGUCUUUUUCAGAAACUAUGAGCUGUGUCACCUGACUGGUUUUGGAGGUUCUGUCCACUGCUAUGGAGCAGAGUUUUCCCAUUUUCAGAAGAUAAUGACUCACAUGGGAAUUGAACUGGGACCUGCACUGAACUUAAACAGGCAUGUCAUUGCCUCUGUAUUUAAGCCAACAGAGUUACCCAACCCAGAGACUGUUAAUCAUGGAUGUUAGAGCUCAAACGGGCUUUUAUAUACACUAGGAAUUCUUGACGUGGGGUCUCUGGAGCUCCAGGAAAUUCGGGCACAUCAUAUGUCCAUGAAACUUCAGAUAAACUAGGGAAAACUGGGUGCUGAGGUGAAAGCAUAACUUUUUUGGCACAGAAAGUCUAAAGGGGCCACUGAUUUUCAAAGAGAUCUGUGAUCCCUUUUUGUUUUUUGUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCACAAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUGGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCAUGCCCAGCUAAUUUGUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGUGUGGUCUCAAACUCCUGACCUCAUGAUUUGCCUGCCUCGGCCUCCCAAAGCACUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCACAUCCAGCCAGUGAUCCUUAAAAGAUUAAGAGAUGACUGGACCAGGUCUACCUUGAUCUUGAAGAUUCCCUUGGAAUGUUGAGAUUUAGGCUUAUUUGAGCACUGCCUGCCCAACUGUCAGUGCCAGUGCAUAGCCCUUCUUUUGUCUCCCUUAUGAAGACUGCCCUGCAGGGCUGAGAUGUGGCAGGAGCUCCCAGGGAAAAACGAAGUGCAUUUGAUUGGUGUGUAUUGGCCAAGUUUUGCUUGUUGUGUGCUUGAAAGAAAAUAUCUCUGACCAACUUCUGUAUUCGUGGACCAAACUGAAGCUAUAUUUUUCACAGAAGAAGAAGCAGUGACGGGGACACAAAUUCUGUUGCCUGGUGGAAAGAAGGCAAAGGCCUUCAGCAAUCUAUAUUACCAGCGCUGGAUCCUUUGACAGAGAGUGGUCCCUAAACUUAAAUUUCAAGACGGUAUAGGCUUGAUCUGUCUUGCUUAUUGUUGCCCCCUGCGCCUAGCACAAUUCUGACACACAAUUGGAACUUACUAAAAAUUUUUUUUUACUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-718.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -756.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((((((((..(((...((((((...))))))..((((((.(((..((((((.(((...((((((((....(((...(((....((.((....)).))...)))...)))((((.(((.(((.(((..((((((.(((((..((((((.(((.......((((((.((((((..(((((((((..(((((......(((((((..(.(((((((...(((((((((((((.((....((((....))))...)).)))))).........((((((..........)))))).(((((.((((....((((((((((.....))))....)))))).....(((((.......)))))((((.((((((...)))))))))).(((((.........(((((......((((((..(((((......)))))..))))))..(((((..((((...((((((.((((....((((.((....)).)))).(((((((...((.((((.....((((((.....(((((..(((...........))).)).)))((((.(((((.............)))))..((((((((((((((((....)))))...)))))))))))......)))))))))))))).))....))).)))).......)))).))))))))))..)))))((((((...(((((((..((((((((.(((..(((((((.((((((........((((((((.((...............)).))))))))((((((((.........))).)))))...(((....)))(((.(....).)))...(((.....))))))))))))))))))))))...)))))...))))))).....((((....))))..)))))).((((((.(((((((...........))))))).)).)))).)))))...))))).((((.((((....))))..))))(((((..........)))))....))))))))).((((...(((((((.(((((((((.((.(.((((((((((..((((((.........))))))..)).))).))))).)..)).)).))))))).))..)))))....))))(((((((...(((.(((((..(((((....(((((.......(((((.........)).))).......))))).....)))))....)))))..)))......)))))))))).))))...))))))).)....))))))).((((......)))).(((((((.....((((......))))...)))))))(((((.....)))))..(((((((((((...(((((((.(((.((((((....)))))).))).)))))))...))))))))...((((..((((..(((((.((..(((((((.(((((((((.((((.(......))).)).)))..))))))...))))))).)))))))..))))...)))))))))))).)))))))))......((((((......))))))((((......))))........)))))).)))))).....))).)))))).(((((((((((....((((............(((......))).(((((......)))))...))))..))))..)))))))....(((((.((((((((....))))).))).)))))..(((((...(((.((((((.((.(((((...))))).)))))))).)))...))))).(((((((((((......).))).).)))))).....))))))))))).)))))).))).))))((((....)))).)))))))))))))))))..)))))))))....(((((((.........))))))))))..)))))).((.(((((((((((((((............(((((..((((((......((((((..(((..(((...((((((......))))))..)))..))).((((.......))))(((((((((...((((((....))))))...........))))))).))))).)))....))))))..)))))............)))))))..(((((((((..((....))..))))))....)))...(((.....))).........)))))))).))))))).))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((.((((((((((({.(((...((((((...))))))..((((({{(((..((((((.(((...((((((((.,,(((({(((,{,((({(((((,(((,,{{{,((,({,...,|,,..,.,,,)))))...,)))}})))}||.}||||||,,,{,,.....((((((.((((((..(((((((((..(((((......(((((((..,.(((((((..,{{{{{{,((((((.((....((((,,,.}}))...)).)))))}.......,,((((((.......,..))))))......{{{{{,.,,((((((((((.....))))),..,})))}|.,,.(((((.......)))))((((.((((((...)))))))))).((({....}}}},,(({{{......((((((..(((({......}))))..)))))}..((((({.{(({{..((((((.((((....((((.((....)).)))).(((((((...((.((((,....{((((({....(((((..(((.,.......,.))).)).)))||||,((({,.............,}}}}..((((((((((((((((....)))))...)))))))))))......}},,,})))))))).)).,..))).)))).......)))).))))))}}})},)))})|||||(,,.(((((((..((((({{(.,{,..((((({{{((((((........((((((((.((..,.........,..)).))))))))(((((,,(,,.......,)),)))))...(((....)))(((.(....).))),{,,{,.....)))))))))))))))),},}))...)))))...))))))),,,{|{|{,.,,,))||,,|,}}}}.((((((.(((((((...........))))))).))}}})).,))))}}}},,,,.,,{,.{{{,..,,||||.{||||{(,,,({{{{.{{{||...{{{{{{||,.{(((..((({.{(({,.,((((((((((((({......}))}|)))}|||||||||...|||)..))),.,).))},.}))).,.,}))),.))))),,|))||}}.}}}}},,|{(((......))))|||||,,,,,,}|||}})),||,.,},...(((((((((.(...(((,({(({(.(((((((....))))))}.}}},.,..,,,..,,}}.)))...).))))))))).))))))).}....))))))).{{{{..,,..}})}.(((((((.,...((((......))))..,))))))){{{{(.....}}}}}..{{{((((((((...(((((((.(((.((((((....)))))).))).)))))))..,))))))))...{(((..((((..(((((.((..(((((((.(((((((((.((((.(......))).)).)))..})))))...))))))).)))))))..))))...))))))}})))).)))))))))......((((((......))))))((((......))))........)))))).)))))).....},},||||}},({({(((({{,..,.{{{|,,}.,,......({{.,,...})).(((((......)))))...}))),}}}}),,}}}}}|||,.,(((((.((((((({....))))).))).)))))..{((((...(({.((((((,((.(((((...))))).)))))))).)))...}}}}}.(((((((((({......).))).)}})))))..((((((.{....(((({......),))))......}.)))))))))))))))))))))))..))))))))}....{((((((......,,.))))))})))},))))))}|{.(((((((((((((((............(((({.{((((((....,.((((((.,{{{..(((...((((((...}}})))},)})})},{{{|{{.,,....,}})))}(((((((((,..((((((....)))))).....,},...,}))))).))))).)))....)))))},})))))............)))))))..(((((((((..({....))..))))),...,)))...{((.....))),,.......)))))))).)}})))).))))}.................
Back