Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032836.3
Sequence Length
2645 nt
GC Content
0.6631
GACGCUGCCCCCGCUGCCCAAAAUGUCGGCGCCCAGAGGGAGGUAGAGAGCCCCCACAUACCACUGUAUUCCCCGCCACCAUGGAUGACGUCCCCGCCCCAACCCCUGCACCAGCACCGCCCGCCGCUGCCGCCCCCAGGGUCCCGUUUCACUGCAGUGAAUGUGGCAAGAGCUUCCGCUACCGCUCAGACCUGCGGCGCCACUUUGCCCGGCACACAGCGCUCAAGCCCCACGCAUGUCCGCGCUGCGGCAAGGGUUUCAAGCACAGCUUCAACCUAGCCAACCACCUGCGCUCGCACACCGGGGAGCGGCCCUACCGCUGCUCUGCCUGCCCCAAGGGGUUCCGCGACUCCACCGGCCUGCUGCACCACCAGGUCGUCCACACUGGUGAGAAACCCUACUGCUGCCUGGUCUGCGAGCUCCGCUUCUCCUCACGCUCCAGCCUGGGCCGCCACCUCAAGCGCCAGCACCGUGGGGUUCUCCCCUCUCCCCUGCAGCCCGGCCCUGGCCUGCCCGCCUUGAGUGCGCCCUGCUCCGUCUGCUGCAAUGUGGGGCCCUGCUCGGUGUGCGGGGGCUCAGGGGCCGGCGGCGGAGAGGGCCCCGAGGGGGCAGGCGCGGGUCUGGGCAGCUGGGGGCUGGCAGAGGCGGCAGCUGCGGCCGCGGCCUCCUUGCCCCCAUUUGCGUGCGGCGCCUGCGCGCGGCGCUUCGACCACGGCCGCGAGCUGGCGGCCCACUGGGCGGCGCACACCGACGUGAAGCCCUUCAAGUGCCCGCGCUGCGAGCGCGACUUCAACGCGCCCGCGCUGCUGGAGCGGCACAAGCUGACGCACGACCUGCAGGGCCCGGGCGCGCCCCCAGCGCAGGCCUGGGCCGCGGGGCCAGGCGCAGGGCCCGAGACGGCGGGCGAAGGCACCGCUGCGGAGGCGGGCGACGCUCCUCUGGCUUCGGACCGCAGGCUGCUCCUGGGCCCCGCGGGGGGCGGCGUGCCCAAGCUCGGGGGGCUGCUCCCCGAGGGCGGUGGGGAGGCGCCUGCACCUGCGGCGGCCGCCGAGCCCUCGGAAGACACCCUGUACCAGUGCGACUGCGGGACCUUCUUUGCGUCGGCCGCGGCCCUGGCCAGUCACCUGGAGGCCCACUCGGGCCCGGCCACCUACGGCUGCGGCCACUGCGGGGCUCUGUACGCGGCGCUGGCCGCCUUGGAGGAGCACCGGCGGGUCAGCCACGGUGAGGGCGGCGGGGAGGAGGCGGCGACCGCCGCCCGGGAAAGGGAACCGGCGUCCGGGGAACCCCCGUCUGGCUCCGGCCGCGGCAAGAAGAUCUUCGGCUGCUCCGAGUGCGAGAAGCUGUUCCGCUCACCGCGAGACCUGGAGCGGCACGUGCUGGUGCACACUGGCGAGAAGCCGUUCCCGUGCCUGGAGUGCGGCAAGUUCUUCCGCCACGAGUGCUACCUCAAGCGCCACCGGCUGCUGCACGGCACCGAGCGGCCCUUCCCUUGCCACAUCUGCGGCAAGGGCUUCAUCACGCUCAGCAACCUCUCCAGGCACCUGAAGCUGCACCGGGGCAUGGACUGACUGCCAGGCUGCGUGCGCCCUGCCCUCCACCCAGCCUCCUGGACUCGGCCUGGACCAGGGGACCUCGGGACUGCGCGUGAGGCCCCGGCCCUCCAAAUCCAAAUCCAGACGCAGGCCCUGAAAUGAGGGGACCCUGACUGGAGAGGUGGGGGCCACCAAAAACCCACAAAGGCCCCGGAGCUGGGGGACCACAAACAAACAGGGUCCUUAGCUGGGGCAGGGGAGCCCAAAUCUAGGGAGAGACUCCUGAGCCUGAGGUCCCUGGAAUGAGUGUGGGUAGCCGUAAGUCCCCAAGACAUGGGGACUUUGCAGUGAGCAAUGGGUCUCCACAAGUACCUCUCAUCUUGAGAGCCCUAAUACUAAAAGAUGGGCACCCACCCCCACCAAGGGAAGACUGCCCCAUUCCCUGAGAGCCAUCAUUCCUAACGACCUUGAUCUGGAGAAUGUGGAGGGAGCAUGUCCCUGAAUUUUCCUAGAUCCCUCCAAAUGCCACCCACCAGAGUCACUGGUGACCCCAGAAAAUGGAUAUAGCCGAAAUCUGCCUUUCCCCUUUUUCAUUCCCUGUGCUGAAAGAGGGACCAGGGUAGAUGCCCCCUGCCCUCGAAUCCCCCCUCCCCGACUGUGGAAUGGAUCGACCCUAACGAUCUUCCCCGCCCCAAACACUAGAAUAGACUGGCCUGAAAUCCCCUUGCCCAGUAGAAUGGACUGAUCUAUGUGCACACACCCCCAUCACAUGGAAUGGGCUGGUCUAGGCUGUGGCCUGCCACCUUCCUUAGAGUGAAUAGGGCGGACACUCCUCUCUUUUCCUGUAGCGUGUGGACCGGUCCACGCAAUUCUUUAUCCUGUGAACUCAUCUGAGUGGGAGGUGGUGGACACUGGGGUUUCCUUCCCUCUCUCCGUAGCAUCCGUUGGUCUUUCUCUCCAUCUCUGUUGGUUUGUCUGUCUCUGUCUUCCUCCCAAUCCCUAGGGGAAGGGGGCAUUUGGCUAGGGGGUGCCCCUGUGAGCCUCGACCUUGCCCCCUCGUCCCUCUCCCCAGUGUUUCCAGGACCCCCAAUAAACCUUGUCCUGUCAGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1232.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1272.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 673.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((((((((.......(((.((((((.(((.(((.....))))))........((((..(((..((((....(((.(.((((((((((((......(((....))).(((((((((((...((((((..(((((((((((((....))))).(((((...(((....))).((((........)))).)))))..((((((((.....(((..((.((.....)).))..))))))).))))((((((((((((...))))......(((((......)).))).(((..((((((((((((......))))))))((..((((....))))...)).......))))..))).....((((((((.....)).)))))).))))))))....((((..((((((((...((.((((.......(((((((((.((((((((((......(((((.((((.((((((....))))........((.(((((((((..((((((((.(((((.(.(.(((((.(((((.((((((...(.((((.((((((.......)))))).)))).)...)))))))))))))))))))))))))))))))..))).)))))).))(((((((.((..(((((.((.((....)).)).))))))).)))))))...)))))))))))..((.((((((............)))))).))))))))))))..((((..(((........)))..))))....((((....))))(((.(((((.......))))).)))...)))))))))....)))).)))))).)))).))))(((((((((((((.....))))..))))))))))))))))).))....))))...)).)))))))))...(((....))))).)))))).))))))))..))))...)))..)))).......)))))).)))(((((((((((.(.(((......))).)))))))))))).))))))))))).((((.((((.......)))).))))........((((((((....((((.((.((..((((((((((......).)))((((((((((.(((((.........(.(((((....))))))))))).....)))))))))).)))))).)).))))))(((((....)))))...(((((((.((((((((((..((.((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).(((((((((..((((.((((((((...)))))...))).))))....((((....(((.(((((((((((((.((((....(((((((.(((.....))).)))..((((((((.(.(((((((....))))))).)..)))))))).(((((((((((((((((.........(((....(((((......)))))....))))))))))).((...(((((......((((((((.(....).))))))))........))))).))......)))))))))....)))))))))))))).((((((.(((((..((((((..((.....))..(((.((((((.(((.((....(((((((....((((.(((((.(......).)))))))))(((((.(((...((...(((((...((((((((......))))...)))).)))))..)))))))))).........))....)))))))))))))))))))(((((..((..(((((.((((((((.(((.((.....(((.......))).....))))).)).)))))).)))))...))..)))))))))))..(((((((((.....))))))))).))))).))..((((.((((..........(((((...)))))((((..............))))..............((((((..........)))))))))).))))................((((((((((((....(((((.....)))))..))))))).)))))..)))).........((((((.....))))))...(((.....)))....))))))))))))))....)))))))))..(((((.(......).)))))..(((((((.......))))))).........)))))))).))).(((..((((((.......)))))))))..((((((..(((.((..(((((((((((.............(((......))).....((((((((.............))))))))..)))))))))))..)))))..(((((((((((((((.((.(((.((((.(((...))).)))).))))).))).(((((((....))))))).................((((....))))))))))))))))....))))))......)))))...)))).)))))))))))).)))))))(((.......)))............))))))))............(((((((((((((...(((((((((...)))))...)))).......))))))))..))))).....)))))))..((((((..............))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((....{((((,{......}.}))))....((((((((((((((,.....(((.(((({.{........{,,({{({(((((.(,((((((((.....((((.((((.((...((((((((.(((.,((((((((((((((({((((....))))}.(((((...(((....))).((((........)))).))}})..{{{{{|||...{(((({.((.((.....)).))...)))))).|||,{(((((,.((((...)))).,}}}}.}}}.....,{((((.{(((((...((((((((((......)))))))}(((((((((.,(((|{({{{{.,......(((((((.{{...}}.))))))).......},))).))},))))....((((..((((((((...((.((((.......(((((((((.((((((((((.,,,..(((((.((({,(.((((....)))).,.,,,,.((.(((((((((..((((((((.(((((.(.(.(((((.(((((.(((((({..(.((((.((((((.......)))))).)))).).}.)))))))))))))))))))))))))))))))..))).)))))).)),||||{{.((,.(((((.((.((....)).)).)))))},.)))}}}}...}|)))))))))..|{.{(((((...........,)))))),))))))))))))..(,((((,((((......|||..,,,..,,..}})))))){|,(((.(((((.......))))).)))),.)))))))))}...}))).)))))).)))).))))(((((((((((((.....))))..)))))))))..))))}})))){(((((,...,,.|||,{(((...{((.{((((((((.,(((({{{.||{{{{{{|||{{,.||...((({(({,(((((.{,||,,.|{|||||||||.|,|||...,,.)))|}))}}))))))),))},},,)))))),)))))))..))))))))),,)))..}}})))),..,...}))))}.}}.)))))).)))))|,,,......}.||,((((((((((.(((((,,....,,,|.(((((....))))),))))}.....)))))))))).},))))))))))}...(((((....))))),.,)},||.))}.)))))))}..}|...))))}))).)))))))},|.((((((....)))))){((((.((((({{(((...}|||(({{{|||,{{,,(((..,,)}}((((,..(((((({{{(((((((((((.((((,...,(((((({((({{...},),),,.,||||||||.{{((({(({|||,,}||||}.,..)))}|||}.(((((((((((((((({.........{{{..,.(((((......))))),...)))})))))))|||.,.(((((,.....((((((((.{....}.))))))))........))))).},...,..)))))))))..,,}})))))))))|||,{((,{{.,{{{|}|((((({{.{{,,..,}),,({{.((((({,(((.((....((((({{....((((.(((((.(......).)))))))))(((((.(((..,({...(((((...((((((((......))))...)))).))))),,}})))))))).........}}....})))))))))))))))|||(({({..,,..{{{||,||{{{{{{,(((,((,,,.,({{.......|||,,...))))).)),,))|||,|}}}|,,,||,.}|||||}}}}},,(((((((((.....))))))))},)),}}.,)},{(((.((((....,{...((((({...})))))..,...........{{{{|{||..|..{{{.....,|||,,,..}},,},,)),,,,)})}.))}),,,}},....},,,,.((((((((((((....(((((.....)))))..))))))).)))))..,,,...,,,,...((((((.....))))))...(((.....)))....,))))},(((((((({..((((((((((........,.))))))))))...}))))))))||.,,,}))}}|{{,.{{{..,,|||,|....}.))}..}|||||}......,))))))).)))),,,...(((.((..(((((((((((.............{((,,....})).,.,.((((((((.............))))))))..)))))))))))..))))),.({(((((((((({((.((.(((.((((.(((...))).)))).))))).))}.(((((((....)))))))...............},((((....)))))))))))))))).}.,.)))))}}},}))))).)).))),.,))))))))))).........,,.....}.}))).)))...))))))))))))))..........(((((((((((((...(((((((((...)))))...))))..,....))))))))..))))}.....)))))))..((((((..............))))))......
Back