Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032927.4
Sequence Length
1748 nt
GC Content
0.4222
GCAUUUCGGGGCGGUACCAAGAUGGACUCCUCGCGGGCCCGGCAGCAGCUCCGGCGGCGAUUCCUCCUCCUGCCGGACGCCGAGGCCCAGCUGGACCGCGAGGGUGACGCCGGGCCGGGUGAGGCGCGCACCAAGCCGCCCCGAGGUUCUCAGAGGCGAGGCGUCGGAAAACGGCCGGCCUCCGGCAGCCCUGGCCCAGUCUGGAAGGACUGAGUUUCGGCUUUGCAAGUCGAAUAUUUAAUGUCAGGGAAGAUCCUUAGAAUCGCGGAGUGCUGUGCAUCGUCAUUUCAGCUGCGCUUCAGAAUUCUCUGGAGAGCUGAUUUGACACCUAUUUGGAAAUAGCGAUUAAAAUUAAAAAUACCCACCAGUUUUAAGUCUUAAGGAUUUACCAGAAACAUGCGUGUACCGCAGUGUACAAUGAUGUGCGCAGUGUUUCACUUCAGGAUUGCUUGUAAUAGCGAAUUACUGGAAAUAUCUGCCUUGCCCGUCAGCAGAAAGCUGUUUAAGUAAAUUUGGGUAUAUGUAUACCUGACACAUCAGGUCGACUCGUAUGUACCAAUGGGGAUGAUUUUCAAAGGGAAGUGUGGAACACUAUGGUAUGCCGCCAUUUGGGUACAAAACAGAAACCUCCACAGCUGUUGAGAAAAAGGAGAAACCUCUUCCAAGACUUAAUAUCCAUUCUGGAUUCUGGAUUUUGGCAUCCAUUGUUGUGACCUAUUAUGUUGACUUCUUUAAAACCCUUAAAGAAAACUUCCACACUAGCAGCUGGUUUCUCUGUGGCAGUGCCUUGUUGCUUGUCAGUUUAUCAAUUGCAUUUUACUGCAUAGUCUACCUGGAAUGGUAUUGUGGAAUUGGAGAAUAUGAUGUCAAGUAUCCAGCCUUGAUACCCAUUACCACUGCCUCCUUUAUUGCAGCAGGAAUUUGCUUCAACAUUGCUUUAUGGCAUGUGUGGUCGUUUUUCACUCCAUUGUUGUUGUUUACCCAGUUUAUGGGGGUUGUCAUGUUUAUCACACUCCUUGGAUGAUUUCCGAAGAGACAGGGUCUUCUAUGUUGCCCAGGCUGUCUUUGAACUCCUGGGAUCAAGUGAUCCUCCUGCCUCAGCCUUCGAAGUAGUUGGGACUACAGGCCCACGCCACCGUGCCUGGCUGGACAUGUAAAUUUGAAGUGAAUGGUUAAACAUCCAGCUAGCUGAAAGCAUGGCAGACCCUAACAGAAAAGCUACAGUGUGUUUUUGCAGCUAUGAAGUGAAUGGUUUCCUGGGGAAAAUUGUGACUUUGUAUAACUGUUGUUGAAACCAGAAUAAAUUAUAUUUCACUUGCAUAUGCAUAAAUUAUUAAAAUUUUCAGAAGUCAGUGAUACAGAAGUACUAUUUUGCAAUGUUAAUCUGUUUGAGUCUUUGGAGAAAGUGGUUUCAUUGUAGGUACAUAGUGCACUGUUAAUAUUUUAAACAAGUAGUUCACUCUUCCAUUUAAGGGAUAGCAGUUCCUUGUAUAAAAUGACUGGAUGUGUAUAAAGGAAUUAUGUUGUCAUGUGCCUUUAACCAGCUUUAGUAAUUACUAUAAUCUCAUAUUUAUGAUAGUUUUGUUAGGUGACAGGACCAAAUGAAAAUAUUUUAUGUUUUCUCAUCACUUUAGAUUUUAUCAUUAUGUACAUUACUGGGUUUUUAGCAUUUCCUAAUGUGAAGUUUUAAUCACUUUUAAGUAUACAUUUUUUUCUGUAUCAUUUAAAUAAAAUAUUUUUAUAACUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-504.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -542.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 603.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((.(((...)))....(((((((..(((((.((.((((((((((.((.......)))))))))).))....))...))))).)))))))((((.(((...(((......))))))))))..))))))))))((((((....(((((((((.((.....))(((((...)))))..(((((((.((((((....))))))...((((((((...))))))))........))))))).((((((((((((((((...((((...)))).((((..((((((...(((((((....)))))))))))))..)))).((.....)).....)))))).......(((((........))))).....))))))))))....(((((((..((((((..((........))..)))))).)))))))..(((((..(((((......)))))....)))))......))))))))).((((.((.(((((((((...((((((.(((((((((((..((((((....))))))..))....)))))))...((((((.((((....(((((.((((((...((.((((((.(((.(((((((((((...(((((((((..((((..((((((.((.(((((((.....(((....)))......(((((...))))).(((((((((((((((...((((.(..((............((((((((.....))))))))...(((((((.((.((.(((((....(((((.(((((...(((...(((.........)))..)))...))))))))))...))).))..)).)).)))))))..))).)))).))))))))).))))))......................))))))).)).))))))(((.....))).((((.(((....)))))))))))..)))))............))))...)))))))...)))).)))))))))))...))))))))))))))).))))))((((((..(((((((....(((.((((((.(((.(((((((...((((((((....)))))........)))..))))))))))))))).).)))(((....))).(((((((((((((((..(((.((((..........))))..))))))))))))......)))))).)))))))........((((((..((.(((((.(((((((((((((.(....(((((...)))))....).)))))))).....))))).)))))))..............(((((.((...((...(((((.....))))).))...)).))))).((((..((((((((((((((((..((((..(((...((....)).)))..)))).)))))))))...))))))).))))...............))))))..))))))((((((((((((....)))))))).....))))((((((..((..((((((...((((....))))..))))))..))..))))))..............)).))))))))))))))).)..).))))))))))..(((((((((((((((........(((......)))....................((((............))))..((((........))))..(((((((((((........))))).)))))))))))))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,((((((((((.{{,...||}.{.(((((({({((((((.,{.((((((((((.((.......)))))))))).)).|..||{{.||.}}.}}))}}))||{.,||}|}|||..,}},))})}})},,..))))))))))|{{(((..{.(((((((({.((.....))(((((...)))))..(((((((.((((((....))))))...((((((((...))))))))........))))))).(((((((((((,{((({{.,{{|,,,)}})}((((..((((((...(((((((....)))))))))))))..)))).((.....}}.....)}||||{{{{({.,,,,........,))))),,.}}})))))))))....(((((((,,((({{{,,({,,,,,,,.}}.,)))))).)))))))..(((((,{(((((......))))),},.)))))......})))))))),{{(({(,.{{{{|||{{.,,{{{,,,,{{(((((((({..((((((....))))))..}}.,,})))}})),,{{(((({.{{{{{{..{(((,{((((((,,.{{.(((({,.(((.(((((((((({,{,(((((((((..((((,.((((((,{,.,{{((((....,||||{{,{{{,|,,..(((({...})))).{{((({{{{{{{{{{,{,,{{{|{,,,,......|,,...((((((((.....))))))))...{((((((.((.((.({(((....(((({{(((((...{{{,{,{{(.........}}}..)))...})))))))))...))).)}..)).)).))))))}.,}},.}}},,))}}}))}|.}))))}.,,}|},,..,},..,|,,,,.}}}}}}}.},,}))}}){{,..,,,}}}.{((,{(((....))))}))))))..)))}}...,.....,}}}}})},.,)))))}...)))).))}||}))})},,.}))))))))}||||,.}}})))||,|||..{((((((.{{{(((,,(((({{(((.(((((({...{{((((((....)))))}.,,,...}})..})))))))))))))).}.}}}(({.,,,|}}..||}||{((((((((..{{(.,{{({......,,,,,}}..}}})))))))))},,..})))))),))))))}..{{{({{{((......},|}}})}}||||{{{|{{|||{|||||{{|{,|||,{{{{{.(({,{{{{{{{{.{{{{||.|{{{{{,,,.{{{{{.{{{,..,,,,,,|{|....))),}}.}}}}}.....})))}}.,,.}}|}.|}|||||,|}||.|}}}}||,,||,...}}}}}}}},,}}}}}}))}}|}|||}}|.,,,||,{{(({{{{{(((.((((((,{....}}}},,,,|}})}.)))}.,.((.....,)}(((((((((((((((((((..{(......}}.)))))}}})))))..}))))))))))}))).,)}}}},}}}|{{{,,,,|}}|,,..,,},,}}}}}||||||}}||.|..|,|}}}}})))}..((((((((({|||||,...}},..||,,,,.,}},.,,},}}},},}||.||}}}}|||}..,,,|,||,,}}}}}})|}|}},.,,}},,}),|{((((((((((........))))).)))))}}}}}}}}}}))))))......
Back