Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032952.3
Sequence Length
3195 nt
GC Content
0.6357
AGGGACCAGGCGGUUGCGGCGGCGACAGCCAUGGCCGGCGCGCUGGCAGGUCUGGCCGCGGGCUUGCAGGUCCCGCGGGUCGCGCCCAGCCCAGACUCGGACUCGGACACAGACUCGGAGGACCCGAGUCUCCGGCGCAGCGCGGGCGGCUUGCUCCGCUCGCAGGUCAUCCACAGCGGUCACUUCAUGGUGUCGUCGCCGCACAGCGACUCGCUGCCCCGGCGGCGCGACCAGGAGGGGUCCGUGGGGCCCUCCGACUUCGGGCCGCGCAGUAUCGACCCCACACUCACACGCCUCUUCGAGUGCUUGAGCCUGGCCUACAGUGGCAAGCUGGUGUCUCCCAAGUGGAAGAAUUUCAAAGGCCUCAAGCUGCUCUGCAGAGACAAGAUCCGCCUGAACAACGCCAUCUGGAGGGCCUGGUAUAUCCAGUAUGUGAAGCGGAGGAAGAGCCCCGUGUGUGGCUUCGUGACCCCCCUGCAGGGGCCUGAGGCUGAUGCGCACCGGAAGCCGGAGGCCGUGGUCCUGGAGGGGAACUACUGGAAGCGGCGCAUCGAGGUGGUGAUGCGGGAAUACCACAAGUGGCGCAUCUACUACAAGAAGCGGCUCCGUAAGCCCAGCAGGGAAGAUGACCUCCUGGCCCCUAAGCAGGCGGAAGGCAGGUGGCCGCCGCCGGAGCAAUGGUGCAAACAGCUCUUCUCCAGUGUGGUCCCCGUGCUGCUGGGGGACCCAGAGGAGGAGCCGGGUGGGCGGCAGCUCCUGGACCUCAAUUGCUUUUUGUCCGACAUCUCAGACACUCUCUUCACCAUGACUCAGUCCGGCCCUUCGCCCCUGCAGCUGCCGCCUGAGGAUGCCUACGUCGGCAAUGCUGACAUGAUCCAGCCGGACCUGACGCCACUGCAGCCAAGCCUGGAUGACUUCAUGGACAUCUCAGAUUUCUUUACCAACUCCCGCCUCCCACAGCCGCCCAUGCCUUCAAACUUCCCAGAGCCCCCCAGCUUCAGCCCCGUGGUUGACUCCCUCUUCAGCAGUGGGACCCUGGGCCCAGAGGUGCCCCCGGCUUCCUCGGCCAUGACCCACCUCUCUGGACACAGCCGUCUGCAGGCUCGGAACAGCUGCCCUGGCCCCUUGGACUCCAGCGCCUUCCUGAGUUCUGAUUUCCUCCUUCCUGAAGACCCCAAGCCCCGGCUCCCACCCCCUCCUGUACCCCCACCUCUGCUGCAUUACCCUCCCCCUGCCAAGGUGCCAGGCCUGGAGCCCUGCCCCCCACCUCCCUUCCCUCCCAUGGCACCACCCACUGCUUUGCUGCAGGAAGAGCCUCUCUUCUCUCCCAGGUUUCCCUUCCCCACCGUCCCUCCUGCCCCAGGAGUGUCUCCGCUGCCUGCUCCUGCAGCCUUCCCACCCACCCCACAGUCUGUCCCCAGCCCAGCCCCCACCCCCUUCCCCAUAGAGCUUCUACCCUUGGGGUAUUCGGAGCCUGCCUUUGGGCCUUGCUUCUCCAUGCCCAGAGGCAAGCCCCCCGCCCCAUCCCCUAGGGGACAGAAAGCCAGCCCCCCUACCUUAGCCCCUGCCACUGCCAGUCCCCCCACCACUGCGGGGAGCAACAACCCCUGCCUCACACAGCUGCUCACAGCAGCUAAGCCGGAGCAAGCCCUGGAGCCACCACUUGUAUCCAGCACCCUCCUCCGGUCCCCAGGGUCCCCGCAGGAGACAGUCCCUGAAUUCCCCUGCACAUUCCUUCCCCCGACCCCGGCCCCUACACCGCCCCGGCCACCUCCAGGCCCGGCCACAUUGGCCCCUUCCAGGCCCCUGCUUGUCCCCAAAGCGGAGCGGCUCUCACCCCCAGCGCCCAGCGGCAGUGAACGGCGGCUGUCAGGGGACCUCAGCUCCAUGCCAGGCCCUGGGACUCUGAGCGUCCGUGUCUCUCCCCCGCAACCCAUCCUCAGCCGGGGCCGUCCAGACAGCAACAAGACCGAGAACCGGCGUAUCACACACAUCUCCGCGGAGCAGAAGCGGCGCUUCAACAUCAAGCUGGGGUUUGACACCCUUCAUGGGCUCGUGAGCACACUCAGUGCCCAGCCCAGCCUCAAGGAGCGUGCGGGCUUGCAGGAGGAGGCCCAGCAGCUGCGGGAUGAGAUUGAGGAGCUCAAUGCCGCCAUUAACCUGUGCCAGCAGCAGCUGCCCGCCACAGGGGUACCCAUCACACACCAGCGUUUUGACCAGAUGCGAGACAUGUUUGAUGACUACGUCCGAACCCGUACGCUGCACAACUGGAAGUUCUGGGUGUUCAGCAUCCUCAUCCGGCCUCUGUUUGAGUCCUUCAACGGGAUGGUGUCCACGGCAAGUGUGCACACCCUCCGCCAGACCUCACUGGCCUGGCUGGACCAGUACUGCUCUCUGCCCGCUCUCCGGCCAACUGUCCUGAACUCCCUACGCCAGCUGGGCACAUCUACCAGUAUCCUGACCGACCCGGGCCGCAUCCCUGAGCAAGCCACACGGGCAGUCACAGAGGGCACCCUUGGCAAACCUUUAUAGUCCUGGCCAGACCCUGCUGCUCACUCAGCUGCCCUGGGGGCUGCUUUCCCUGGGCACGGGCUCCAGGGAUCAUCUCUGGGCACUCCCUUCCUGCCCCAGGCCCUGGCUCUGCCCUUCCCUGGGGGGUGGAGCAGGGUCCAGGUUUCACACUUGCCACCUCCUGGAGGUCAAGAAGAGCAGAGUCCCCGUCCCUGCUCUGCCACUGUGCUCCAGCACCGUGACCUUGGGUGACUCGUCCGCUGUCUUUGGACCGCUGUGUUUCAAUCUGCAAAAUGGGGAUGGGGAAGGUUCAAUCAGCAGAUGACCCCCAGGCCUUGGCAGCUGUGACAUUGGGGGCCUAGGCUGGCAACUCCGGGGGCUCAACGGUGGAAAGAGGAGGAUGCUGUUUCUCUGUCACCUCCACUUGCUCCCCGACAGGUGGGGCACAGACCUCUGUUCCUGAGCAGAGAAGCAGAAAAGGAGGUUCCCUCUCUCUGCUCCUUCACUGCUGACCCAGAGGGGCUGCAGGAUGGUUUCCCCUGGGAGAGGCCAGGAGGGCCUGAUCCCAGGAGACACCAGGGCCAGAGUGACCACAGCAGGGCAGGCAUCAUGUGUGUGUGUGUGUGUGGAUGUGUGUGUGUGGGUUUUGUAAAGAAUUCUUGACCAAUAAAAGCAAAAACUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1310.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1366.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 640.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((....)))(((((((((((((.((((((..(((.(((((...((..(((((((((((..(((((((((.((.((.(((((......((((((((.(((.((.......)).)))...))))))))..))))).)).)))).)))))))...)))))).))))).)).))))))))...)))))))))))))))))))(((((...))))).))).(((((.(((...((((((.((....)).))))))....))).)))))(((((......(((((((.(((((..((((.(((((((((((((((.(((......)))....(((..(((.((....)).)))...))).))).))))))).)))).).)))).....((((((....((((((((((..((((((.((((.....))))...(((.((((((((.........(((((((((((((.(.((((......))))).)))))))...)))))).((.((((((.(((..(((..((((.((((..((...(((((.((.((((.(.((((((((.((((((........((((((((.(((......))).))((.((((.....((((.(((........))).))))..(((...(((((((.(((((((.(((....((((((...((((((.........(((((((..((.(((((((.........)))))))))..)))))))(((((..(((....))))))))...............((((.((....)).)))).......)))))).......)))))).....))))))))..)).)))))))))).((((......))))..((((........))))))))))....))))))((......))(((((((.((....)).)))).)))..............)))))).)).....))))))))))))).....))))).))..))))))))..((((((....)))))).....(((((((..(((((...(..((((..((((.(((...)))..))))))))..).)))))......((((......)))).(((((((((((..((((....((((....)).)).))))...)))).))).))))............)))))))..))).))))))))).))...................)))))))).)))..)))))).........(((((((((...((((..................))))...)).))))))).....(((((((((((..(((((((...))))))).....(((....)))........(((.(((..((((((((((((....)))).)))).((((((((((..........((((((...(((((.((((((..(((((((.......(((((((((...))))....))))).....((.((.(((((((((((..((......)).))))))))))).))))(((((.(((((((((((((((..((((((.(((((((........(((((((..((((((.((.((((((....)).)))).))...((((((.((.......(((((((...)))))))..(((((((......(((((..((.....))..))))).......))))))).(((((((.((..(((((((.......((((..(((((((.(((.........(((....)))........(((((..((((.......)))).(((((...))))).......(((((((((((.......)))))).).)))).((((..((.((.....))))..))))..))))).))))))))))..)))))))).)))..))))))))).....(((((.((((.(((((((..((.............(((((..(((((.............)).)).)..)))))................)).)))).))).))))))))).........)).))))))......((((..((((((.(.(.((((.....)))))))))))).....))))..((((..(((((((.((.((((((((.(((((((((((..(..((((((...))))))..)........(((((((..((((...))))..).)))))).(((..(((((.((((..((((((.....))))))..)...))).)))))..))).......)))))).)))))....((((..((...(((.((((((...........((.(((.....))).)).......(((.(((((.((((.....)))).))))).)))(((((......))))).((((((((..(((...((.....))..))).))))))))......)))))).))).)).))))((((.........))))...............)))))...)))))..))))))).))))))))))..))).))))....(((((....((....)).....))))).....((((......))))......)))))))))))))...(((((.((((..(((((......((((((((.........)).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))........(((((.((((((...(((((.((((.....((((....((((((((((((...((((((.(((.(((((((.((.(((...((....)).))))).)))...)))).))).))).........)))...))))))))))))..)))).(((....))))))).)))))...)))))).)))))...)))))))...)))))).......((((((.....(((((..(((((((.......))))))).))))).......)))))).)))))))))))......((((((....(.(((((.((((((((...(((((...))))).))))))...)).))))).)..))))))))))))))))((((.((.(((((((.(((((.....)))))..))))))).)).))))))))..))).)))..))))))))))).....))).)))).)))....))))))))))).)))))))((((((......................))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((({((....}}|(((((((((((({,((((((..(((.(((((...((..(((((((((((..(((((((((,((.{(.(((((..{...((((((((.(((.((.......)).)))...))))))))..))))).}),)))).)))))))...)))))).))))).)).))))))))...))))))))))))))))))}(((((...))))).))}.(((((.(((...(((((({(((...)))))))))....))).)))))(((((...,..(((((((.(((((,.((((.{((((((((((((((.(((......)))...,{({..{{{.||....}|,|},..,}),.)))}})))))).)))).).)))).....((((((....(({{((((((..((((((.((((.....))))...{{(,(({(((((..{.{,.,,({(({(((({(({.(.(({{...,,,||||,.,||||}|,{{|||||,.((.((((((.(((.{.((((,,((((((({{((.{.(((({.(((((,{.(,((((((((,(((({{........{({(((({,|{{......}}}.||(((({{,..,|||{{(,(((,.......}}},)}|||,,,,..,(((((((,{((((((,(((.,..(({((((..{(((((,.....{{,(((((((..((.(((((((.........)))))))))..))))))){((((,,(((,,,,|}}}}}||.,.......,.....{(((.({....}).)))}.......}}}}}},.,,,.,}}}|||.....)))}}})},,}},)))))}}|||,,|||...{{{|||,..))}},}..,,,,|}}}}))},}}}.}))))))||.,....))(((((((.({....)).)))).)))..............)))))).}).,...)))))),,)))}},,...,,,||{||,{||||,|,|{{((((((....))))))......,,.,||,.|{|||...|.|(({(.,((((,({,...|||,.}},}))))..}.,}))),.,,,||}.,...},})}}}}|,}}}|||||.,,|}}|}}}}||||,...)).}}},}))))})))).)))))),......,.}),,}).,..)))),,..))))))))),),..........|........}}}}))),})))},})))))}}}|||...||{||||{|,.,||{|,..,,.......,)}}},}}))}}}).,))))}}}.....(((((((((((..(((((((...))))))}.....,((....,},........(((.(((..((((((((((((....)))).)))).((((((((((...{{(((..((((.,,{{.{({..((((((.{(((((((.,,....(((((,{(,,..,}}}..,.))))).....)).((.(((((((((((..((......)).))))))))))).))|{((,((.(((((((((((((((..((((({,(((((((........(((((((..((((((.{((((({({....}).)))),,|...{(((((.((.......(((((((...)))))))..(((((((...{..(((((..{{.....})..))))).......))))))).(((((((,({..(((((((.......((((..(((((((.(({.........(((....)))........(((((..((((.......)))).(((({...})))).......(((((((((((.......)))))).).)))).((((..((.((.....))))..))))..))))).))))))))))..)))))))).)))..)))))))))....{(((((.((((.(((((((.,,(,............(((((..(((((..,.......,..))},).)..))))),,...............),)))).))).))))))))}}}.......)).)))))},}....((((..((((((.{.(.((((.....)))))))))))).....))))..((((..(((((((.((,{(,(((((.(((((((((((.{{.{((((((..,|}}}}},,,..,.....(((((((,.((((...))))..),}))))).(((..(((((.(((,..((((((.....))))))..}...))).)))))..))),,,....)))))).)))))....((((..{{...(((.((((((.,..{{,,..,((.{{|,,..,))).}}.......(((.(((((.((((.....)))).))))).)))(((((......))))).((((((((..(((...((.....))..))).))))))))...,..)))))).))).}}.)))){{((.........))))..........,....)))))...)))})..))))))).))))))))))..))).))))....{((((....({....}).....))))).....(({(,.....}))).},...)))))))))))))...(((((.((({.,(((((......((((((((.........)))))})))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))....,||.(((((.((((((...(((((.(((({....((((....((((((((((({...((((((.((((....)))).|}},,...(({{{{,.{|,|,{{.{{{..,,))},)).)))..,}..,,.)))...,)))))))))))..)))).,{{....}}))))).)))))...)))))).)))))...))))))).}.)))))),,)),..|)))|......}|}||..,{.(((((..{{...,,,,},}},,))))).}}|{{{|||{,...)),))))},....((((((....{.(((((,({((((((...(((((...))))).)))))).,}}}.))))).}..))))))))))))))))((((.((.(((((((.(((((.....)))))..))))))).)).))))))))..))).)))..)))))))))))||{...,),)}))}))).,}.))))))))))).))))))),|{{({.,{{....}}}...........,,,,..))))).
Back