Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032960.4
Sequence Length
3091 nt
GC Content
0.5888
GUGACGCGGCCGCCGGCCCGGGGCUGGGUACAUUGUCGCGCGGCCGCUUCCCCCCGGCCGGGCCCCCGCCGCCCCGCGGUCCCCAGAGCGCCAGGCCCCCGGGGGGAGGGAGGGAGGGCGCCGGGCCGGUGGGAGCCAGCGGCGCGCGGUGGGACCCACGGAGCCCCGCGACCCGCCGAGCCUGGAGCCGGGCCGGGUCGGGGAAGCCGGCUCCAGCCCGGAGCGAACUUCGCAGCCCGUCGGGGGGCGGCGGGGAGGGGGCCCGGAGCCGGAGGAGGGGGCGGCCGCGGGCACCCCCGCCUGUGCCCCGGCGUCCCCGGGCACCAUGCUGUCCAACUCCCAGGGCCAGAGCCCGCCGGUGCCGUUCCCCGCCCCGGCCCCGCCGCCGCAGCCCCCCACCCCUGCCCUGCCGCACCCCCCGGCGCAGCCGCCGCCGCCGCCCCCGCAGCAGUUCCCGCAGUUCCACGUCAAGUCCGGCCUGCAGAUCAAGAAGAACGCCAUCAUCGAUGACUACAAGGUCACCAGCCAGGUCCUGGGGCUGGGCAUCAACGGCAAAGUUUUGCAGAUCUUCAACAAGAGGACCCAGGAGAAAUUCGCCCUCAAAAUGCUUCAGGACUGCCCCAAGGCCCGCAGGGAGGUGGAGCUGCACUGGCGGGCCUCCCAGUGCCCGCACAUCGUACGGAUCGUGGAUGUGUACGAGAAUCUGUACGCAGGGAGGAAGUGCCUGCUGAUUGUCAUGGAAUGUUUGGACGGUGGAGAACUCUUUAGCCGAAUCCAGGAUCGAGGAGACCAGGCAUUCACAGAAAGAGAAGCAUCCGAAAUCAUGAAGAGCAUCGGUGAGGCCAUCCAGUAUCUGCAUUCAAUCAACAUUGCCCAUCGGGAUGUCAAGCCUGAGAAUCUCUUAUACACCUCCAAAAGGCCCAACGCCAUCCUGAAACUCACUGACUUUGGCUUUGCCAAGGAAACCACCAGCCACAACUCUUUGACCACUCCUUGUUAUACACCGUACUAUGUGGCUCCAGAAGUGCUGGGUCCAGAGAAGUAUGACAAGUCCUGUGACAUGUGGUCCCUGGGUGUCAUCAUGUACAUCCUGCUGUGUGGGUAUCCCCCCUUCUACUCCAACCACGGCCUUGCCAUCUCUCCGGGCAUGAAGACUCGCAUCCGAAUGGGCCAGUAUGAAUUUCCCAACCCAGAAUGGUCAGAAGUAUCAGAGGAAGUGAAGAUGCUCAUUCGGAAUCUGCUGAAAACAGAGCCCACCCAGAGAAUGACCAUCACCGAGUUUAUGAACCACCCUUGGAUCAUGCAAUCAACAAAGGUCCCUCAAACCCCACUGCACACCAGCCGGGUCCUGAAGGAGGACAAGGAGCGGUGGGAGGAUGUCAAGGAGGAGAUGACCAGUGCCUUGGCCACAAUGCGCGUUGACUACGAGCAGAUCAAGAUAAAAAAGAUUGAAGAUGCAUCCAACCCUCUGCUGCUGAAGAGGCGGAAGAAAGCUCGGGCCCUGGAGGCUGCGGCUCUGGCCCACUGAGCCACCGCGCCCUCCUGCCCACGGGAGGACAAGCAAUAACUCUCUACAGGAAUAUAUUUUUUAAACGAAGAGACAGAACUGUCCACAUCUGCCUCCUCUCCUCCUCAGCUGCAUGGAGCCUGGAACUGCAUCAGUGACUGAAUUCUGCCUUGGUUCUGGCCACCCCAGAGUGGGAGAGGCUGGGAGGUUGGGAGGCUGUGGAGAGAAGUGAGCAAGGUGCUCUUGAACCUGUGCUCAUUUUGCAAUUUUAUCAGUAAUUUGACUUAGAGUUUUUACGAAACCUCUUUUGUUGUCCUUGCCCCACUCCUCUCCACCAGACGCCUUCCUCUCUGGAUACUGCAAAGGCUUGUGGUUUGUUAGAGGGUAUUUGUGGAAACUGUCAUAGGGAUUGUCCCUGUGUUGUCCCAUCUGCCCUCCCUGUUUCUCCACAACAGCCUGGGGUUGUCCCCGCUGGCUCACGCGUUCUGGGAGCUCAAGGCCACCUUGGAGGAGGAUGCCACGCACUUCCUCUCUCGGAGCCCUCAGACAUCUCCAGUGUGCCAGACAAAUAGGAGUGAGUGUAUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGCACACGUGUGUAUGAGUGCGCAGAUCUGUGCCUGGGAUCGUGCAUUUGAGGGGCCAGGGGCAGGCAGGGCUGCAGAGGGAGACGGCCCUGCUGGGGCUUAGGAACCUUCUCCCUUCUUGGGUCUGCCCUGCCCAUACUGAGCCUGCCAAAGUGCCUGGGAAGCCCACCCAGAUUCUGAAACAGGCCCUCUGUGGCCUGUCUCUAUUAGCUGGGUUCCGGGAGGCAGAGAGGAGUGACCGGGCACUGGCACUGCGAUCAGGAAGACUGGACCCCCAGCCCCCAGGGCCCCCCUCCCCCCACUUAGUGCUGGUCCUAGGUCCUCUGAGGCACUCAUCUACUGAAUGACCUCUCUACUUCCCCUUCUUGCCAUUAUUAACCCAUUUUUGUUUAUUUUCCUUAAAUUUUUAGCCAUUUCUCCAUGGGCCACCGCCCAGCUCAUGUAGGUGAGCCUGGGCAGCUUCUGUUGGCAGAGCUUUUGCAUUUCCUGUGUUUGUCCUGGGUUCUGGGGCAUCAGCCAGCUACCCCUUGUGGGCAAAGGCAGGGCCACUUUUGAAGUCUUCCCUCAGAUUUCCAUUGUGUGGCCUGGUGGGUCAGGGGGAGUCUUUGCACCAAAGAUGUCCUGACUUUGCCCCCUUGCCCAUCAGCCAUUUGCCAUCACCCCAAACAACUCAGCUUCGGGGCCGGUGAGGGGAGGGGCCUCCCCCAGCACAGAUGAGGAGCAGCUGGGGUAGGCUGUCUGUGCCAUGGCCCCCCACUCCCCCUUCCCUUGGAGGGAGAGGUGGCAGGAAUACUUCACCUUUCCUCUCCCUCAGGGGCAGGUGGUGGAGGGGCGCCCAGGGUCGUCUUUGUGUAUGGGGGAAGGCGCUGGGUGCCUGCAGCGCCUCCCUUGUCUCAGAUGGUGUGUCCAGCACUCGAUUGUUGUAAACUGUUGUUUUGUAUGAGCGAAAUUGUCUUUACUAAACAGAUUUAAUAGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1285.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1339.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 921.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((((((((((((((((((((...(((..(((((.(((((((((.((((((.(((.(((.((..(((....(((((.(.((.....)).)..)))))..)))..)).))).))).)))))).))))...))))))))))(((((..((((.((((.(((.(((((((....(((((....)))))))))))))))..((.(((.(((...((((((((.(((((..(((((..(((((((.((((.(..((((((.((.((.((.((((((((((.(((.((((((........)))))))))))))))).((((((..((.............((((....)))))).))))))..))))))))).))))))..).)))).)))))))..((((((.((((.((......(((((..((....))))))).....)).)))).....((((((((((.((......(((((((((.((..((((...........((((((((....)))))((.....))(((((((((((........)))).............(((((.....)))))))))))).....)))...........))))..))))))....)))))......)).))))))))))..((((((((((...)).)))))).))..((((((((((((......)))))...)))))))))))))(((.....)))(((..((....((((((((((((.((((.(((....)))..))))..(((........)))..)))))))))).))....))..)))..............((((.((.(((((((((...((((....(((............)))...((((((((.(..(((((((..............)))....)))).....).)))))))).....)))).(((((((...)))))))...((((((((...........((((((....(((((((.((((((((.(.(((.(((((.....))))).))).)..))))))....))..))))))).))))))...((((((((...)).)))))).)))).)))).........................))))))))))))))).))))).)))))..)))).))))..)))))).))..................((((((.(((((.....(.(((((((.(((.(.((((((((..((((.......))))..)).....(((...((((......((...(((((.(((....))).)))))...))......)))).)))......((((((((((((...((((....(((((.((((((.(((((.(((.(((((((((((.((......))....))))).......(((.(((.....))).)))..((((...........))))....))))))..))).))))).))(((((((((...((((((((((((...(((((.(((((...((((.......))))))))).))))).))))..(((((............)))))..(((.......(((((.....))))).......)))((((((...(((((((..(((((.(((((.(..(..(((.(((((((((((((...))))....)))...)))))))))..)((((...)))).).))))))))))..)))))))))))))(.((((((((((((((........)))).)))))))))).).......((((....))))....)))))))).))...))))))))))).)))))))))(((((..((((.(((((..........))))).........((((((((((.......(((((((..((.(((......((((((((...))))))))...)))))..))))))).........)))))..)))))((((....)))).(((((.(((....((((((.((((..((.......((((((((.(((...)))))))))))))..)))).))))))........))).))))).......)))).)))))..)).))))))).))).((((((....))))))..(((.((((((((.((((...(.(((((((((((.(((((...((((..(((((..(((((((((.((((((((((.((((((...)))))).........))))))))..)).)...))))))))....((((((.(((((..((((((((...((((((((((.....((.(((((((......))))))).))......)))))).((....))......)).))..)))))))))))))..))..))))......(((....)))((((...)))).)))))..))))....)))))))))))))))).)))))..)))))))).))).))))))).))).))))))))))))).))))))..............(((((.......)))))............)))).)))))))))(((((((((((....))))).))))))......((.(((((((((....))....(((((.(((((((.((((.((((........))))..)))).....))))))).)))))(((((....(((((((......)))))))......)))))(((((((((.((((((((((...(((.......)))...))))...)))))).)))))))))...))))))).))...)))...)))))))))).))))))))((((.(((((...((((((((((((((.((.((.(..(((((...(((.......)))...((((((((((...((((((((.((((((((((((((.((.....)))))))))))).))))...))))).))).))))).))))).)))))).)).))))))))).)))))))((((((((........))))))))))))).))))....))))))))(((((......)))))..((((((((.(((((...((.(((......))).))..)))))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((({{((((((((((((((((((((...,,{..(((({{(((((((((.((((((.(((,(((.((.,(((.{,.(((((.{.{{,,...)},||,)})))}.))).,)}.))).))).)))))).))))...}))))))))){((((..((((.((((,{((.(((((((||..(({{{..,}}}))}}))))))|))..{{.(((.{{{,,,((((((((.(((({..(((((..(((((((,(((({(.{(((({{,((.({{((.((,(((((({{(((.((((((........)))))))))))))))){(((({,..{{|||||........||||....))))||.))})))..,)))}))})))))))).}).)))}.))}))}}.||{{{{||||||,||.,,,,,(((((,.,,.},,)}|||||,.,.,||,||||,....((((((((((.((......(((((({((.((..(({(,......}}.,},.|||||....))))|((,{{,.|||{{{{{||||||({{,....{((....{{{|}|.{.(((((.....))))).,..|{|||..,},}}),,.....,,))))..))}))),,..})))).,,.,,)).))))))))))..{{((((((({...}}.)))))).}}.,((((((((({((......))))}...))))))))||||}{{{..,,,}}|(((..{{.{{.(((({({(((((.(((({(((....)))}.})))..{((.,,.....}}},.))}))})))).}},},,}},.}}},.,,........,.{(((.{{.(((((((((...{{({....(((............)))...((((((((.,..(((((((..............}}}....)))).....}.)))))))).....}}}}.(((((((...)))))))...((((((((...........((((((....(((((((,,,((((((.(.(((.(((((.....))))).))).)..)))))),,,.)}..})))))}.))))))...(((((({,...,}.)))))).)))).)))),,.,,,...................)))}}})))}}}})}.))))).}))))..)))).))))..||||}}.}}....,,,,,,........{(((((.(((((.....{.(((((((.(((.(.((((((((..((((.......))))..)).....(((,..((((......((...(((((.(((....))).)))))...))......)))).}}}...,((((((((....,.,{{,.(((((.....)))))..)).))}))))},|{,,((({{((,({,,..,.||,{{{|}|||},,,|||{{{|(((.....,,|,{{|..((((..,........)))}...}}}.{((...(((((.,......))))).))}.|...,}}}((((,..(((((,(((((.,,((((.....}.)))}})))).|}))},}}}}..||||(|{{,,{({,...{(((((,{{{{{{.....,}}}}....,.}}}||,,...{|,||{{{{...(((((((..(((((.(((((.(..{,.(((.(((((((((((((...))))....)))...)))))))))..}((({...}))).}.))))))))))..))))))))))))),))(((((((((((((........)))).)))))))))..,.,.,,..{(((....})))...|||||{{{...}}}}.}))).}))))))))}|,}}|{{{{|{|||||,{|{|{|||,,||||,}}})},.,,,,...((((((((((.....,,(((((((..((.(((......((((((((...))))))))...)))))..)))))))..,,.....)))))..)))))((((....)))),(((((.(((,.{,((((((.(((({{((...}}}}((((((((.(((...)))))))))))},..)))).))))))........))).))))).,....})))),)}))},,}))))))}})}}||{(((({,....))))))}.({(.((((((((,((((...{.{((((((((({.((((({{.((((,,{(((({,(((((({({,{(((((((((.((((((...}}})}}..,,..,}.))))))}}}}}},,},,))))))))}...(({{{(,((((,.,((((((((...,{((((((((.....((.(((((((......))))))).))......)))))),||,,,.}),.,.,.)),)),.}})))))}}))))..))..)))).....||||....)))|||{,,,))))})},}}.,}},}....}))))))))))))))),})))).,)))))))}.}}).))))))},))).)))))))}))))).)))))}..............|||{{.......,}}},.....,......)))).))))))})}(((((((((((....)))))}})))))......{(.(((((((((....))...,(((((.(((((((.((((.((((........))))..)))).....))))))).)))))|,(((..,.(((((((......))))))).}..}})||||{((((((((.((((((((((...(((.....,.)))...))))...)))))).))))))))))),))))))).}}...,,,...)))))))))))))))))))((((.(((((,..((((((((((((((.((.((.{..(((((...(((.......)))...((((((((((...(((.((((({((((((((((,((.{({....}))},))},.))))))))))))))).))).))))).))))).)))))}.)).))))))))).)))))))((((((((.,......))))))))))))).)))),...))))))))|{||{...,,,|||||..{{(((((({({,(({.,{({{,...,}.,},)})..)))))...}))))))}
Back