Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033023.5
Sequence Length
2742 nt
GC Content
0.5762
ACACGCGCGCCCUGCGGAGCCCGCCCAACUCCGGCGAGCCGGGCCUGCGCCUACUCCUCCUCCUCCUCUCCCGGCGGCGGCUGCGGCGGAGGCGCCGACUCGGCCUUGCGCCCGCCCUCAGGCCCGCGCGGGCGGCGCAGCGAGGCCCCGGGCGGCGGGUGGUGGCUGCCAGGCGGCUCGGCCGCGGGCGCUGCCCGGCCCCGGCGAGCGGAGGGCGGAGCGCGGCGCCGGAGCCGAGGGCGCGCCGCGGAGGGGGUGCUGGGCCGCGCUGUGCCCGGCCGGGCGGCGGCUGCAAGAGGAGGCCGGAGGCGAGCGCGGGGCCGGCGGUGGGCGCGCAGGGCGGCUCGCAGCUCGCAGCCGGGGCCGGGCCAGGCGUCCAGGCAGGUGAUCGGUGUGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCCAGACUCCCUCCGGAGUUCUUCUUGGGGCUGAUGUCCGCAAAUAUGCAGAAUUACCGGCCGGGUCGCUCCUGAAGCCAGCGCGGGGAGCGAGCGCGGCGGCGGCCAGCACCGGGAACGCACCGAGGAAGAAGCCCAGCCCCCGCCCUCCGCCCCUUCCGUCCCCACCCCCUACCCGGCGGCCCAGGAGGCUCCCCGCGCUGCGGGCGCGCACUCCCUGUUUCUCCUCCUCCUGGCUGGCGCUGCCUGCCUCUCCGCACUCACUGCUCGCGCCGGGCGCGCUCCGCCAGCUCCGUGCUCCCCGCGCCACCCUCCUCCGGGCCGCGCUCCCUAAGGGAUGGUACUGAAUUUCGCCGCCACAGGAGACCGGCUGGAGCGCCCGCCCCGCGGCCUCGCCUCUCCUCCGAGCAGCCAGCGCCUCGGGACGCGAUGAGGACCUUGGCUUGCCUGCUGCUCCUCGGCUGCGGAUACCUCGCCCAUGUUCUGGCCGAGGAAGCCGAGAUCCCCCGCGAGGUGAUCGAGAGGCUGGCCCGCAGUCAGAUCCACAGCAUCCGGGACCUCCAGCGACUCCUGGAGAUAGACUCCGUAGGGAGUGAGGAUUCUUUGGACACCAGCCUGAGAGCUCACGGGGUCCAUGCCACUAAGCAUGUGCCCGAGAAGCGGCCCCUGCCCAUUCGGAGGAAGAGAAGCAUCGAGGAAGCUGUCCCCGCUGUCUGCAAGACCAGGACGGUCAUUUACGAGAUUCCUCGGAGUCAGGUCGACCCCACGUCCGCCAACUUCCUGAUCUGGCCCCCGUGCGUGGAGGUGAAACGCUGCACCGGCUGCUGCAACACGAGCAGUGUCAAGUGCCAGCCCUCCCGCGUCCACCACCGCAGCGUCAAGGUGGCCAAGGUGGAAUACGUCAGGAAGAAGCCAAAAUUAAAAGAAGUCCAGGUGAGGUUAGAGGAGCAUUUGGAGUGCGCCUGCGCGACCACAAGCCUGAAUCCGGAUUAUCGGGAAGAGGACACGGAUGUGAGGUGAGGAUGAGCCGCAGCCCUUUCCUGGGACAUGGAUGUACAUGGCGUGUUACAUUCCUGAACCUACUAUGUACGGUGCUUUAUUGCCAGUGUGCGGUCUUUGUUCUCCUCCGUGAAAAACUGUGUCCGAGAACACUCGGGAGAACAAAGAGACAGUGCACAUUUGUUUAAUGUGACAUCAAAGCAAGUAUUGUAGCACUCGGUGAAGCAGUAAGAAGCUUCCUUGUCAAAAAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAAAACAAAACCACAAAUGACAAAAACAAAACGGACUCACAAAAAUAUCUAAACUCGAUGAGAUGGAGGGUCGCCCCGUGGGAUGGAAGUGCAGAGGUCUCAGCAGACUGGAUUUCUGUCCGGGUGGUCACAGGUGCUUUUUUGCCGAGGAUGCAGAGCCUGCUUUGGGAACGACUCCAGAGGGGUGCUGGUGGGCUCUGCAGGGGCCCGCAGGAAGCAGGAAUGUCUUGGAAACCGCCACGCGAACUUUAGAAACCACACCUCCUCGCUGUAGUAUUUAAGCCCAUACAGAAACCUUCCUGAGAGCCUUAAGUGGUUUUUUUUUUUGUUUUUGUUUUGUUUUUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACACCAUAAAGUGAUUAUUAAGCUUUCCUUUUUACUCUUUGGCUAGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAUUAUCUCUUGGAUGACAUUUACACCGAUAACACACAGGCUGCUGUAACUGUCAGGACAGUGCGACGGUAUUUUUCCUAGCAAGAUGCAAACUAAUGAGAUGUAUUAAAAUAAACAUGGUAUACCUACCUAUGCAUCAUUUCCUAAAUGUUUCUGGCUUUGUGUUUCUCCCUUACCCUGCUUUAUUUGUUAAUUUAAGCCAUUUUGAAAGAACUAUGCGUCAACCAAUCGUACGCCGUCCCUGCGGCACCUGCCCCAGAGCCCGUUUGUGGCUGAGUGACAACUUGUUCCCCGCAGUGCACACCUAGAAUGCUGUGUUCCCACGCGGCACGUGAGAUGCAUUGCCGCUUCUGUCUGUGUUGUUGGUGUGCCCUGGUGCCGUGGUGGCGGUCACUCCCUCUGCUGCCAGUGUUUGGACAGAACCCAAAUUCUUUAUUUUUGGUAAGAUAUUGUGCUUUACCUGUAUUAACAGAAAUGUGUGUGUGUGGUUUGUUUUUUUGUAAAGGUGAAGUUUGUAUGUUUACCUAAUAUUACCUGUUUUGUAUACCUGAGAGCCUGCUAUGUUCUUUUUUUGUUGAUCCAAAAUUAAAAAAAAAAAUACCACCAACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1104.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1151.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 878.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((..(((((((............(((((.(((((((...(.(((((.((((((((....((((((.(((((((.(((.((((....(((((...(((((((((((.((((((((((.....))).))).))))..))).))))))))..)))))...)))).))).))))))).)((((((((((((((.....))).(((((.((((((((.(((..(((...)))(((((.(....).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))).))))))))..))))).).))))))).)))))))))))).))))))))(((((.(.(((...))).))))))((((((((....((((.((((...((((((((.((((((.((((((.((((((((((((((....)))))).....)))))))).)).)))).....((((((......(((((((.....))))..)))(((((((((((((((.((((.((((((...(..(((.......)))..).....)))..))).)))).)))......((((....((.((........)).))....))))))))))))))))(((((.((((.(((..((((((((.((((((.((((((.((.(((.(((((((.(((.....))).((((..((((((((((((((.(((((((((.....((((..(((......)))..))))((((...)))).(((..........)))).))).)))).).))).)))))))..))))))))(((((((.........(((((((..(((((..((..(.......)..))..)))..))..)))))))(((((((.......(((((.(((.....))).))))).))))))).......)))))))....))))))).)))..)).......((((.((.((((.....((((((......))))))....(((((....)))))..)))).)).))))..)))))).....(((....((((.(((((......))))).))))....)))(((....))).....)))))).))))))))..)))...)).)).)))))..)))))).((((.....))))........(((((....)))))..)))).))))))).)))...)))))))).))))))))....(((.(((((......(((((((.(((.(((((.......))))))))..))).))))))))))))(((((.(((.((((((((((((((((...(((......(....)......))).(((((((..(((((...(((((((...(((((((((.(((.((((....))))..))).(((((.((((((.((...)).)))..((((....(((((.(((((((((((((((((..(((......))).((((......))))))).))).)).)))).....((((((((..(((........))).((((((..(((((((((((((..(((..................)))..)))))))))))))....))))))............(((((...((((...((((((..(((...)))..))))))....))))...)))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((....((((((((((((((...(((((((........(((...)))..(((((((..(...((((((.(((.(((((((((((.(((....)))))))))))((((((((((..((((.((.(((((((........(((.((((.(((((((......))))))))))).)))(((((((((...))))))))).....))))))).))))))...)))))).)).)).............))).)))))(((..........)))))))...)..))))))).(((((((......))))))).))))))).))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))).(((......)))......(((((..((............))..))))))))))))))))).....(((((((((((((((((..((((.(((((((...........))....))))).))))((((.(((((....)))))..)))).(((...)))...)))).)))))).)))))))...))))))))....)))))..)))))...))))......))).))))).))))))))))))))))..))))).....)))))))..))))))))))........((((.........)))).((((((.((((((((((.(((.((((.....)))).))).((((....)))).........((.(((((((.(.(((((.(((....)))((((((.(((.....)))))))))........))))).).))))))).)))))))))))).)))))).........))))))..)))..))))).....(((((.........)))))..................((((....))))....))))))))(((((...(((((((.(((((((((.(((.(((....)))..))).)))))).............((((((.......)))))).(((((......)))))))).)))))))...)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((...|}||....(((((((..((((.({{(,((((..({((,,({({{((...,(,(((((((.(((((((.(((.((((....(((((...(((((((((((.((((((((((.....))).))).))))..))).))))))))..)))))...)))).))).))))))).)))))}},))....)).))).)))))))).))).))))))))))),,,))))))))).(((((((((((({{{{(({{|,,,||))))))||(((((..((((((....(((((..{((((((((((((((((.(((({|{{{{(((|.(((.(((.((.((((.{{.{.{(((({{(.(((.(((((...((((({(({.{(({({((,(({((((((((((.((((((((((((((....)))))}.....)))))))).,}.}}||.....,}}.,,....(((((((((.{({.{{{(,,{,((((((((((((((((.((((.((((((...(..(((.......)))..).....)))..))).)))).)))....{{(,(({,{.,,.,,........))}))...,)),))))))))))))))}|||.|},..|.},,.}}|||....,..)))))))))))))))).))).}.)))}},)))))))).))))).))).)))))))},)))).)).)))}))}))))},))|..(((({{{(((.,((((....,((.((((..........))))))...)))).,)))))))))}))).))))))))..})))))))})))))..))))))..)))).))){{({{{..{,{,({{{((((,,{{{{||||{||{{{((((({((...{{{{{.{,,.....})),)))))}|(((,|(((({({{{.{{|}|}}||,..|||||{|.|||}||}}.{,{((,{.{{,{({{{{,.{{(({{.|,.,})))))|....({{((...,)))||{{|,,||||{,||.,.,,,))),))})}))),),|||{.(((((......))))).}}||{(({{({(((..,,}}}..}}}))|||{,{,,,,{(,({{(((({{(({{{|..{{{((({....|||,.}}}}))),.....,.,{,|||)))}),))}.{{{.{{{,.,,,)}),}}}..|||||||||}|||}....{((,({(((,({{....(((((((.{((,((({{......,)))))}}}..)))}}))),,,,,))).}|}|||}}.||}||,...,})}}))}},))}|,....,}|||{{,,,..{|,.,{{{{{{,.(((({.,,(((((((...(((((((((.{((.((((....))))..))}.{((((.(({{(({{,...}),))}..((((....(((((|((((,((({((,(((({..(((......))).{{{{...{{{|||||,}.|||.|},,},)},}),|,||}|||}|{{(({......)}}{((((((,{(((((((((((({..((,....,|.,....,,{|..}}),,))))))))))}))}}}.,}))))|||,{{,,,.,,{((((...{(((...((((((..(((...)))..))))))....))))...))))|((((((((((((((((((((((((((((((((((((....{{{.{{.((((((((((((((...(((((({.,,,....,,,...}}),.(((((((..(...(((((.,,{{,{{(((((((((.(((....)))))))))))|||{((((((..((((.((.(((((((........(((.((((.(((((((......}))))))}))).)))(((((((((...))))))))).....))))))).))))))...)))))).}}.},...,|{{|.||.||{.,...,,},}}}.}}.}}},,,)))))...)..))))))).(((((((......))))))).})))))).)))))))))))))),}}}}))))))))))))))))))))))}|.({{......)))......{((((..((............))..))))),}))))))))))))}},{((((((((((((((((.{({((.(({{{{{,.......,,.|}...,)))}}.))))((((.(((((....)))))..)))).|||.,,)))...)))).)))))).))))))}.,,}}}}}}}|,,,,))))).})))))...))))......))).))))}.)))))))))))))))).,))))}.,,,,||}}|||,,|}..,}})}},..,,,..,||||}........},,,||{{{{,({({((({{{.({{.|||(,,,..}}}).)))}{{({..,.))})},.....|{((,((({{{(,,.{{(((,(((....,))||||||.{{{.,.,,))))))})).,,,....))))).),))})})),)})))))})))).)))))})))))))))))).{(((({((((,,.{{{{,.,,|||........}}}}),..}})}}}}}.}).....((((....))))....))))|||.(((((...(((((((.,,.((((((.(((.(((....)))..))).)))))),,...........((((((.......)))))).,{{{{......))))),,,.})))))).,.))))),.,}....
Back