Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033164.4
Sequence Length
1114 nt
GC Content
0.6553
AGCCAGCGGCCACCGGCUCCGGCAGCGGCGCACAGCGAUUCGGUGCGGCGCGGCGAGCACGACGUUCCACGGGACCCGCGGAGCCGCGUCGUGAUCGCCGCCGGCCUCCCGCACCCGCACCCUCUCCGCUCGCGCCCUGCUCAGCGCGUCCUCCCGCGGCGGCCCGCGGGACGGCGUGACCCGCCGGGCUCUCGGUGCCCCGGGGCCGCGCGCCAUGGGCAGCCCCCGCUCCGCGCUGAGCUGCCUGCUGUUGCACUUGCUGGUCCUCUGCCUCCAAGCCCAGGAAGGCCCGGGCAGGGGCCCUGCGCUGGGCAGGGAGCUCGCUUCCCUGUUCCGGGCUGGCCGGGAGCCCCAGGGUGUCUCCCAACAGCAUGUGAGGGAGCAGAGCCUGGUGACGGAUCAGCUCAGCCGCCGCCUCAUCCGGACCUACCAACUCUACAGCCGCACCAGCGGGAAGCACGUGCAGGUCCUGGCCAACAAGCGCAUCAACGCCAUGGCAGAGGACGGCGACCCCUUCGCAAAGCUCAUCGUGGAGACGGACACCUUUGGAAGCAGAGUUCGAGUCCGAGGAGCCGAGACGGGCCUCUACAUCUGCAUGAACAAGAAGGGGAAGCUGAUCGCCAAGAGCAACGGCAAAGGCAAGGACUGCGUCUUCACGGAGAUUGUGCUGGAGAACAACUACACAGCGCUGCAGAAUGCCAAGUACGAGGGCUGGUACAUGGCCUUCACCCGCAAGGGCCGGCCCCGCAAGGGCUCCAAGACGCGGCAGCACCAGCGUGAGGUCCACUUCAUGAAGCGGCUGCCCCGGGGCCACCACACCACCGAGCAGAGCCUGCGCUUCGAGUUCCUCAACUACCCGCCCUUCACGCGCAGCCUGCGCGGCAGCCAGAGGACUUGGGCCCCCGAGCCCCGAUAGGUGCUGCCUGGCCCUCCCCACAAUGCCAGACCGCAGAGAGGCUCAUCCUGUAGGGCACCCAAAACUCAAGCAAGAUGAGCUGUGCGCUGCUCUGCAGGCUGGGGAGGUGCUGGGGGAGCCCUGGGUUCCGGUUGUUGAUAUUGUUUGCUGUUGGGUUUUUGCUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAAACAAAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -528.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 324.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((..(((((...(((((.(((((..((((....(((((((.(((((((.(((((((((((.(((...))).)))...)))))))).)))))))(((....)))...))))))).....)))).))))))))))...((((((.((((((((....)))))))).))))))....)))))(((((.((.((((((((((((.((((((((..((((((.((((((((((.(..((((((((((((((.((((..(((.....)))..))))(((.((..((((((((((((((((((((.....))))))........)))))).))))))))..)))))....(((((.(.((((((.(((...)))..))))).).).))))).....((((((((....(((((((((....((((((....((.......((((....)))).......))..))))))..((((....(((......)))..)))).)))).))))).(((((((((...))...(((((.((((((((..(((((....))))).....))))).((((((......)).))))...))).)))))....))))))).)))))))).......))))))))..)))).))..).)))......)))))...((((((.............)))))).(((...)))......)).))))))...))))))......((....))))))))))))...)))).)).))).))((((((..(..(((((((....)))))))..)..)))))).(((((........)).))).((((.((.(((((...(((.................)))...))))))))))).((((((((.(.((((((((((((((.(((.((....)).)))....(((((((((((...(((.(((..((((...((((((((.(((.(((.........)))..))).)))))))).....))))))))))...)))))))).))).)))).)))).))))))))))))))).........))))))))........((((((...................)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((,,(((((,,.(((((.(((((..((((....(((((((.(((((((.(((((((((((.(((...))).)))...)))))))).)))))))(((....)))...))))))).....)))).)))))))))}..,((((((.((((((((....)))))))).)))))).{,,|}}||((((({(({((((((((((,({{((({{(({{{{({{|.{|{{{{{|{{,{.{((((((((((((((.{{(({,(((((({{((({,,..{(({.{{..((((((((((((((((((((.....))))))........))))))}}))))))),,)}|)),}|{{{{({,(,((((((.{({...,}},.))))).},},))})),}.,,((({{({{..,.(((((((((..,,((((((.,,,.|.,,....((((....))))...},..,)}.)))))).}((({....(((......)))..}))).)))).))))).(((((((,,...}}...(((((.(({(((((.,(((((....)))))...,.))))),(({(((......)))})))...))).)))))....))))))).,)))))})},|}}}.)))))))),.,)))},}..},|||{{{{...||||...((((((,,{.....,,.,.)))))).,,.{{,.||{{.{{{|,.,,,,},})}),)))).}}}.{((....))),}}|}|||,...))))})),)))}))||||||..|.,(((((((....)))))))..),,))})))}|||||,,......,,.}}|.((((.({|(((((...(((..............,..,}}...))))))))))),|||(({({.{.(({(({(({{{{||,(((,({....)).))).|{((((((((((((...(({{(((..((((.,.((((((((.(((.(((.........)))..))).))))))))...,.))))))))))...)))))))).)))))))),)))),))))))))))))}}}.........)))))))).,....,,||,,.....,{{{{,,,,,......)))).)))))}
Back