Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033219.3
Sequence Length
1505 nt
GC Content
0.6120
CUGUGUCCCGGGGAGCCGGAGGAGGUGGAGAUGAAUGGCGGGCGCGGCGACCGGGAGCCGGACCCCUGGGAGGUCGGAGCUUGUCGAGGGAUGCGGCUGGCGCUGCCCGGAGCAUGGCGACCGCGUGGCUGAGCUCUUCUGUCGCCGCUGCCGCCGCUGCGUGUGCGCGCUUUGCCCGGUGCUGGGCGCGCACCGUGGCCACCCUGUGGGCCUGGCGCUGGAGGCAGCGGUGCACGUGCAGAAACUCAGCCAAGAAUGUUUAAAGCAGCUGGCAAUCAAGAAGCAGCAGCACAUUGACAACAUAACCCAGAUAGAAGAUGCCACCGAGAAGCUCAAGGCUAAUGCAGAGUCAAGUAAAACCUGGCUGAAGGGGAAAUUCACUGAACUCAGAUUACUACUUGACGAAGAGGAAGCGCUGGCCAAGAAAUUCAUUGAUAAAAACACGCAGCUUACCCUCCAGGUGUACAGGGAACAAGCUGACUCUUGCAGAGAGCAACUUGACAUCAUGAAUGAUCUCUCCAACAGGGUCUGGAGUAUCAGCCAGGAGCCCGAUCCUGUCCAGAGGCUUCAGGCAUACACGGCCACCGAGCAGGAGAUGCAGCAGCAGAUGAGCCUCGGGGAGCUGUGCCAUCCCGUGCCCCUCUCCUUUGAGCCCGUCAAGAGCUUCUUUAAGGGCCUCGUGGAAGCCGUGGAGAGUACAUUACAGACGCCAUUGGACAUUCGCCUUAAGGAAAGCAUAAACUGCCAGCUCUCAGACCCUUCCAGCACCAAGCCAGGUACCUUGUUGAAAACCAGCCCCUCACCAGAGCGAUCGCUAUUGCUGAAAUACGCGCGCACGCCCACGCUGGAUCCUGACACGAUGCACGCGCGCCUGCGCCUGUCCGCCGAUCGCCUGACGGUGCGCUGCGGCCUGCUGGGCAGCCUGGGGCCCGUGCCCGUGCUGCGGUUCGACGCGCUCUGGCAAGUGCUGGCUCGUGACUGCUUCGCCACCGGCCGCCACUACUGGGAGGUUGACGUGCAGGAGGCGGGCGCCGGCUGGUGGGUGGGCGCGGCCUACGCCUCCCUUCGGCGCCGCGGGGCCUCGGCCGCCGCCCGCCUGGGCUGCAACCGCCAGUCCUGGUGCCUCAAGCGCUACGACCUUGAGUACUGGGCCUUCCACGACGGCCAGCGCAGCCGCCUGCGGCCCCGCGACGACCUCGACCGGCUCGGCGUCUUCCUGGACUACGAGGCCGGCGUCCUCGCCUUCUACGACGUGACGGGCGGCAUGAGCCACCUGCAUACCUUCCGCGCCACGUUCCAGGAGCCGCUCUACCCGGCCCUGCGGCUCUGGGAGGGGGCCAUCAGCAUCCCCCGGCUGCCCUAGGGGCCAGGACCGGCGUGACAGCCUCCAGACUUGAAUCUGUAGACAUUUCUUUAUUGAUAUGGCAAAUUGCUUGCAGAUAUUUUUAAAUGACAGCAAUUUUCUAAUAUUUGGUUUAAUAAAAUGUGAAUAAUGUCCCUUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-614.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -640.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.((((((((.((((((.((.((((..((((....(((((...(((((..(((.(((((.(((((((((((.(((((((.(((((((...(((((((.((((.(((((((..(((((.(((.(((((.((((((((((((((((((((((.((((.(((.((((((((((.((.....)).))))))))))))).(((((((...)))..)))))).)).)))))))))((....)).........((((.(..((((...)))).)))))..((((...((....))...))))............)))))))))...(((.(((..((((...((....)).))))((((....((((((((((((((........(((....)))....((.(((....)))))..((.(((((((((........))).............((((..(((..(((((..(((((..((((.((.(((((...))))))).))))...((.((((((..((((((......(((((((((.((...(((((......)))))....)).)))))))))....(((((..(((((.((((((.(..(((...((((.((..(((....))).))))))...)))..)))))))....((((...((((...))))...)))))))).)...)))))))))))..)))).))))..)).)))......)))))..))).)))).......)))))).))....))))))........))))))))..)))).......(((((..((..((((((((.(((..(((((.(.....((((.(((((((((.((((...((((.......(((.((.(((..(((((((((.((.....))..))))).)))).))))).))))))))))).))))...))))).))))).))))).)))..))))))))..)).)))))))))))...)))).)))))))).))))))).)))))((((((..((((..(((((.((((((((..((.((((((((...)))))).)).))..))))))))(((((((....))).))))..(((.(((((((....).)))))).))))))))..))))..)))))).........((((.((...)).))))))))))))))).((((....))))....))))))).)))))..)).)))))))).....).))))))).)))))))).........(((.((((.(((....))).)))))))....)))))(((.(.((((.((((((((.............)))))))).)))).))))))))..)))))))))))).)))..)))))))((((.(((......)))..((((......))))...((((((..(((..(((((((.((((((((..((..((....))..))..)))))))).)).))))).....)))..)))))).......)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.((((((((,((((((.((.((((..((((...,(((((.,.(((((..(((.(((((.(({({((((((,({(((((.(((((((...(((((({{((((({(((,,(..(((((.(((.((((({(((,,,((((((((((((((((.(({({(((,((((((((({.((.....}}.|}))))))))}}}|({{{{{{.,,)})}})))))),)).)))))))))),,,,.))))}}.}}}}{{{{.{..((({...,))),}})))......,,,{|||,.}|...,|}.............},,}}}}}},|,{,.{({(,,{{({,,{(({..{(({{{(((({((....((((,{({{{{{(.....,,.||,...})))..,,{|{(((|.....{{({,{({((((,,,.,.....,,.,,}.......,,.,}|||||.||||}}}}}}},,}))),...,,))))})}}||}}}|||})}..}}}},.,|||,},.}},}}}}},....((((((((((((..,.,.,{(((......)))}{(((((.(((.((.{{{,,.((((((,.(((((.,,{(,,{({.,,,}}},,|,.{{,}|||.,.})))})}},}}..}))),.||||||,.,({((((...((((...))))...)))}}))},}}..}))}})},},},......,.)).))).)))))).,{{.,,....,)},.{{,.....)))..)))).)))))))).(((((((...((((((,..{.{((((({..,((((.......(((.(((((((.....((.{,...,{(.(((((.((...(((((.(((.......))).)).))).)).))))).}}}}.)}))))))))))((((.((((.{.(((({.{.((,...)).,)))))})))))))))))).}.))))))).),))))))..))))))),}}))).},))))})))))))).))))),|{||,||((((((..((((..(((((.((((((((..((.((((((((...)))))).)).))..))))))))(((((((....))).))))..(((.(((((((....),}))))).))))))))..))))..))))))}.}}},.,{({{{.||,,,,,,))})))))))))))).{(((....)))}....))))))).))))),.}},)))))})).....}.))))))).)))))))).........(((.((((.(((....))).)))))))..,.}))))(((.(.((((,((((((((.............)))))))),)))},})))))))..)))))))))))).))),.)))))))|(({.(((......)))..((((......))))...((((((..(((..(((((((.((((((((.,((..((....))..)).,)))))))).)),,)))).....}))..)))))).......))),.......
Back