Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033227.3
Sequence Length
2378 nt
GC Content
0.3995
AACCCCGCCUCUCAGUUGAGGACUCUGAAGGCUGUUUCUGUGGCGCUUCCCCUGCGAGGAUGGCUACCCUGGUUGUAAACAAGCUCGGAGCGGGAGUAGACAGUGGCCGGCAGGGCAGCCGGGGGACAGCUGUAGUGAAGGUGCUAGAGUGUGGAGUUUGUGAAGAUGUCUUUUCUUUGCAAGGAGACAAAGUUCCCCGUCUUUUGCUUUGUGGCCAUACCGUCUGUCAUGACUGUCUCACUCGCCUACCUCUUCAUGGAAGAGCAAUCCGUUGCCCAUUUGAUCGACAAGUAACAGACCUAGGUGAUUCAGGUGUCUGGGGAUUGAAAAAAAAUUUUGCUUUAUUGGAGCUUUUGGAACGACUGCAGAAUGGGCCUAUUGGUCAGUAUGGAGCUGCAGAAGAAUCCAUUGGGAUAUCUGGAGAGAGCAUCAUUCGUUGUGAUGAAGAUGAAGCUCACCUUGCCUCUGUAUAUUGCACUGUGUGUGCAACUCAUUUGUGCUCUGAGUGUUCUCAAGUUACUCAUUCUACAAAGACAUUAGCAAAGCACAGGCGAGUUCCUCUAGCUGAUAAACCUCAUGAGAAAACUAUGUGCUCUCAGCACCAGGUGCAUGCCAUUGAGUUUGUUUGCUUGGAAGAAGGUUGUCAAACUAGCCCACUCAUGUGCUGUGUCUGCAAAGAAUAUGGAAAACACCAGGGUCACAAGCAUUCAGUAUUGGAACCAGAAGCUAAUCAGAUCCGAGCAUCAAUUUUAGAUAUGGCUCACUGCAUACGGACCUUCACAGAGGAAAUCUCAGAUUAUUCCAGAAAAUUAGUUGGAAUUGUGCAGCACAUUGAAGGAGGAGAACAAAUCGUGGAAGAUGGAAUUGGAAUGGCUCACACAGAACAUGUACCAGGGACUGCAGAGAAUGCCCGGUCAUGUAUUCGAGCUUAUUUUUAUGAUCUACAUGAAACUCUGUGUCGUCAAGAAGAAAUGGCUCUAAGUGUUGUUGAUGCUCAUGUUCGUGAAAAAUUGAUUUGGCUCAGGCAGCAACAAGAAGAUAUGACUAUUUUGUUGUCAGAGGUUUCUGCAGCCUGCCUCCACUGUGAAAAGACUUUGCAGCAGGAUGAUUGUAGAGUUGUCUUGGCAAAACAGGAAAUUACAAGGUUACUGGAAACAUUGCAGAAACAGCAGCAGCAGUUUACAGAAGUUGCAGAUCACAUUCAGUUGGAUGCCAGCAUCCCUGUCACUUUUACAAAGGAUAAUCGAGUUCACAUUGGACCAAAAAUGGAAAUUCGGGUCGUUACGUUAGGAUUGGAUGGUGCUGGAAAAACUACUAUCUUGUUUAAGUUAAAACAGGAUGAAUUCAUGCAGCCCAUUCCAACAAUUGGUUUUAACGUGGAAACUGUAGAAUAUAAAAAUCUAAAAUUCACUAUUUGGGAUGUAGGUGGAAAACACAAAUUAAGACCAUUGUGGAAACAUUAUUACCUCAAUACUCAAGCUGUUGUGUUUGUUGUAGAUAGCAGUCAUAGAGACAGAAUUAGUGAAGCACACAGCGAACUUGCAAAGUUGUUAACGGAAAAAGAACUCCGAGAUGCUCUGCUCCUGAUUUUUGCUAACAAACAGGAUGUUGCUGGAGCACUGUCAGUAGAAGAAAUCACUGAACUACUCAGUCUCCAUAAAUUAUGCUGUGGCCGUAGCUGGUAUAUUCAGGGCUGUGAUGCUCGAAGUGUUUUUCAGAUAAUAUGUGACCAAUAUACUGGGAAAGAGGUAGUCACAGAGAAAGGGUAAAAGGUCAUGCUGUUACAGGUGUAGUUUGUGUGCAUAAAUAAUACUUCCGAAUUAAAUUAUUUAAUAUUUGACUGAUUUCAAUAACUGUGAAAAAUAAAAAAGGUGUUGUAUUGCUUGUGAGAACUUGAACUGUUUACUAGUUAAUUGAAGAAAAAGUGUAACACUAAGGUGAACUUGCUUCCCUUUUCACUAAUUUUGCUAAACUUUGUAAUGCACAUUCUUAGCAUAUAACUGAACACAGUUGAAAAAUUGUGCCUGAUUAUAAUGUAUGUAUAAUGGUAGGUGUUUGUGUGUGAUUCAUUUUUAAAGAAAUAUUUUUCUCAAGCUCCUAUUACUAUUUGUGGUUGUAUUAUUUCACUAAUCAUUAGUUAAGACUGUGCUAGUCUUCCCUGGGAAACUAAGAAGAGAGCUUUUUUAUAUACAGUAUAUUAGAAUUUUCCUAGUAGCUGAAUUUCUGUAUUAGGUCUAAAUAUUACUGUAUGUUAUAUAAAGCAGGUAUGUCAAGUGUAUAGCCGUAGUCUAUAAUUCAGGAAUGCUUUAUAACCAUCAGAAGCCAUUAUUUGCACUACAUAUAUGAUAAGUAUAGACAGCAAUAAAAUGUUAAGAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-651.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -703.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 472.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((......)))).........((((((..(((((.........(((((.(((((((....((((((((((((.(((((((..((((((((((((((((((.((((((((.((((((((.(((.((((......)))).)))((....((((((((((.......))))))))))...))...))))))))....)))))))))))))))...(((......)))))))).)))).))...((((((...))))))((((((.(....(((((((((..(.((........)).)..)).)))))))...).))))))......................(((((((((..(((.(((.(((((((((....)))).((((((((((.((((...((((....)))).)))).)).((((.((((((((....))))..)))).)))).......)))))))).((((((.....))))))....(((((((((((.(((((.((..((.....(((((....((((((......((((((...((((((.((((((.(((((((.(((((.(...(((..(((((...)))))..))).....))).)))))))))).)).)))).)).(((((......))))).)))).))))))))))))....))))))).)).)))))))))).))))))))))).))))))...))))))))).......)))))))...((((.(((((((((((((((((((((...((((....))))...((((...(((((((((...((((((.(((((.(((((((.(((.((.(((((((..........((((((((.....(((((((.(((((((((((((.((((((((.(((((((((((((........))))))(((((..(((((.((((..((((........)))).)))).)))))...)))))....(((((((((.((.((.(((.((.....)).))).))))))).))))))((((.((((((....)))))).))))..(..((((((((((..((..((((..((((...((((((((((((...)).)))))))))).(((((......)))))..........))))))))..))))))))))))..).(((((...........)))))......(((((....)))))((((((((((.(((.((......((.(((..(((((((..((((........))))..)))))))))).)).....))))).))..)))))))).........((((((((((......))))))))))...)).)))))))).(((((.((((.((((((((.((((((....((((.........))))...))).(((((((.....)))))))....)))...)))))))))))))))))(((((((....(((...(((..((((((((.(.......).))))))))....))).((((((((((((((((((((((......(((.(((......((((........))))....))).))).(((((.....((((....((((.(((((..(((((.(((((((((.((.....)))))))......)))))))))..)).))).)))).....))))........))))))))))).)))).((((....))))........((((((.....((((........))))))))))...((((((...(((.((((..((((((((((((.((((((....)))))).)))))).(((((.............)))))(((..((((((((((((((((.........((((....(((.....)))...))))......))))).)))).)))))))....))))))))).....)))).)))....)))))))))))))))))).......(((((.(((.........)))))))).....(((((((....)))))))..)))..)))))))........))))).)))))).))))))).)))))))........)))))))).....)))))....)).)).)))))))))).)))))))))))........(((((((...)))))))..))))))...)))...))))(((((...((((((((((..(((((.....(((((((.(.((...)).)))))))))))))....)))))))))).....)))))..))))))..))))...)))))).))))).))))......)).)))))))))).....)))))))..))))))))))(((((.....)))))))))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,((((......)))).,.,,||||(((({{..{{{||,.,,,,...((((({(((((((.,..(((((((((({,.(((((((,{(((((((((((((((((,,((((((((.((((((((.(((.((((......)))).))){(....((((((((((.......))))))))))...}),..)))))))).,..,))))))))))))))...(((......)))))))).)))).)}...((((((...))))))((((((.(....(((((((((,.(.((........)).,.))),}))))))...).))))))..........,........,{,(((((((((..({(.(((.(((((((((....)))).((((((((((.((((...((((....)))).)))).)).((((.((((((((....)))),,)))).)))).......)))))))).{(((((.....)))))}....{((((((((((.(((((.((.........(((((....((((((......((((((...((((((.((((((.(((((({{(((((.,...(((..(((((...)))))..))).....,)),}))))))))).))},))).}}.(((({.....,))))).,))).))))))))))))....))))),,,)).)))))))))).)))))}))))).)))}))...)))))))))..,,,,.)))))))...((((.(((((((((((((((((((((...((((....))))...((((...(((((((((...(((((,,(((((.((((((({((,.{,,{,(((((......{{,.,,,,|||{...,,{((((((.((((((({(((((.(((((,{,.(((({(((((((,..((((((((.((((((((.,(((((.((((..((({{......})))).)))).,})))}},)))))....((((((((,.((.((.{{(,({.....,,,))}.)))),}}}})))))}},.))}.)))))))).{(((({{((((((.(.(((((((({{{{{,{.,,,{(({{,...,,||))}})|}))..,.)))))))).).))}})))}..}))))}.((((((((((({(((....,,,,(({{{,((((((((,(({{{{,...,,,||}||,,,...(({{{....))})}{{,((((((({(((.(({,....||,|||,.{((((((..((((........))))..))))))|||}.||{{{{{|||||{||{{||,||||,,........((((((((((......))))))))))...,..),))))))}||||},,,,..{|||||||}||||..}}}.{{((.,.......}}}}..,|}}.,.,,,,}}}}}}),}|||.....)})...,,,,||,,||||}||}|......,,.}}.}}}}..}}..)))))))).}})}),}},,.,.,)))).....{(.((((((((((({((((((((((......(((.(((.,{{..((((........)))).}},))).))).(((((.....((((....((((.((({(..(((((.((((,,((({(.,,...,,,)),,.}}}}})))))))))..}}.})).)))).....)))).,,.....))))))))))).)))).(({{....})))........((((((.....((((........))))))))))..,((((((...,((,((((..((((((((((((.((((((....)))))).))))),.{{{{({(({....}},,.}}))){{{..{(((((((((((((((.........((((.,,.{(,.....)}},..})))......))))).)))),,)))))}....}}))))))).....)))}.)))....)))))))))))))))))))).))))))))))),..}}}}}}}.|||{{{({,,,..(((((((....)))))))...,.}}}}}.}}}..}),...))))).)))))).))))))).))))))}...{{,,,,,,,))))}....)))))....,....})))))))))).)))))))))))........(((((({...)))))))..))))))...)))...))))(((((...(((((((((((((((((.....(((((({,(.{,...,}.)))))))))))))})),}))))))))).....)))))..)))))}..))))...))))))},)))).))))......}}.))))))))))...,.))))))).}))))),,,,.{(({{.....)))))}}}}}}........,,........
Back