Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_052863.3
Sequence Length
478 nt
GC Content
0.6946
AGCCGCAGGUUCCCCGCGCGCCCCGAGCCCCCGCGCCAUGAAGCUCGCCGCCCUCCUGGGGCUCUGCGUGGCCCUGUCCUGCAGCUCCGCUGCUGCUUUCUUAGUGGGCUCGGCCAAGCCUGUGGCCCAGCCUGUCGCUGCGCUGGAGUCGGCGGCGGAGGCCGGGGCCGGGACCCUGGCCAACCCCCUCGGCACCCUCAACCCGCUGAAGCUCCUGCUGAGCAGCCUGGGCAUCCCCGUGAACCACCUCAUAGAGGGCUCCCAGAAGUGUGUGGCUGAGCUGGGUCCCCAGGCCGUGGGGGCCGUGAAGGCCCUGAAGGCCCUGCUGGGGGCCCUGACAGUGUUUGGCUGAGCCGAGACUGGAGCAUCUACACCUGAGGACAAGACGCUGCCCACCCGCGAGGGCUGAAAACCCCGCCGCGGGGAGGACCGUCCAUCCCCUUCCCCCGGCCCCUCUCAAUAAACGUGGUUAAGAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -231.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((...(((((...........)))))...))).))....((((((.((((.....((((.....(((((((((((...)))))((((((.....(.((((((((((((((((((((.(((((....(((((((.(((((((((((.((..(((((((((((....)))))).......)))))..)).....))))))..))))).))...)))))(((((.(.((((((((......)))).).))).))))))........))))).)))(((((((((((((.(.((((((.....)))))).).))))....)))))))))..)))).))))))))))))).)....))))))..........))))))..))))......)))).))))))..........((((.(((((((............)))))))))))..............)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((({(,{{{.,,(((((....,,{,,..}|}|}...}},.)},}..{{{{{{.,|||||.,.||||,,...(((((((((((...}}}))((({{{{,,..{.((((((((((((((((((((.(((((...,(((((((.(((((((((((.{(,{(((((((((((....)))))}.....,})))))..)),,...)))))),.})))).))...)))))(((((.,.(((,((((......)))).}.))).,)))))........))))).)))(((((((((((((.{.((((((.....)))))).}.))))....)))))))))..)))).))))))))))))).}.,..)))))).........,)))))).,}})).}|,}.}}}}.)})))).,........((((.(((((((...........,))))))}))))..............)))))}.......
Back