Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_053004.3
Sequence Length
6642 nt
GC Content
0.6110
CUCUGGACGCUGCGCGGCGCUCCUAGGAGCAGGCGUUCCCGACUCCGGCAAGAGGGUGGCGCCUGGACUCUCGCCCUCAGAGGGAGGCCCGUCCCACGGUCUGUGGCUACGGAUCCCAGGACCCUCUUCGCGGGCGAUUCGCGUAGCCUCAGGUAACUGCAUCCUGCCCAGCAUGACGGCCCCCUGCCCGCCGCCACCUCCAGACCCCCAGUUUGUCCUCCGAGGCACCCAGUCACCGGUGCAUGCGCUGCACUUCUGCGAAGGAGCCCAGGCUCAGGGGCGCCCGCUCCUCUUCUCAGGGUCUCAGAGUGGCCUGGUACACAUCUGGAGCCUGCAGACGCGGAGAGCGGUUACCACCCUGGAUGGCCACGGCGGCCAGUGUGUGACCUGGCUGCAGACGCUGCCCCAGGGGCGCCAGCUCCUCAGUCAGGGCCGGGACCUGAAGCUGUGCCUGUGGGACCUCGCGGAGGGCAGGAGCGCUGUCGUGGACUCCGUGUGCUUGGAGAGUGUGGGCUUCUGCCGGAGCAGCAUCCUGGCCGGGGGCCAGCCACGCUGGACGCUUGCCGUGCCAGGGAGGGGCAGCGACGAGGUUCAGAUUCUGGAGAUGCCCUCCAAGACGUCAGUGUGCGCCCUGAAGCCGAAGGCAGAUGCCAAGCUGGGCAUGCCCAUGUGCCUGCGGCUGUGGCAGGCCGACUGCAGCUCCCGCCCACUCCUUCUGGCCGGCUAUGAGGAUGGAUCGGUGGUCCUGUGGGACGUCUCUGAGCAGAAGGUGUGCAGCCGCAUCGCCUGCCAUGAGGAGCCCGUCAUGGACCUUGACUUUGACUCCCAGAAGGCCAGGGGCAUCUCAGGCUCCGCGGGGAAGGCGCUGGCUGUCUGGAGCCUGGACUGGCAGCAGGCCCUGCAGGUGCGUGGGACUCAUGAACUCACCAAUCCCGGGAUCGCCGAGGUCACGAUCCGGCCAGAUCGCAAGAUCCUGGCCACCGCAGGCUGGGACCACCGCAUCCGCGUGUUCCACUGGCGGACGAUGCAGCCACUGGCCGUGCUGGCCUUCCACAGCGCCGCUGUCCAGUGCGUGGCCUUCACCGCCGAUGGCUUGCUGGCCGCGGGCUCCAAGGAUCAGCGGAUCAGCCUCUGGUCACUCUACCCACGCGCAUGACUCACCCACUCCCUUCCCGGGAGACGAGGAGGGCGGGCAGGGAGGUGGGCAUCAGGCCCCAGCCUUGGCCUGAAACCUCAAGGGCCUCUGAGGACCAGCAAGUCAUGGCCCAAGGACCAUGGAGUCCCCGCUGUCUUCAUGAGGUUGGUAUUUCCUUUUGUGGAGUGCCUCAUCACAGGACGGUGACUCUGGGGGCCAGCCAGAGCCCUGGCCGUCCGAGGCCUGCAGGAGACGUUGGCUUGGGCCUGCUGUGUUGCCAGCUGAGGGUAUUUUAUAAUAAAUUUCCAUUGCCAAGUUGCAGGCUUGAGGUGGGAGCUCCCUGAGGAGGCCCUGGUCCCCCACUUAGCAUCAGUGCCCUCAGACCCCCACCAGGCAGGAUGCUCAGCCCCACCCUCACACCUGCUGUUGAAUGGGCCACCCCGAGUGUGGGUUUCCUGGGCCAGGCCUCAGGAGAUGAUAGGCCCCAACCAUAGCUGCGUCGAUGUCCACAUGACCCCUCACCCCGAGGAGGCCAGGAGCUCCCAACACACAGGUUGAGGCCAGGAUCAGGAUCAGGAAGUAACUGAACUCCCUAAAGAGUGAAGCAGAGAAAGGUGCCUGUGAGGGACGGCAAGGGGGGCUUGCAGCGCACAGGGCCAGGCCAGAUGUGGGAUCCGGGAGGGCACGCCUGCCCGCAGAGGGUGCAGUGGGGAAGGCGCACAGGGUGCACCUCCAGGUGAGUGCUGGGCAGAAGGCACGAGAGCAGCAAGGGAGUGUGACAAGCACCGCCUCACAGUGGCCAAGGCCACAGUCACAGCUGCGGCUGCACACAGGGUGGCCCCCAGGGCACAACACAGCAAGAGCAGGACUUAGCAGCCAGAGCCUCACACUGCAUGCAGCCGGGCCCAGCCUGGCCGGUCGUCUCCUCCUAAAAGCGGGUGUUGAUUGGGAAAGAACCAUGACCCUGAAUAUUGGAGUGGGGCCCAUGGGCAGAUCCAGAGAAGCUGGGACCACACACGCCUGUGUCUGCCCGGAUUGCCGGAAGAGCCCCUCUAGCUGAAGGCCCGGGGUGGCCUCCCUUGAGGCAGUUGCCCUGCAAGGCCCUGCCGAUGCUCCUUGGGACCCCCACCUGGGCUUCUAGUCCUAGAACUAGACUCGAGUCCAGCAGACCCCCAGGAUGAGAUACAGAGGGUGACCCUGAGAGUGGCACCAGCCUCCUGCAGGACCACAUGGCAUUUCCAGGUUUCCAGGCAGAAAUCUGAACAUGUGUGGGACGGAUCGGAAGGGUGUGGGAUCCAGGUGGCCGGAGCAGGGGUGGAUCAGGGGAGUUCCCGGAACAGACCUGCCAAACGGAGGGCUGGACUGGGCGCUGCAGCUUGGGGCCAGGAAGGCUCCAGUGCCGGGCUGGGGGUGGGGGCUGGAUUACAGCCUGAGGGUGGCUGCACUGAGUGAAGUGGACAUGGCCAGCCGCCGUGGGGUACAGCCGAGGAGGGCUUCCAAGGCCUGGGGAUGGGGGUGUUGGAUUUGUCAGUGAGACCUGUGCACCCACUGCAGGGGGUCCCAAGGCCGUGCCUCCCCAACCCCACUGUGAGGAACAUGGUUGCUGGGGGGCCCGGAGUCCUUGAGGAGUCCUGUGACCACACUUCUCUGUUGGUCAGAGGUACCAUGGGGACCGUUCCAUCAAACGGGAAUGUCAGUGCUGGCCGGGAAAGCGGCCCCUGGCCCAAGCUUGGAGACCACCUGGCUCGGGUACUGGCCUGGCUCCGUUGGACAAGGGUGGCCACCAGGUGCCCAGGACCUUUGGAGAGGGGGGCCCUGCUGCUUUUCCUCGAGUGUCCUAUAGCCGCCAGGAUGCGUAGGGCACUCCGGGAGGUAUUUUCAUAUCACUGAGGUGUCAGGGAGGGGAAGGGUCCUGGGUUUAGGCUGCAGUGACUGCAGGUGCUGAGGGAGCUGUGCCCUGGGUGCUCAUCACAGGCUGUCACAGUGAGGGAAGGUGUCAGGUUCUGACAUCCCCAUGACAGCGGCAGGGUAGGUGGAGUGGGAAUUGGCUUUGCAGUUUCCCUGCAUGCCCUUGACAGCCUUGCCAAAGGCACAUCUGCCCCGCCUCAGCUCCCACCCUGAGGGUUCUGGGCCUCUACCCCUUCCCCUGUUUAUGUCCCUGUCAUCUUUGGCAUCAUCACUGUAGUUACAAAACUCCCUACGUCCCACAGCCACGAGGUGGGUAUCCCACAUGAGGGCCCAGGUGUGCAUGCCAGCAUGAGGUUGGCGAGUGGCACUGCCUGCUGAUGUCUUACAUAGAGGCCAUGAAGAGCUGUGGGCAGGGUGUACAGACCCUGAGUUGGCCCCUGGCCCUCGUGCUUUCAGUCAAAGGCACAAGCAGGGUGGAUGGCAGGCGGCUGCCCCCUAGCCUGGCCUUGAGCUCCCUGCCCCAGGCCAUGUGGCGUUGAGCAGUGUCCAGGCACAUCUUGUUCUGAAUCUCAGUGUGCAGGGAUGGAGUCGGGACAGCGUGAGUCCUGCAUGCCUAACACAGCCCUCACCCCUCCAGUGCACAACGGGGCCACGUGCCCGCAUCUGGGUGGCUAGGCAGAUAGGGCCCCCCUUGCCAGGCAGAUCCAGCUUCUGAGGCCUUAUAGACGUCCUGUGGAGGGCAGGCCCAGGACUUUCAUUCACCUGGCUGAGCUGCCUGGGAGAGCAGCAGAACCGGUGCUGGGGUCCAAGCCGGCCAAGAGCAGUGCAGCCCUCCUGGUCCUGUUCCUCUCUUGAGCUGCUCCGUGGUGUCCACAGCAGAGCCAUGUGGCUCUGGACAGGUCGGCCUUUGUGUCAACAGAACCUGGGUCGUGAUGAAUCACCAUGCGUCUGACCAGCCUUGAAACCCCCACAACAGAAGAAGAAACGGUCUCAGCUCCAGACAUCCAGCUUGGAAAAGAUGCACCUGAACAUUGGCAUUCUCUUCCUAGCAAACAGCCACUUCCUGUAGGCUGGCAGGAACGCCAACAGAGCCAGCAGUGAAGGCAUUAAGUGGGGAGGAGGGGUGGCCCGGAGGCAGCACGCGAAGGUCAGCAUGCAGCUCCUGGGAUGAACCUGAGAGGCGACUCCUGGCAGCAUGGCUGGUCGCUGCCAUCACGCCCCUGGCCAACCCACCAACUGGGAGAGGCAGCCCUUCCACAUCUUCCUCCAUAAUGCUCUUGGGUAGCAGUGAGGCCUCUCAAGCCAGAGAGAACUUGGUGUUUGGAAACAACGGCGGACAUUUCUUGCCAUUUUCAGUGCCAACUCAGGUAGGUGUGUUCUACCAUCCUGUGUUUUUGGGGUGUUUUUUUUUUUGAGUCAGAGUCUCACUCUGUCCCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGAGCAGUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGAUUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGAAGCUCAGGACCACCCACAUAGGUGCAGGCCAUCAUGCCCAGCUAAUUUUUUAUUUUUUUUUAUAGAGAAGGAGUCUCGCUAUGUUGCCCAGGCUGGUUUCGAACUCCUGGGCUCAAGCGAUCGAUCCUCCCGCCUCUAGCCUCCCAAAGCACUAGAAUUAUAGGCCUGAGCCACUGCGCCCGGCCCACCAUCCUGUUCUUAUUGGAAGAAUUUCCAUGUGUCGAGGCACGGGCACAACGUAGCUGGUCCUCUGCUCAGGGCCCCACAAGGCUGCGUCAGGGUGGCAGCGCGGCUGGGGGCUUUUUCUGUUCAAAUCCAGAUUCUCGUGGCUGUGAGCCCCAGCCCUGGGCACUGUCCGCCUGGUGGUGUCUUCACAGCCAGCAGGGGUGGCCUUGGGGUGUUCUGUGGAGUAACUUUCACGGCCCAGAGUGGG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2943.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3052.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 2108.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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