Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_058164.4
Sequence Length
1982 nt
GC Content
0.6115
GGGGCGGAAUCCCGGCCGCCGGCGAGGCGGGGGAGGCGGCGGCGCAGGGUCGCCCCGGCCGGGCGGGCGGGGUCGCGCCUGGUGGCGGUCCCCGCGCCGAGGCGCCGCUAGGGCGGGCGGGGGUCGGGACGCCGGGCUAGGGGCGCGUCAUGUGGCCGCUCACGGUCCCGCCGCCGCUGCUGCUGCUGCUGUGCUCAGGCCUGGCCGGACAGACUCUCUUCCAGAACCCAGAAGAGGGCUGGCAGCUGUACACCUCAGCCCAGGCCCCUGACGGGAAAUGCAUCUGCACGGCCGUGAUCCCAGCGCAGAGUACCUGCUCUCGAGAUGGCAGGAGUCGGGAGCUGCGGCAACUGAUGGAGAAGGUCCAGAACGUCUCCCAGUCCAUGGAGGUCCUUGAGUUGCGGACGUAUCGCGACCUCCAGUAUGUACGCGGCAUGGAGACCCUCAUGCGGAGCCUGGAUGCGCGGCUCCGGGCAGCUGAUGGGUCCCUCUCGGCCAAGAGCUUCCAGGAGCUGAAGGACAGGAUGACGGAACUGUUGCCCCUGAGCUCGGUCCUGGAGCAGUACAAGGCAGACACGCGGACCAUUGUACGCUUGCGGGAGGAGGUGAGGAAUCUCUCCGGCAGUCUGGCGGCCAUUCAGGAGGAGAUGGGUGCCUACGGGUAUGAGGACCUGCAGCAACGGGUGAUGGCCCUGGAGGCCCGGCUCCACGCCUGCGCCCAGAAGCUGGGCUGUGGGAAGCUGACCGGGGUCAGUAACCCCAUCACCGUUCGGGCCAUGGGGUCCCGCUUCGGCUCCUGGAUGACUGACACGAUGGCCCCCAGUGCGGAUAGCCGGGUCUGGUACAUGGAUGGCUAUUACAAAGGCCGCCGGGUCCUGGAGUUCCGUACCCUGGGAGACUUCAUCAAAGGCCAGAACUUUAUCCAGCACCUGCUGCCCCAGCCGUGGGCGGGCACGGGCCACGUGGUGUACAACGGCUCCCUGUUCUAUAACAAGUACCAGAGCAACGUGGUGGUCAAAUACCACUUCCGCUCGCGCUCUGUGCUGGUGCAGAGGAGCCUCCCGGGCGCCGGUUACAACAACACCUUCCCCUACUCCUGGGGCGGCUUCUCCGACAUGGACUUCAUGGUGGACGAGAGCGGGCUCUGGGCUGUGUACACCACCAACCAGAACGCGGGCAACAUCGUGGUCAGCCGGCUGGACCCGCACACCCUCGAGGUCAUGCGGUCCUGGGACACCGGCUACCCCAAGCGCAGCGCUGGCGAGGCCUUCAUGAUCUGCGGUGUGCUCUACGUGACCAACUCCCACCUGGCUGGGGCCAAGGUCUACUUCGCCUAUUUUACCAACACGUCCAGUUACGAGUACACGGACGUGCCCUUCCACAACCAGUAUUCCCACAUCUCGAUGCUGGAUUACAACCCCCGGGAGCGCGCCCUCUAUACCUGGAACAACGGCCACCAGGUGCUCUACAAUGUCACCCUGUUUCACGUCAUCAGCACCUCUGGGGACCCCUGAGCCAAUGCUGUGGCUCGGGCUGCUGCCUGGGGGGCCUCUGGGGGCUGGGGGCCCUUUUCAUUCUGCCUGUGUCCCUCAAGGGUGAUCUCUCUGUCUCUGUCACGCCCUUUCUCCCCGCCUUUUUGCUGGGCUUUUGUUCUCUGCCUAUGUAUUUCUGUCUAUUUUUUCAAUUUCCCCUCUUCUCCUUUAUUGAUCUCUGCUUUUAAUACACCACUUCUUUCUUUCUGCCUUUUUAUGGAUGUCUUUUUCUUUUUAUGGCUCUGGUUCUCCAGUUCUUUCCGUCUCUGCCUCUCUCUGUCUCUCUCUCUCUGUCCUUCCACCCCUCCCUCCUUGCUUCCCACCCAUUCCUCAUCCCUCACUCCCACCCCCACCCCCACCCCCAGGAGUUGAGUGCAUGGAUCUGUUUCUUUUUUUAUUUACACUUUUUCUUUCCGGUUUGCCGGAAUAAACAGGACCUUUGACAUUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-810.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -840.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 652.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((...(((((((.....)))))(((((((((((((((..((((((((.....))))).((((((.(.((((....))))).)))))))))...))))))))((((.(((.((((((.((((((((((((((((((((((((..(...((((....(((((((..(((((((((((.(((.(((.((((..(((((((((..((((((((((((.........))))))))((((..((((.......))))))))..(((....))).......))))..))))))..((((.((.((((.....)))).)).).))))))..))))))).))).))))))((((..(((((.(........).)))))))))...((((((((........((((.....))))))))))))........))))).))).)))).....))))...)..))))).(((((((.((.((((....((((......))))...)))).)).)))))))...(((((..........))))))))))).))))))))...(((((((....(((((((...(((((....((..(((((((.((((.((((.....)))))))).)))....))))..))...(((((((((.(((......((((...((((.(.(((((..(((((.(((.((((((((((((((((.....)))...((((((...))))))(((((((((((((.((((.......(((((((..((.....))..)))))))))))..)))))).((((((((.........((((((((((((((((...(((((((((((........((((........)))))))))).)))))...)))))))..)))).............))))).....)))))))).((((...((((((((((((((..((((((((((((((((((((((.((((....((((....))))....(((((((...((((((......))))))..((((((.(((((((((..(((.(((((((((((((((((.(..((.................))..).))))))).)))))))).....)).))).))))).)).)).))))))))))))))))))))))))))).........((((((...(((...((((.((((((.(((((.(((.(((.....)))..))))))))(((....)))(((......))).....))))))..))))...))).))))))))).)))...)))).))....)))))..)))))))))..)))).....................(((((((.((.......))..)))))))...))))))).((((((((..........)))))))).........((((((((((.((((((((....)))).....((((.(((((((((.....((((...........))))....))))))..))))).))...((((((......)))))))))))))).))))))))))))))((((((.(.((((............)))).)))))))..))))).))).).))))..))).)).).))))....))))......((((((((...........))))).)))......................))).))))))))).((((((.........))))))..................(((.......(((........)))......))).((((....)))).....))))).)))))))....))).))))........)))))...))))))))).))))))))))).)).)))))...))))..(((((....................))))).(((((((.((.(((((((.......................((((((....)))))).))))))).))..)).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,(({,..||{{||{||||.{{|||||(((((((((((((((.,((((({{(,,,,,|||||,((((((.(.((((....))))).))))))}))...}))))}}}{(((.(((.(((((,.(((((((((((({{((((((((({.,|,|,(({|,,..{|||||{||((|({{,((((|{((,(((||(({..{|||(((((,.((({||{{{({{..,......||||}|||((((..((((.......)))))))).||{{.,.,})},,.,|,.|))),.)))))}.,{,{{,((,((((,....}})).)}.},|},))).||}),))).))).)))))|,{{(.,(((({.(,|,....,},|||||||||,{.(((((((({,{{.{{((({,.,,|,|}},))}}}})}|,,,|..,))))).,||.||||{{{{.||||.{{{{{||,||.,{|||||}||},|||}}.}|||||}....}}}),.,}||}|||||||}|||..|{{(((,.,|||,...,}))))}})))},})))))),,,||{((((....(((((((...((({{,...,|,.|||,{((,(((((((((,..,.}}}}}))),|}}|...|||||,|,...{((((((({.(((,,,,,,,((({..(({({(.(((((,.{{(((,(((,((((({(((((({(((.....}}}.,.((((((...)))))){((((({{(((((,{((({,.....(((((((..((.....))..)))))))))))..}))))).((((((((,,{.,..,,((((((((((((((((...(((((((((((........((((........)))))))))).)))))...))))))}.})))).|...,,.,,...})})),....)))))))}.{(((...((((((((((((((.,(((((((({{{{(((((((((,,(((({,{{((((,,...}},.{,,(((((((...((((((,.....})))))..|{||{|,(({,{||||}}|||)),{{(((((((((((((.(..((.................)}..).))))))).))))))}|{..((((.....)))).,)).,},)))))))}}}})))))))))))))))).........{({(((...{{{,||((((,((((((.((({{{(((.(((.....)))..)))))))),{{....))}|||...,,.|||{...})))))}..))))...})).))})))))),))),..)))).))..,.)))))..)))))))))..}))}.......,,,,..........(((((((.({.......,,..)))))))...,}}}}}}.((((((((..........)))))))).......,{((((((((((.((((((({....}))).....((((.(((((((((.....{(({.|,...},...)}))....))))))}.})))).))...((((((......)))))))))))))).))))))))))))))|||||}}|}|||{............)}}}.}},)))}},})))),))).}}))))..})),},})})))}.,,})}})}}...,|}|||||,....,..,,.,))}}},))),,..,},,..............,))}))))))}}}.{{{{{{.........}})))}..................(((.......(((........)))......))).((((....)))).....})))).)))))))....))),)))}........))))),,,,)))),))).))}}))))))}.,},...||,|.,,,{{{(((((....................))))}|}||{|,|.||.{{((({,.......................((((((....)))))).,)))))).}}..,}.,,,,...
Back