Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_058244.4

Sequence Length

1581 nt

GC Content

0.5142

CUCACUUCUCUGGACUUGGCCCUGAGCUGGACCUGGUCCACUGGGGUAGGCAGGGCGAUGGGGAACCUGUUUAUGCUCUGGGCAGCUCUGGGCAUAUGCUGUGCUGCAUUCAGUGCCUCUGCCUGGUCAGUGAACAAUUUCCUGAUAACAGGUCCCAAGGCCUAUCUGACCUACACGACUAGUGUGGCCUUGGGUGCCCAGAGUGGCAUCGAGGAGUGCAAGUUCCAGUUUGCUUGGGAACGCUGGAACUGCCCUGAAAAUGCUCUUCAGCUCUCCACCCACAACAGGCUGAGAAGUGCUACCAGAGAGACUUCCUUCAUACAUGCUAUCAGCUCUGCUGGAGUCAUGUACAUCAUCACCAAGAACUGUAGCAUGGGUGACUUCGAAAACUGUGGCUGUGAUGGGUCAAACAAUGGAAAAACAGGAGGCCAUGGCUGGAUCUGGGGAGGCUGCAGCGACAAUGUGGAAUUUGGGGAAAGGAUCUCCAAACUCUUUGUGGACAGUUUGGAGAAGGGGAAGGAUGCCAGAGCCCUGAUGAAUCUUCACAACAACAGGGCCGGCAGACUGGCAGUGAGAGCCACCAUGAAAAGGACAUGCAAAUGUCAUGGCAUCUCUGGGAGCUGCAGCAUACAGACAUGCUGGCUGCAGCUGGCUGAAUUCCGGGAGAUGGGAGACUACCUAAAGGCCAAGUAUGACCAGGCGCUGAAAAUUGAAAUGGAUAAGCGGCAGCUGAGAGCUGGGAACAGCGCCGAGGGCCACUGGGUGCCCGCUGAGGCCUUCCUUCCUAGCGCAGAGGCGGAACUGAUCUUUUUAGAGGAAUCACCAGAUUACUGUACCUGCAAUUCCAGCCUGGGCAUCUAUGGCACAGAGGGUCGUGAGUGCCUACAGAACAGCCACAACACAUCCAGGUGGGAGCGACGUAGCUGUGGGCGCCUGUGCACUGAGUGUGGGCUGCAGGUGGAAGAGAGGAAAACUGAGGUCAUAAGCAGCUGUAACUGCAAAUUCCAGUGGUGCUGUACGGUCAAGUGUGACCAGUGUAGGCAUGUGGUGAGCAAGUAUUACUGCGCACGCUCCCCAGGCAGUGCCCAGUCCCUGGGUAAGGGCAGUGCCUGAUAAUACCCCACACAAGUUCACUUGAUUAAUUGCAUCAGUGGAAGGGGACAUAGCUUCUCUCUUAGAGAGAACAGAUUGGAAAGCAAUCGGAAAAUUGCAGUUUUGGUCUGUAGUCCUCAUGAUAUCUGCUAUCAGUGGGGAAAAUGGAGGCCCAAGAUUCUACAGCAUAUUCCUGGCGGGGCUGAAAUUGGAACCUGGGCCUCCUGACUUUGGCAGACCCCCAUUUCAUCUUUCCUGCAAACUACUUUCCCAUCUUUGUGCCUGUACUUAUGCAGCUUUCUACAGGGAGAGUUUGGUUUGGGGUCUAUAUCUAGAGGGACCUUCAAAGUAUUUGUUCCUUUAAAUUUCAGACCAUGUCCAACCCAGCUGUGCUGCUGGGAAUCAGGAGAAUAGAAGCAAAAAACGAAAGAGUUCUGUUCAGACUUCUGAAGAGCAGCCUGUGGCUACAAAUCUAUGCUGAUAAAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-587.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -614.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 388.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((((((((...(((((((.((.(((((...))))))).)))....((((((((((((...))))))...((((((((((.....((((((((((......))))...))))))..((((((((((.(((....))))))))..)))))(((((((((..........((((.....))))))))))))))))))))))).((((......)))).(((((((((.(........).))))))))))))))).....(((.(((((((..............))))))).)))))))))))))))..........((((((((.(((((...))))))).))))))....((((.(((((..((((((((((((..(((.......(((((((((..((((((......((......))...))))..(((((((...(((((((((.(((((......(((..((((((.......((((((((((((....)))..)))))))))......((..((((.(.((((((.((...........)).)))))))))))..))(((.......))).((((......(((((....)))))))))(((((((.(((((((((((...(((.....))))))))))).........))).)))))))........))))))..)))........(((..((((...(((......)))...))))..)))...((((....))))(((.((.....)).)))...))))).))))))))).......((((..((((...((((((.....((....))...))))))))))..))))...)))))))(((((((.((((((.......)))))).)))))))))..))))))))).((((...((((((((((......)))(((.((....)).))).....((((..((((((.(((.((((((....(((((((((.....((((((..((.(...(((((.((((((.....(((((((((.(((..((((.((..(((((.((((..(((....)))....))))))((((((.(((((...((...))...))))).))))))...)))..))))))..))))))))))))....)))))).)))))).))..))))))((((((...))))))(((((((((((.(((((......)))))..)))))))))))..(((((((((((.....))))).))))))....(((((((((.(.(((((((((....(((....)))))))....)))))).)))))))))))))))))).......)).)))).)))..))))))..))))...))))))).)))).(((((....)))))((((((....)))))).((((.....(((((..((.(((((((((.............))))))))).))...)))))....))))((((((......))))))..((((((((((((((................))))))))....)))))).)))..)))))).))))))..))).)).))))...))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((,((({{((({((,(({((,.,,.{||{|}.,)))))}})))}}|||(({(({{(((((,,.}}}||},,{(((({(((({,,,,.{(((({{{({....,,}}||.,,|}}}},..((((((((((.(({....})))))))..))))){((((((((..........((((.....))))))))))))|||||||}|||.((,(,{{{{{||||.{((((((((,(.,.....,}.))))))))))),,,,.....||}}|||,((({,{{{{{.......}}}}}}|||||,||.}}}}}}}},..,,..,,,{{((((((,{((({,,,}}|||}}.}}||}}...,||{{,|||||.,|||||||||{||,,{{{.......(((((((((..((((((...,..((......)},,.))))..(((((((...(((((((((.(((((.,,,,.(((..((((((.......(((((((((({(....})}.})))))))))......((..((((.{.((((((.((...........)).))))))}))))..))(((.......))).(((({,....,{(((....)))))))))(((((((.(((((((((((...((,...,},}})))))))),........})).)))))))........))))))..))).,,.....,,({(((((...,{{......}},...}},|{{||...,}}}|....))))|||.,(,{,,.}}.))))),))))).))))))))),,}.,||{{|,.,||{{,,.(({{{{,,.,.}||},|||..,})})}.))}}.,))))...)))))))(((((((.((((((.{....,)))))).)))))))))..))))))))).,,,,...,|||||||||,,.||.))},||}||||,.},|}}},|||,|||{,.((((((.(((.((((((....(((((((((...,,((((({..((,(...(((((.((((((.,,..(((((((((.(((..((((.((..,{{((,({((..((.....})).}.,))}}}}((((((.(((((...((...))...))))).))))))...,,,.,),))))..)))))))))))).,,.)))))).)))))}.}}..}}}})}((((((...))))))(((((((((({.(((({......}))))..)))))))))))..(((((((((((.....))))}.))))))....(((((((((.(.(((((((((....(((....)))))))....))))),}))))))))))))))))))....,}.},.)))).)))..))))))..}}}},}})})))),.}}))}||{{|....})}}|{{{{{{....))))))}{(((.....(((((..{{.(((((((((.............))))))))).}}.,.)))))....))),((((((......))))))..((((((((((((((.,.............})))))))}...,)))))).})).,})}}}}}}))}}}..})}.}}.))))...})))