Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_080596.3
Sequence Length
457 nt
GC Content
0.5908
ACUUUCAGUAAGUUGUGACCAGUAUGUCUGGACGUGGCAAGCAAGGCGGUAAAGCUCGCGCCAAGGCCAAGACCCGCUCUUCUCGGGCUGGGCUUCAGUUCCCCGUGGGCCGAGUGCACCGCCUGCUCCGCAAGGGUAAUUAUGCCGAGCGGGUUGGAGCCGGCGCGCCAGUGUACCUGGCUGCGGUGCUGGAGUACCUGACCGCUGAGAUCCUGGAGCUGGCUGGCAAUGCGGCCCGCGACAACAAGAAGACCCGUAUCAUCCCGCGUCACCUCCAACUGGCCAUCCGCAACGACGAGGAGCUCAACAAGCUGCUGGGCAAAGUCACCAUCGCGCAGGGUGGUGUCUUGCCCAAUAUCCAGGCCGUGCUGCUGCCUAAGAAGACUGAGAGCCACCAUAAGGCCAAAUAAGGAGCGAGGUUGUGAAAACUGGAAAACAAAGGCUCUUUUCAGAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -185.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((((.((((.....))))..((((..((((.((((((...(((((.(((.(((((.((.((((.......)))))).)))))((........))))))))))..))))))))))))))...((((....))))..((.((((((((..((((((((((.....))))).(((((.(.((....)).))))))........((..((.(((((......))))).))..))....((.((......)).))..)))))..)))))))).))....))))))....((.((((.....)))).))((((((.(.(((((((......))))))).)))))))....((..((((.((((.((((((......................))))......)).)))).))))..))..)))))))......((((((....)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(((((((..,((({{.{((({,,{{|||(,.((((,.{((,,((((((...(((((.{((,,({{(,{(.((((,,,....}))))}|)})}|{,,.......||)}})))))..)))))))))}||}}...((({....}))){.((.((((((((..((((((((((.....))))).{{(({,|,||....)).)}))))........((..((.(((((......))))).))..))....,,.{{...,..,,....,)))))..)))))))).)),.,.||},.,...,{(.((((.....)))).)|((((({{(.(((((((......))))))).)))))))....|}}}}|||}|}}|}||||||,,....}))))}}),,.......|||,....,||||||}.}}||,|,...}}}}},,.,,,..{|||||,,..})}))).
Back