Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_080679.3
Sequence Length
6101 nt
GC Content
0.6356
ACACAGAAGCGGCAGCCACCGAGGAGGGAGCAGUGCCGGGAGCCCCGACGGCGCCUUGCUGCAUGGAGCUGGGCCGCUGACAGCUGUCGCUGCCCGCAGCCUCUGACCUCCCUGGGACCCCGGCGUCUGAGGCUCAUAGUCUGCUCCCUGUCUUCUGUCAGCCUCAGGGCAUCCAGCGUCUCAGGCCGACCUGGGUCCCUGGGACCCGGCGUUUCGGCUUCUCAGCCAUGGAGCGGUGCAGCCGCUGCCAUCGCCUCCUCCUCCUCCUACCUCUGGUGCUGGGGCUGAGCGCGGCCCCAGGCUGGGCAGGUGCACCCCCUGUGGAUGUGCUCCGGGCCCUGAGGUUCCCCUCCCUCCCUGAUGGUGUCCGGAGAGCGAAAGGCAUCUGUCCAGCUGAUGUGGCCUACCGAGUGGCACGACCUGCCCAGCUCAGUGCACCCACUCGCCAGCUUUUCCCAGGAGGAUUUCCCAAAGAUUUCUCUCUGCUGACUGUUGUCCGGACCCGCCCUGGUCUCCAAGCUCCCCUCCUGACUCUCUACAGUGCCCAGGGUGUCCGACAGCUGGGCCUGGAGCUGGGCCGACCUGUCCGCUUCCUGUAUGAAGACCAGACUGGGCGGCCUCAACCUCCCUCUCAGCCAGUCUUCCGAGGCCUCAGCCUAGCAGAUGGCAAGUGGCACCGUGUGGCUGUGGCUGUGAAGGGCCAGUCUGUCACCCUCAUUGUUGACUGCAAGAAGCGAGUCACCCGGCCUCUCCCCCGAAGUGCUCGUCCAGUAUUGGACACCCAUGGAGUGAUCAUCUUUGGUGCCCGUAUUCUGGAUGAAGAAGUCUUUGAGGGUGAUGUCCAGGAGCUGGCCAUUGUCCCAGGGGUCCAGGCAGCCUAUGAAUCAUGUGAACAGAAGGAGCUGGAAUGCGAGGGGGGCCAGAGGGAAAGACCCCAAAACCAACAGCCUCACAGAGCCCAGAGAUCUCCACAGCAGCAACCAUCAAGACUUCACAGGCCACAAAAUCAGGAACCCCAGAGCCAGGCUGCCCAUGGACCCCGAGGGCUGAAGGGAGAGAAAGGAGAGCCUGCAGUGUUGGAACCUGGUAUGCUCGUGGAGGGGCCCCCUGGCCCAGAAGGCCCUGCGGGAUUGAUUGGUCCCCCUGGCAUCCAGGGGAACCCAGGCCCAGUUGGAGACCCUGGAGAGAGGGGCCCCCCUGGCCGAGCAGGGCUCCCUGGAUCAGAUGGGGCUCCUGGUCCUCCUGGCACAUCUCUCAUGCUCCCAUUCCGGUUUGGCAGUGGUGGGGGUGACAAGGGCCCUGUGGUGGCGGCCCAGGAGGCUCAGGCCCAGGCGAUCCUGCAGCAGGCGAGGCUGGCGCUCCGUGGACCCCCUGGCCCCAUGGGAUACACAGGGCGCCCUGGACCCUUGGGCCAACCUGGGAGCCCUGGCCUGAAAGGAGAGUCUGGAGACUUAGGACCUCAGGGCCCCAGAGGACCUCAGGGCCUCACAGGCCCUCCUGGCAAGGCUGGGCGAAGGGGCCGGGCAGGUGCUGAUGGAGCCCGAGGGAUGCCUGGAGAUCCUGGAGUGAAGGGUGACCGAGGUUUUGAUGGACUCCCAGGGCUCCCUGGAGAGAAGGGCCAUAGGGGUGAUACUGGUGCCCAGGGCCUUCCUGGUCCCCCUGGUGAGGAUGGAGAGAGGGGAGAUGACGGGGAGAUUGGGCCUCGAGGGCUGCCUGGAGAGUCGGGACCUCGAGGUCUCCUUGGCCCCAAAGGCCCACCUGGUAUUCCUGGACCCCCUGGCGUCCGAGGCAUGGAUGGUCCCCAGGGCCCCAAAGGGAGCUUGGGACCCCAGGGAGAGCCAGGACCUCCUGGACAACAGGGCACCCCUGGGACCCAGGGUCUUCCCGGGCCCCAGGGUGCCAUCGGCCCUCAUGGAGAGAAGGGUCCUCAAGGGAAGCCAGGGCUCCCCGGCAUGCCUGGCUCAGACGGACCCCCGGGUCACCCAGGGAAGGAAGGUCCCCCUGGAACCAAAGGAAACCAGGGUCCCUCUGGACCUCAGGGACCUCUAGGAUACCCAGGACCUCGAGGGGUCAAGGGUGUGGACGGAAUUCGGGGUCUGAAGGGUCAUAAGGGUGAGAAGGGUGAGGAUGGCUUUCCUGGGUUCAAAGGUGACAUAGGCGUGAAAGGUGACAGGGGCGAAGUUGGAGUCCCUGGUUCCAGGGGAGAGGAUGGUCCUGAGGGGCCAAAGGGACGCACUGGACCGACUGGAGACCCUGGGCCCCCAGGGCUCAUGGGCGAGAAGGGCAAGCUGGGUGUUCCUGGUCUGCCUGGCUAUCCUGGACGUCAGGGACCCAAGGGGUCCCUAGGAUUUCCUGGCUUUCCUGGUGCCAGUGGAGAGAAGGGAGCCCGGGGCCUGUCGGGGAAGUCAGGGCCUCGGGGAGAACGGGGCCCCACGGGUCCACGGGGUCAGCGGGGACCCCGAGGUGCCACUGGGAAGUCUGGAGCUAAGGGAACAUCUGGUGGUGAUGGCCCCCAUGGGCCCCCUGGAGAGAGGGGCCUCCCUGGACCUCAGGGUCCCAACGGGUUUCCUGGACCGAAAGGACCCCCGGGCCCCCCUGGGAAGGAUGGGCUGCCGGGACACCCAGGCCAAAGAGGAGAAGUGGGUUUCCAAGGGAAGACCGGCCCCCCUGGUCCUCCAGGAGUGGUGGGACCUCAGGGAGCAGCAGGAGAAACCGGCCCUAUGGGGGAGAGAGGUCACCCAGGCCCCCCGGGGCCCCCUGGAGAGCAGGGACUACCUGGGACAGCUGGAAAAGAAGGAACAAAGGGUGACCCUGGUCCCCCUGGGGCCCCAGGGAAGGAUGGUCCUGCUGGUCUGAGGGGAUUCCCAGGAGAGAGAGGCCUCCCAGGCACUGCUGGUGGACCUGGUUUGAAGGGGAAUGAAGGUCCGUCUGGCCCCCCUGGCCCUGCAGGCUCCCCUGGGGAACGAGGUGCAGCAGGAUCAGGGGGACCCAUUGGUCCGCCAGGGCGCCCAGGCCCGCAGGGUCCCCCUGGAGCAGCAGGAGAGAAAGGUGUCCCAGGUGAGAAGGGCCCCAUUGGCCCGACUGGCCGAGAUGGAGUGCAGGGUCCUGUGGGGCUUCCUGGUCCUGCUGGGCCUCCAGGUGUGGCUGGAGAGGAUGGAGACAAGGGUGAGGUGGGGGACCCCGGACAGAAGGGCACCAAAGGGAACAAGGGUGAACAUGGCCCUCCUGGACCCCCUGGACCCAUUGGUCCUGUGGGGCAGCCUGGAGCAGCGGGAGCAGAUGGGGAGCCCGGAGCUCGGGGACCCCAGGGACACUUUGGAGCCAAAGGUGAUGAAGGAACAAGAGGAUUCAAUGGGCCCCCAGGACCCAUUGGCCUACAGGGUUUGCCAGGCCCCUCUGGGGAGAAGGGAGAAACAGGAGAUGUGGGUCCUAUGGGACCACCUGGCCCCCCAGGACCUCGAGGUCCAGCUGGACCCAAUGGCGCUGAUGGCCCACAAGGUCCCCCAGGAGGUGUUGGGAACCUGGGUCCCCCUGGAGAGAAGGGGGAACCAGGAGAGUCAGGAUCUCCAGGGAUCCAGGGCGAGCCAGGUGUCAAGGGUCCACGCGGGGAACGUGGAGAGAAAGGAGAGUCGGGGCAGCCAGGAGAGCCAGGGCCACCAGGGCCUAAAGGCCCCACAGGCGAUGAUGGCCCCAAAGGGAACCCUGGUCCUGUUGGUUUUCCUGGUGACCCUGGCCCCCCUGGAGAAGGUGGCCCUCGGGGCCAGGAUGGUGCUAAGGGUGACCGAGGCGAGGAUGGUGAGCCAGGACAGCCUGGAUCCCCUGGUCCCACCGGGGAGAAUGGACCCCCAGGGCCACUUGGAAAGCGAGGUCCUGCUGGCUCGCCUGGUUCCGAGGGGCGACAAGGAGGGAAGGGAGCCAAGGGAGAUCCUGGCGCUAUAGGUGCCCCGGGGAAGACAGGCCCGGUGGGUCCUGCAGGCCCAGCAGGGAAACCUGGCCCUGAUGGUCUGAGGGGGCUCCCAGGCUCAGUGGGUCAGCAAGGCCGACCUGGAGCUACAGGCCAGGCUGGGCCCCCAGGUCCUGUGGGACCCCCAGGGCUGCCUGGUCUCCGGGGCGAUGCUGGAGCCAAGGGAGAGAAGGGCCACCCAGGUCUCAUUGGACUGAUUGGGCCCCCGGGUGAGCAGGGAGAGAAGGGAGAUCGGGGACUUCCUGGGCCUCAGGGCUCCCCUGGGCAGAAGGGUGAGAUGGGUAUCCCAGGAGCAUCCGGCCCCAUUGGUCCUGGAGGUCCCCCCGGCCUCCCCGGACCUGCUGGCCCCAAAGGAGCCAAAGGAGCCACAGGCCCAGGCGGACCCAAGGGAGAGAAGGGUGUGCAGGGCCCUCCAGGACACCCGGGUCCCCCAGGCGAGGUGAUCCAGCCACUGCCCAUUCAGAUGCCCAAGAAGACUCGGCGCUCGGUGGAUGGAAGCCGUCUGAUGCAGGAAGAUGAGGCCAUACCGACCGGGGGAGCCCCCGGCAGUCCUGGGGGGCUGGAGGAGAUCUUUGGCUCACUCGACUCCCUGCGGGAGGAGAUCGAGCAGAUGAGGCGGCCAACAGGGACCCAGGACAGCCCUGCUCGCACCUGCCAGGACCUGAAGCUGUGCCACCCAGAGCUUCCCGAUGGAGAGUACUGGGUCGACCCCAACCAGGGCUGUGCUCGGGAUGCCUUCCGAGUUUUCUGCAACUUCACAGCAGGGGGUGAGACCUGUGUGACGCCUAGGGAUGACGUCACGCAGUUCUCUUACGUGGACUCAGAGGGCUCCCCAGUGGGUGUGGUCCAGCUCACCUUCCUGCGGCUGCUCAGCGUCUCAGCCCACCAGGACGUCUCCUACCCCUGCUCUGGAGCAGCCCGUGACGGUCCCCUGAGACUCCGUGGGGCCAAUGAGGAUGAGCUGAGCCCGGAGACUAGCCCCUAUGUCAAAGAAUUCAGAGAUGGCUGCCAGACACAGCAAGGCCGGACGGUGCUG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2956.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3047.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 1231.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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