Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_080681.3
Sequence Length
6164 nt
GC Content
0.6353
ACACAGAAGCGGCAGCCACCGAGGAGGGAGCAGUGCCGGGAGCCCCGACGGCGCCUUGCUGCAUGGAGCUGGGCCGCUGACAGCUGUCGCUGCCCGCAGCCUCUGACCUCCCUGGGACCCCGGCGUCUGAGGCUCAUAGUCUGCUCCCUGUCUUCUGUCAGCCUCAGGGCAUCCAGCGUCUCAGGCCGACCUGGGUCCCUGGGACCCGGCGUUUCGGCUUCUCAGCCAUGGAGCGGUGCAGCCGCUGCCAUCGCCUCCUCCUCCUCCUACCUCUGGUGCUGGGGCUGAGCGCGGCCCCAGGCUGGGCAGGUGCACCCCCUGUGGAUGUGCUCCGGGCCCUGAGGUUCCCCUCCCUCCCUGAUGGUGUCCGGAGAGCGAAAGGCAUCUGUCCAGCUGAUGUGGCCUACCGAGUGGCACGACCUGCCCAGCUCAGUGCACCCACUCGCCAGCUUUUCCCAGGAGGAUUUCCCAAAGAUUUCUCUCUGCUGACUGUUGUCCGGACCCGCCCUGGUCUCCAAGCUCCCCUCCUGACUCUCUACAGUGCCCAGGGUGUCCGACAGCUGGGCCUGGAGCUGGGCCGACCUGUCCGCUUCCUGUAUGAAGACCAGACUGGGCGGCCUCAACCUCCCUCUCAGCCAGUCUUCCGAGGCCUCAGCCUAGCAGAUGGCAAGUGGCACCGUGUGGCUGUGGCUGUGAAGGGCCAGUCUGUCACCCUCAUUGUUGACUGCAAGAAGCGAGUCACCCGGCCUCUCCCCCGAAGUGCUCGUCCAGUAUUGGACACCCAUGGAGUGAUCAUCUUUGGUGCCCGUAUUCUGGAUGAAGAAGUCUUUGAGGGUGAUGUCCAGGAGCUGGCCAUUGUCCCAGGGGUCCAGGCAGCCUAUGAAUCAUGUGAACAGAAGGAGCUGGAAUGCGAGGGGGGCCAGAGGGAAAGACCCCAAAACCAACAGCCUCACAGAGCCCAGAGAUCUCCACAGCAGCAACCAUCAAGACUUCACAGGCCACAAAAUCAGGAACCCCAGAGCCAGGACCCCACCCCAGGUGAAGAGGAAGAAAUCCUGGAGUCGAGCCUCUUGCCACCCCUUGAGGAGGCUGCCCAUGGACCCCGAGGGCUGAAGGGAGAGAAAGGAGAGCCUGCAGUGUUGGAACCUGGUAUGCUCGUGGAGGGGCCCCCUGGCCCAGAAGGCCCUGCGGGAUUGAUUGGUCCCCCUGGCAUCCAGGGGAACCCAGGCCCAGUUGGAGACCCUGGAGAGAGGGGCCCCCCUGGCCGAGCAGGGCUCCCUGGAUCAGAUGGGGCUCCUGGUCCUCCUGGCACAUCUCUCAUGCUCCCAUUCCGGUUUGGCAGUGGUGGGGGUGACAAGGGCCCUGUGGUGGCGGCCCAGGAGGCUCAGGCCCAGGCGAUCCUGCAGCAGGCGAGGCUGGCGCUCCGUGGACCCCCUGGCCCCAUGGGAUACACAGGGCGCCCUGGACCCUUGGGCCAACCUGGGAGCCCUGGCCUGAAAGGAGAGUCUGGAGACUUAGGACCUCAGGGCCCCAGAGGACCUCAGGGCCUCACAGGCCCUCCUGGCAAGGCUGGGCGAAGGGGCCGGGCAGGUGCUGAUGGAGCCCGAGGGAUGCCUGGAGAUCCUGGAGUGAAGGGUGACCGAGGUUUUGAUGGACUCCCAGGGCUCCCUGGAGAGAAGGGCCAUAGGGGUGAUACUGGUGCCCAGGGCCUUCCUGGUCCCCCUGGUGAGGAUGGAGAGAGGGGAGAUGACGGGGAGAUUGGGCCUCGAGGGCUGCCUGGAGAGUCGGGACCUCGAGGUCUCCUUGGCCCCAAAGGCCCACCUGGUAUUCCUGGACCCCCUGGCGUCCGAGGCAUGGAUGGUCCCCAGGGCCCCAAAGGGAGCUUGGGACCCCAGGGAGAGCCAGGACCUCCUGGACAACAGGGCACCCCUGGGACCCAGGGUCUUCCCGGGCCCCAGGGUGCCAUCGGCCCUCAUGGAGAGAAGGGUCCUCAAGGGAAGCCAGGGCUCCCCGGCAUGCCUGGCUCAGACGGACCCCCGGGUCACCCAGGGAAGGAAGGUCCCCCUGGAACCAAAGGAAACCAGGGUCCCUCUGGACCUCAGGGACCUCUAGGAUACCCAGGACCUCGAGGGGUCAAGGGUGUGGACGGAAUUCGGGGUCUGAAGGGUCAUAAGGGUGAGAAGGGUGAGGAUGGCUUUCCUGGGUUCAAAGGUGACAUAGGCGUGAAAGGUGACAGGGGCGAAGUUGGAGUCCCUGGUUCCAGGGGAGAGGAUGGUCCUGAGGGGCCAAAGGGACGCACUGGACCGACUGGAGACCCUGGGCCCCCAGGGCUCAUGGGCGAGAAGGGCAAGCUGGGUGUUCCUGGUCUGCCUGGCUAUCCUGGACGUCAGGGACCCAAGGGGUCCCUAGGAUUUCCUGGCUUUCCUGGUGCCAGUGGAGAGAAGGGAGCCCGGGGCCUGUCGGGGAAGUCAGGGCCUCGGGGAGAACGGGGCCCCACGGGUCCACGGGGUCAGCGGGGACCCCGAGGUGCCACUGGGAAGUCUGGAGCUAAGGGAACAUCUGGUGGUGAUGGCCCCCAUGGGCCCCCUGGAGAGAGGGGCCUCCCUGGACCUCAGGGUCCCAACGGGUUUCCUGGACCGAAAGGACCCCCGGGCCCCCCUGGGAAGGAUGGGCUGCCGGGACACCCAGGCCAAAGAGGAGAAGUGGGUUUCCAAGGGAAGACCGGCCCCCCUGGUCCUCCAGGAGUGGUGGGACCUCAGGGAGCAGCAGGAGAAACCGGCCCUAUGGGGGAGAGAGGUCACCCAGGCCCCCCGGGGCCCCCUGGAGAGCAGGGACUACCUGGGACAGCUGGAAAAGAAGGAACAAAGGGUGACCCUGGUCCCCCUGGGGCCCCAGGGAAGGAUGGUCCUGCUGGUCUGAGGGGAUUCCCAGGAGAGAGAGGCCUCCCAGGCACUGCUGGUGGACCUGGUUUGAAGGGGAAUGAAGGUCCGUCUGGCCCCCCUGGCCCUGCAGGCUCCCCUGGGGAACGAGGUGCAGCAGGAUCAGGGGGACCCAUUGGUCCGCCAGGGCGCCCAGGCCCGCAGGGUCCCCCUGGAGCAGCAGGAGAGAAAGGUGUCCCAGGUGAGAAGGGCCCCAUUGGCCCGACUGGCCGAGAUGGAGUGCAGGGUCCUGUGGGGCUUCCUGGUCCUGCUGGGCCUCCAGGUGUGGCUGGAGAGGAUGGAGACAAGGGUGAGGUGGGGGACCCCGGACAGAAGGGCACCAAAGGGAACAAGGGUGAACAUGGCCCUCCUGGACCCCCUGGACCCAUUGGUCCUGUGGGGCAGCCUGGAGCAGCGGGAGCAGAUGGGGAGCCCGGAGCUCGGGGACCCCAGGGACACUUUGGAGCCAAAGGUGAUGAAGGAACAAGAGGAUUCAAUGGGCCCCCAGGACCCAUUGGCCUACAGGGUUUGCCAGGCCCCUCUGGGGAGAAGGGAGAAACAGGAGAUGUGGGUCCUAUGGGACCACCUGGCCCCCCAGGACCUCGAGGUCCAGCUGGACCCAAUGGCGCUGAUGGCCCACAAGGUCCCCCAGGAGGUGUUGGGAACCUGGGUCCCCCUGGAGAGAAGGGGGAACCAGGAGAGUCAGGAUCUCCAGGGAUCCAGGGCGAGCCAGGUGUCAAGGGUCCACGCGGGGAACGUGGAGAGAAAGGAGAGUCGGGGCAGCCAGGAGAGCCAGGGCCACCAGGGCCUAAAGGCCCCACAGGCGAUGAUGGCCCCAAAGGGAACCCUGGUCCUGUUGGUUUUCCUGGUGACCCUGGCCCCCCUGGAGAAGGUGGCCCUCGGGGCCAGGAUGGUGCUAAGGGUGACCGAGGCGAGGAUGGUGAGCCAGGACAGCCUGGAUCCCCUGGUCCCACCGGGGAGAAUGGACCCCCAGGGCCACUUGGAAAGCGAGGUCCUGCUGGCUCGCCUGGUUCCGAGGGGCGACAAGGAGGGAAGGGAGCCAAGGGAGAUCCUGGCGCUAUAGGUGCCCCGGGGAAGACAGGCCCGGUGGGUCCUGCAGGCCCAGCAGGGAAACCUGGCCCUGAUGGUCUGAGGGGGCUCCCAGGCUCAGUGGGUCAGCAAGGCCGACCUGGAGCUACAGGCCAGGCUGGGCCCCCAGGUCCUGUGGGACCCCCAGGGCUGCCUGGUCUCCGGGGCGAUGCUGGAGCCAAGGGAGAGAAGGGCCACCCAGGUCUCAUUGGACUGAUUGGGCCCCCGGGUGAGCAGGGAGAGAAGGGAGAUCGGGGACUUCCUGGGCCUCAGGGCUCCCCUGGGCAGAAGGGUGAGAUGGGUAUCCCAGGAGCAUCCGGCCCCAUUGGUCCUGGAGGUCCCCCCGGCCUCCCCGGACCUGCUGGCCCCAAAGGAGCCAAAGGAGCCACAGGCCCAGGCGGACCCAAGGGAGAGAAGGGUGUGCAGGGCCCUCCAGGACACCCGGGUCCCCCAGGCGAGGUGAUCCAGCCACUGCCCAUUCAGAUGCCCAAGAAGACUCGGCGCUCGGUGGAUGGAAGCCGUCUGAUGCAGGAAGAUGAGGCCAUACCGACCGGGGGAGCCCCCGGCAGUCCUGGGGGGCUGGAGGAGAUCUUUGGCUCACUCGACUCCCUGCGGGAGGAGAUCGAGCAGAUGAGGCGGCCAACAGGGACCCAGGACAGCCCUGCUCGCACCUGCCAGGACCUGAAGCUGUGCCACCCAGAGCUUCCCGAUGGAGAGUACUGGGUCGACCCCAACCAGGGCUGUGCUCGGGAUGCCUUCCGAGUUUUCUGCAACUUCACAGCAGGGGGUGAGACCUGUGUGACGCCUAGGGAUGACGUCACGCAGUUCUCUUACGUGGACUCAGAGGGCUCCCCAGUGGGUGUGGUCCAGCUCACCUUCCUGCGGCUGCUCAGCGUCUCAGCCCACCAGGACGUCUCCUACCCCUGCUCUGGAGCAGCCCGUGACGGUCCCCUGAGACUCCGUGGGGCCAAUGAGGAUGAGCUGAGCCCGGAG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2979.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3072.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 1234.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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