Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_133269.4
Sequence Length
2410 nt
GC Content
0.4544
AUCCUGCUAAUGUGCAUUGAAAGGAGAGCAACGGGGCUGAGGCCGUGUCAGCACGAUGGACCCCAAACAGACCACCCUCCUGUGUCUUGUGCUCUGUCUGGGCCAGAGGAUUCAGGCACAGGAAGGGGACUUUCCCAUGCCUUUCAUAUCUGCCAAAUCGAGUCCUGUGAUUCCCUUGGAUGGAUCUGUGAAAAUCCAGUGCCAGGCCAUUCGUGAAGCUUACCUGACCCAGCUGAUGAUCAUAAAAAACUCCACGUACCGAGAGAUAGGCAGAAGACUGAAGUUUUGGAAUGAGACUGAUCCUGAGUUCGUCAUUGACCACAUGGACGCAAACAAGGCAGGGCGCUAUCAGUGCCAAUAUAGGAUAGGGCACUACAGGUUCCGGUACAGUGACACCCUGGAGCUGGUAGUGACAGGCUUGUAUGGCAAACCCUUCCUCUCUGCAGAUCGGGGUCUGGUGUUGAUGCCAGGAGAGAAUAUUUCCCUCACGUGCAGCUCAGCACACAUCCCAUUUGAUAGAUUUUCACUGGCCAAGGAGGGAGAACUUUCUCUGCCACAGCACCAAAGUGGGGAACACCCGGCCAACUUCUCUUUGGGUCCUGUGGACCUCAAUGUCUCAGGGAUCUACAGGUGCUACGACUCCAUCCACCAAGAUUACACGACGCAGAACUUGAUCCGCAUGGCCGUGGCAGGACUGGUCCUCGUGGCUCUCUUGGCCAUACUGGUUGAAAAUUGGCACAGCCAUACGGCACUGAACAAGGAAGCCUCGGCAGAUGUGGCUGAACCGAGCUGGAGCCAACAGAUGUGUCAGCCAGGAUUGACCUUUGCACGAACACCAAGUGUCUGCAAGUAAACACCUGGAGGUGAAGGCAGAGAGGAGCCAGGACUGUGGAGUCCGACAAAGCUACUUGAAGGACACAAGAGAGAAAAGCUCACUAAGAAGCUUGAAUCUACUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUGGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGAGCAAUCUCGGCUCAUUGAACCUCUUGGGUUCAAGUGAUUCUUGUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGAAUUACAGGCACAUACCACUGCACCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACUGUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUAUAGGCAUGAGCCACCACGCCUGGCCAGAUGCAUGUUCAAACCAAUCAAAUGGUGUUUUCUUAUGCAGGACUGAUCGAUUUGCACCCACCUUUCUGCACAUAAGUUAUGGUUUUCCAUCUUAUCUGUCUUCUGAUUUUUUAUAUCCUGUUUAAUUUCUUCCUUCAUUGUUCUUCUCUUUUUUUAUUUAUUUUAUUUAUUUUUAUUUUUAUUUUUAUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCGGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUGCAGGCUCCCACCAUCACGCCCAGCUACUUUUACAGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCAUCACAUUGGCCAAGCUGGUCUCAAACUUCUGACCUCGUGAUCUGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGAUGUGAGCCACUGCGCCCAGCCUUCUUUUUAUAUUUUUAAAUGUGUCUUCCCCAAAUAUAAAUGGUUGGUAAGCAUGCCAAAUAUAUUCAAUAACCCCCCUCCUUUAUUUUUUUUUGUUGAAGUGAGGCUCUCCCUAUGUUGCCUAAGCUGGUCUUGAACUCCUGGUCUCAAGCAAUCCUCCUACCUCAGCCUCCUGCUGUGUUCAUCUACAAAUUGAUAAGAGUGAAAGUCAUAAUCCUACAGGAGGAUUACCCUAUUUAUUUCACAAACCCUAUUUCUACCGGAUUUUCAUACAAGGAAUACAGGCAUGUGUUUCACCUCAUUAAUUUAUUUUUUCACUUAGUUUUGAUGAUAUUCACAUAUAUUAUCAAGUGUGCAAACAUUAAAUUCUUGUGUACAAAACUCAAAUGGUCUUCCAAAUAAUUCCCCAUUCUUUUUUCUUAUAAACUUUCACAGCUUUACCCUUGACAGACUUUACUCAAGGAAAUCUAAGUUGGUCAUAUGUGGCUCUUUCACUGAUUGCUAUUUACUUCAUUGUCCAGUAGCUUAUGUAUGAAAAUAUAAUUAUAAAAUGUAAGGGUCCUACUUCCAGUGAAACUGAAGGGACUUAGGCCCACUUUUAUCCUUUACUGAGAGCUUAUCUCUACUUGAUAAAAUUUCUACUGUAUUCUUGGCUUAACUCAGGUCCUGUGAUUAAAAAAAAAAUGCAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-725.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -770.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 564.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((.(((((..(((((((((((...(((((((((((((((....)))).(((...))).........(((((((((((((.((.(((((.......))))).))..))))))))).)))).........((((...(((..(((((........(((.(((((((....(((((((((((((((..(((.(((..((((................)))).....))))))..)))))...........(((((...((((...(((....))).((((((.....))))))...((((((.....(((((((((((.((((.((((....((((((((((...)))))).....((((.((((((((((.((((((((............)))))))).))))))....(((.....)))...))))))))..))))(((....((((((((((((.((.((((((((....((((((((..((((......)))).....(((..(((.......))).))).....)))))))).))))).))).))))))))))....(((.....)))))))....))).)))).)))))))))...)))))).)))))).))))...)))))...)).))))))))....))))))).))))))))...)))...))))(((((.(((((((..((((.((.(((((.....((((((..(((((.....((((..((((((((.....(((..(.(((...))).).))).))))))))..)))).....)))))....))).)))))))).))..))))((((((.((.(((...)))))))))))..((((..((((((.(((((((((((((.((((((.(.((((.((((..(((......)))..))))..((((((...(((((........)))))...))).)))..............((((((((...)))))))).....((((((.((((((((((((.......)))).((((((((...))))))))........(((((((((((..(....)..)))).......)))))))...))))))))))))))......((((.((((((((....(((((............(((((((.(((....((.(.((((....)))).).))...))).))))))))))))...)))))))).))))(((....))).)))))))))))(((.((((((.....((((......)))).......))))))...)))...............)))))))))..(((((..((((....)))))))))..(((....)))..................))))..)))))).))))..........................................((((((((((((((((...))))))))(((((((.((((((((((((((.((....)))).)))))))..)))))...)))))))))))))))...))))))).)))))....(((((((((((..((..((......))..))..)))))))))))..............(((((.((((((((..........(((((...)))))..........))))))))..)))))..)))))))))))...(((.((((((....(((.((.....)))))..)))))))))((.(((((((((.................))))))))).))((((((....))))))..................((((((((...........))))).)))))))))).......(((((((...(.((((((((...))).))))))(((((((((..(.((((.....)))).)...(((........)))....((((...))))........))))))))).((((.((..((((((..(((((((((.......(((((((((((.((((((((....))))))))............................(((((((((((......)))))))))))(((((..(((.........)))))))).........(((....)))...................................((((((...((((((..........))))))......))))))((((...((((.....)))))))).((((((.((......))..))))))...))))))))))).........))))...)))))..........))))))..)))))).)))))))....(((((((.......((((.....)))).....)))))))))))...)))))..)))))(((((.(((...))).).)))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{{{....((((({....(((((((...(((((((((((((((....)))).{((...},,....,.,|.(({((((((((((.((.(((((.......))))).))..)))))))))}.)))|.....,,|((((...(((..(((((........(((.(((((((....(((((((({({((((..(({,((({.({((.,...,,,...,.,..)}}}....,))))))..})}}}...........(({((,,{({{{.,.({{....))).{(({{{,...,)))))),,{((((((,.,{,({{(({{{{||.{|||,{{{{..,{{|{{(({{{{...,}||||..{{{(((,.,,{,((((((.((((((((,........,,,}})))))).)))))).,..,||}}}}}))),..}}}},}}},{||||{{{{.|||||.{(((((((,(({{.{((({((...{{||{|||..{{||,..,,,))))..,,,|||,,||{..,,...))).|||,...|||||}}}}.,))))))))})}}}}|||},..{{{(({....))),))}..,,,,,.})}|,|||||}}||,,.}}}}}),))}}))))))),..))))),..)).))))))))....))))))).))))))))...)))...))))|((((.(((((((..((((.((.(((({....{((((((.,(((((,....{(((..((((({{{.|{{.({,....||{..}))}}}}},}.))))))))..))))..,,.))))).,,,})).)))))))),)}..)))),(((((.(,{(((...))))))))))|,,,,.....{((((((((((.(((((.,((,(((((.((((((((((..(((......)))..)))).,(((((({{,((((({.....}.}))))...}}}.}}}...,,,,,,..,}.((((((((...)))))))).....((((((.(((((((((,({.......}}|((((((((((...))))))))}))}....(((((((((((..(....)..)))),......)))))))..)))))))))))))))................(((((((,(((({...,,{(({((((((((((((((...,..,.({((..,,}}}|((((({{..(((.((((....)))).))).)).))))},,||{..,,)}})))).))))))))),}}|||,|,....((({......}))).......,,||||{{,......,..,})}}))),,.)))))))..(((((..((((....))))))))}..{{{....))}..})))))))))).})..))))).))))))}..,,}}}},,....,,,,,...........................((((((((((((((((...))))))))(((((((.{(((((((((((((.((....)))).)))))))..)))))...)))))))))))))))...))))))).))))}....(((((((((((..((..((......))..))..)))))))))))..............(((((.((((((((..........(((({...}))))..........))))))))..)))))..)))))))))))...(((.((((((....(((.((.....)))))..))))))))},,.{{((((((,....,,|,,......,,|}}}}}},,|}}{(((({....)))))}.,,,..............((((((((.........,.))))).))))))))))....,..((({{{{..,|.((((((((...))).))))),(((((((((..,.((((.....)))).},{,(({........}}}.,|,{{{|...,}}}........))))))))).{{{{.,{,,,{((((,.{{(({,,,,.....,,(((((((((((.((((((((....))))))))........,,...........,,..,,.,((((((((((......))))))))))}(((({{.|{{.........}}}))))}.......,,(((....}},.........,,,,,.....................((((((...((((((..........))))))......))))))((((...(((|.....,)))}))}.((((((.((......))..))))))...)))))))))))......,,..,,,},.}|||}....,,{,,,||}}}),})))))),}}))))),,,.{{(((({.......((((..,..}}}}.....)))))},.,}}...,}}},..,}))}|,,.,,|}}},,,})})},,,,......}))))}..,,.
Back