Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_133510.4
Sequence Length
1559 nt
GC Content
0.4484
GUUGCUUUGCGGCGUUUUCCGCGGGGAAACUGUGUAAAGGGUGGGGAAACUUGAAAGUUGGAUGCUGCAGACCCGGCAUGGGUAGCAAGAAACUAAAACGAGUGGGUUUAUCACAAGAGCUGUGUGACCGUCUGAGUAGACAUCAGAUCCUUACCUGUCAGGACUUUUUAUGUCUUUCCCCACUGGAGCUUAUGAAGGUGACUGGUCUGAGUUAUCGAGGUGUCCAUGAACUUCUAUGUAUGGUCAGCAGGGCCUGUGCCCCAAAGAUGCAAACGGCUUAUGGGAUAAAAGCACAAAGGUCUGCUGAUUUCUCACCAGCAUUCUUAUCUACUACCCUUUCUGCUUUGGACGAAGCCCUGCAUGGUGGUGUGGCUUGUGGAUCCCUCACAGAGAUUACAGGUCCACCAGGUUGUGGAAAAACUCAGUUUUGUAUAAUGAUGAGCAUUUUGGCUACAUUACCCACCAACAUGGGAGGAUUAGAAGGAGCUGUGGUGUACAUUGACACAGAGUCUGCAUUUAGUGCUGAAAGACUGGUUGAAAUAGCAGAAUCCCGUUUUCCCAGAUAUUUUAACACUGAAGAAAAGUUACUUUUGACAAGUAGUAAAGUUCAUCUUUAUCGGGAACUCACCUGUGAUGAAGUUCUACAAAGGAUUGAAUCUUUGGAAGAAGAAAUUAUCUCAAAAGGAAUUAAACUUGUGAUUCUUGACUCUGUUGCUUCUGUGGUCAGAAAGGAGUUUGAUGCACAACUUCAAGGCAAUCUCAAAGAAAGAAACAAGUUCUUGGCAAGAGAGGCAUCCUCCUUGAAGUAUUUGGCUGAGGAGUUUUCAAUCCCAGUUAUCUUGACGAAUCAGAUUACAACCCAUCUGAGUGGAGCCCUGGCUUCUCAGGCAGACCUGGUGUCUCCAGCUGAUGAUUUGUCCCUGUCUGAAGGCACUUCUGGAUCCAGCUGUGUGAUAGCCGCACUAGGAAAUACCUGGAGUCACAGUGUGAAUACCCGGCUGAUCCUCCAGUACCUUGAUUCAGAGAGAAGACAGAUUCUUAUUGCCAAGUCCCCUCUGGCUCCCUUCACCUCAUUUGUCUACACCAUCAAGGAGGAAGGCCUGGUUCUUCAAGGCCAAGAGAAGCCAUAGGGAUACUGUGACCUUUGUCUAGAGUUGAUGGGGGUGUGAUUUGUGAAAUAAAACAGGACCGUACUGCUUGGAAGAAGGAAACGGAAGCUGACAUAAUGGGGAUUAAUUAGUUGAUUGCUGUUGAGAUGGUAACAGAUUUGCUCCUAAACCAUUGAGCUAGCGAUUUCAGACCUAGCAGGGAAGGUGAAGAUGAAGAAGCCUUUGUUCAGGUCUCUAGAUGUGUAGGGCUGAGGGCUUUGCCGCCAUGGGAUGUCAACAGCCAUAAUAAUAAUUUGCACUUAUAUAGCACCUUUCAACCAGGCACCUCAAAGCGGUUUAACCACAUUAAUUAAUUAAAGCCCACAAUCCUCCUGGGGAGAGGAGGAGGAUGACUAACAAGAUUUGUAAUUACAGGAGGGAACAUUUCCGAAUAAAGUAUUGUCUACCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-462.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -494.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 436.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((..(((((((...)))))))..)))))))((((((.((((((.....(((((...(((..((((.....)))).)))....(((......))).((((...((((.....)))).))))((((((.......))))))((((.(((((.(((((.......)))))(((.....)))((((.(((.((((.(((((.(((......(((((((((((..((......))))))......((((....))))..(((.((((((.(((((((((..((..((((....((((((.((...(((((.(((((.((..(((.((..((((.((.(((((((((((((.....((((((((((.((((((((.(((.((...)).)))))))))))))))..(((((((.(((((...)))))......((((((((......))).))))).))).))))...((((((((((.(((..(((((...........)))))..)))...(((((((.(((((..((((..((((..(........)..))))))))...))))).))))))).......(((((.....)))))((((((.....))))))((((...(((((((((((..((((((.....((((....(((((....)))))....)))).....)))))).....((((..((..((((((.....(((((....))))).)))))).))..))))(((((((((...((((.....(((((.....))))).....))))........))))))))).((((.((((((((.........((((....(((.((...((((((........)))))))).)))..)))))))))))).))))((.(((((.((((((((..(((((((.(((......))).))....))))))))))(((((.....)))))..))).))))).)).))))))).))))...)))).)))))))))).....((((...(((.(((((......))))).))).))))..((((.((((((.(((..((((.((((..........))))))))..(((((((....)).)))))))).).))))).))))..))))))..))))))))))))).)).))))..)))))((((........))))..((((..(.(((.....))).).)))).((((((..((((....)))).)))))))).))))).)))))...)).))))))))))..))..))).)))))).........((((((.(.((.((((((............)))))).)))))))))(((......)))(((((..(((....((......))..)))..)))))..........))))))))).....))))))))))))))).)))))))))))(((((..................)))))((...(((((((......)))))))...))....((((...))))....)))))))))......)))))...)))).)).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((..(((((((...)))))))..)))))))((((((.((((((.....(((((,,,(((..((((,...,)))).)))....{{{......})}.((((...((((.....)))),)))){(((((.......)))))|((((.(((((.(((((.......)))}}(((,....})}((((.((,,((((.(((((.(((,.....(((((((,{{{,.,{.....,}}}}||((((((((((((((((((((,{{..({...,,})}}.))))......)))),.,))))))))))}.(((((.(((((.((..,{{,((.{((((,((.(((((((((((((.{{{.{,((((((((.((((((({{(((.({...}).)))))))))))))))|(((((((.{.((((((.,(({{{.,,..{(((((((......))).))))}(({{,,,...)))}.}|,,{{{{(({((({{{{{,,,.,,..,|}|(((((((,.,.(((((((.(((((..((((..((((..(,.......,}}))))))))...))))).))))))).....{{({({{,|,,,.,|||{|,{{,{{{{{(,||,,{(((......))}}.||})}},||||,|,{{({{{....|||||}..,)))},..,,}))}},..{(((((({......}))))))})))))})}.,}|||||,,,,)))))..))))))..,.)))))))|...{{,..({{,...,.{{{{,.....|||||,,({{(|{(((,.,|||||||||.,..,,(({(((,(((,.......}}||||}},.,,{|{{...((((((........))))))|,||||,.,,|}}}}}})}}|}}}}.{{((,,,..)))}.|{{.((((((((.((.((((((((.(((...(((({{(((((.(((.,...{(({(({((.....))}},..}|.,})})))..))).))))))))))...))).)))....))))).))..)))))))).}},,}|||,,|..,||,.|||||,,|||..|{||.||||.,.,,,,,,})))))))),.{||||,,.,,,}}.,})))}}),}..}}|||||}}...)))))..))))))))))))).)).)))))})))}}((((........)))}..((((..{.(((.....))).,.)))).((((((..((((....)))).)))))))).))))).))))){{{{..,|{,.,.{{||.,..,,},,.}}}},,|}|,,,,.((((((,{,((.((((((............)))))).)),)))))),,,,..{{{{{{(((((..(((..,.((.....)),,.)))..)))))...........)))))).,.....))))))))))))))).)))))))))))((({{.,,,..............}}})),,...(((((((......)))))))}},}}.,..{{{|...}))}....))))))))),.....)))))...)))).)).))))))...
Back