Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_134324.3
Sequence Length
1454 nt
GC Content
0.5839
AGUGGUUCCCGGCGUGCACCGGGGCAGUGGCUGCUGCCUCCAGCUCUAAAUAGUUUGGGGUUGGCCCGGUUCCCAGACUGCACUGGAACACUGGGCUUUAUGCCCCCACAUUCAGUGCAUUUGUAUAGAGCAAAUGCUGGCCGCCAACCCAGGCAAGACCCCGAUCAGCCUUCUGCAGGAGUAUGGGACCAGAAUAGGGAAGACGCCUGUGUACGACCUUCUCAAAGCCGAGGGCCAAGCCCACCAGCCUAAUUUCACCUUCCGGGUCACCGUUGGCGACACCAGCUGCACUGGUCAGGGCCCCAGCAAGAAGGCAGCCAAGCACAAGGCAGCUGAGGUGGCCCUCAAACACCUCAAAGGGGGGAGCAUGCUGGAGCCGGCCCUGGAGGACAGCAGUUCUUUUUCUCCCCUAGACUCUUCACUGCCUGAGGACAUUCCGGUUUUUACUGCUGCAGCAGCUGCUACCCCAGUUCCAUCUGUAGUCCUAACCAGGAGCCCCCCCAUGGAACUGCAGCCCCCUGUCUCCCCUCAGCAGUCUGAGUGCAACCCCGUUGGUGCUCUGCAGGAGCUGGUGGUGCAGAAAGGCUGGCGGUUGCCGGAGUACACAGUGACCCAGGAGUCUGGGCCAGCCCACCGCAAAGAAUUCACCAUGACCUGUCGAGUGGAGCGUUUCAUUGAGAUUGGGAGUGGCACUUCCAAAAAAUUGGCAAAGCGGAAUGCGGCGGCCAAAAUGCUGCUUCGAGUGCACACGGUGCCUCUGGAUGCCCGGGAUGGCAAUGAGGUGGAGCCUGAUGAUGACCACUUCUCCAUUGGUGUGGGCUCCCGCCUGGAUGGUCUUCGAAACCGGGGCCCAGGUUGCACCUGGGAUUCUCUACGAAAUUCAGUAGGAGAGAAGAUCCUGUCCCUCCGCAGUUGCUCCCUGGGCUCCCUGGGUGCCCUGGGCCCUGCCUGCUGCCGUGUCCUCAGUGAGCUCUCUGAGGAGCAGGCCUUUCACGUCAGCUACCUGGAUAUUGAGGAGCUGAGCCUGAGUGGACUCUGCCAGUGCCUGGUGGAACUGUCCACCCAGCCGGCCACUGUGUGUCAUGGCUCUGCAACCACCAGGGAGGCAGCCCGUGGUGAGGCUGCCCGCCGUGCCCUGCAGUACCUCAAGAUCAUGGCAGGCAGCAAGUGAAGCCCCAGCUGGACUCAUGGAUGUGCACCCUUUGCUCCCUGCUCUUUCUGCCUCUGGGCUCAUGUAUCUGCGCAGCUCUGGUACCCUCUGUGGGUGCCAUCUCUACCUCUGACACAGACUGCCUGCCUUGAAGCUGAGAAGGCACAGGGCAAGGAGCCAAGGACCACAGAGCCUCAGCCAGCCCAGGAUCCGUCCUCAUUUUAUUGGUGAUGAUGAAUGGGAAUGAAAUCAGGGGGCUGUCUACUAGAGCCUGGAAUAAAUAUGCUGCUUUGUGGAUUUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-590.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -617.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 460.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((.......((...((((((((((((((((((((.(((((((((.....((((.....)))).....))))))))))))).....(((....)))((.(((..((((.(((((....(((.((((((((((((((.((((.((((((.((((.........((((((((.(..((((((....((.(.(((((..(.(((.((((......((.((...(((....)))..)).)).....))))...))).)..)))))).)).))))))..)....)))).))))...(((((((.........))))))).((((((((((.(((((...(((....)))....)))))))......))))))))....((((((.....)))))).)))).)))))))))).))))))...((((.(((((((((((...(((((((((....))))..........(((...((((....)))).))).(((((....))))).(((.((.....))))).))))))))))))).))))))).)))))))))))))))))).)).....))).))..)))).))))))))))))...))..........((((..((.(((.((((((....))))))..))).))..)))).....((((....))))...))))))..))))))))).....))))))))).))))))..(((((((..(((.(((((((..((((((...((((((((((.(((.(((((....((((..((((.((...))))))))))))))).)))....)))).(((((((...)))))))......(((........)))(((.((......)).))))))))).)))))).))))))))))..)))))))..((((...))))...(((...(((((((........)))))))...)))...(((.(((((((.(((........))))))))).).)))((((((((((((((...))))))))...))))))...)))))))))).....((..((((((.....((((((((......))).)))))..((((((.((((((..((...........))..)))))).)))))).(((((((((((.(((((.(((.....((((...((((.(((((.((((((...(((((((.((((((.(((...(.((((...((((((((.....))))))))........((((...))))))))))))..)).)))).)).))))).)))))).))))).))))..))))))).).))))((.((((.....((((.(((((.....))))).))))..))))..)).......)))))).)).)))))))))..)).((((.((.(........).)).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((,..(((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((.......,{|{|((((((((((((((((((((.(((((((((.....((((.....)))).....))))))))|||||,.....||}},||||(({{(({..,{,.|||{,....((,,((((((((((((((,((((,((((((.({,,,(((.{({{((((((({.{..((((({....((.(.(((((..(,({{.((((......((.((...{((....)))..)).))....,))))...})).}..)))))).)).})))))..),,..)))),,)))..,{((((((.........))))))}.{(((((||({{{|{((|.||,||||||||{{{{|}|||||,,....,||,}},,,,,.((((({..,..})}))}.,}}}.})}},,,)}}|}}}|||.,,{(({.{{{,((({{{{..|||{{|||||..,,}||.,,,.,,},}.)}},})))}}},,,|||}}}.}}||{||,..,}}}|||{{,,{|,,,,.})))))))))))))))))),)))))}}.,,)))))))))))))}||.||.,.,.))),})}.)))).)))))))))))).,,,}..........((((..((.(((.((((((....))))))..))).))..))))...,,{{{{....}))).,,})))))..))))))))).....))))))))).)))))).{((((((({,{({,{,({(((.,(((,,({(,(((((((({{.{((.(((((....((({..((((.((...))))))))))))))).)),....|((((((((((..(((((((((,,(((((((........)))}}}))|......{{{|,.....))})..||{{...)))))))).)))))))))))))))}|{{{((.......(((((((.,....,.)))))))})))))...|||,.||{|||.|||,|....}.)))}))))},}.||.((((((((((((((...))))))))...)))))).}})))))))))),,,,,{(,.((((((,...,(((((,((.,....))).))))).,((((((.((((((..((..,,...,,..))..)))))).)))))).{((({((((((.(((((.((...{{.((((...((((.(((((.((((((...(((((((.((((((.({{...(.((((...((((((((.....))))))))........,{{|...))))))))}}))..)),}))).)),,)))).)))))).))))).))))..))))...))..)))))}|{{{.,,,.{(((,(((((,,,,{}}|}},)))},,)))}..}}....,..)))))).}},}}))))))).,},.,,,,.,,.|,||,,,))}}}}.,,,..
Back