Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_138370.3

Sequence Length

2490 nt

GC Content

0.6442

AGGCAAGUGUCAGGCCGAUGUGUCGCCCGCGAGGGGCCGGGGUCGGGGCCGCCGGGGCCAUGCGCGCGGGCUGGGCAGGGGGCCGGCGGGGCGCAGAGCGGAGCCGCCUCGGAGCCUGAGCCGCCCGGGGCCGGGGCCGGGGAGCCGCGCGGGGCCGGCCGGCCGGGGGGAGGGGAGCGAUGCGGCGCCGGCGGGCGGCAGUGGCCGCGGGUUUCUGCGCCUCCUUCCUGCUGGGCUCCGUCCUCAACGUGCUCUUCGCUCCGGGCUCGGAGCCUCCGAGGCCAGGCCAGUCCCCUGAGCCUUCGCCGGCCCCGGGUCCGGGCCGUCGCGGGGGCCGCGGGGAGCUGGCCCGGCAGAUCCGGGCGCGCUACGAGGAGGUGCAGCGCUAUUCCCGCGGGGGCCCCGGGCCCGGGGCGGGCCGGCCGGAGCGGCGGCGCCUGAUGGACCUGGCUCCGGGCGGGCCCGGCCUGCCGCGCCCCCGGCCCCCUUGGGCCCGGCCCCUGUCCGACGGCGCCCCAGGCUGGCCCCCGGCUCCCGGCCCAGGCUCCCCCGGCCCGGGCCCGCGCCUGGGCUGCGCCGCGCUUCGCAACGUGUCCGGCGCGCAGUACAUGGGCUCAGGCUACACCAAGGCCGUGUACCGGGUCCGCCUGCCCGGCGGUGCCGCGGUGGCGCUCAAGGCGGUGGACUUUAGCGGCCACGAUCUGGGCAGCUGCGUGCGCGAGUUCGGGGUACGGAGGGGCUGCUAUCGGCUGGCGGCCCACAAGCUGCUUAAGGAGAUGGUGCUGCUGGAGCGGCUGCGGCACCCCAACGUGCUGCAGCUCUAUGGCUACUGCUACCAGGACAGCGAGGACAUCCCAGACACCCUGACCACCAUCACGGAGCUGGGCGCCCCUGUAGAAAUGAUCCAGCUGCUGCAAACUUCCUGGGAGGAUCGAUUCCGAAUCUGCCUGAGCCUGGGCCGCCUCCUCCACCACCUGGCCCACUCCCCACUGGGCUCCGUCACUCUGCUGGACUUCCGCCCUCGGCAGUUUGUGCUGGUGGAUGGGGAGCUCAAAGUGACGGACCUGGAUGACGCACGUGUGGAGGAGACGCCGUGUGCAGGCAGCACCGACUGCAUACUCGAGUUUCCGGCCAGGAACUUCACCCUGCCCUGCUCAGCCCAGGGCUGGUGCGAGGGCAUGAACGAGAAGCGGAACCUCUAUAAUGCCUACAGGUUUUUCUUCACAUACCUCCUGCCUCACAGUGCCCCGCCUUCACUGCGUCCUCUGCUGGACAGCAUCGUCAACGCCACAGGAGAGCUCGCCUGGGGGGUGGACGAGACCCUGGCCCAGCUGGAGAAGGUGCUGCACCUGUACCGGAGCGGGCAGUAUCUGCAGAACUCCACGGCAAGCAGCAGUACCGAGUACCAGUGUAUCCCAGACAGCACCAUCCCCCAGGAAGACUACCGCUGCUGGCCAUCCUACCACCACGGGAGCUGCCUCCUUUCAGUGUUCAACCUGGCUGAGGCUGUGGAUGUCUGUGAGAGCCAUGCCCAGUGUCGGGCCUUUGUGGUCACCAACCAGACCACCUGGACAGGUCGGCAGCUGGUCUUUUUCAAGACUGGAUGGAGCCAAGUGGUCCCUGAUCCCAACAAGACCACAUAUGUGAAGGCCUCUGGCUGACCUAUCUGAGGGCUCGGCUGACCAGCUGACUAUCCUCAGCAGCUGGGCUUGCCUGUGGAGGGAGUGACUUGCACUGGCAGCACUGCAUGUCACCUGGGAACCCCUGCAGACAAAGCUAACAUCCCAGACAGACAGAUGUGACCAGGACAAACGUGCAAUAAUGCCAAAUGUUAAAAUGUGAGUUUACCAGCCUAGCUAUGGGACUGCUGGCUCCUAGUCCAGGAAUCAUGGGGGUAUGACUGCCUCUCCAACCCUGUGGGCUGUAAGCAAGCUCAGGCUAGUCUCCCCACUGGGGGCUGUGCCCCUCCCUGGGACGGUUCCGUGGGCAGCCCCAUCACUGUGUUCAAUAGUGUGAGAAUGUAGCUAAAGCCCCUGCUGCUGCUGCUGCACAUGCCACAGCAGGCGGUGGGGGCUGCGUGGGGACAAUCCAUCGUGGAGUGUUCUCUCAGCUUAGGUCUGGACAGGAGACUUGGCGGGAGAUGCUCCAGGAUGUGGGUGAUUCUGUACCUGGGGAGGCUAUCUCUGACCUCCCGACAGGGGACACUCCCAGGCCAGCCCAGGGGUCAGGGGCAGAGGUGCACACCUCAGCAUGAGCCAAGACUGGGGUCAGGGAGCAGGUGUGGUUUGAGCCAGGACCUGGGGCGGGGGUGGGGCCGGGGCCUUUCUGCCUCAUUUGCUUUCAAUGAAAGCCUCAAAGCAGCCAAAACCAGGCUUUCCCCCUUCCUCGAGUUUGAAUAUCCAGAAUCUUUUGUACUUCUUGUUGGUUAAAUUGUUUAUUUUUGUAAAAAAUAAAAUAAAAUUAGUUAAUAAAAUGAUGUUUCACAGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1223.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1263.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 545.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((..((((.((.((.((((((((...((((((((((((((((((((((((((...((.(((((((((((((((((((((..((((((.(.((((.((((.(((((...)))))(((((((((((((((.((((((.(((((.((...(((((((((((.(((((((((.((...((((.(((.((((.((....)).)))).)))..))))))))))))))).).((((..(((.....))).))))..((((((((((((((.(((((((..(((.(((((((((((((.((((((((((((((.......))))))..)))))))))).))))).)))))).))).....((((.(((((((......))..)))))....))))))))))).))))))))))))))))))))))))..))))))).)))..))).)))))))))))))))...)))))))))))))))))))))))))...)))))))))..)).))...).))))).))).)).))))))).))))))))..)).((((((.((((((((((((((.((((.(((..(((...)))..))))))))))))).........(((((((((((((((..((((((.....(((((((((.(((..(.((((((.....)))))))..))))))))))))..))))))......(((((((((.(((((.(.......).)))))...(((((((((.....)))))))))...))))))))).((.((((((((((((((((((((((((((((......))))))))))).....)))((((.(((..((((((.(.((....(((((.(.((.(((......))).)).))))))..)))))))............((((((((....((.(((((((..(((....))).(((((..((..(((..(((((((((((((.((.((...((.(((.....(((.(((((((((..(((...(.((((((...((((.....)))))))))).)...)))....)))))))))))))))))...)).)))))))))))...(((.((((((((((((((.........(((.((((...(((((((......(((..((((((.......)))))).)))(((.((((((....(((..(((((((((.((.......)).)))))................)))))))...)))))))))......(((((((......)))).)))(((((.((.((.((((.(....).)))).)).)).)))))...))))))).)))).)))..))))))))..))))))))).)))).)))..)).))))).)))).))).)))))))))).))..))).)))).....)))).)))))))))).)).((((((((((..((((((((((.(((...(((...(((((....)))))....)))........((((((.((((.(((((.((.....)).))).)))))).)).))))...((((((........))))))..)))..))))))))))))))))))))......(((......)))..((.((((((((((((.......(((....)))...((((((((((.......(((((((.((((((....))))))...)))))))...(((((((.(((((.((((...(((((.((((.((....)).)))).)))))((((((......((.......)).....))))))....(((((.((.(((..((((...(.(((....))))...)))).......(((((...(((((((....)))).)))..)))))((((((((((......(((((((....))))))).....))))((((((.......))))))))))))..(((((((..((((((((.((((.....)))(((....)))).))))))))..((((((.....))))))..........((...(((((((((((((((((..((....))..))))).))))))))))))))))))))).....((((.((((((((.(((((.(((.((((((.......)))))))))))))))))))))).))))..))).))))))).(((((((((((.......).))))))..)))).....))))))))).))))))).)))))))))).(((((....))))).((....))......)))))))))))).))))))))))))))))).)).)))))).))))))..))).))).))...)).))))))))))))......((((((((................))))))))..........((.((((......)))).))...........((((((...((((...(((((((..(((..(((........)))..)))..))))))).))))..)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((((..((((.((.({.(((((({{...((((((((((((((((((((((((((.,{((,({(((((((((((((((((({.(((((((.(.((((.((((.(((((...)))))(((((((((((((((.((((((.(((((.((...(((((((((((((({({(,,(((.({((,(({,(({(((({,({....|{||||{|,,..))))))),))),)))}))||||}.|||}}}}.,),},)))}.((((((((((((((.(((((((..(((.(((((((((((((.((((((((((((((,{....}))))))..)))))))))).))))},)))))).))).....((((.((((({(......))}.}))))....))))))))))).))))))))))))))))))))))))..))))))).)))..))).))))))))))))))),..))))))))}))))))))))))))))...))))))))).,)).)).,,).))))).))).)))))))))).))))))))..||.((((((.((((((((((((((,((((.(((..(((...)))..)))))))))))))|........(((((((((((((((..((((((.....(((((((((.(((..(.((((((,...,)))))))..))))))))))))..))))))......(((((((((.(((((.(.......).)))))...(((((((((.....))))))))).,.))))))))).((.(((((((((((((({{.(((((((((((......))))))))))),,..,{{,((({,(((..((((((.(.((....(((((.(.((.(((......))).)).)))))).,)))))))............((((((((....,{,({(((((,.(({....}||.|((((|{(,.{({,({((({(((((((({,((.{({{,((.{{{....,|||,(((((((((.{(,,,{.({((({((.{{((((.....)))))),)),.}}}}))),}}.)))))))))}}}}}},}..,)}.))))))))))).,,||(.((((((((((((((.........(((.((((...(((((((.....,{{(..((((((,...,..}))))).)),|{(.(((({{,...{,((((.(((((((.{,.......}}.))))))}.)))}.........,||,,,,.,,)}))})))}......{((((((......)))).))}(((((.((.((.((((.{....}.)))).)).)).)))))...))))))).)))).)))..)))))))}.,))))))))).})))|)})..}).)}.}}.)))).,)).,,)))))))).})..))}.)))}),...)))).))))))))))})}.{(((((({{{,,((((((((((.(((...{,,...{|{((,.,,|}|}}.,,,|}}........((((((.((((.(((((.((.....)).))).)))))).)))))))...((((((........)))))).,)))..))))))))))))))}}))},....|||||.,,...))},}|(.((((((((((((.......,,,...,|||...(((((((.(((((((..(((((((.((((((....))))))...)))))))...(((((((.(((((.(((({{.((((({((({{(((..{{{{((,,(((|.,{(((((......((.......)).....))))))}}}..))).}))..)))){,{{,{{{{(({....))),..,)))}....,}}}}||||,}|((((((,,..||||.}|{{{,{{|,.{{|{{((|{......(((((((....))))))).....}}},})))))),.))).,})||{{|.{{{{{((((((,..((((((({.{{{|..,..}||{{|..}})}})})}}}}))),,((((((.....))))))..........{{...(((((((((((((((((..((....))..)))))}})))))))))))}}|}))|||,..,{((((.(((((((,{(((((.(({,((((((.......)))))))))))))))))))))).)))).}|||,..}}}.)})|})))))))))}.,.)))},,||||..,,}))},,.))))))))).)))))))))))))),}.))))))}.,.,}}|||.{{.,,,),......)))))))))))).),))))))))))))))).)).)))))).))))))..))))})),))...)).))))))))))))}.....((((((((................))))))))..........{,{(((({,,,,,||||..,.,,}}......(((((((((((.{{{(((((((({...,}}})))))}}}},.))}})))))}}..,}},}},}}},))),,.