Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_138393.4
Sequence Length
1360 nt
GC Content
0.6537
AGGCUGCGGGAAAGCGGUGCGCGUGCAGCGGGGUGGGUGCCCUGGUCCGCGGGCGAGCUCGAGCAGCCAACCCCGGGCGCGUCGGGGCCAUGGACGGCCUGAGGCAGCGCGUGGAGCACUUCCUGGAGCAAAGGAACCUGGUCACCGAAGUGCUGGGGGCGCUGGAGGCCAAGACCGGGGUGGAGAAGCGGUAUCUGGCUGCAGGAGCCGUCACUCUGCUAAGCCUGUAUCUGCUGUUCGGCUACGGAGCGUCUCUGCUGUGCAAUCUCAUCGGAUUUGUGUACCCCGCAUAUGCCUCAAUCAAAGCUAUCGAGAGCCCAAGCAAGGACGACGACACUGUGUGGCUCACCUACUGGGUGGUGUACGCCCUGUUUGGGCUGGCCGAGUUCUUCAGCGAUCUACUCCUGUCCUGGUUCCCUUUCUACUACGUGGGCAAGUGCGCCUUCCUGUUGUUCUGCAUGGCUCCCAGGCCCUGGAACGGGGCUCUCAUGCUGUAUCAGCGCGUCGUGCGUCCGCUGUUCCUAAGGCACCACGGGGCCGUAGACAGAAUCAUGAACGACCUCAGCGGGCGAGCCCUGGACGCGGCGGCCGGAAUAACCAGGAACGUCAAGCCAAGCCAGACCCCGCAGCCGAAGGACAAGUGAAGCAGCCCCCUGAGCCUCACAAGGACCUCCUGGCUGGUGAGGAGGGGGCCGCGCCAGGCUCCCAGGCCUCCACAGAGUCUUCAGCGCAUCCCCCAACAGCAGCCCCUGCCAGUCCCUCGGGUCCAGGCAAGGCCCUGGGGGUCUCCUUAAAUGCCACCUCGGGCAAGUCCCAGUCCCAGUCCUCGGCCACCCCCAGCUCUGGAUCCCAGGGCCAGCUGCCCUCUGGCUCUGGCUGUGGCUCCCGCCUGUCCGGCAGGGCCCAGGGCCAGCGUCGGGCACAGGGCAGCUCCCACUGGUCUCGGCAACACACCCAGCCGCCUGGUACUUCCUCCAGCCCCUCCCAGUCAGCCCUCCCGUCCUCGGGGCCCCUGCAGCCACCCAACGUCACCUCCAGCCCGGUCUCACCCAUGGUCCAGUCUCCCAGCAGCAGCAACAUCCCCACGCAGCCCCCCAGCAAGUCCUCUGGCAAGCCGGAGGACGCAGCCCCCAAGACCAGCGGACAGCGCCAGAAGGAAUCGUCGAAACAGCCUGCCAGCAGCGCCUCAGUGCCCGAGCUGGUCCCCUGCCAUUCCGGGACCUCUCUGGAGUACACUUCGGAGUCCACCACCGAGAUCACCUGCAGCUGGCCACACCACAGGCCCCCGUGCCUGCAGCACUACUGGUGCCUGAAACACCUGGCCUGCUAGGAGGCUCCAAUAAAGCUAACCCGGACCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-569.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -593.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.(.((((..((((.((((.(((...((((((((((((((........)))))((((((.....(((.((((((.....))))))...)))..((((((((((.((((((((((((((((...((.((........)).))...))))))))(((((.(((((..((((((((((((.(((((..(((.....((((((((((.(((......(((((..((.(((......(.(((((((.(((.(.((((..((((((((((((....))))...)))))..(((((.(((((......(((...(((..((((((((((.((.((((..((((..((((.....))))..))))..)).)))).))))))))))...)))...)))(((.(((........))))))..................))))).)))))..(((((((((((((....((((.((.(((((((...))))))).....((((...))))(((((((.(((((((((...(((.(((.((...))))).))).((......))........))))))))).))....))))))).))))))))))).))))))..........))).)))))))).))))))).)))).))..)))))......((((((....)))..)))((((((((.((((.(((((..((((.((((((...((...))...))))))...))))..)))))....((((...)))).((.((((((((.((......)).)))))))).)).......((((......))))..........((((..((.((.....)).))..))))...((((((..((((((((((((((.((((((.(((.(((.(((.....))).))).))).)))))).)))))....))))))))).)).))))...((((..........)))).((((........))))..)))))))))))).....(((....)))))).)))))))))).....)))...))))).))))))))......)))))))))))))).((....)).......)))))).........((..(((((((((....)))))))))...))...........((((.(((.((......((....))......))))))).)).))))))))).)))))))))((((((..........)))))).((((((((....)))))))))))))).)))....))).)))).).((((........))))...((((.....))))...(((.((((......(((((....))))))))).))).....)))..)))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,(,((((..{(((((((((({({{.((((((((,(({{{{{{{,,{||||}|{|{{{{.},,.||,.|{((((|,|||},||{|{{,,|,.,((((((((((.((((,((({((,((((,{,(,,(,..,...,{||{||...},,}|||((((((.((((({{(({{((((((((.(((((..(((.....((((((((((.(({......(((((..((.(((.,,,..,.{((((((.(((.(.((((..(((({(((((((....)))),..|}}}}..(((((.{((({{......,{...,,{..((((((((((.((.((((,.((((..((((.....))))..)))).,)).))}),)))))))))).,,,||{,.,.|({{.{{,....,,..)}}}|||,..............,,))))).)))))|.(((((((((((((...{(({,.||,(((((((,..||||||{{.,.,((((...}}}}{{(((({.{(({{{((({,,(((.(((.((...))))).))),}}}....,}}.,,)},..)))))})})}))}}}},,),))).)))))))))))}}))))).}....}}..))).)))))))).)))))))})))).))..)))))....,,{{{{{{....}||..,,.((((((((.((((.(((((..((((.((((((...((...))...))))))...))))..)))))....({{(...)))|,,{,(({{.(((((((({,..{{{,{(((((({,,.......{(((.....,|||}...,,..},,||||..,,.||,.,}}})}))},)))))))),)))),,((((((((((((((.((((((.(((.,((.(((.....))).))).))).)))))).)))))....)))))))))....}}}}...,(({..........)))|.{(((........))))..))))))))))))....,(({....)))))).)))))))))).....)))...))))).))))))))...,..})))}}})))))))}||.,,.||.......,,,,)).}},,,,,,||..(((((((((....)))))))))...,,......}}}}}|,|{.|.|},||,,.,}|....,})......))})})),)).))))))))).)))}},,))||||||..,,...,,,)))},,.((((((((....)))))))).,,.,}.))),}.,}.}})))}}},||{||..,,.|,|||}}},|||},}}},))})}..{||,||||,.....{{{{|,,.,))}))}))),}},.....)))..)))),}))...
Back