Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_138444.4
Sequence Length
6231 nt
GC Content
0.4365
ACUCGCCUGGAGCGCGCGGGCAAGGCGGGCGGAGCGCACUGGAACUCAAGGGGGCGCACAGCGGCGCGCUCGCACCGCUCGGCUCCGCGCGGCUCUAGGAGGUGGCGGCGGUGGCGGUGGCGGCGGUGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCGCAGGGCUGAGCGAGCGUCCGGGUUCCGGGGCUCCGGGGAAGGCGGUUGCAGCUCCUGAGUGCAGCGCGGCUUCCUGCCACUGUCCCGGCCCGGCCACCUCUCUGUCAUGGCUCUGGCGGACAGCACACGUGGAUUACCCAACGGGGGCGGCGGCGGGGGCGGCAGUGGCUCCUCGUCGUCCUCCGCGGAGCCACCGCUCUUCCCCGACAUCGUGGAGCUGAACGUGGGGGGCCAGGUGUACGUGACCCGGCGCUGCACGGUGGUGUCGGUGCCCGACUCGCUGCUCUGGCGCAUGUUCACGCAGCAGCAGCCGCAGGAGCUGGCCCGGGACAGCAAAGGCCGCUUCUUUCUGGACCGGGACGGCUUCCUCUUCCGCUACAUCCUGGAUUACCUGCGGGACUUGCAGCUCGUGCUGCCCGACUACUUCCCCGAGCGCAGCCGGCUGCAGCGCGAGGCCGAGUACUUCGAGCUGCCAGAGCUCGUGCGCCGCCUCGGGGCGCCCCAGCAGCCCGGCCCGGGGCCGCCGCCCUCGCGGCGCGGGGUGCACAAGGAGGGCUCGCUGGGUGACGAGCUGCUGCCGCUUGGCUACUCGGAGCCCGAACAGCAGGAGGGCGCCUCUGCCGGGGCGCCGUCGCCCACGCUGGAGCUGGCUAGCCGCAGUCCGUCCGGGGGCGCGGCGGGCCCGCUGCUCACGCCGUCCCAGUCGCUGGACGGCAGCCGGCGCUCGGGCUACAUCACCAUCGGCUACCGCGGCUCCUACACCAUCGGGCGGGACGCGCAGGCGGACGCCAAGUUCCGGCGAGUGGCGCGCAUCACCGUUUGCGGAAAGACGUCGCUGGCCAAGGAGGUGUUUGGGGACACCCUGAACGAAAGCCGGGACCCCGACCGUCCCCCGGAGCGCUACACCUCGCGCUAUUACCUCAAGUUCAACUUCCUGGAGCAGGCCUUCGACAAGCUGUCCGAGUCGGGCUUCCACAUGGUGGCGUGCAGCUCCACGGGCACCUGCGCCUUUGCCAGCAGCACCGACCAGAGCGAGGACAAGAUCUGGACCAGCUACACCGAGUACGUCUUCUGCAGGGAGUGAGCUCCCCAGACCCCCUCGCCACUCCAGCGCCCAGUCCUUCUCCUGCCCGAGAGAUGAUUACAGAGCCUCUUGUCCCACCUUUGUCCCCUGGCUGCUGCCCUCCCAUUCUCCCCCUCCAGUAGUAGCUGGGUGAGACCUGUCCGCCCACCUUCCCUCCACUACAGAACCUGCAGCCGCAAAUCCUCUGGGCUGCUUCGUCUUCUUUGGACCUCCUGAACCGAGAGAACCCAGAGGAACCCCCACCCCACCCCCACCUACCACUCCAUGCUUUCUCUACUCCCUGCCUCAAACCACCCCUCCCCCAGAUGGUACUUCAGUUUGGAUCUAUUGGGGGAGUGUGGCCACAGACCGGGGGAUGAUUGAAUUGUUCAGAACCUGAUUGGACCGUGUCCAAUGUGCGGAAGAUUUCCUUGAAAUCUUCUCAAGCUCUUAUGACUCACUGGGGGUUUAAGAGAUCAGGAUUGGUUCCACUGUCUGGGGUUAGUGUUUUACAAGGUCAUUACACAGUCUUUUUGACCUCUUUUGAAGGUAGAGUUUUAGAAGGCUGGAUGGAAGAUUCUGAGCCUGGAAUUAGGACCCCAUGGAGGCAGUUCAGUAACUAAACUAAUAAAGUUUUGAAAAGUUACACGUAAAGUAGAAGAAUCUAGUGCGUGGGACAGUAAAGGAUCCUUUCUCGUACAGAAUAAAAGGUCUCAGCCUGUAGCUUAAACUUAUAGAAAGUGAUCCGCCUGCCUGCAGAGGCGCCCUUUUCAGCUGCUGCUCGCCAGAAGCCCUUGAUUCCACUGGUUGACAUGGCAGCAGUUACUGGCAAGAGGGAGAAAGGACGCUGCCGCCUAAGAGUGCAAGGCUGCUCAGGUCUCCAAGCGCCGUAGGAGGUCACCUGGCAGUGACUGUAGGGAGCUGGGUCAUAGUGCACGUCGUGGGUAUUAGGAAAGCCUGUAUUCUUUCAAUGAAUGUCAGUAGGACCUUCCUUUAGCUGUAAGACUUGGUGGGCGGGGUGGGGUGGGGAGGGAGGAAAGGGUAGGAAGGGUGGGAAGGGAGAAGCAGACAUAGUCAUUUAUGAUUUGAAAGUUGGAAGUUUGUACCAUCUGUUUGAGUAUAUGCACAUUUAAAAAAUAUCAUAUAGUAAAUGCAAACAUGCCAAGUAUUUUAUAAAGAUUAAUAACAGACCUACUCUUACCUGGCAGUUUACUUAACUUACUGUUUUGAGUCCUAAACUUAGAGUUGUUAAUGCUUAUAUAUAAUCUAACCAAAGAGUUACCCAGUAGGGUUUUAGUUUUUGAACUUUUAUUUUCUUGUUGAUUAUAAAUCCUGAUUUUGGAAUCUAUUGCGCAAAAGAAGUUUCAUUUUGGUUACUUAGACCUAAGAUCACUUAUUAAAAAUCCUUAUUUUCUCCAAGCCCAGCAAACGUUGACUUCUGGGCAAACCUGAAAACCUGAAAAUGCCACUUUCAUGCAGUUUGUUUGAAGUUAAGUGGAAUCCUUUCAAAUGACGAGCUGCAGAGAACUCAGCACCAAGGGCUGCCUAUCUGUAGAUAGCUGUAAAAUGGAAUAUUUUUAAAUGAAGGCAAAUAAGUACUUAAAAGUGAGCUGAGCAAUAAAAUGGUCCAAUAAUAGGUAAAUGCAACAGAAACAGAAGGAGACCUGGUUGCCUUAUGCCUUUACUCUUACAUGGAAUAAAUUCCCAAUGCAUAUCCUAUGUAAACCAUAAGUGAAGGGAAAUAAACCUCGUCAUGCUCCAUGCUGUGAGGUGUCCUUUGGAUAUUCUGUGAUGACAGAGAAGCCUAUUUUGUUUUGUUUUCAGCAUCUUUCUCUGAUGUACGUUUUUAAGGAUUUUGUAAGAGCUGUUUUCAGUGUUUAAAUUAGUGCUAUUUUUCCUUGUUUUUAAAAAUGAAUCUCGUACUGUAUCUUACUAUGUCCAUACAGAUGUUACAAAUCGACAGUUUUAUUCUUAGACUCAUGUGAUCCAAGCUGUAUAUACCAUAUAUAAACAUUUUACAUGAAUCAUUUAGUUUUUUAAUUCAUUUACUAAUGCUAUAAAAUUUCCUAUAUUACCCCAGUAAUUUGCAUCAGCUGGUUUAUAUACUAAAGCAACAUGUUUUGAUGAGUUUCUUACAUCCUUAUCGAGGAAUUGGGUUAGGAAAAAAUACAUAAUUGUAAAACUGAGUUUGCUGUAUUAUACUUUUUUUCUUGAGUAUUAGUUGUAUUACUAAUCAUAUGUUGAUUAACUGUCUACUUAAAGUCAAGGUACCUGUAUUUUUAAUCCACUAAUUUUUUUUUAGUUGGGAAAUAGAUUUCAGGUCUUUUAUUAGACUAACAUUUUUUGAGAAGUAAAAUUGACUUCAUAUACAAAGCCUGUAAUUUUAGGCGAAAUGGAAGCAGAAAUCUAGGAAGUUGUGCUUGCUUGUAUGUUGAGUUUGGUCUCAGACUAAGUAAUGCAUCAGAAUUCAUCUGUUUGAAGCCUGAAAUAAUUUAGGACUCUGAUUCACUGACCAAAAGUCAGUGUUGCAGAGAUUUCUCUACCCCGUAUGGUAUUUUGUUAGAUUGUUCAACAGGAAGCACAUGAUUGAGAACAUCUUGGGACAGACCAAAACCACUGACAGAUGGCAAGGCUCGGCGAUUCUGAUUUCCCUUCUCAAAUCUGCUCAACUCCAAGAGUCUUGAGAAACUGCUAAAAUUUUGCCUCUGUCACUCAAGUCUUACAAAUGUUAUCUUGUAAACCUUUGAGGUGAACUAUUCCACUGUCUUGUACAUAGGCAUCUUAUUCACUGCACCCUGUCACACCCAGCACCCCCCGCCCCGCACAUUAUUUGAAAGACUGGGAAUUUAAUGGUUAGGGACAGUAAAUCUACUUCUUUUUCCAGGGACGACUGUCCCCUCUAAAGUUAAAGUCAAUACAAGAAAACUGUCUAUUUUUAGCCUAAAGUAAAGGCUGUGAAGAAAAUUCAUUUUACAUUGGGUAGACAGUAAAAAACAAGUAAAAUAACUUGACAUGAGCACCUUUAGAUCCCUUCCCCUCCAUGGGCUUUGGGCCACAGAAUGAACCUUUGAGGCCUGUAAAGUGGAUUGUAAUUUCCUAUAAGCUGUAAUAGUGGAGGUAUUGUGGGUUCAUUUGAGUAAGCCCUCCAAAGAUACCAUUCAAAUAACCUGGGAGAAUGUCAUAAAUUAUUCAGAUAAUUAACACUGCAUGAAUCUGAUUCAGAGGCAUGCAUUUACAUAUGUUGCCCUAAUUACCAUUUGAUGAUCAUAAAUACAAGUGAAUGACAUUGGACUUUUAGUAACAAACUUAAUUUUUAAAAAGGUGUAGACAAUGGUGGUUAAAAAAAAAAAAAAAACAGGUACCAGGUUCUGUGUGUUUGCACCAAGUAAUUGACAUGUUUUUUAAUACAUGUGGACCAUGAACAGUAUUCAUUCUACUUUUUCAAAUGAUAUGCUGUAGAAAAUAUUCCUUGAAGAUGUGAGAUUUAAAAAUUUUUCCCUUUCAAUGUUGUUAUGUAUUCUACUGGUUUUUGAUUGAUAGCACAGUGAUAAAUCAUAAUACUAGACAAAAUUGUCUUCUCUUUCAAACCAGAGCCAUAUAUAUGUCUGUAUAUAUGGGACCUACUGCUUCUCUGAGGAAAUGCAUAAUCUGUUAAUAUCAGACAAAAUGAGCAAUUGGCAGUGCUCAUAAUAUAUUCCAAUUUUUAUUGGAAUUUUCGAUGGAAUGUUAUUUCAAUAAAGCCAUGUAAGGUGAAACUUUGAUAACUUUUUACUCUUCAAGUUAGGG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1930.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2051.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 1543.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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