Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_138716.3
Sequence Length
3429 nt
GC Content
0.3599
AAUUGUAAAGAGAGAGAAGUGGAUAAAUCAGUGCUGCUUUCUUUAGGACGAAAGAAGUAUGGAGCAGUGGGAUCACUUUCACAAUCAACAGGAGGACACUGAUAGCUGCUCCGAAUCUGUGAAAUUUGAUGCUCGCUCAAUGACAGCUUUGCUUCCUCCGAAUCCUAAAAACAGCCCUUCCCUUCAAGAGAAACUGAAGUCCUUCAAAGCUGCACUGAUUGCCCUUUACCUCCUCGUGUUUGCAGUUCUCAUCCCUCUCAUUGGAAUAGUGGCAGCUCAACUCCUGAAGUGGGAAACGAAGAAUUGCUCAGUUAGUUCAACUAAUGCAAAUGAUAUAACUCAAAGUCUCACGGGAAAAGGAAAUGACAGCGAAGAGGAAAUGAGAUUUCAAGAAGUCUUUAUGGAACACAUGAGCAACAUGGAGAAGAGAAUCCAGCAUAUUUUAGACAUGGAAGCCAACCUCAUGGACACAGAGCAUUUCCAAAAUUUCAGCAUGACAACUGAUCAAAGAUUUAAUGACAUUCUUCUGCAGCUAAGUACCUUGUUUUCCUCAGUCCAGGGACAUGGGAAUGCAAUAGAUGAAAUCUCCAAGUCCUUAAUAAGUUUGAAUACCACAUUGCUUGAUUUGCAGCUCAACAUAGAAAAUCUGAAUGGCAAAAUCCAAGAGAAUACCUUCAAACAACAAGAGGAAAUCAGUAAAUUAGAGGAGCGUGUUUACAAUGUAUCAGCAGAAAUUAUGGCUAUGAAAGAAGAACAAGUGCAUUUGGAACAGGAAAUAAAAGGAGAAGUGAAAGUACUGAAUAACAUCACUAAUGAUCUCAGACUGAAAGAUUGGGAACAUUCUCAGACCUUGAGAAAUAUCACUUUAAUUCAAGGUCCUCCUGGACCCCCGGGUGAAAAAGGAGAUCGAGGUCCCACUGGAGAAAGUGGUCCACGAGGAUUUCCAGGUCCAAUAGGUCCUCCGGGUCUUAAAGGUGAUCGGGGAGCAAUUGGCUUUCCUGGAAGUCGAGGACUCCCAGGAUAUGCCGGAAGGCCAGGAAAUUCUGGACCAAAAGGCCAGAAAGGGGAAAAGGGGAGUGGAAACACAUUAAGUACUGGUCCAAUAUGGCUGAAUGAAGUGUUUUGUUUUGGGAGAGAAUCAUCUAUUGAAGAAUGUAAAAUUCGGCAAUGGGGGACAAGAGCCUGUUCACAUUCUGAAGAUGCUGGAGUCACUUGCACUUUAUAAUGCAUCAUAUUUUCAUUCACAACUAUGAAAUCGCUGCUCAAAAAUGAUUUUAUUACCUUGUUCCUGUAAAAUCCAUUUAAUCAAUAUUUAAGAGAUUAAGAAUAUUGCCCAAAUAAUAUUUUAGAUUACAGGAUUAAUAUAUUGAACACCUUCAUGCUUACUAUUUUAUGUCUAUAUUUAAAUCAUUUUAACUUCUAUAGGUUUUUAAAUGGAAUUUUCUAAUAUAAUGACUUAUAUGCUGAAUUGAACAUUUUGAAGUUUAUAGCUUCCAGAUUACAAAGGCCAAGGGUAAUAGAAAUGCAUACCAGUAAUUGGCUCCAAUUCAUAAUAUGUUCACCAGGAGAUUACAAUUUUUUGCUCUUCUUGUCUUUGUAAUCUAUUUAGUUGAUUUUAAUUACUUUCUGAAUAACGGAAGGGAUCAGAAGAUAUCUUUUGUGCCUAGAUUGCAAAAUCUCCAAUCCACACAUAUUGUUUUAAAAUAAGAAUGUUAUCCAACUAUUAAGAUAUCUCAAUGUGCAAUAACUUGUGUAUUAGAUAUCAAUGUUAAUGAUAUGUCUUGGCCACUAUGGACCAGGGAGCUUAUUUUUCUUGUCAUGUACUGACAACUGUUUAAUUGAAUCAUGAAGUAAAUUGAAAGCAGGACAUAUGAGAAAACUGACCAUCAGUAUAUUUGUCCAGAUAAUUGGUGGAUCAAAAAUGCCACUUAACAGGAAGUUUAGUUUGUUAUGCACUUUAAAUGGAAUAAUUAGCUUGUUACAAUUCUAGGACAUGGUGUUUAAAAUUUAAAUCUGAUUAAUCCAUUUUAACAAACAAUGCAAACAUCUUCAGUGCAGAAGGAAGAGUGGUUUCAACUGUUUGGAGUCUUUUAUGAAGUCAGUCAACAUUUACAACCAAAGGGCGGGGGGGGGGGUGGGGGGUGCGUCUUUAGUCCUAAAGGGACAAUAACUCUGAGCAUGCCCCAAAAAAGUAGUUUAGCAACCUUUUGUUGGUAGUCAACCCAUCCCCAGGGCCAUAGUGUAGAGUGUGAAAAGCUACCCUGAAACCCAGUAAUUCUACCCUGAAAGUGACUGCCUGCAGAAAGACCAGCAGUUGAUAUUAAAGCGCAAAUGAAUUCAACCUCAGCCCUGAAAAUAACAGAAUUCUGAAGUUUCCUAUGACUAAUUCACAAAAAAAGUAAUUGUAAACUAGUACUAUUAUGGAAUUACUCUACUGUUCUUUCUUUAAUAGUGGCAAAUGAAAGCAUAAGCUUAAGCAUUUUUUCAUAUUCUGAAGUCUCACCACACAUAAUAACCAAGUGGUAGACUCACAGCCGUCCAACUUAAAAAGGCAAAACCUUACCUUGGAAUUGGAAUUACUGUAAACAGCCUACUGAAAAUGCAUUUUUAUCAUGUAACAUUCUUCUACUUGUUUAACAUUGCUGAUUUUCUCUGGCAGCAUAAUUUUGUGGUUAAGAGAAUGAAUUCUGAAUGUACACUUUCUGUCUCAAACCCUGGCUGUAAUUUCAGCUAGUUAAUAAUUCUUUGUGUUCAGUUCCACUAUCUAGGUAUUUUCUUCAAAAGGUAAAUACAAUGGUUUCUGAAAGAAUCAUUUGCAUUAUCAGCCUGUUUGGGAUGUCUGAGAUCAGUGCCUCUGGGUUGUUAAUACUGUAUUGCUGUAUGGUAUAUGUAUGCUGAUUUACUACUUAUGCGUAAGUGGUAUGCAUGGGAUGUCUGAAAUCAGUGCCUAUGGGUUGUCAAUAGUAUUAACUAUUAGUGUUAACUGUUAGUAUUAACUAUUAGUAUUAUUAACACUAAUAAUAGUACUAUUACUAUUACUAUUUUUAUUUUAAAAUAAAAUUUACCUUUAAAAUAAUAAUAGUACUAUUGCUAGUACUAGUACUAUUGCUAUUACUAGUACUAUUACUAGUACUAGUACUAUGACACUGUUAAUAGUACUAUUAACAACCCAUAGGCACUUGGGAUGUCUGAGAUCAGUGCCUAUGGGUUGUUAAUACUAUAUUGCUGUAUGGUAUAUGCAUGCUGAUUUACCACUUAUGCAUAGAUAUAUCUUUAAUAAGUAAUCUAAAAAUCCUUUUUGUAUUUGAGAGAAUCUACUAAGUUCAGUCCAGUCAAGAAAAGAACCUAAUAGCACCAAUACAAAUUGAGGACUUAAUUUACUUUGGAAUGUUGAAUUGCAUUUGUUCCAUUAAAAAAAACAGAAAUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-887.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -959.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 827.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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