Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_139010.3
Sequence Length
4636 nt
GC Content
0.4126
AGAGCUGGGGAAAUGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCUUCUCCUCCUGAUGCUUUUGCAGACCGCGGUCCUGCAGGGGCGCUUGCUGCUGCCUCCUUUGGUGAAGGUGACACAUCAUGUGACCUCUUCAGUGACCACUCUACGGUGUCGGGCCUUGAACUACUACCCCCAGAACAUCACCAUGAAGUGGCUGAAGGAUAAGCAGCCAAUGGAUGCCAAGGAGUUCGAACCUAAAGACGUAUUGCCCAAUGGGGAUGGGACCUACCAGGGCUGGAUAACCUUGGCUGUACCCCCUGGGGAAGAGCAGAGAUAUACGUGCCAGGUGGAGCACCCAGGCCUGGAUCAGCCCCUCAUUGUGAUCUGGGAGCCCUCACCGUCUGGCACCCUAGUCAUUGGAGUCAUCAGUGGAAUUGCUGUUUUUGUCGUCAUCUUGUUCAUUGGAAUUUUGUUCAUAAUAUUAAGGAAGAGGCAGGGUUCAAGAGGAGCCAUGGGGCACUACGUCUUAGCUGAACGUGAGUGACACGCAGCCUGCAGACUCACUGUGGGAAGGAGACAAAACUAGAGACUCAAAGAGGGAGUGCAUUUAUGAGCUCUUCAUGUUUCAGGAGAGAGUUGAACCUAAACAUAGAAAUUGCCUGACGAACUCCUUGAUUUUAGCCUUCUCUGUUCAUUUCCUCAAAAAGAUUUCCCCAUUUAGGUUUCUGAGUUCCUGCAUGCCGGUGAUCCCUAGCUGUGACCUCUCCCCUGGAACUGUCUCUCAUGAACCUCAAGCUGCAUCUAGAGGCUUCCUUCAUUUCCUCCGUCACCUCAGAGACAUACACCUAUGUCAUUUCAUUUCCUAUUUUUGGAAGAGGACUCCUUAAAUUUGGGGGACUUACAUGAUUCAUUUUAACAUCUGAGAAAAGCUUUGAACCCUGGGACGUGGCUAGUCAUAACCUUACCAGAUUUUUACACAUGUAUCUAUGCAUUUUCUGGACCCGUUCAACUUUUCCUUUGAAUCCUCUCUCUGUGUUACCCAGUAACUCAUCUGUCACCAAGCCUUGGGGAUUCUUCCAUCUGAUUGUGAUGUGAGUUGCACAGCUAUGAAGGCUGUACACUGCACGAAUGGAAGAGGCACCUGUCCCAGAAAAAGCAUCAUGGCUAUCUGUGGGUAGUAUGAUGGGUGUUUUUAGCAGGUAGGAGGCAAAUAUCUUGAAAGGGGUUGUGAAGAGGUGUUUUUUCUAAUUGGCAUGAAGGUGUCAUACAGAUUUGCAAAGUUUAAUGGUGCCUUCAUUUGGGAUGCUACUCUAGUAUUCCAGACCUGAAGAAUCACAAUAAUUUUCUACCUGGUCUCUCCUUGUUCUGAUAAUGAAAAUUAUGAUAAGGAUGAUAAAAGCACUUACUUCGUGUCCGACUCUUCUGAGCACCUACUUACAUGCAUUACUGCAUGCACUUCUUACAAUAAUUCUAUGAGAUAGGUACUAUUAUCCCCAUUUCUUUUUUAAAUGAAGAAAGUGAAGUAGGCCGGGCACGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAAGCGGGUGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUAAUAAAAAUACAAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCAGACGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGAAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCAUGAACCCAGGAGGCAGAGCUUGCAGUGAGCCGAGUUUGCGCCACUGCACUCCAGCCUAGGUGACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAAAAUAAAAAUAAAAAUAAAAAAAUGAAAAAAAAAAGAAAGUGAAGUAUAGAGUAUCUCAUAGUUUGUCAGUGAUAGAAACAGGUUUCAAACUCAGUCAAUCUGACCGUUUGAUACAUCUCAGACACCACUACAUUCAGUAGUUUAGAUGCCUAGAAUAAAUAGAGAAGGAAGGAGAUGGCUCUUCUCUUGUCUCAUUGUGUUUCUUCUGAGUGAGCUUGAAUCACAUGAAGGGGAACAGCAGAAAACAACCAACUGAUCCUCAGCUGUCAUGUUUCCUUUAAAAGUCCCUGAAGGAAGGUCCUGGAAUGUGACUCCCUUGCUCCUCUGUUGCUCUCUUUGGCAUUCAUUUCUUUGGACCCUACGCAAGGACUGUAAUUGGUGGGGACAGCUAGUGGCCCUGCUGGGCUUCACACACGGUGUCCUCCCUAGGCCAGUGCCUCUGGAGUCAGAACUCUGGUGGUAUUUCCCUCAAUGAAGUGGAGUAAGCUCUCUCAUUUUGAGAUGGUAUAAUGGAAGCCACCAAGUGGCUUAGAGGAUGCCCAGGUCCUUCCAUGGAGCCACUGGGGUUCCGGUGCACAUUAAAAAAAAAAUCUAACCAGGACAUUCAGGAAUUGCUAGAUUCUGGGAAAUCAGUUCACCAUGUUCAAAAGAGUCUUUUUUUUUUUUUUGAGACUCUAUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCAUGAUCUCGGCUCACUGUAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGUCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCGUGCACCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCUCCUGACCUCGUGAUCCGCCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACAGGUGUGAGCCACCCUGCCCAGCCGUCAAAAGAGUCUUAAUAUAUAUAUCCAGAUGGCAUGUGUUUACUUUAUGUUACUACAUGCACUUGGCUGCAUAAAUGUGGUACAAGCAUUCUGUCUUGAAGGGCAGGUGCUUCAGGAUACCAUAUACAGCUCAGAAGUUUCUUCUUUAGGCAUUAAAUUUUAGCAAAGAUAUCUCAUCUCUUCUUUUAAACCAUUUUCUUUUUUUGUGGUUAGAAAAGUUAUGUAGAAAAAAGUAAAUGUGAUUUACGCUCAUUGUAGAAAAGCUAUAAAAUGAAUACAAUUAAAGCUGUUAUUUAAUUAGCCAGUGAAAAACUAUUAACAACUUGUCUAUUACCUGUUAGUAUUAUUGUUGCAUUAAAAAUGCAUAUACUUUAAUAAAUGUAUAUUGUAUUGUAUACUGCAUGAUUUUAUUGAAGUUCUUGUUCAUCUUGUGUAUAUACUUAAUCGCUUUGUCAUUUUGGAGACAUUUAUUUUGCUUCUAAUUUCUUUACAUUUUGUCUUACGGAAUAUUUUCAUUCAACUGUGGUAGCCGAAUUAAUCGUGUUUCUUCACUCUAGGGACAUUGUCGUCUAAGUUGUAAGACAUUGGUUAUUUUACCAGCAAACCAUUCUGAAAGCAUAUGACAAAUUAUUUCUCUCUUAAUAUCUUACUAUACUGAAAGCAGACUGCUAUAAGGCUUCACUUACUCUUCUACCUCAUAAGGAAUAUGUUACAAUUAAUUUAUUAGGUAAGCAUUUGUUUUAUAUUGGUUUUAUUUCACCUGGGCUGAGAUUUCAAGAAACACCCCAGUCUUCACAGUAACACAUUUCACUAACACAUUUACUAAACAUCAGCAACUGUGGCCUGUUAAUUUUUUUAAUAGAAAUUUUAAGUCCUCAUUUUCUUUCGGUGUUUUUUAAGCUUAAUUUUUCUGGCUUUAUUCAUAAAUUCUUAAGGUCAACUACAUUUGAAAAAUCAAAGACCUGCAUUUUAAAUUCUUAUUCACCUCUGGCAAAACCAUUCACAAACCAUGGUAGUAAAGAGAAGGGUGACACCUGGUGGCCAUAGGUAAAUGUACCACGGUGGUCCGGUGACCAGAGAUGCAGCGCUGAGGGUUUUCCUGAAGGUAAAGGAAUAAAGAAUGGGUGGAGGGGCGUGCACUGGAAAUCACUUGUAGAGAAAAGCCCCUGAAAAUUUGAGAAAACAAACAAGAAACUACUUACCAGCUAUUUGAAUUGCUGGAAUCACAGGCCAUUGCUGAGCUGCCUGAACUGGGAACACAACAGAAGGAAAACAAACCACUCUGAUAAUCAUUGAGUCAAGUACAGCAGGUGAUUGAGGACUGCUGAGAGGUACAGGCCAAAAUUCUUAUGUUGUAUUAUAAUAAUGUCAUCUUAUAAUACUGUCAGUAUUUUAUAAAACAUUCUUCACAAACUCACACACAUUUAAAAACAAAACACUGUCUCUAAAAUCCCCAAAUUUUUCAUAAACUCAGUUUUAAACUAACUUUUUUUCAAACCACAAUCUGAUUUAACAAUGACUAUCAUUUAAAUAUUUCUGACUUUCAAAUUAAAGAUUUUCACAUGCAGGCUGAUAUUUGUAAUUGUGAUUCUCUCUGUAGGCUUUGGGUAUAAUGUGUUCUUUUCCUUUUUUGCAUCAGCGAUUAACUUCUACACUCUAACAUGUAGAAUGUUACUACAAUAUUAAAGUAUUUUGUAUGACAAUUUUAUUUGAAAGCCUAGGAUGCGUUGACAUCCUGCAUGCAUUUAUUACUUGAUAUGCAUGCAUUCUGGUAUCUCAAGCAUUCUAUUUCUGAGUAAUUGUUUAAGGUGUAGAAGAGAUAGAUAUGGUGGAUUUGGAGUUGAUACUUAUAUAUUUUCUAUUUCUUGGAUGGAUGAAUUUGUACAUUAAAAGUUUUCCAUGGCAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1538.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1623.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 1008.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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