Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_139013.3
Sequence Length
1306 nt
GC Content
0.5253
ACUGGAGCCUUAGCGGGCGCAGCAGCUGGAACGGGAGUACUGCGACGCAGCCCGGAGUCGGCCUUGUAGGGGCGAAGGUGCAGGGAGAUCGCGGCGGGCGCAGUCUUGAGCGCCGGAGCGCGUCCCUGCCCUUAGCGGGGCUUGCCCCAGUCGCAGGGGCACAUCCAGCCGCUGCGGCUGACAGCAGCCGCGCGCGCGGGAGUCUGCGGGGUCGCGGCAGCCGCACCUGCGCGGGCGACCAGCGCAAGGUCCCCGCCCGGCUGGGCGGGCAGCAAGGGCCGGGGAGAGGGUGCGGGUGCAGGCGGGGGCCCCACAGGGCCACCUUCUUGCCCGGCGGCUGCCGCUGGAAAAUGUCUCAGGAGAGGCCCACGUUCUACCGGCAGGAGCUGAACAAGACAAUCUGGGAGGUGCCCGAGCGUUACCAGAACCUGUCUCCAGUGGGCUCUGGCGCCUAUGGCUCUGUGUGUGCUGCUUUUGACACAAAAACGGGGUUACGUGUGGCAGUGAAGAAGCUCUCCAGACCAUUUCAGUCCAUCAUUCAUGCGAAAAGAACCUACAGAGAACUGCGGUUACUUAAACAUAUGAAACAUGAAAAUGUGAUUGGUCUGUUGGACGUUUUUACACCUGCAAGGUCUCUGGAGGAAUUCAAUGAUGUGUAUCUGGUGACCCAUCUCAUGGGGGCAGAUCUGAACAACAUUGUGAAAUGUCAGAAGCUUACAGAUGACCAUGUUCAGUUCCUUAUCUACCAAAUUCUCCGAGGUCUAAAGUAUAUACAUUCAGCUGACAUAAUUCACAGGGACCUAAAACCUAGUAAUCUAGCUGUGAAUGAAGACUGUGAGCUGAAGAUUCUGGAUUUUGGACUGGCUCGGCACACAGAUGAUGAAAUGACAGGCUACGUGGCCACUAGGUGGUACAGGGCUCCUGAGAUCAUGCUGAACUGGAUGCAUUACAACCAGACAGUUGAUAUUUGGUCAGUGGGAUGCAUAAUGGCCGAGCUGUUGACUGGAAGAACAUUGUUUCCUGGUACAGACCAUAUUGAUCAGUUGAAGCUCAUUUUAAGACUCGUUGGAACCCCAGGGGCUGAGCUUUUGAAGAAAAUCUCCUCAGAGUCUGCAAGAAACUAUAUUCAGUCUUUGACUCAGAUGCCGAAGAUGAACUUUGCGAAUGUAUUUAUUGGUGCCAAUCCCCUGGGUAAGUUGACCAUAUAUCCUCACCUCAUGGAUAUUGAAUUGGUUAUGAUAUAAAUUGGGGAUUUGAAGAAGAGUUUCUCCUUUUGACCAAAUAAAGUACCAUUAGUUGAAUCUUG

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-492.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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