Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_139208.3

Sequence Length

732 nt

GC Content

0.6544

AGACCAGGCCAGGCCAGCUGGACGGGCACACCAUGAGGCUGCUGACCCUCCUGGGCCUUCUGUGUGGCUCGGUGGCCACCCCCUUGGGCCCGAAGUGGCCUGAACCUGUGUUCGGGCGCCUGGCAUCCCCCGGCUUUCCAGGGGAGUAUGCCAAUGACCAGGAGCGGCGCUGGACCCUGACUGCACCCCCCGGCUACCGCCUGCGCCUCUACUUCACCCACUUCGACCUGGAGCUCUCCCACCUCUGCGAGUACGACUUCGUCAAGCUGAGCUCGGGGGCCAAGGUGCUGGCCACGCUGUGCGGGCAGGAGAGCACAGACACGGAGCGGGCCCCUGGCAAGGACACUUUCUACUCGCUGGGCUCCAGCCUGGACAUUACCUUCCGCUCCGACUACUCCAACGAGAAGCCGUUCACGGGGUUCGAGGCCUUCUAUGCAGCCGAGGACAUUGACGAGUGCCAGGUGGCCCCGGGAGAGGCGCCCACCUGCGACCACCACUGCCACAACCACCUGGGCGGUUUCUACUGCUCCUGCCGCGCAGGCUACGUCCUGCACCGUAACAAGCGCACCUGCUCAGAGCAGAGCCUCUAGCCUCCCCUGGAGCUCCGGCCUGCCCAGCAGGUCAGAAGCCAGAGCCAGCCUGCUGGCCUCAGCUCCGGGUUGGGCUGAGAUGGCUGUGCCCCAACUCCCAUUCACCCACCAUGGACCCAAUAAUAAACCUGGCCCCACCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-305.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -319.45

Frequency: 0.0000

Diversity: 181.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((((....))..(((((((((((..((((.((((((....((((((........))))))(((((((.(.((((((...(((((((((((((((....))))))))...(((((((((((((....)).)))).).)))))).(((..((.((.(((((.((.....(.(((.......)))).....)).))))).)).)))))..))))))).(((.((((((......((..(((((......)))))..))..)))))).))).)))))).).)))))))((((.((((((.((((..(.(((...(((((((((((...)))((((......((((...(((((...))))).)))).....)))))))))))).((.(((....))).))........((((((.((((((((((..((((...((((((((....))))((((((((....((.((.(((((......))).))....)).))....))))))))(((((....)))))))))...((((..(.((((........)))).)..))))..))))..)))..)).))))).))))))..))))..)))).)))))).)))).)))))).))))...(((((....)))))((((((((......)))))))))))).)))))))......((((.........)))).............)))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

......(((((((,,....||.,(((({(((((,((((((.,.{...,}}.{{||||,,.,}.}})))))}(((((((.(.((((((,({(((((((((((((((....))))))))...(((((((((({((....)).)))),,.}))))).,{,..{({,(,(((((,((.....{.,,{.......))))....})).))))),}}.}}}},..))))))).{((.((((((......((..(((((......}))))..))..)))))).)))})))))).).))))))){(((((((((((((((,{...,,...(((((((((((...))){(((......{{{{...(((((...))))).)))).....}}},))))))))............((((((((((((.((((((.,.((({,,,...,..}}},,||.{{.({..{.{(,,((((((((,((......)).)}}}))))).,}))..}}.,))).})))).)))))))))))))).}),))))))))))))))|}{,{{.,,.}}..}}},...||||,..,{|||..,}|||}||||||((((((..(((((((((..(((((((...))))))).|,.{{,,({({,,{.,,.))))),)})))))))))..)))))},}),)),)})))})......{{{{....,,...,))).............)))))))........