Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_145006.4

Sequence Length

1196 nt

GC Content

0.5945

ACUCCCCUGGCAGACCCCGCCAAGCGCCUCGGAGCGCGCAGGAUGCGCUGGGCGGCCGCCACCCUCCGUGGCAAGGCGAGGCCCCGGGGGCGGGCCGGGGUCACCACGCCUGCCCCAGGGAACCGCACAGGCACGUGCGCUAAGCUGCGGCUACCCCCGCAAGCAACCUUCCAAGUCCUUCGUGGCAAUGGUGCUUCCGUGGGGACCGUGCUCAUGUUCCGCUGCCCCUCCAACCACCAGAUGGUGGGGUCUGGGCUCCUCACCUGCACCUGGAAGGGGAGCAUCGCUGAGUGGUCUUCAGGGUCCCCAGUGUGCAAACUGGUGCCACCACACGAGACCUUUGGCUUCAAGGUGGCCGUGAUCGCCUCCAUUGUGAGCUGUGCCAUCAUCCUGCUCAUGUCCAUGGCCUUCCUCACCUGCUGCCUCCUCAAGUGCGUGAAGAAGAGCAAGCGGCGGCGCUCCAACAGGUCAGCCCAGCUGUGGUCCCAGCUGAAAGAUGAGGACUUGGAGACGGUGCAGGCCGCAUACCUUGGCCUCAAGCACUUCAACAAACCCGUGAGCGGGCCCAGCCAGGCGCACGACAACCACAGCUUCACCACAGACCAUGGUGAGAGCACCAGCAAGCUGGCCAGUGUGACCCGCAGCGUGGACAAGGACCCUGGGAUCCCCAGAGCUCUAAGCCUCAGUGGCUCCUCCAGCUCACCCCAAGCCCAGGUGAUGGUGCACAUGGCAAACCCCAGACAGCCCCUGCCUGCCUCUGGGCUGGCCACAGGAAUGCCACAACAGCCCGCAGCAUAUGCCCUAGGGUGACCACGCAGUGAGGCUGGUGCCCAUGCUCCACACUGGGAGGCCAGGCUGACCCCACCAGCCAGUCAGCUACAACUCCACAUCAACUCCACAUGCGCCCAGCUCGAGACUGAUGAGUGGAAUCAGCUUCCAGGUGUAGGGACCCCUUGAGGGGCCGAGCUGACAUCCAAGGCUGAGGACCCCAGUGGGGAGUGUUCUGUUCCGGCAUAUCCUGGCCGUAACGAUUUUUAUAGUUAUGGACUACUUGAAACCACUACUGAGGGUAAUUUACUAGCUGUGGCCUCCCACUAACUAGCAUUCCUUUAAAGAGACUGGGAAAUGUUUUAAGCAAAUCUAGUUUUGUAUAAUAAAAUAAGAAAAUAGCAAUAAACUUCUUUUCAGCAACUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-464.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -482.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 428.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((...((((.......)))).((((((...)).))))(((((((..((((.((((((.((((((.((((...(((.((..(((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((..((((((......)))))...(((.((((...((((((.(((((.(((((((.(.....).))).)).))))))).)).)))).)))))))..(((((((((((........(((((....)))))((.((((((((((((((((.(((((.....(((((.((((((..((.(((((..(((..(((((......))))).)))..(((.((........(((....((((((..(.((..(((.....(((((((.(((....)))...))))))).....)))..)))))))))...)))........)).)))..))))).))..)))))).)))))..))))))))..((((((......))))))........((..(((..((.(((((((((((.......))))))...)))))))..)))..))))))).)))))))))).(((((((..........(((((((((.......)))))).))).((((....))))...))))).)).)))))).))))).)..))))))).......(((((...((((.....)))).....)))))..........)))))).)))))....(((......)))....))))).))))))))))))))).))).((((((((((..(((((...(((.....)))....((((.((((.((......))))))))))(((((((.(((((((.(.((.(((((((...........))))))).....(((((((((.(((.....((.....))..)))..))))..))))).(((((((...(((((((((.((((....))))))...)).)))))..))))))))).)))))))).))))))).)))))..))))).))))).(((((((..........)))))))..............)))).))))))............)))))).)))).......))).)))).....))).(((((((..((((...((...(((.(((((((...))))))).))).....))...))))...)))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{{{,{,,,,((((((((((((.(({(...,|,||||{{{.,.||}}},(((((((.(((((.....)))))..{(((.(..(((.(((((((((.{((....)).,))))))))).)))..)))).|.((.{((((,|{..{((.((((...((((((.(((({,(({{(((.(.....).))).}}.))))))).)).)))).))))))}}}})).)))))))))..,,..,,......))))))))))))(((((((((((((((((((((((.(((((.((((((..((,(({((.{((({,(((((......))))).|||{{{,{,,(,{,{{...{|{..|,{||||||,{{(,..{{{.....{((((((.({{....|},...))))))|,,{||}||{,||,||||,||{{}}}......,))}.)))}.))))},)}.,|}|}}|.|}|}}..,.(((((((,,(((((,,,{{{||}||,.....,}.||,.(((..((.(((((((((((.......))))))...)))))))..)))..,|{{({(({((({{{|||.{||{|||}.....,.,,(((((((((.......)))))),,||.{{{|,..,)))),,.))))).))|||.||||||}},.,,||{{((((.......(((((...||{{,..,,||||,,,..}||}|,..,...,,,||||||.}|||||...(((.....,}}},...})},.,))))),,},))))})})}...}||}.,}))},..,,|,,|{{{,,...})),}},)))),,))))}),))).}))))),)))).,)}}}},},||||}.|,)},|||||||,,,..,,,,|,|||||||.....{{({({{{{.{{{.....({.....)),.}}).,))})}.})))}.,,..)))))))))))))).......)))))))))..{{{{...,|,..}|||||}}||||||||||||}}|{{,|{{{{.{{(|,..,,,||||||{|||........,.||}}}}).},,...,...,}.}}}}||||||,,,,...{{{{..((((....))))...)))),}}}}}}},...,,|.{{||||,.,(({{...((...{((.(((((({...})))))).))).....}}...}}}}...})})))),.......