Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145243.5
Sequence Length
1861 nt
GC Content
0.3772
GUCACCGCUUUCGCUUCUGCUUGAGUAGUCAAGUGAAAAAAUGAGCUUCAUCUGUGGAUUGCAGUCUGCUGCUAGAAACCAUGUUUUCUUCCGAUUUAAUUCACUGUCUAACUGGAGAAAAUGUAACACAUUAGCAUCCACCUCACGGGGCUGUCAUCAAGUACAAGUUAACCAUAUAGUAAAUAAGUAUCAGGGACUGGGAGUAAAUCAGUGUGACAGGUGGAGUUUUCUGCCUGGAAACUUUCAUUUUUAUAGUACUUUUAACAACAAAAGAACAGGAGGCCUCUCAAGUACCAAAAGUAAGGAAAUUUGGAGGAUUACCAGCAAAUGUACUGUAUGGAAUGAUGCUUUUUCAAGACAGCUGCUAAUAAAAGAAGUUACAGCAGUCCCUAGUCUGUCAGUAUUGCAUCCUCUAAGCCCUGCUUCCAUAAGAGCUAUUAGGAAUUUCCAUACUUCUCCACGGUUUCAAGCUGCUCCGGUUCCUCUCUUGUUGAUGAUUCUUAAACCAGUACAGAAGUUAUUUGCAAUCAUUGUAGGCAGGGGCAUAAGGAAAUGGUGGCAGGCACUUCCUCCUAACAAGAAGGAAGUAGUUAAAGAAAAUAUAAGGAAGAAUAAAUGGAAGCUAUUCCUUGGUUUGAGUAGUUUUGGAUUGCUCUUUGUGGUGUUUUAUUUUACUCACCUGGAAGUAAGUCCAAUCACAGGAAGGAGCAAGCUACUAUUAUUGGGGAAAGAACAGUUCAGACUUUUAUCGGAACUGGAAUAUGAAGCAUGGAUGGAAGAAUUUAAAAAUGAUAUGCUAACUGAGAAAGAUGCCCGAUACCUGGCUGUUAAAGAAGUGCUUUGUCAUCUAAUUGAAUGCAAUAAAGAUGUUCCAGGGAUCUCUCAGAUCAAUUGGGUUAUUCAUGUGGUUGAUUCCCCAAUUAUUAAUGCCUUCGUGCUUCCAAAUGGACAAAUGUUUGUUUUCACUGGAUUUUUAAAUAGUGUAACCGAUAUUCAUCAACUUUCUUUCCUUCUGGGCCAUGAAAUAGCACAUGCAGUACUUGGGCAUGCUGCAGAAAAGGCUGGCAUGGUUCAUUUGUUGGAUUUCCUAGGUAUGAUUUUCCUCACAAUGAUUUGGGCCAUUUGUCCUCGAGAUAGCUUGGCACUUUUGUGCCAGUGGAUACAGUCUAAAUUGCAGGAGUAUAUGUUUAAUAGACCAUACAGCAGAAAAUUGGAGGCCGAAGCUGACAAAAUUGGACUACUGCUUGCUGCAAAGGCUUGUGCAGACAUAAGAGCCAGUUCAGUGUUUUGGCAGCAAAUGGAGUUCGUUGAUAGCCUGCAUGGCCAACCCAAGAUGCCAGAAUGGUUAUCUACACACCCUUCUCAUGGCAAUCGAGUUGAGUACUUGGAUAGACUUAUACCUCAGGCUCUCAAAAUUAGAGAGAUGUGUAAUUGUCCACCACUGUCUAAUCCAGACCCUCGAUUACUAUUCAAACUCAGCACGAAGCAUUUUCUUGAAGAAUCAGAGAAAGAAGACCUAAAUAUCACGAAGAAACAGAAAAUGGAUACUCUUCCUAUUCAAAAACAGGAGCAAAUACCAUUAACAUACAUAGUUGAGAAAAGAACGGGCAGUUGAAUUAAAAUUUAUGAGACACAAGAUAUAUGAAGAAUGUUGCAGUCCUUAUCAUUUUAUGUUACUUUUUAAAAAAUGAUGUUUGAAGUGAAAAAAAAAAGGAUAUUCAGGGUCAAAUCAUGUACAUUACAGAUAUUAUCUAAAUUCUUCUAGAAUUUAUUUUUCAUGAAAUAUUGAUGUAUUUUAAUCUAUGUUAAAAUAUCUUCAAUGAGGAAAAUGUCACAGAAUAAAUUUAUAUUACACAUUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-459.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -496.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 518.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((....(((.((((((....))))))))).....))))....((((((....((((....))))........(((((((((((...(((((((((((((((...(((((..(((((...)))))..).))))(((...)))(((((((....((((..(((.((......)).)))..))))...((((((((........(((....((((((((....))))))))...))).(((((((((((((((((((........))))...((...((((.(((((.((........))..)))))))))....)).......)))))))).)))))))...........(((.((((.((((.......)))))))).)))))))))))((((((.(((...(((((((...((((((((((...((((((((((((..((.((((((((((((.(((((....((((((....((((..((((.(((((((((...........)).))))))).)))).....).)))..))))))....))))).)))).))(((((((((.((....)).))))))).)).............((((((((((((((((((((((((........))))))))))((.(((((((((.(.(((......((((((........))))))......))).).))))))))).)).........((((((((((((((((.((......)).))))))......((((((((((.((........................((((((.........((..(((((............(((....(((......)))..)))...........)))))..))))))))...(((((((....(((......)))...))))))).......))))))))))))......((..((((((.(((..(((((..........))))).))).))))))..))....))))))))))...(((((((...((((...(((((((........)))))))......)))).)))))))))))))))...))))))))))))))..)))))...........((((.....))))....)))))))((((((....)))))))))))....(((((....(((........)))....))))).....)))))....))))))).))).))))))...((((((((...((((((((((........))))).))....))).))))))))....)))))))....((.((..((.(((((((....((((...........))))....))))))).))..))))((((((..((..(((.(((((((..((((((((.........(((((.(((....((((((.((..(((........)))..)).))))))..))).))).))...))))))))))))))).))).))..((((((((....))).))))).............................(((((......(((((..........)))))......)))))............))))))......)))))).))))))))).(((((((((....((((....(((((((......((((((....((((...(((((((................)))))))...)))))))))).....((((...(((.((((...)))))))...))))..)))))))....))))...)))))))))..(((((.((((((((((....))))))))))..)))))))))))))))))))))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{{(({{{{((({(({{{{}}}},,))))))},..,,|||},,..((((((....((((....))))........{{(((((((((...(((((((((((((((...(((((..(((((...}))))..}.)))}{{....|}{((((((...,{(((,..(({..(({{((({{{.,,..||,|..,{,(((((,......|}|}|.|,.((((((((....)))))))),,,}},.||,,||,,.,.((.(((((......})))).}}.((,,.((((.(((((.((........))..)))))))))..,.)).,,..,.,)))))))})),})},}}}}}..,...}}}}||||}{||{.......}}}}|||}{||||},|||,(((((((.(((...(((((((...((((((((((..,((((((((((((..(,{((((((((((((.(((((....((((((.,,,{{{{..((((.(((((((((,,......,..))}}}))))).)))).....).}))}.))))))....))))).)))).)){{(((((((.((....)).))))))).}}.............((((((({((({{{{(((((({{{,.,,,,,,}||||||},|((.{((((((((.(,(((.{{,.,((({({,.....}}))))))...,},))).}.})))))))}.))},,},,,,,{(((((((((((((((.((......}).)))))),,,,,,((((((((((.((....,,,.......,,,.......((((({..,,,.{{,({,.{{{((,...........,,|,,,|,(({{{.{{{|,..,))}}..})))}..}))))}})))))))),,,{((((((..,.{((......))),..))))))).,.....)))))))))))),,.,,{((,.{{{|||,|||..(((((..........))))).}}).))))}}..)}....)))))))))}.,{{((((((...{(((...(((((((........)))))))......)))).)))))))))))))))...})))))})))))))..))))).....,,,...((((.....)))),...)))))))|(((((....)))))})))))....(((((....(((........)))....))))).....)))))....))))))).))).)))))))..,,,|||||.|||,{((((((,.,((((({|{,.,.}},..,}))).}}.||}.,,}))}))))))}.,||,||}}{{.(((((((....((((..........,))))....))))))).}}..,}}|{((({,.,((..(((.(((((((..((((((((....,,...{{(((.(((....((((((.((..(((........)))..)).))))))..))).))).)).,,))))))))))))))).))).)).{((((((((....})))))))}}..,.........,|.....,........(((((......{((((.{,.....,.)))))......)))))..,.......}})))}},......))))))},)))))))}.(((((((((....,{,(((((((.{{((.{{{..((((((.{{,((((.,,((({(({....|,,.,,,,.,.,)))))))...,,,,))))))...}}},}},..,||,|||}...},,}|||...}}}|{((((({...))))))),..))))))))}..(((((.((((((((((....))))))))))..))))))))))))))})))))))..,....................
Back