Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145341.4
Sequence Length
3565 nt
GC Content
0.3804
AGAGACUCUCCGAGGCGGCGGCAGAGACAGAAGAGCGGGGUCGGGGCCGGCUGACCAGGAACCUGGGCGAGCAGCGGCGGGGGCCCGAGGGAUUCUGAAGGAAGAUUUCCAUUAGGUAAUUUGUUUAAUCAGUGCAAGCGAAAUUAAGGGAAAAUGGAUGUAGAAAAUGAGCAGAUACUGAAUGUAAACCCUGCAGGGUAUUUUCCCUAAUUCUCCAUGGUGCUUCAAUAGCAUGUUAUUAUCAUAAAAAUGAACAGUUUUGUGGAAUAGAUGACCAAAUAUCCUGAUAACUUAAGUGACUCUCUCUUUUCCGGUGAUGAAGAAAAUGCUGGGACUGAGGAAAUAAAGAAUGAAAUAAAUGGAAAUUGGAUUUCAGCAUCCUCCAUUAACGAAGCUAGAAUUAAUGCCAAGGCAAAAAGGCGACUAAGGAAAAACUCAUCCCGGGACUCUGGCAGAGGCGAUUCGGUCAGCGACAGUGGGAGUGACGCCCUUAGAAGUGGAUUAACUGUGCCAACCAGUCCAAAGGGAAGGUUGCUGGAUAGGCGAUCCAGAUCUGGGAAAGGAAGGGGACUACCAAAGAAAGGUGGUGCAGGAGGCAAAGGUGUCUGGGGUACACCUGGACAGGUGUAUGAUGUGGAGGAGGUGGAUGUGAAAGAUCCUAACUAUGAUGAUGACCAGGAGAACUGUGUUUAUGAAACUGUAGUUUUGCCUUUGGAUGAAAGGGCAUUUGAGAAGACUUUAACACCAAUCAUACAGGAAUAUUUUGAGCAUGGAGAUACUAAUGAAGUUGCGGAAAUGUUAAGAGAUUUAAAUCUUGGUGAAAUGAAAAGUGGAGUACCAGUGUUGGCAGUAUCCUUAGCAUUGGAGGGGAAGGCUAGUCAUAGAGAGAUGACAUCUAAGCUUCUUUCUGACCUUUGUGGGACAGUAAUGAGCACAACUGAUGUGGAAAAAUCAUUUGAUAAAUUGUUGAAAGAUCUACCUGAAUUAGCACUGGAUACUCCUAGAGCACCACAGUUGGUGGGCCAGUUUAUUGCUAGAGCUGUUGGAGAUGGAAUUUUAUGUAAUACCUAUAUUGAUAGUUACAAAGGAACUGUAGAUUGUGUGCAGGCUAGAGCUGCUCUGGAUAAGGCUACCGUGCUUCUGAGUAUGUCUAAAGGUGGAAAGCGUAAAGAUAGUGUGUGGGGCUCUGGAGGUGGGCAGCAAUCUGUCAAUCACCUUGUUAAAGAGAUUGAUAUGCUGCUGAAAGAAUAUUUACUCUCUGGAGACAUAUCUGAAGCUGAACAUUGCCUUAAGGAACUGGAAGUACCUCAUUUUCACCAUGAGCUUGUAUAUGAAGCUAUUAUAAUGGUUUUAGAGUCAACUGGAGAAAGUACAUUUAAGAUGAUUUUGGAUUUAUUAAAGUCCCUUUGGAAGUCUUCUACCAUUACUGUAGACCAAAUGAAAAGAGGUUAUGAGAGAAUUUACAAUGAAAUUCCGGACAUUAAUCUGGAUGUCCCACAUUCAUACUCUGUGCUGGAGCGGUUUGUAGAAGAAUGUUUUCAGGCUGGAAUAAUUUCCAAACAACUCAGAGAUCUUUGUCCUUCAAGGGGCAGAAAGCGUUUUGUAAGCGAAGGAGAUGGAGGUCGUCUUAAACCAGAGAGCUACUGAAUAUAAGAACUCUUGCAGUCUUAGAUGUUAUAAAAAUAUAUAUCUGAAUUGUAAGAGUUGUUAGCACAAGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGCACUUGUUUUGGGUACAAGGCAUUUCUGACAUUUUAUAAACCUACAUUUAAGGGGAAUUUUUAAAGGAAAUGUUUUUUCUUUUUUUUUUGUUUUUCGAGGGGGCAAGGAGGGACAGAAAAGUAACCUCUUCUUAAGUGGAAUAUUCUAAUAAGCUACCUUUUGUAAGUGCCAUGUUUAUUAUCUAAUCAUUCCAAGUUUUGCAUUGAUGUCUGACUGCCACUCCUUUCUUUCAAGGACAGUGUUUUUUGUAGUAAAAUCACUGGUUUAUACAAAGCUUUAUUUAGGGGGUAAAGUUAAGCUGCUAAAACCCCAUGUUGGCUGCUGCUGUUGAGAUACUGUGCUUUGGGAGUAAAAAAAGAAAGUUAUUUCUUUGUCUUAAAGAAUUUUUAAAAAAUUAGUCAUGAGACUUAUUCAUCUUUCCAGGGAACAUACUGAUUGGUCUUAAAAGACUAGACAGUUAAGUAAAAGGUGGCUGGAACAUCUAUUUUUCUACAAAACUGGAAAAAUGAACCUGGUUCUAGAAGAAUGUACACCAAAAUAAAACAUGUGAAGCAGUAUUGAUUCUUUAUUGGGAGUACAUUUUUUUAGGUCUCUUAAACUUUAAUUUCACACAGUAAAUUUUGAAUCUCAUAAGGAAGCAUAUUUGAACCUAGUCAAUUUAAUCUUAGUGUUCCCUUGAAAACUUUUUUUCCCUACAAAAUUUUAAGUGAAAAAUACAAUAGUAAAUUAAGAUUACACUGGGGAAAAAAAUGCAGGUAUCACUUUACUCCAUUGUUAUCUGACCUAGAGCUUAAUUAAGUUUUAGAAAUAUGUAAUACCUUCCAUCAUUCCAUCAUCCUUAAAUUCUGUUACCAAAUAAUGGCUAAUGUUACAAAAAGUUAUACUCCAGAGACCCAAAGCUUGACAUUUACCUAAUGUAUGAGAAAAUAUUACCAAUUAACAAUAAAGAAUGAUCAUAUUUUUAACCUCUUUUACAUAGCCUAAUAACUCAGCAAGGCCUCAACGUCUGUGCUAAUUUAAACUGCCAAAUAUUGACUGCAGCAAACAAGAAUUAUAUUCAGAAUUUAUGAGGGUACUGUUAGGAGUAUACUGCUUACAGGUUUAGAUAUAGUCUGUUAGAAUUAAAACCAAGUUUAGUGUUCAUAUUUACCUCAUGGGCUUUAUCAAGCCCAUAUUACCUCAGCUUAUAUAUAGUUACCAUUUUUAGGUUUUUAAUUGUUUGACACUUGGAUGAUAAAUGCAGUCAUUUUAUUCUCAAGUGCUUAAAAUUAAUGUAAUUAAAAGCUUAGCUGACUACAGAAUAGGUGAGGGUUUCUUAAAAAUGAGAUUUAAGGGCUGGGCACGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGCGGAUCACUUGAGGUUGGGAGUUCAUGACCAGCUUGACCAACAUGAAGAAACCCUGUCUCUAUUAAAAAUACAAAAGUAGCCAGGCAUGGUGGCGCAUGCGUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCUGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGUCGAGAUGGUGCCAUUGCUCUCGUUUGGGCAACAAGAGUGAAACUCUUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAUGAGGUUUAAGACAGUUUUGUCAUUACUGGUGGGAUCUGGUCACACAAGAUAGCAUUAAACGUGACAUGGCACAUAAAAUUGGUUAAAAAAUUUUGUUUUUUAAUUACGUAAUGUAAAAGCCCAACAAACACUUUAUGCAAGAUUGGAAUGUAUCUUCAAAUUCAGAUUUAAUAAACAUGUAAAGAUCCUCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-956.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1024.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 1131.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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