Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_145652.4

Sequence Length

1009 nt

GC Content

0.5491

CUCUUUCCUCUCCUGACUAAGUUUCUCUGGCUUCCCUGAGGCUGCAGGUGUUAAUCUGGGGGGCCCUGGGCCCUGAGCCGGCAGCAGAAAUAUGAGGACCCAGAGCCUUCUCCUCCUGGGGGCCCUCCUGGCUGUGGGGAGUCAGCUGCCUGCUGUCUUUGGCAGGAAGAAGGGAGAGAAAUCGGGGGGCUGCCCGCCAGAUGAUGGGCCCUGCCUCCUAUCGGUGCCUGACCAGUGCGUGGAAGACAGCCAGUGUCCCUUGACCAGGAAGUGCUGCUACAGAGCUUGCUUCCGCCAGUGUGUCCCCAGGGUCUCUGUGAAGCUGGGCAGCUGCCCAGAGGACCAACUGCGCUGCCUCAGCCCCAUGAACCACCUGUGUCACAAGGACUCAGACUGCUCGGGCAAAAAGCGAUGCUGCCACAGCGCCUGCGGGCGGGAUUGCCGGGAUCCUGCCAGAGGCUAAUUCUGAUUUAGGAUCUGUGGCUCUGCACCUAAGCUGGGGACCAACGGAAAGAGUUCACGAUGGGAGGCCUGGGGCCCUGCCCGCUGGACAGCACUAUCUCUACCAGCGGUGGUUCCAGCCUUCUGAUAAUCACUGGCCUGCUGACACUUCCCUGCAACCCAUCCACCCCUGGUUUCUCCUCCUGGGAGUCAAAGUCCAUAGCCUGAGCUCGGAGGAAGGCCUCUGUAUCACCCCAGUACUCUGCACCACUGCCAUACGAGCUUCCCACCCUUCCUAACGCUUUCACACCAAUCCGUACAUGCUGCUUCCUCCACCAAAAAUGCCCAAUUCAGGCAGACCCUGACCUCUCCCUCAGGCAGCCCAACCAUCCAGAAUGAAUAUUCUUGCAGAGUUUUCCAAACAUCAGUCAUUCACCUCUUUCAUGAUUUUCACCAUACCUACAAAAUAGCACCAUGAUAGGUUGCACGCUGCCUGUACCACCAUUUACUUAAUGUUUUCUUUAAAUGGCUCACUUUUGUAUAUAAAUAAAUUCAUUUCAAAAGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-337.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -356.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(((((((.(((((.......((((((...)))))).(((((....))))).((((((...)))))).....((((((((.....(((...((((.((((.(((((....))))).......)))).))))...))).....))))))))))))))))).)))((((((((...((((((..(((((.(((((...((((((..((.((((((..((.(...((((((((((.(((((.((((.((.(((....)))..(((((((..(((....))).)))))))(((((((.(((((((((((.((.(((..((((((((((.((....((......)))))))))).))))..))))))))..(((.(((.....))).)))..(((....)))...((.(.(((.(((((((.((((.(.(((((((((.....))))))))).)))))..((((((...)))))))))))))...))))))...))))))))...(((((....))).))..(((((((.(((((((....(((((((...............))))))).))))))))))))))......)))))))))))))...))))).))))............))))))....).)))))))).))..))))))...))).))..((((((((.....(((((.......(((....(((....)))..)))((((.................))))............))))).....))))))))...................))))).)))))).))))))))((((((((.(((((.....((((((..(((((...)))))..............)))))).......(((((...........................)))))..)))))...)))))))).....(((((((..............)))))))......(((((......))))).........)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{(({..(((((((.(((({.......((((((,,.}}||||.(((((....))))).{(((({...))})}},|||,((((((((.....(((...((((.((((.,((((....))))).......)))).))))...)))..,..))))))))}))))))))}})}((((((((...((((((..(((((.(((((...((((((..((.((((((..((.{...((((((,(,({(((,(.(((,.(({(((....},,..(((((((,,{{{....))).,))))))(((((((.(((((((((((,((,(((..((((((((((.{{.,,|||......}})})))))).))))..}}}}}}}}..(((.(((.....))).)))...{{|.||||}...,|||.{{{,(((((((.((((.,.(((((((((.....))))))))).|))))..{{(((|...)))))))))))))...))},,....)))))))),,.(((({....))).)).||((((({,(((((((..,.(((((((..{{......,,.,.))))))),)))))))))))))}......))))))),,}},),,,)),,,,)))}.....,,}}}.,))))))...,}.}})))))).))..))))))...))).))..(((((((({{...(((((.....,,({.....{{,....})}...,,((((.................)))}............))))).},..))))))))...................))))).)))))).))))))))((((((((.(((((,,,..((((((..{{{{{,,.|||||......,.......}}}}}}.......,{{{|,..........................}}})),.)))))...)))))))).....(((((((...,,....,,...)))))))......{{({,......,,,...........)))))...