Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145731.4
Sequence Length
1287 nt
GC Content
0.5812
ACCGCGCGGGUGCAGCCACGAUGGAAGGGGGUGCGUACGGAGCGGGCAAAGCCGGGGGCGCCUUCGACCCCUACACCCUGGUCCGGCAGCCGCACACCAUCCUGCGCGUCGUGUCUUGGCUGUUCUCCAUAGUGGUGUUCGGCUCCAUCGUGAACGAGGGCUACCUCAACAGCGCCUCCGAGGGGGAGGAGUUCUGCAUCUACAACCGCAACCCCAACGCCUGCAGCUAUGGCGUGGCCGUGGGCGUGCUCGCCUUCCUCACCUGCCUGCUGUACCUGGCCCUGGACGUGUACUUCCCGCAGAUCAGCAGCGUCAAGGACCGCAAGAAAGCCGUCCUGUCCGACAUCGGUGUCUCGGCCUUCUGGGCUUUCCUCUGGUUCGUGGGAUUCUGCUACCUGGCCAACCAGUGGCAGGUCUCCAAGCCCAAGGACAACCCACUGAACGAAGGGACGGACGCAGCCCGGGCCGCCAUCGCCUUCUCCUUUUUCUCCAUCUUCACCUGGAGCCUGACCGCAGCCCUGGCCGUGCGGAGAUUCAAGGACCUAAGCUUCCAGGAGGAGUACAGCACACUGUUCCCUGCCUCGGCACAGCCGUAGGCCUCCCCGGCUUGCAGAGGCCGGCAGCCCUGUAUCACCCCUGGCAGUGAGGUGGCAGGAGCAGCCUAGUGCCAGAAAUGUCCAAGAUGCCAGGGCAUGCAGGGCAGUGGAAGGCUGGCUUGAGGAACCAAUUCAGGUUCUCCACUGACUCAUUCAUUCCUUCACCGCCUCCUUCAUUGAUUCUUCAUGCGUUCAUUCAUUCAGUAAACAUUUAUUGAGCAGCUGUUUUGUGCCUAGUGAUGAAUUAGGUGGGGUCCUUGGCUCCAGGAGCCCACAGGCUGGGGAGGAGAAAACAAACACAUCAAUAUCUCUUCCAAAUGGACAGCCGUGGACAGUUACCAGGUAGGUAGCGGCCCCAUACAUGGGCUGCCUAGAGGCGUUCAUGGUCCCCAUUGCUGAGCUGUGGGUGCAGAGCAAUAGCCUCUCCCUUCACAGCGGUGUGAAGAGUGACCUCACUGUCCUUAGGGUUAGCAUCCUGGCCGAGGAUGUCACAGGGCUCCUGGUCUGGCUCUGUCCUCAUGUGCUAUGUGACCCUGACAAACCCGUGCACCUCUCUCAGCCUCAGUCCACUUACCUGAACUGAGGGGUGAUAAUGGACCAACCUCUCAAGGCUGUUGUGCCAAUGAAACAAAGGCCAGCCCAGGGCUUAGCACAAGCAUGCUCAAUAAAUGUAAGCUCUUUUGUUCAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -530.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 466.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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