Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145860.2
Sequence Length
1852 nt
GC Content
0.3423
GGGUCCUUCCGGCGUCGCCGGAGUGAAUUGAUCCGGGAGUUGAAGAGGGCUGCAAGGUGGGAAGUGAAGUCAGUGCCUCAGUUGCUGAUCAGUGUGUUUUUUGUGUCCAAUUCUUUUAUCACCAAAAAAGAGAAGAAAUAUUGCAGUGAAUGAAGAUUCCUCUGCAUUUUAGCACUGCUUUUUCAACUGUAGUUGGCUUUUGAAUGAGGAUGACAAUGGAAGAGAUGAAGAAUGAAGCUGAGACCACAUCCAUGGUUUCUAUGCCCCUCUAUGCAGUCAUGUAUCCUGUGUUUAAUGAGCUAGAACGAGUAAAUCUGUCUGCAGCCCAGACACUGAGAGCCGCUUUCAUCAAGGCUGAAAAAGAAAAUCCAGGUCUCACACAAGACAUCAUUAUGAAAAUUUUAGAGAAAAAAAGCGUGGAAGUUAACUUCACGGAGUCCCUUCUUCGUAUGGCAGCUGAUGAUGUAGAAGAGUAUAUGAUUGAACGACCAGAGCCAGAAUUCCAAGACCUAAACGAAAAGGCACGAGCACUUAAACAAAUUCUCAGUAAGAUCCCAGAUGAGAUCAAUGACAGAGUGAGGUUUCUGCAGACAAUCAAGGAUAUAGCUAGUGCAAUAAAAGAACUUCUUGAUACAGUGAAUAAUGUCUUCAAGAAAUAUCAAUACCAGAACCGCAGGGCACUUGAACACCAAAAGAAAGAAUUUGUAAAGUACUCCAAAAGUUUCAGUGAUACUCUGAAAACGUAUUUUAAAGAUGGCAAGGCAAUAAAUGUGUUCGUAAGUGCCAACCGACUAAUUCAUCAAACCAACUUAAUACUUCAGACCUUCAAAACUGUGGCCUGAAAGUUGUAUAUGUUAAGAGAUGUACUUCUCAGUGGCAGUAUUGAACUGCCUUUAUCUGUAAAUUUUAAAGUUUGACUGUAUAAAUUAUCAGUCCCUCCUGAAGGGAUCUAAUCCAGGAUGUUGAAUGGGAUUAUUGCCAUCUUACACCAUAUUUUUGUAAAAUGUAGCUUAAUCAUAAUCUCACACUGAAGAUUUUGCAUCACUUUUGCUAUUAUCAUUCUUUUAAGAAUUAUAAGCCAAAAGAAUUUACGCCUUAAUGUGUCAUUAUAUAACAUUCCUUAAAAGAAUUGUAAAUAUUGGUGUUUGUUUCUGACAUUUUAACUUGAAAGCGAUAUGCUGCAAGAUAAUGUAUUUAACAAUAUUUGGUGGCAAAUAUUCAAUAAAUAGUUUACAUCUGUUAAACAUUUCUUUACUUGAAAAAAUGCAUAUAUAUAUGUGUGUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUGAACAGAAGACCAAGACAACUUGGUGUAAUGUCUAAAAAACUUCUAAUGGGAGCUUAUCAGCAGUUUAUCAAAUAAUAAAGCAAGAAUUUCUAUUUUUGUCCUUAAUCACUUUGGACACAGAGUAGUCAAUGGAAAUAUUUUUGUUAAUUACUUAUAAGGUACUGAGUAUUUUUAUAUGAUUUCCAACCUGUUUUAAACGACUUAUGAGUAAGAGAUAGCAUUUUCUAGUGUUUUUGCACUAUAAUGCCACUUUUUGAACUCUUGUGACAAAUGUAGAUUUGACUCUUAAAAAUUAAGCCUUUCGUAUACUGGGCCCUCAUAAGCUUUGCACAAUUUUUUCCCAAAAAAUAGCCACAAUUAAUAGUAAUUUGAAGCUAUAUCAACGGUUGGAUUGAAAUUGUCAUGAGUGUUAAUAUUAUAUACACUCUUCAACUAGGUACAGUUUUAUUUCACCAUAGAGAAGUUUUAAGGAAAUUAUGUAUCAAGUGUUCAUGUUAAGUGGUUUCAUUUUUCAAUUAUAAAAUAAAGGGAAAAAAUCAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-422.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -459.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 575.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((...))))))).)....))))).((((((...((((((((((.(((.((((((.((.((((((((((((...)))..............(((((((((.((((((........))))))..........(((((.((((....))))..)))))....((((((((..........)))))..)))..(((.(((((((((.((((((((((((...((...((((((((((((......)))))))..........((((((((((((((((((..((((.........))))((.....))(((((((((.((..((((((((((((...........))))..............(((((((((.(......((.(((.........))).))......).)))((((....))))((((((......)))))).((((..(((((.(((((......))))).))........))).))))........)))))).......(((((....)).))).........))))))..((((.(....).)))).........))..))...)))))))))....))))))))((....))...........(((((((.(((........)))..)))))))..........((((..((...(((((((((((((...........((((.((((((((........((((((.......))))))..)))))))).))))...............))))))..)))))))...))...............((((((......((((.((...........)).))))))))))..........((((......))))...((((((.....))))))....))))..............))))))))))........((((((.....))))))........((.(((...((((.(....).))))...)))))(((((((...))))))))))))..))...)))))..........((((((....((((((...((((.(((((....))))).))))..))))))..........((((.((((((......((((..((....................))))))......)))))).)))).........((((.(((((..(((((..((((((..((((((((....))))))))...))))))((((((....).))))).((((.......)))).....((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))).(((..(.((((((....)))))).)..)))........(((((...))))).))))).))))).))))..........))))))..))))))).))))))))).)))..)))))))))(((((((.(((((((....))))))).)))))))...))))))))).).........).)))))).)))))).....((((((((....((((((...(((((...((((((....)))))).)))))(((.............))).(((((....))))).)))))).....))))....))))......)))))))...)))))).....((((((((((.....(((((..(((...........)))..)))))......(((.(((.((((((((((..((((((...........)))))).........).))))))))).))))))...(((((((......((((((((.((.((........)).)).)))))))))))))))..............)))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((...))))))).,....))))),((((((.,.(((((({,(,((((.((((((.((.(((((((((,{{.,,|||,..,,.,,,.....(((((((({,((((((........}}))))}||{,,....{((((,((((,.,,|}}}..))})),,...{||||||..,,||.{{|}}}}||{||||,(((,(((((((((.{(((((({,({({,,,,..,,.((,(((((((......)))))))...}}..,},|{{{{{{|||{{{|||||.,||||,,.}}|||}}..,,|},...,,(((((((((.({.,({{(((((((,{,{{{{......}}}||.............{{((((,,,...,,}|.{{,,{{,,....,|||}|.,,......|||||((((....)))){(((((......)))))).((({.,{{({(.(((((......))))).))|,......}}}.}}}}.....,..,},|||.......,||||....}}.}}}.......,||}}}}}..((((.,....}.)))).......,,})..))...))))))))}..,.}}))}}}}{{.,.,))...........(((((((.(((........)))..)))))))...,,.......,...,{..,||{{{{{((((((...........{|||,((((((((.......{((((((.......)))))),})))))))}.||||,{{,,,||,.....,|}}}})},.})))))...,|......,,.,,....,{{{{,.....{((((.((..{{....}}.)).)))))}}}}|{{,,,.,...{{{|,,,,,.}))),,.((((((.....)))))).,,..,,,..,,......,},,}|||||}|}}...,,.}}|||{{(.,,..})}}}|.,.||||.||,{{{,,,,|{|}|,,,||||||||},{{{{{({{{{,..|||||||||,||,,||||,,,,|||}....,,..}})),})),,}}||||||},.{(((.((((({{{{{||||,||||,.,},|||.....,,|,.,,,,,||}}..,},}}..,,}}},,}}}}}))))).)}}}}}},})))))||{{{...,{{{{{.,..((((..((({....))).)))),||}}}|,,,,|}}|{{{{{{|,.,,))))))))...}}||||{,|||,.,||}|},,,|{{(({,{,....))}.,,,,,((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))).{((..(.((((((....)))))).)..)))........{{{({...)))))}},}}}}))}}|||||,.....,,.,,||,{{,,|}}}}))).))))}}}}}.}}}..}))))))))|((((((.{((((({....))))))).))))))}...))))))))).}.........}.)))))).))))}}.....{{{{{{{{..,,({((((,..(((((...((((((....)))))).))))){,|,}}},..}}}}.,)}).(((((....))))).},||||.....))))....}}}}.....})))))))...))))}}.....((((((((((.....{{((({{(,,{({,,,.,,|||||{,|||,,.,,...(({{(((.((((((((({..((((((...........)))))).........).))))))))).))))))...||,,|||}}},,.{{{{{{{{.,,.{{.|....,.)),}}.))))))}}})))}},.........,,...)))))))))).....
Back