Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145897.3
Sequence Length
461 nt
GC Content
0.5076
CUCUUCGUUAAGUCGGCCUUCCCAACAUGGCGCAGUCUAUUAACAUCACGGAGCUGAAUCUGCCGCAGCUAGAAAUGCUCAAGAACCAGCUGGACCAGAUGUAUGUCCCUGGGAAGCUGCAUGAUGUGGAACACGUGCUCAUCGAUGUGGGAACUGGGUACUAUGUAGAGAAGACAGCUGAGGAUGCCAAGGACUUCUUCAAGAGGAAGAUAGAUUUUCUAACCAAGCAGAUGGAGAAAAUCCAACCAGCUCUUCAGGAGAAGCACGCCAUGAAACAGGCCGUCAUGGAAAUGAUGAGUCAGAAGAUUCAGCAGCUCACAGCCCUGGGGGCAGCUCAGGCUACUGCUAAGGCCUGAGAGUUUUUGCAGAAAUGGGGCAGAGGGACACCCUUUGGGCGUGGCUUCCUGGUGAUGGGAAGGGUCUUGUGUUUUAAUGCCAAUAAAUGUGCCAGCUGGGCAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((......))).((.((((.(.(((((((...((((.(((((..(((((((..(((...(((........)))...)))..)))))...)).))))).((((((((((..((((((((((((((....(((.((((....(((.....(((.((...)).))).....)))..)))).)))))).(..((((((((((((.......((((((((..(((......))))))))))).......)))))..)))))))..)(((........))))))))))((..((.((((((....)))))).))..)).)))))))))))))).((((((((........)))))))).((....))........((((..((((((((((((...(((.(((....))).)))..)))))....)))))))..))))))))..)))))))).)))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,({......,}|,((,((((.{.(((((((,,.{,{{.{(((({,({(((((..(((...(((,,......}))...}}}.,|||}}{,.||,}}},,.,|||{||||,.||||{|.||||||{...,,}||||{|||{.,}}}}}}}.,|}}}},},,},},,.,,,,,|||||{,{,,,,|}..||.({(((((,{{{{,,.,...((((((((..(((......)))))))))))....,..))))},,||}}}}}{{|(((......,.|||({((((....))))}|{{{{....)))))}|||{|||.,|{|||||||}|},.((((((((........)))))))).,|..,|,|.....,,.||(({{(((...)))))})}}}}}}|||||||}}},})),}))}|||,|{|,}},,}.,,))),,....)))))))}.)))).)}..
Back