Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145902.3
Sequence Length
2127 nt
GC Content
0.6121
CUUUUUAAGCUCCCCUGAGCCGGUGCUGCGCUCCUCUAAUUGGGACUCCGAGCCGGGGCUAUUUCUGGCGCUGGCGCGGCUCCAAGAAGGCGUGAGUUCGCGGCCGCUCCGGUGGCUUCUUUUUUUUAUAUCUAUAAUUUAAUUAAAUUAUUUAUUUAUUGAGGCCGCGCACGGGCCGUGCCCAGCUUCCUGCCCCUCGCCAUCCUUCGGGGGAGGGGGAAUAUUUUUGUCCCCCCGCCUGGCUGUGACACAUAAAUACCCCGCGGGGGCCUGGGCGGCGAGCACGCGGCGGCGGCGGUCUCUGAGCGCCUCUGCUCUCUCCCGGUUUCAGAUCCGCAUUUGCUACCAGCGGCGGCCGCGGCGGAGCCAGGCCGGUCCUCAGCGCCCAGCACCGCCGCUCCCGGCAACCCGGAGCGCGCACCGCAGGCCGGCGGCCGAGCUCGCGCAUCCCAGCCAUCACUCUUCCACCUGCUCCUUAGAGAAGGGAAGAUGAGUGAGUCGAGCUCGAAGUCCAGCCAGCCCUUGGCCUCCAAGCAGGAAAAGGACGGCACUGAGAAGCGGGGCCGGGGCAGGCCGCGCAAGCAGCCUCCGAAGGAGCCCAGCGAAGUGCCAACACCUAAGAGACCUCGGGGCCGACCAAAGGGAAGCAAAAACAAGGGUGCUGCCAAGACCCGGAAAACCACCACAACUCCAGGAAGGAAACCAAGGGGCAGACCCAAAAAACUGGAGAAGGAGGAAGAGGAGGGCAUCUCGCAGGAGUCCUCGGAGGAGGAGCAGUGACCCAUGCGUGCCGCCUGCUCCUCACUGGAGGAGCAGCUUCCUUCUGGGACUGGACAGCUUUGCUCCGCUCCCACCGCCCCCACCCCUUCCCCAGGCCCACCAUCACCACCGCCUCUGGCCGCCACCCCCAUCUUCCACCUGUGCCCUCACCACCACACUACACAGCACACCAGCCGCUGCAGGGCUCCCAUGGGCUGAGUGGGGAGCAGUUUUCCCCUGGCCUCAGUUCCCAGCUCCCCCCGCCCACCCACGCAUACACACAUGCCCUCCUGGACAAGGCUAACAUCCCACUUAGCCGCACCCUGCACCUGCUGCGUCCCCACUCCCUUGGUGGUGGGGACAUUGCUCUCUGGGCUUUUGGUUUGGGGGCGCCCUCUCUGCUCCUUCACUGUUCCCUCUGGCUUCCCAUAGUGGGGCCUGGGAGGGUUCCCCUGGCCUUAAAAGGGGCCCAAGCCCCAUCUCAUCCUGGCACGCCCUACUCCACUGCCCUGGCAGCAGCAGGUGUGGCCAAUGGAGGGGGGUGCUGGCCCCCAGGAUUCCCCCAGCCAAACUGUCUUUGUCACCACGUGGGGCUCACUUUUCAUCCUUCCCCAACUUCCCUAGUCCCCGUACUAGGUUGGACAGCCCCCUUCGGUUACAGGAAGGCAGGAGGGGUGAGUCCCCUACUCCCUCUUCACUGUGGCCACAGCCCCCUUGCCCUCCGCCUGGGAUCUGAGUACAUAUUGUGGUGAUGGAGAUGCAGUCACUUAUUGUCCAGGUGAGGCCCAAGAGCCCUGUGGCCGCCACCUGAGGUGGGCUGGGGCUGCUCCCCUAACCCUACUUUGCUUCCGCCACUCAGCCAUUUCCCCCUCCUCAGAUGGGGCACCAAUAACAAGGAGCUCACCCUGCCCGCUCCCAACCCCCCUCCUGCUCCUCCCUGCCCCCCAAGGUUCUGGUUCCAUUUUUCCUCUGUUCACAAACUACCUCUGGACAGUUGUGUUGUUUUUUGUUCAAUGUUCCAUUCUUCGACAUCCGUCAUUGCUGCUGCUACCAGCGCCAAAUGUUCAUCCUCAUUGCCUCCUGUUCUGCCCACGAUCCCCUCCCCCAAGAUACUCUUUGUGGGGAAGAGGGGCUGGGGCAUGGCAGGCUGGGUGACCGACUACCCCAGUCCCAGGGAAGGUGGGGCCCUGCCCCUAGGAUGCUGCAGCAGAGUGAGCAAGGGGGCCCAAAUCGACCAUAAAGGGUGUAGGGGCCACCUCCUCCCCCUGUUCUGUUGGGGAGGGGUAGCCAUGAUUUGUCCCAGCCUGGGGCUCCCUCUCUGGUUUCCUAUUUGCAGUUACUUGAAUAAAAAAAAUAUCCUUUUCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-864.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -904.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 576.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(((.((((..(.((((.(((.(.((.(((...((((.(((((...))))).......(((((((..(((((((((..(.((((.((..(.(((((((((((((((.(((((((............(((((((....)))))))...........((((.......))))(((((...((((((((((((((........)))))).(((((.(((....))).)))))..(((((((.(((...........((((...((((((.(..(((.((..(((((((..((((.(.(((((.((((((((((.(.(((((........((((...((((...))))))))))).)).)))).))))..))).))))).).)).)).)))))))..((((....)))).)).)))..).)))))).)))).(((((((((((......))..((((((.((..(((.(((....))).)))...)).))))))).))))))))..))))))))))...((((...))))))))))..))...))))).)))))))...)))))))).))))))).)..)))))).)...))))))..))).)))))))...))))))))).).))).)))).)...)))).)))........((((.((....))))))((....)).....((((.((((.(((((((((.(((((((.((((.....((((.(((((.((....((.((((..(((....))).....((((((((.(((........))).......(((((((((....)))))))))))))))))(((((.((((((....)).)))).)))))..)))))).))))))).))))(((((((.(((.....(((...)))....................(((((....................)))))...((.((((((((((((...(((((((.((((((.(.((((.....(((....))).....)))).))))))).)......((((......)))).(.(((((((((((((((........)))))).....((((((((((((((((((((((((...)).)))))))))...((((...))))....((((.(((((.((((((((.(((((...((((.......(((....))))))))))))..))))))))))))).))))......(((((....))))).......((.((((.............))))..))..)))))))))))))....(((.(((((((.((((...)))).)))))))...))).((((((((((((((((((.((((((((((((((..((((((((((....((((((......))))))))))..((((......))))...))))))...)))))))))))))))..............((((..(.(((..(((..((.....))..)))..))).)..))))..))))))))))))..)))))......))))))))).).)))))).)))))))))))).))....)))))))))))))).)))))))(((((((((...........((......)).....((((.((....)).))))............(((((...........)))))....((((((..((((((((.((((...((.(((..(.((((((((((((((((((((((...........)))))))..((((((.....((..........)).....))))))........((.((((....))))))..((((........))))....((((((.(((((.((..(((((((((((.((......)).)))))..)))))).))))))).))))))(((((.(........))))))....)))))))))))))))..)..))).)).....))))..))).)))))))))))................))))).))))(((.(((.(((((((..........)))))))))).))).......((((((...))))))........))))))))).)))).)))).......)))))).....(((......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{(((,.(((.((((..{.((((.(((.(.({{(({..{(((,{((,((.{({((,({{,....||||,||}}|{,((((((..(.((((.((..{.(((((((((((((((.(((((((......,.,,..(((((((....}})))))..},.}}..}}((((.......))))(((((...((((((((((((((........)))))).(((((.{((....)))}))))}(.(((((((.(((...........({((,||(((((({(,{(((.({.,(((((((,{((((,(.{{(((,{||,{{{|{{.,.{{{(({..,,,,.{{{{..,||,,,,,,))})}})))),)),}}})}},)}}}))).))),},)})).)}.))|||||{,({((....))))}))}})).,},)}}}}}.)))).(((((((({((......)}..((((((.((..(((.(((....))).}))...)).))))))}.))))))))..))))))))))}..((((...))))))))))..})...))))).)))))))...)))))))).))))))).,..)))))).)...))))))..})).))),))),..,,,.}))),.).))).)))).,...)))).)))........((((.((....))))))((....,}..,..{(((.((((.((((((((({((((,((.((({.....{{((.({(((,((..,,((,((({..,{,,,,,(||{|||{{{{{({(((((((,,......|||.,.}}}|||||||||...,|}||||}|||,,,,,,,(((((.(((({{....}).)))).)))))..}}}}},.}}}}}}},||||{({{{{{.{{,...,,(((..,|||.|,,................(((({..................,,)}}},...{{.{{{(((((((((...(((((((.((((((,(,(({{.....(((....))).....})))}})))))).},.....((((......)))),(.(((((((((((((((........)))))),...,((((((((((((((((((((((((...)).)))))))))...((({...||||,{..((({.(((((.((((((((.(((((..,(((({......,{{....}}))))))))))..)))))))).))))}))))..,,..(((((....))))).......,,.(({{.,...........})))..))}}))))))))))))),...{{{.{((((((.((((...)))).)}}))))}.,))}.((((((((((((((((((.((((((((((((((..((((((((((....((((((......))))))))))..|{{(......))}|...)))))).,.)))))))))),)))},,},.........,||||},|.(((..(((..((.....))..)))..))).}..,,,,..))))))))))))}.,))))......))))))))).).)))}}}.)))))))))))).)),,..})))))))))})))|})))}}}||{,,{{{,.....{|,,,,},.,,,,.)).....,{{{|||,...}}.))))............(((((.......,...)))))....{{{|||,,{{{|||{(.((((,,{({.{((..,.((((((((((((((((((((((...........||||}}}..{,{{{{.....,|..}}|}....}}.....,|||,...}}}.,{{{{((((....))))}||,|{{(........}}}}{{,,((((((.(((((.({..(((((((((((,((.....,)).}))))..)))))).))))))).)))))){{|||||....,,|.,}}}))},..}))))))))))))))..),,))}.))..}..))))..))).)))))))))))........,,,,....,)))},))))|((.(((.(((((((,......,..)))))))))).))}..,,...||||||,,.))))})}.}}}}}.))))))))).)))).)))}..,,,..,,,,},.....{((......)))
Back