Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_147148.3
Sequence Length
1345 nt
GC Content
0.5242
CUAGUGCUUCCGGACCUUGCUCCCUGAACACUCGGAGGUGGCGGUGGAUCUUACUCCUUCCAGCCAGUGAGGAUCCAGCAACCUGCUCCGUGCCUCCCGCGCCUGUUGGUUGGAAGUGACGACCUUGAAGAUCGGCCGGUUGGAAGUGACGACCUUGAAGAUCGGCGGGCGCAGCGGGGCCGAGGGGGCGGGUCUGGCGCUAGGUCCAGCCCCUGCGUGCCGGGAACCCCAGAGGAGGUCGCAGUUCAGCCCAGCUGAGGCCUGUCUGCAGAAUCGACACCAACCAGCAUCAUGUCCAUGACACUGGGGUACUGGGACAUCCGCGGGCUGGCCCACGCCAUCCGCCUGCUCCUGGAAUACACAGACUCAAGCUACGAGGAAAAGAAGUAUACGAUGGGGGACGCUCCUGACUAUGACAGAAGCCAGUGGCUGAAUGAAAAAUUCAAGCUGGGCCUGGACUUUCCCAAUCUGCCCUACUUGAUUGAUGGGGCUCACAAGAUCACCCAGAGCAACGCCAUCCUGUGCUACAUUGCCCGCAAGCACAACCUGUGUGGGGAGACAGAAGAGGAGAAGAUUCGUGUGGACAUUUUGGAGAACCAGGCUAUGGACGUCUCCAAUCAGCUGGCCAGAGUCUGCUACAGCCCUGACUUUGAGAAACUGAAGCCAGAAUACUUGGAGGAACUUCCUACAAUGAUGCAGCACUUCUCACAGUUCCUGGGGAAGAGGCCAUGGUUUGUUGGAGACAAGAUCACCUUUGUAGAUUUCCUCGCCUAUGAUGUCCUUGACCUCCACCGUAUAUUUGAGCCCAACUGCUUGGACGCCUUUCCAAAUCUGAAGGACUUCAUCUCCCGCUUUGAGGUUUCCUGUGGCAUAAUGUGAUGGUCAAUUUUCUGCAUCAACUUGACUGGGCUAAGGGAUGCUCAGAUGGCAGGUAAAAUCAUUGUGCUUGUGAGGGUGUUUCCAGAAGAGAUUUGCCUUUGAAUCAGAAGACAGCAAAGAUUUCCUUCAGCAAUGAAGGAGGCAUCCACCAAACUGUCAGGGCCCAGAGAGAAGAAAAAGACAGGAAGGGUGAAUUUGACCUCUCUGACUGGGACAUCCAUCUCUGCCUAUCCUGGGACCUCCACACUCCUGGUUCUCUGGCCUUCAGACUUGAUCAGGGACUAACACCAUCGCCUCCCACCCCCACCUUUGUUCUGAGGCCUUUAGCCUCUGAAUGAUACCACUGGCUUUCCUGCUUCUCUAUCCUGCAGUCGGCAGAUCAUGGGACUUCUUCACUCCAAAAUUGUGUGAGCCAAUUCCCAUAACAGAUAGAUAAAUUUAUAAAUAAACACACAAAUUUCCUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-447.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -470.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 285.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...(((((((.(((((((.......(((((..((.(.(((((((((((..........))))).)))))).)..))..))))).((((((.((((((((((((((.......))))).....((((..(.(((((.......)))))..)..))))))))))))).).)))))..)))))))))))))))))))))..........((.(((.((((((..((((.((((((.(((((((.(.((((((((....(((((((((((((..(.((..((((..((((....))))..)))).......((....))(((((.((((....)))))))))((((((((....(((((((......(((.((.((......((((((.(((((.(...(((((((.......))).((((...))))...........(((((..((((.(((......)))....))))..)))))....(((((.((....)).).))))))))..).))))).))))))......))))..))).....)))))))))))).)))....)).)..))))).))))))))..(((((((.(((.....)))...))))))))))))))).).))).))))...((((((((..(((((...(((((((((((..(((((((((....(((((...((((((((..((((((.(((...)))))))))(((.(((.((..((.(((((((((......)))))....))))..))..)).))).)))(((((..(((......(((((((......))))))).(((.....((((((.((((.............)))).)))))).....))).....)))..))))).....))))))))......((((((........))))))..((((((.....((((.......))))(((((((.((((.((((((((((((((......))))...)))))....(((((((....)))))))((((..((((...(((((.....................)))))....))))....)).)))))))..)))))))))))...)))))).....))))))))))).......)))..))))).)))))).))))))))))).)).........))))))...........((((((.(((((.....))))).)))))).....))))..))))))....((((((((((.....))))...((((((....(((((...........))))).....))))))....))))))................))).))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{(((,..,((((((,,(((((((,......{((((,.((.,{(((((((((((.,.....,..)))))))))))).)..)),.))}}|.((((((.((((((((((((((.......|}}||.....((((..,.{{{{{.......)))))..,..))))))))))))).).))))),.)))))))))))))))|||}||{.......,,||,||{,{(((((..((((.((((((.(((((((.(.((((((((....(((((((((((((..(.((..((((..((((....})))..)))),,,...,{{....))(((((.((((....)))))))))((((((((....(((((((......(((.((.((..{.{.((((((.(((((.(...(((((((.......}}}.((((...||||,,,{.....},||{{|,,((({.(((......))}....}}}}..}}}}}..,.|(((|,{{....)).,.})))))))..).))))).)))))).}.},.))))..))).....)))))))))))).)))....)).}..))))).))))))))..{((((((.(((.....)))...))))))})))))))).}.))).))))...((((((((..(((((...(((((((((((..(((,(((({....((({{{{{((((((((..((((((.(((...))))))))){((.(((.((..((.(((((({((......,}})}.,.}))))..))..)).))).))|(((((..(((..,,,.,{{({((,,....}}}}|||.{((..,,,|{{{{{.{(((,{,,,,......,}}}),))))}),,,,.))),,,..)))..))))).....))))))))..,}}.,{|||{...,{{{.||||||{,((((((.....{(((.......))))((((({{{((((.((((({((((((((......))))...))))},.,{(((((((....)))))))||{|,.((((...(((((.....................)))))....)))).....,..,)))))..)))))))))))...}))))).}}..)))),},))),..}}}}.)))..)))))}}))))).))))))))))).)).........))))))...........{(((((.(((((.....))))).)))))).....))))..)))))),,..((((((((((.....))))...((((((.,,.(((((..,,....,}.)))))..,,.))))))....))))))................,,}.,............
Back