Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_147199.4
Sequence Length
1504 nt
GC Content
0.4987
AGGUCAGGCUUCAGAGUCAGCAAGAACUGGAUUUCAAACUGGAUUUGAGGACCCCCACCUUUUGAUAGGUGACUUAUUCUCUGUGAGUCUCUGAUCUGCCCUCUUUAAAUGAGGAAGUAAAUCCCACAUGGCAGGGUGGUGGGGAGAAUCAGAGAUCAUACAGCUGGUGAUCACAACUGGUUUCUGUUUCCAGGGUCACCAGACUAGGGUUUCUGAGCAUGGAUCCAACCAUCUCAACCUUGGACACAGAACUGACACCAAUCAACGGAACUGAGGAGACUCUUUGCUACAAGCAGACCUUGAGCCUCACGGUGCUGACGUGCAUCGUUUCCCUUGUCGGGCUGACAGGAAACGCAGUUGUGCUCUGGCUCCUGGGCUGCCGCAUGCGCAGGAACGCCUUCUCCAUCUACAUCCUCAACUUGGCCGCAGCAGACUUCCUCUUCCUCAGCGGCCGCCUUAUAUAUUCCCUGUUAAGCUUCAUCAGUAUCCCCCAUACCAUCUCUAAAAUCCUCUAUCCUGUGAUGAUGUUUUCCUACUUUGCAGGCCUGAGCUUUCUGAGUGCCGUGAGCACCGAGCGCUGCCUGUCCGUCCUGUGGCCCAUCUGGUACCGCUGCCACCGCCCCACACACCUGUCAGCGGUGGUGUGUGUCCUGCUCUGGGCCCUGUCCCUGCUGCGGAGCAUCCUGGAGUGGAUGUUAUGUGGCUUCCUGUUCAGUGGUGCUGAUUCUGCUUGGUGUCAAACAUCAGAUUUCAUCACAGUCGCGUGGCUGAUUUUUUUAUGUGUGGUUCUCUGUGGGUCCAGCCUGGUCCUGCUGAUCAGGAUUCUCUGUGGAUCCCGGAAGAUACCGCUGACCAGGCUGUACGUGACCAUCCUGCUCACAGUACUGGUCUUCCUCCUCUGUGGCCUGCCCUUUGGCAUUCAGUUUUUCCUAUUUUUAUGGAUCCACGUGGACAGGGAAGUCUUAUUUUGUCAUGUUCAUCUAGUUUCUAUUUUCCUGUCCGCUCUUAACAGCAGUGCCAACCCCAUCAUUUACUUCUUCGUGGGCUCCUUUAGGCAGCGUCAAAAUAGGCAGAACCUGAAGCUGGUUCUCCAGAGGGCUCUGCAGGACGCGUCUGAGGUGGAUGAAGGUGGAGGGCAGCUUCCUGAGGAAAUCCUGGAGCUGUCGGGAAGCAGAUUGGAGCAGUGAGGAAGAGCCUCUGCCCUGUCAGACAGGACUUUGAGAGCAACACUGCCCUGCCACCCUUGACAAUUAUAUGCGUUUUUCUUAGCCUUCUGCCUCAGAAAUGUCUCAGUGGUUCCUCAAGGUCUUCAAAUAGAUGUUUAUCUAACCUGACAGUUGCGGUUUUCACCCAUGGAAAGCAUUAGUCUGACAGUACAAUGUUUAGAUUCUCCUUGAUAUUACCAACACAUUUUCCCUGUUAUCUCACACUGAAUCUUUCCUACAGAACACUUUUUCUGCAAUUUUCUUUGUAAUAAAAGGAGUUCCUGUACAAAACCCUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-498.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -525.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 496.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((((((((.((((...(((......)))...)))).))))))).))..(((((......)))))....((((..((((((.....(((.(((((((.......))))..))).)))....((((((((((((((((((((((((((.((..(((..(((((((((....((((.........))))))))))))).(((((((...((((.((((......)))))))))))))))...((((.((((..........((.((((((((...(((((((((...))))))....)))))))(((((((......))))))).......((((((((((((((....((((..(.(((((((((((((.((........)).)))))..))).............((((((.(((((((((.(..((........))..).)))))))....................((((((((.((.((((.........(((((...((.((((.(((..((((...............((((((...(((.(((.(.((((.....)))))))).))))))))).(((((((((((((...((((((.(((((((((((...(((....)))..))))))).(((.((((.((((((((...(((.((......)).))).))))))))((((((((((((.(..((((.((((((((((((((.....(((((((...))))))).....))).(((((....)))))...................((((.(((((((....(((((((.....))))))).....))))))))))))).))))))))).))))..)))))))).))))).((.(((((....((....))....))))))).((((....)))).....................)))).)))((((((((((((((...(((...............)))....))))))))))))))......)))).))))))..(((((.............)))))...(((((((....(((......)))....)))))))((((....)))).)))))..))))))))))))..))))))).))...)))))(((((((((...(((....)))))))))))))))).)).)).)))))))))))))))))))).))))))))))))..(((((((((((.(((....)))...(((((....((((............(((((.((.(....).)).)))))))))...)))))..)))))))))))....(((((....))))).)))))))))).))((((((.......)))))).))))))))...)))..)).))).)))))))))......))))).........)))))))))))))))..))))......((((((((.(((((..(((((......)))))..)))))..))).)))))....)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((.{(((({,((((...,,.}}}},.}},...}}}}|{(((((((((..{{{({.,,,,,}||||........{(((((.(((((((((((.(((((,,.....)))),......,{((,({{.,,...))})})))})),})))))))},.,,,,,(((((((((....((((.........))))))))))))).(((((((...((((.((((......))))))))))))))).}}}))}..|||}}}}.,}}},.(((((((,,((({(,,{{{(((...||}}}}.,,,}}}},,,(((((((......))))))).....{(((((((.((,((((....(((({.{((((((((((((((.((........)).)))))..)))....,,,......{((,.....{{{{{{{.({(((....{{{{{{{{{,}|}||},{{.......,,,,{.,...{(((((({{.{{,{,,,,,|,||,{,,...{,,,{(..({{,,{{{{{{{{|.{{,..........((((((...{((.{{{.{.((((.....))))}))),})})))))).{{{{{{({(((((,,(,((.({(((,((((((((...(({....}))..)))))))))}),)}}|,|{,.||||}}..,...,.}}.|||}{|||{{((((({,((({(((,{{{|}|.,||{{,||||{||||}|,,..,,},|{({{{{...}))))))}..}}}}}}|||,,..}})),})},,,,...,,},||||,{{((((.(((((((.,..(((((((.....)))))}|,....))))))))))},))}))))),))|))))|,}|}}||||,|}}}},}}}}|))),.,,||}}..||,{{,|.,|{({{((((,,{(((((((,.({...(((,,.....,.)))...,,((((((((((((((...{,,.,{........,...}},....))))))))))))))......,.}.)))))))},(((,(,{,,,,,,,,..,|||}}.{{{,...}||||.|{{......||.((((((.......)))))))))}}}))),}})))))))))),,.))))))))))},))}))))|||||||,{,.}|||,...}})))))))}}))))),,,.,,..)).)),}}))))))))),,)))))||{||,,,,}))),,..,,))}))}.,))))))))),}}|))..})))}......{{{,,,,,.,.||},,{{{|...})))),,))))).,))))))),,,.))))))))}}|((({....))))}.))))))..,{{.(((({{.......((((((..(((((.((({({.,.((((({.,{,,,,..,,.)).,},...,..},,,,....}))),...})).)))))..))))))((((((((.(((((..(((((......)))))..)))))..)))}})))).,}}))).,....
Back