Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_148966.2

Sequence Length

1857 nt

GC Content

0.6381

GAAGGCGGAACCACGACGGGCAGAGAGCACGGAGCCGGGAAGCCCCUGGGCGCCCGUCGGAGGGCUAUGGAGCAGCGGCCGCGGGGCUGCGCGGCGGUGGCGGCGGCGCUCCUCCUGGUGCUGCUGGGGGCCCGGGCCCAGGGCGGCACUCGUAGCCCCAGGUGUGACUGUGCCGGUGACUUCCACAAGAAGAUUGGUCUGUUUUGUUGCAGAGGCUGCCCAGCGGGGCACUACCUGAAGGCCCCUUGCACGGAGCCCUGCGGCAACUCCACCUGCCUUGUGUGUCCCCAAGACACCUUCUUGGCCUGGGAGAACCACCAUAAUUCUGAAUGUGCCCGCUGCCAGGCCUGUGAUGAGCAGGCCUCCCAGGUGGCGCUGGAGAACUGUUCAGCAGUGGCCGACACCCGCUGUGGCUGUAAGCCAGGCUGGUUUGUGGAGUGCCAGGUCAGCCAAUGUGUCAGCAGUUCACCCUUCUACUGCCAACCAUGCCUAGACUGCGGGGCCCUGCACCGCCACACACGGCUACUCUGUUCCCGCAGAGAUACUGACUGUGGGACCUGCCUGCCUGGCUUCUAUGAACAUGGCGAUGGCUGCGUGUCCUGCCCCACGAGCACCCUGGGGAGCUGUCCAGAGCGCUGUGCCGCUGUCUGUGGCUGGAGGCAGAAUGAAGCUGGGAUGGAGGCUCUGACCCCACCACCGGCCACCCAUCUGUCACCCUUGGACAGCGCCCACACCCUUCUAGCACCUCCUGACAGCAGUGAGAAGAUCUGCACCGUCCAGUUGGUGGGUAACAGCUGGACCCCUGGCUACCCCGAGACCCAGGAGGCGCUCUGCCCGCAGGUGACAUGGUCCUGGGACCAGUUGCCCAGCAGAGCUCUUGGCCCCGCUGCUGCGCCCACACUCUCGCCAGAGUCCCCAGCCGGCUCGCCAGCCAUGAUGCUGCAGCCGGGCCCGCAGCUCUACGACGUGAUGGACGCGGUCCCAGCGCGGCGCUGGAAGGAGUUCGUGCGCACGCUGGGGCUGCGCGAGGCAGAGAUCGAAGCCGUGGAGGUGGAGAUCGGCCGCUUCCGAGACCAGCAGUACGAGAUGCUCAAGCGCUGGCGCCAGCAGCAGCCCGCGGGCCUCGGAGCCGUUUACGCGGCCCUGGAGCGCAUGGGGCUGGACGGCUGCGUGGAAGACUUGCGCAGCCGCCUGCAGCGCGGCCCGUGACACGGCGCCCACUUGCCACCUAGGCGCUCUGGUGGCCCUUGCAGAAGCCCUAAGUACGGUUACUUAUGCGUGUAGACAUUUUAUGUCACUUAUUAAGCCGCUGGCACGGCCCUGCGUAGCAGCACCAGCCGGCCCCACCCCUGCUCGCCCCUAUCGCUCCAGCCAAGGCGAAGAAGCACGAACGAAUGUCGAGAGGGGGUGAAGACAUUUCUCAACUUCUCGGCCGGAGUUUGGCUGAGAUCGCGGUAUUAAAUCUGUGAAAGAAAACAAAACAAAACAAAAACGGCUUCUUGGCGUUUCUGCGGGGCUGGGGUGUUAAGUGGACUGGACUUUUCUCGAGGGAUUCGAAGGGGACGGGAAUCUUGUCACCCCGGGAUCUGGCACCCAUGGUGGAGUCCAGUGUGGCCUUAGCUCCCAAGCCUGCCCCUCCCGAGUCCACUCUGGCUCAAUUACCCCGAGAAGGAGAGAGCAAGUCGCGGCCACAGCGAGUGAGUGAACCGGAGCCCAGAUGAGAGCGCUUUAAUGGGGCUGCGAGGUGGCGGAGACAGGGUCGGGAUGGGGUGCAGCAGUUGGAGACACAGGGUCAGGGCCCCUCAUCCUCUAUUCACUCCACCGGGGCAGUGAAAGGGUCCCGGCAGCGAGUGGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-835.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -861.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 483.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((.....))..((((((((((.........((..(((((....(((((((..(((.(((((..(((((((.((((((....))))))))((((((((((.((((((((.....(((((((((..((((....))))..))))))))).((..(((((((.(((..((((..((((.(((((((((((((...(((..(..(((((((((.((((.((..(((((((.((......)))))))..))..)))))))))))))))..).)))........(((((.....))))))))))))...))))))...)))).....(((....(((((..(((..((((((((.....))))))))..)))..)))))...)))(((((...)))))(((.((((((.(((((.((((((((((((((.(((....((.((.(((((((((...(((.((..(((((..........)))))..)))))(((......((((.((...)).)))).......)))..((((((....))))))...)))))).))).))))))).)))))))))........))))).))))).).)))))..))).))))..)))))))))).))......)))))))))))))))))).((((((((.(((........))).((.(((.((......))))))).))))))))...)))))..))))).))).)))))))....))))).))..((((((....))).)))....))))).)))))((((((........))))))(((((((.(((...(((.((((((((.((((((((((.....((((((.(((((....)))))))))))..))))))).((((((((.((((((((((((.((.(((((((...(((.((.((((.(((((.((((..((((((.((.(.(((((((..((((.((..(((..(.(.(((((((((((((..((((..(((....)))..)))).)))))))))))))).)(((..........))).(((((((((.......)))))))))...(((((.((..(((...)))..)))))))((((..((((..((((((((((..((((((((((.((((((..(((((((...(((((.((.(((((((((((.....))))))))))))).((((.(((((..((((((.((((......))))..(((.((((...((((((((((((....))...)))...)))))))...)))).)))........)))))).......))))).(((.((((..(((......)))...)))))))......))))..)))))...))))))))))...)))....(((.(((((....(((((((((..(.(((.....))).)..)))))))))....))))))))....((((((........))))))....................))))))))))..)))....))))))))))).))))....((((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((((..............((((.((((...(((((.(((...))).)))))..)))).))))...)))))))))..))))))).))).((........))((.....)).))))).))))).))))))).))).))))))....))).)))).).))..)))).))......))))))))).)))))).)))..)).)))))))))))))))))))((......)))))))))))))))).........((((((((.....)).)))))).))))).))).))).)).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{{.....}}..((((((((((..,{..{{.({.,(({((.,,,(((((((..(((.(((((..(((((((.((((((....))))))))((((((((({,(((((((({,{{.(((((({{(,,((((....))))..)))||}||},|{||(({{{((,(({..(({(,,((((.(((((((((((((...(((..(..(((((((((.((((.((..(((((((.((......)))))))..))..)))))))))))))))..}.)}}.,,,....(((((.....))))))))))))...))))))...)))).....(((....(((((..(((..((((((((.....))))))))..)))..)))))...))}{((((...)))))|||,||||||{((((({{{((((((((((((.(((..{{((,((,((.((((((.,.(((.((..(((((..........)))))..)))))},}}.)})}{{||.||.,,)),}}||{......))).,||||{,{{{{||||,,...,},.)))))))),,.))).)))))))))..,,,..}))))),,})))})})}))),.)))}))},})))))}})))).},......)))))))))))))))))).((((((((.(((,,......|}|{((.(((.((......))))))).))))))))...)))))..))))).))).)))))))....}}}}}.}}.,{({(({....}}),}))....))))).)))))((((((........))))))(((((((.(((...(((.((((({((.((((((((((.....((((((.(((((....)))))))))))..))))))).((((((((,((((((((((((.((.(((((((...(((.((.((((.(((({,((((..,.{(((((((((((,(((({.((((({{{.{,{{.{{(.(((((((((((((..((((..(((....)))..)))).)))))))))))))|{,(((...,,{|...||(.,{{{|||{{.,,,,.,))))}}|||,|.{{(((,{{..{{|..,))}..}}|}}))|{{,.||.,}.}},.}}|})|)})||,(((({....))))),}))))))}}.}))),)))}.(((((((((({.....})))))))))).)))))))|,(((((((...)))).)))......(((...(((((((((.((((({{.,({....}}.....,..{((((((((({.(((({.(((((...))))).........(((((.(((.((((..(((......)))...))))))).(((((((.(((({..{{.(((((........})))}})..}}..,.......)})))).)))))))..(((..(((((..(((((((((((((((..(((({{(.((((((........))))))....................{((((.(.....).))))).,|{((({{({(((.(((((({{.((((((((({.{,({.{((((((,..(((((((((...)))))).)))..))))},....||}.,)),)))))))))).).,.))))))}))),.,))})),,)}}.,.)))).)))))))}.........,)))))))..))))).,.)))))))).}}.))).)))))))}})))}.)))...)).)))))))))...)))))))))))).)))))).)))..)).))))))))))))))))))){|......,,)))))))))))))).........((((((((.....)).)))))}.))))).))).))).)).)))))