Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_148970.2
Sequence Length
1419 nt
GC Content
0.6434
GAAGGCGGAACCACGACGGGCAGAGAGCACGGAGCCGGGAAGCCCCUGGGCGCCCGUCGGAGGGCUAUGGAGCAGCGGCCGCGGGGCUGCGCGGCGGUGGCGGCGGCGCUCCUCCUGGUGCUGCUGGGGGCCCGGGCCCAGGGCGGCACUCGUAGCCCCAGGUGUGACUGUGCCGGUGACUUCCACAAGAAGAUUGGUCUGUUUUGUUGCAGAGGCUGCCCAGCGGAUGAAGCUGGGAUGGAGGCUCUGACCCCACCACCGGCCACCCAUCUGUCACCCUUGGACAGCGCCCACACCCUUCUAGCACCUCCUGACAGCAGUGAGAAGAUCUGCACCGUCCAGUUGGUGGGUAACAGCUGGACCCCUGGCUACCCCGAGACCCAGGAGGCGCUCUGCCCGCAGGUGACAUGGUCCUGGGACCAGUUGCCCAGCAGAGCUCUUGGCCCCGCUGCUGCGCCCACACUCUCGCCAGAGUCCCCAGCCGGCUCGCCAGCCAUGAUGCUGCAGCCGGGCCCGCAGCUCUACGACGUGAUGGACGCGGUCCCAGCGCGGCGCUGGAAGGAGUUCGUGCGCACGCUGGGGCUGCGCGAGGCAGAGAUCGAAGCCGUGGAGGUGGAGAUCGGCCGCUUCCGAGACCAGCAGUACGAGAUGCUCAAGCGCUGGCGCCAGCAGCAGCCCGCGGGCCUCGGAGCCGUUUACGCGGCCCUGGAGCGCAUGGGGCUGGACGGCUGCGUGGAAGACUUGCGCAGCCGCCUGCAGCGCGGCCCGUGACACGGCGCCCACUUGCCACCUAGGCGCUCUGGUGGCCCUUGCAGAAGCCCUAAGUACGGUUACUUAUGCGUGUAGACAUUUUAUGUCACUUAUUAAGCCGCUGGCACGGCCCUGCGUAGCAGCACCAGCCGGCCCCACCCCUGCUCGCCCCUAUCGCUCCAGCCAAGGCGAAGAAGCACGAACGAAUGUCGAGAGGGGGUGAAGACAUUUCUCAACUUCUCGGCCGGAGUUUGGCUGAGAUCGCGGUAUUAAAUCUGUGAAAGAAAACAAAACAAAACAAAAACGGCUUCUUGGCGUUUCUGCGGGGCUGGGGUGUUAAGUGGACUGGACUUUUCUCGAGGGAUUCGAAGGGGACGGGAAUCUUGUCACCCCGGGAUCUGGCACCCAUGGUGGAGUCCAGUGUGGCCUUAGCUCCCAAGCCUGCCCCUCCCGAGUCCACUCUGGCUCAAUUACCCCGAGAAGGAGAGAGCAAGUCGCGGCCACAGCGAGUGAGUGAACCGGAGCCCAGAUGAGAGCGCUUUAAUGGGGCUGCGAGGUGGCGGAGACAGGGUCGGGAUGGGGUGCAGCAGUUGGAGACACAGGGUCAGGGCCCCUCAUCCUCUAUUCACUCCACCGGGGCAGUGAAAGGGUCCCGGCAGCGAGUGGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-639.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -661.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 389.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.....))..((((((((((.........((..(((((....(((((((..(((...((((((((((((.((.(((((...(((((...))))).))))).)))))))....(((((((((..((((....))))..))))))))).)))))))((((.(((((((.(((((((.((((..(((.(((((......))))).)))..))))...((((((.......)))))).(((.((......))))).))))))))).......))))).))))))).)))))))....))))).))..((((((....))).)))....))))).)))))((((((........))))))(((((((.(((...(((.((((((((.((((((((((.....((((((.(((((....)))))))))))..))))))).((((((((.((((((((((((.((.(((((((...(((.((.((((.(((((.((((..((((((.((.(.(((((((..((((.((..(((..(.(.(((((((((((((..((((..(((....)))..)))).)))))))))))))).)(((..........))).(((((((((.......)))))))))...(((((.((..(((...)))..)))))))((((..((((..((((((((((..((((((((((.((((((..(((((((...(((((.((.(((((((((((.....))))))))))))).((((.(((((..((((((.((((......))))..(((.((((...((((((((((((....))...)))...)))))))...)))).)))........)))))).......))))).(((.((((..(((......)))...)))))))......))))..)))))...))))))))))...)))....(((.(((((....(((((((((..(.(((.....))).)..)))))))))....))))))))....((((((........))))))....................))))))))))..)))....))))))))))).))))....((((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((((..............((((.((((...(((((.(((...))).)))))..)))).))))...)))))))))..))))))).))).((........))((.....)).))))).))))).))))))).))).))))))....))).)))).).))..)))).))......))))))))).)))))).)))..)).)))))))))))))))))))((......)))))))))))))))).........((((((((.....)).)))))).))))).))).))).)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{.....}}..((((((((((..,{..{,.({.,(({{{..,,(((((((..(((.({((({{(((((((.((,(((({..,{(({{,.,|}||},|}|}},}))))}}.,|.(((((((((..((((....))))..))))))))}.))}))}}{{((,({{{{{(.(((((((.{{{{..{{{,|{{{{...,,,||}}}.}})|||||}||.((((((.......)))))).,|{,|{,,,}}.}}}},.))))))))}....,}}))},))))).))).)))))))....))))}.}}.,|{{(({....}}),}))....))))).)))))((((((........))))))(((((((.(((...(((.((((({((.((((((((((.....((((((.(((((....)))))))))))..))))))).((((((((.((((((((((((.((.(((((((...(((.((.((((.(((({,((((..,.{(((((((((((,(((({.((((({{{.{,{{.{{(.(((((((((((((..((((..(((....)))..)))).)))))))))))))|{,(((...,,{|...||(.,{{{|||{{.,,,,.,))))}}|||,|.{{(((,{{..{||..,))}..}}|}}))|{{,.||.,}.}},.}}|})|}}}||.(((({....))))),}))))))}}.}))),))}}.(((((((((({.....})))))))))).)))))))|,(((((((...)))).)))......(((...(((((((((.((((({{.,({....}}.....,..{((((((((({.(((({.(((((...))))).........(((((.(((.((((..(((......)))...))))))).(((((((.(((({..{{.(((((........}))}}}}..}}..,.......)})))).)))))))..(((..(((((..(((((((((((((((..(((({{(.((((((........))))))....................{((((.(.....).))))).,|{((({{({(((.(((((({{.((((((((({.{,((.{((((((,..(((((((((...)))))).)))..))))},....||}.,)),)))))))))).).,.))))))}))),,,))})),,)}}.,,)))).)))))))}.........,)))))))..))))).,.)))))))).}}.))).)))))))}})))}.)))...)).)))))))))...)))))))))))).)))))).)))..)).))))))))))))))))))){{......,,)))))))))))))).........((((((((.....)).)))))}.))))).))).))).)).)))))
Back